MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_020512	GATC	2	8	489298	489305	25 %	25 %	25 %	25 %	478428552
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9504	NC_020512	CCAATC	2	12	489469	489480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478428552
9505	NC_020512	AAT	2	6	489503	489508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428552
9506	NC_020512	CTT	2	6	489553	489558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428552
9507	NC_020512	TTG	2	6	489748	489753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428552
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9509	NC_020512	GACA	2	8	489811	489818	50 %	0 %	25 %	25 %	478428552
9510	NC_020512	AG	3	6	489880	489885	50 %	0 %	50 %	0 %	478428552
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9512	NC_020512	ATT	2	6	489935	489940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428552
9513	NC_020512	CAT	2	6	489958	489963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428552
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9522	NC_020512	CT	3	6	490413	490418	0 %	50 %	0 %	50 %	478428553
9523	NC_020512	T	6	6	490609	490614	0 %	100 %	0 %	0 %	478428554
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9543	NC_020512	A	6	6	492590	492595	100 %	0 %	0 %	0 %	478428557
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9547	NC_020512	GATC	2	8	492656	492663	25 %	25 %	25 %	25 %	478428558
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9992	NC_020512	CT	3	6	516314	516319	0 %	50 %	0 %	50 %	478428582
9993	NC_020512	CTT	2	6	516498	516503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428582
9994	NC_020512	T	6	6	516502	516507	0 %	100 %	0 %	0 %	478428582
9995	NC_020512	A	6	6	516528	516533	100 %	0 %	0 %	0 %	478428582
9996	NC_020512	TTCT	2	8	516545	516552	0 %	75 %	0 %	25 %	478428582
9997	NC_020512	AGA	2	6	516581	516586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428582
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9999	NC_020512	AGA	2	6	516635	516640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428582
10000	NC_020512	ATC	2	6	516706	516711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428582

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