MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020512	A	7	7	238823	238829	100 %	0 %	0 %	0 %	478428339
4502	NC_020512	TCG	2	6	238883	238888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428339
4503	NC_020512	TC	3	6	238947	238952	0 %	50 %	0 %	50 %	478428339
4504	NC_020512	GT	3	6	238957	238962	0 %	50 %	50 %	0 %	478428339
4505	NC_020512	TCC	2	6	239162	239167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428339
4506	NC_020512	TCT	2	6	239213	239218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428339
4507	NC_020512	AGG	2	6	239476	239481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428340
4508	NC_020512	CTC	2	6	239523	239528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428340
4509	NC_020512	TAG	2	6	239532	239537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428340
4510	NC_020512	GAA	2	6	239717	239722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428340
4511	NC_020512	T	6	6	239724	239729	0 %	100 %	0 %	0 %	478428340
4512	NC_020512	CTG	2	6	239796	239801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428340
4513	NC_020512	GAC	2	6	239826	239831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428340
4514	NC_020512	TAT	2	6	239833	239838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428340
4515	NC_020512	TTC	2	6	239880	239885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428340
4516	NC_020512	CT	4	8	239945	239952	0 %	50 %	0 %	50 %	478428340
4517	NC_020512	CAG	2	6	240098	240103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428340
4518	NC_020512	CAG	2	6	240237	240242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428340
4519	NC_020512	AC	3	6	240378	240383	50 %	0 %	0 %	50 %	478428340
4520	NC_020512	TCTCCT	2	12	240593	240604	0 %	50 %	0 %	50 %	478428340
4521	NC_020512	TCTTT	2	10	240690	240699	0 %	80 %	0 %	20 %	478428340
4522	NC_020512	TAG	3	9	240704	240712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428340
4523	NC_020512	TTCT	2	8	240778	240785	0 %	75 %	0 %	25 %	478428341
4524	NC_020512	AAT	2	6	240800	240805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428341
4525	NC_020512	CT	3	6	240837	240842	0 %	50 %	0 %	50 %	478428341
4526	NC_020512	GTC	2	6	240905	240910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428341
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4529	NC_020512	AGA	2	6	240983	240988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428341
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4531	NC_020512	TCA	2	6	241071	241076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428341
4532	NC_020512	TCT	2	6	241098	241103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428341
4533	NC_020512	AAACCA	2	12	241168	241179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428341
4534	NC_020512	A	6	6	241189	241194	100 %	0 %	0 %	0 %	478428341
4535	NC_020512	AATCT	2	10	241284	241293	40 %	40 %	0 %	20 %	478428342
4536	NC_020512	TCA	2	6	241309	241314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428342
4537	NC_020512	CA	3	6	241326	241331	50 %	0 %	0 %	50 %	478428342
4538	NC_020512	ACT	2	6	241474	241479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428342
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4541	NC_020512	CTG	2	6	241556	241561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428342
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4544	NC_020512	ATTA	2	8	241683	241690	50 %	50 %	0 %	0 %	478428342
4545	NC_020512	T	7	7	241741	241747	0 %	100 %	0 %	0 %	478428343
4546	NC_020512	AAT	2	6	241813	241818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428343
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4552	NC_020512	CTC	2	6	242121	242126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428343
4553	NC_020512	TCCA	2	8	242164	242171	25 %	25 %	0 %	50 %	478428343
4554	NC_020512	CT	3	6	242317	242322	0 %	50 %	0 %	50 %	478428343
4555	NC_020512	CA	4	8	242347	242354	50 %	0 %	0 %	50 %	478428343
4556	NC_020512	CCA	2	6	242364	242369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428343
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4558	NC_020512	GTT	2	6	242439	242444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428343
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4560	NC_020512	TTAA	2	8	242574	242581	50 %	50 %	0 %	0 %	478428344
4561	NC_020512	CT	3	6	242596	242601	0 %	50 %	0 %	50 %	478428344
4562	NC_020512	TAG	2	6	242635	242640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428344
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4567	NC_020512	TGA	2	6	242732	242737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428344
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4598	NC_020512	CGAT	2	8	243958	243965	25 %	25 %	25 %	25 %	478428344
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4602	NC_020512	TGC	2	6	244049	244054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428344
4603	NC_020512	GCT	2	6	244056	244061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428344
4604	NC_020512	CAG	2	6	244063	244068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428344
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4606	NC_020512	TAG	2	6	244150	244155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428344
4607	NC_020512	GGA	2	6	244161	244166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428344
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4609	NC_020512	TCT	2	6	244510	244515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428345
4610	NC_020512	GT	3	6	244549	244554	0 %	50 %	50 %	0 %	478428345
4611	NC_020512	A	7	7	244558	244564	100 %	0 %	0 %	0 %	478428345
4612	NC_020512	CTTC	2	8	244577	244584	0 %	50 %	0 %	50 %	478428345
4613	NC_020512	CAGA	2	8	244617	244624	50 %	0 %	25 %	25 %	478428345
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4616	NC_020512	GCTG	2	8	244799	244806	0 %	25 %	50 %	25 %	478428345
4617	NC_020512	CTT	2	6	244818	244823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428345
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4619	NC_020512	TAAAC	2	10	244882	244891	60 %	20 %	0 %	20 %	478428345
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4740	NC_020512	A	6	6	250162	250167	100 %	0 %	0 %	0 %	478428350
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4748	NC_020512	GCC	2	6	250736	250741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478428351
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4750	NC_020512	CT	3	6	250795	250800	0 %	50 %	0 %	50 %	478428351
4751	NC_020512	GAT	2	6	250811	250816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428351
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4781	NC_020512	C	7	7	252571	252577	0 %	0 %	0 %	100 %	478428354
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4994	NC_020512	A	6	6	262952	262957	100 %	0 %	0 %	0 %	478428365
4995	NC_020512	AGC	2	6	263007	263012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428365
4996	NC_020512	AGC	3	9	263033	263041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428365
4997	NC_020512	GAT	2	6	263094	263099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428365
4998	NC_020512	TC	3	6	263195	263200	0 %	50 %	0 %	50 %	478428365
4999	NC_020512	TAA	2	6	263230	263235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428365
5000	NC_020512	AAG	2	6	263264	263269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428365

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