MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020512	ACGAC	2	10	516791	516800	40 %	0 %	20 %	40 %	478428582
10002	NC_020512	CTCTT	2	10	516874	516883	0 %	60 %	0 %	40 %	478428582
10003	NC_020512	TCC	2	6	516928	516933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428582
10004	NC_020512	GAG	2	6	516981	516986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428582
10005	NC_020512	T	6	6	517036	517041	0 %	100 %	0 %	0 %	478428582
10006	NC_020512	CTC	2	6	517083	517088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428582
10007	NC_020512	CAC	2	6	517121	517126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428582
10008	NC_020512	TCTCTA	2	12	517587	517598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478428583
10009	NC_020512	TC	3	6	517654	517659	0 %	50 %	0 %	50 %	478428583
10010	NC_020512	CTTC	2	8	517691	517698	0 %	50 %	0 %	50 %	478428583
10011	NC_020512	TCT	2	6	517802	517807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428583
10012	NC_020512	AGT	2	6	517959	517964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428583
10013	NC_020512	TCT	2	6	517982	517987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428583
10014	NC_020512	ATAG	2	8	518001	518008	50 %	25 %	25 %	0 %	478428583
10015	NC_020512	TCT	2	6	518083	518088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428583
10016	NC_020512	TGC	2	6	518089	518094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428583
10017	NC_020512	TGAACT	2	12	518095	518106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478428583
10018	NC_020512	TTG	2	6	518130	518135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428583
10019	NC_020512	CAA	2	6	518595	518600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428584
10020	NC_020512	ATA	2	6	518629	518634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428584
10021	NC_020512	TC	3	6	518727	518732	0 %	50 %	0 %	50 %	478428584
10022	NC_020512	TAA	2	6	518769	518774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428584
10023	NC_020512	AGA	2	6	518807	518812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428584
10024	NC_020512	AAG	2	6	518844	518849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428584
10025	NC_020512	GA	3	6	518882	518887	50 %	0 %	50 %	0 %	478428584
10026	NC_020512	ATCC	2	8	518889	518896	25 %	25 %	0 %	50 %	478428584
10027	NC_020512	CAT	2	6	518924	518929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428584
10028	NC_020512	AGA	2	6	518940	518945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428584
10029	NC_020512	T	6	6	518964	518969	0 %	100 %	0 %	0 %	478428584
10030	NC_020512	TCT	2	6	518989	518994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428584
10031	NC_020512	A	6	6	519039	519044	100 %	0 %	0 %	0 %	478428584
10032	NC_020512	GAA	2	6	519059	519064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428584
10033	NC_020512	TAA	2	6	519069	519074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428584
10034	NC_020512	AAT	2	6	519129	519134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428584
10035	NC_020512	AAT	2	6	519174	519179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428584
10036	NC_020512	ACA	2	6	519313	519318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428584
10037	NC_020512	TAATTC	2	12	519425	519436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478428584
10038	NC_020512	CGA	2	6	519447	519452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428584
10039	NC_020512	T	6	6	519490	519495	0 %	100 %	0 %	0 %	478428584
10040	NC_020512	TC	3	6	519554	519559	0 %	50 %	0 %	50 %	478428584
10041	NC_020512	A	6	6	519607	519612	100 %	0 %	0 %	0 %	478428584
10042	NC_020512	AAG	2	6	519638	519643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428584
10043	NC_020512	CTG	2	6	519648	519653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428584
10044	NC_020512	TTC	2	6	519660	519665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428584
10045	NC_020512	ACTCCT	2	12	519694	519705	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478428584
10046	NC_020512	TGCAA	2	10	519756	519765	40 %	20 %	20 %	20 %	478428584
10047	NC_020512	CTG	2	6	519848	519853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428584
10048	NC_020512	GCA	2	6	519896	519901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428584
10049	NC_020512	AAG	2	6	519914	519919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428584
10050	NC_020512	TC	3	6	519923	519928	0 %	50 %	0 %	50 %	478428584
10051	NC_020512	TGT	2	6	519931	519936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428584
10052	NC_020512	ATC	2	6	520045	520050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428584
10053	NC_020512	ATT	2	6	520059	520064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428584
10054	NC_020512	TAC	2	6	520086	520091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428584
10055	NC_020512	GAG	2	6	520132	520137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428584
10056	NC_020512	GATGAA	2	12	520214	520225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478428584
10057	NC_020512	TCT	2	6	520238	520243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428584
10058	NC_020512	GGA	2	6	520290	520295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428584
10059	NC_020512	TTC	2	6	520449	520454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
10060	NC_020512	GGA	2	6	520480	520485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428585
10061	NC_020512	TA	3	6	520488	520493	50 %	50 %	0 %	0 %	478428585
10062	NC_020512	AATG	2	8	520533	520540	50 %	25 %	25 %	0 %	478428585
10063	NC_020512	GTT	2	6	520597	520602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428585
10064	NC_020512	TCT	2	6	520631	520636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
10065	NC_020512	CAT	2	6	520643	520648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
10066	NC_020512	TCT	2	6	520690	520695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
10067	NC_020512	AAT	2	6	520710	520715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428585
10068	NC_020512	TCA	2	6	520748	520753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
10069	NC_020512	TTGC	2	8	520763	520770	0 %	50 %	25 %	25 %	478428585
10070	NC_020512	AATC	2	8	520772	520779	50 %	25 %	0 %	25 %	478428585
10071	NC_020512	AGCAC	2	10	520813	520822	40 %	0 %	20 %	40 %	478428585
10072	NC_020512	TAA	2	6	520830	520835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428585
10073	NC_020512	AAT	2	6	520924	520929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428585
10074	NC_020512	AGT	2	6	521016	521021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
10075	NC_020512	GAA	2	6	521048	521053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428585
10076	NC_020512	GAT	2	6	521063	521068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
10077	NC_020512	TTCTG	2	10	521080	521089	0 %	60 %	20 %	20 %	478428585
10078	NC_020512	AT	3	6	521139	521144	50 %	50 %	0 %	0 %	478428585
10079	NC_020512	TTG	2	6	521205	521210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428585
10080	NC_020512	CA	4	8	521255	521262	50 %	0 %	0 %	50 %	478428585
10081	NC_020512	ATCC	2	8	521298	521305	25 %	25 %	0 %	50 %	478428585
10082	NC_020512	ACT	2	6	521359	521364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
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10084	NC_020512	TCA	2	6	521429	521434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
10085	NC_020512	TC	4	8	521447	521454	0 %	50 %	0 %	50 %	478428585
10086	NC_020512	GAT	2	6	521526	521531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
10087	NC_020512	CAG	2	6	521574	521579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428585
10088	NC_020512	TAG	2	6	521597	521602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
10089	NC_020512	ATA	2	6	521746	521751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428585
10090	NC_020512	CAG	2	6	521820	521825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428585
10091	NC_020512	GTA	2	6	521859	521864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428585
10092	NC_020512	CAACA	2	10	521898	521907	60 %	0 %	0 %	40 %	478428585
10093	NC_020512	GA	3	6	521908	521913	50 %	0 %	50 %	0 %	478428585
10094	NC_020512	CTT	2	6	521957	521962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
10095	NC_020512	ACA	2	6	522115	522120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428585
10096	NC_020512	CTCC	2	8	522136	522143	0 %	25 %	0 %	75 %	478428585
10097	NC_020512	T	6	6	522157	522162	0 %	100 %	0 %	0 %	478428585
10098	NC_020512	CTT	2	6	522176	522181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
10099	NC_020512	TTG	2	6	522210	522215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428585
10100	NC_020512	CT	3	6	522372	522377	0 %	50 %	0 %	50 %	478428585
10101	NC_020512	AAG	2	6	522419	522424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428585
10102	NC_020512	GAG	2	6	522557	522562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428585
10103	NC_020512	CTT	2	6	522634	522639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
10104	NC_020512	AGA	2	6	522699	522704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428585
10105	NC_020512	CTG	2	6	522710	522715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428585
10106	NC_020512	TCA	2	6	522802	522807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
10107	NC_020512	TAA	2	6	522837	522842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428585
10108	NC_020512	CCT	2	6	522883	522888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428585
10109	NC_020512	TCT	2	6	523070	523075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
10110	NC_020512	TAC	2	6	523086	523091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428585
10111	NC_020512	TGT	2	6	523276	523281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428585
10112	NC_020512	AGC	2	6	523287	523292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428585
10113	NC_020512	TTC	2	6	523293	523298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
10114	NC_020512	GCC	2	6	523570	523575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478428585
10115	NC_020512	AACT	2	8	523695	523702	50 %	25 %	0 %	25 %	478428585
10116	NC_020512	AGC	2	6	523713	523718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428585
10117	NC_020512	AAC	2	6	523741	523746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428585
10118	NC_020512	GA	3	6	523784	523789	50 %	0 %	50 %	0 %	478428585
10119	NC_020512	CAA	2	6	523802	523807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428585
10120	NC_020512	AAG	2	6	523868	523873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428585
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10122	NC_020512	TTC	2	6	523897	523902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428585
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10235	NC_020512	GC	3	6	530738	530743	0 %	0 %	50 %	50 %	478428592
10236	NC_020512	ATGA	2	8	530788	530795	50 %	25 %	25 %	0 %	478428592
10237	NC_020512	GAT	2	6	530808	530813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428592
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10239	NC_020512	AAC	2	6	530940	530945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428592
10240	NC_020512	CTGA	2	8	530949	530956	25 %	25 %	25 %	25 %	478428592
10241	NC_020512	GA	3	6	530955	530960	50 %	0 %	50 %	0 %	478428592
10242	NC_020512	GTT	2	6	530976	530981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428592
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10255	NC_020512	AGGGT	2	10	531418	531427	20 %	20 %	60 %	0 %	478428592
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10350	NC_020512	TCCTC	2	10	535281	535290	0 %	40 %	0 %	60 %	478428594
10351	NC_020512	CA	3	6	535343	535348	50 %	0 %	0 %	50 %	478428594
10352	NC_020512	TA	3	6	535372	535377	50 %	50 %	0 %	0 %	478428594
10353	NC_020512	CAA	2	6	535471	535476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428594
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10357	NC_020512	AGA	2	6	535541	535546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428594
10358	NC_020512	CTTT	2	8	535549	535556	0 %	75 %	0 %	25 %	478428594
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10483	NC_020512	CAA	2	6	541826	541831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428602
10484	NC_020512	TC	3	6	541861	541866	0 %	50 %	0 %	50 %	478428602
10485	NC_020512	CTTC	2	8	541889	541896	0 %	50 %	0 %	50 %	478428602
10486	NC_020512	CT	3	6	541910	541915	0 %	50 %	0 %	50 %	478428602
10487	NC_020512	ATA	2	6	541917	541922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428602
10488	NC_020512	ATC	2	6	541943	541948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428602
10489	NC_020512	TCA	2	6	541993	541998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428602
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10492	NC_020512	A	7	7	542421	542427	100 %	0 %	0 %	0 %	478428603
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10499	NC_020512	T	6	6	542832	542837	0 %	100 %	0 %	0 %	478428604
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