MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 3156

< Previous1234567Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020292	ACA	2	6	84314	84319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822673
2002	NC_020292	A	6	6	84363	84368	100 %	0 %	0 %	0 %	451822673
2003	NC_020292	TAC	2	6	84395	84400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822674
2004	NC_020292	AT	4	8	84481	84488	50 %	50 %	0 %	0 %	451822674
2005	NC_020292	TGC	2	6	84515	84520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822674
2006	NC_020292	TAA	2	6	84547	84552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822674
2007	NC_020292	ATT	2	6	84553	84558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822674
2008	NC_020292	AAATG	2	10	84620	84629	60 %	20 %	20 %	0 %	451822674
2009	NC_020292	TAA	2	6	84659	84664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822674
2010	NC_020292	AT	3	6	84690	84695	50 %	50 %	0 %	0 %	451822674
2011	NC_020292	TAA	2	6	84722	84727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822674
2012	NC_020292	T	6	6	84732	84737	0 %	100 %	0 %	0 %	451822674
2013	NC_020292	AAC	2	6	84789	84794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822674
2014	NC_020292	T	9	9	84837	84845	0 %	100 %	0 %	0 %	451822674
2015	NC_020292	TAAA	2	8	84883	84890	75 %	25 %	0 %	0 %	451822674
2016	NC_020292	ACT	2	6	84894	84899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822674
2017	NC_020292	ATA	2	6	84928	84933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822674
2018	NC_020292	TA	3	6	84949	84954	50 %	50 %	0 %	0 %	451822674
2019	NC_020292	TTA	2	6	84982	84987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822674
2020	NC_020292	ATA	2	6	84994	84999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822674
2021	NC_020292	TGA	2	6	85061	85066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822674
2022	NC_020292	TAA	2	6	85099	85104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822674
2023	NC_020292	GAAAT	2	10	85110	85119	60 %	20 %	20 %	0 %	451822674
2024	NC_020292	AGA	2	6	85139	85144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822674
2025	NC_020292	AGC	2	6	85236	85241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822674
2026	NC_020292	TAT	2	6	85252	85257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822674
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2028	NC_020292	ATA	2	6	85354	85359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822674
2029	NC_020292	TA	3	6	85375	85380	50 %	50 %	0 %	0 %	451822674
2030	NC_020292	ATA	2	6	85384	85389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822674
2031	NC_020292	ATT	2	6	85396	85401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822674
2032	NC_020292	TTA	2	6	85402	85407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822674
2033	NC_020292	TTA	2	6	85417	85422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822674
2034	NC_020292	AT	3	6	85433	85438	50 %	50 %	0 %	0 %	451822674
2035	NC_020292	AT	6	12	85463	85474	50 %	50 %	0 %	0 %	451822674
2036	NC_020292	ATT	2	6	85518	85523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822674
2037	NC_020292	AAAGC	2	10	85573	85582	60 %	0 %	20 %	20 %	451822674
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2039	NC_020292	A	6	6	85623	85628	100 %	0 %	0 %	0 %	451822674
2040	NC_020292	GAAAA	2	10	85639	85648	80 %	0 %	20 %	0 %	451822674
2041	NC_020292	TAT	2	6	85649	85654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822674
2042	NC_020292	G	6	6	85667	85672	0 %	0 %	100 %	0 %	451822674
2043	NC_020292	TGG	2	6	85711	85716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822675
2044	NC_020292	TA	6	12	85864	85875	50 %	50 %	0 %	0 %	451822675
2045	NC_020292	GGT	2	6	85880	85885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822675
2046	NC_020292	GGA	2	6	85928	85933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822675
2047	NC_020292	GGA	3	9	85940	85948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822675
2048	NC_020292	CTTA	2	8	85951	85958	25 %	50 %	0 %	25 %	451822675
2049	NC_020292	GGT	3	9	86069	86077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822675
2050	NC_020292	GAT	2	6	86093	86098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822675
2051	NC_020292	ATGGTT	2	12	86103	86114	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451822675
2052	NC_020292	TGG	2	6	86116	86121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822675
2053	NC_020292	GGA	2	6	86129	86134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822675
2054	NC_020292	AAC	2	6	86152	86157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822675
2055	NC_020292	TGG	2	6	86173	86178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822675
2056	NC_020292	GGA	2	6	86207	86212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822675
2057	NC_020292	GGA	2	6	86279	86284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822675
2058	NC_020292	GGT	2	6	86294	86299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822675
2059	NC_020292	GTG	3	9	86313	86321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822675
2060	NC_020292	TGG	3	9	86365	86373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822675
2061	NC_020292	TCA	2	6	86375	86380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822675
2062	NC_020292	TAT	2	6	86381	86386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822675
2063	NC_020292	ATT	2	6	86392	86397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822675
2064	NC_020292	A	7	7	86482	86488	100 %	0 %	0 %	0 %	451822675
2065	NC_020292	ATATT	2	10	86497	86506	40 %	60 %	0 %	0 %	451822675
2066	NC_020292	T	7	7	86518	86524	0 %	100 %	0 %	0 %	451822675
2067	NC_020292	A	6	6	86537	86542	100 %	0 %	0 %	0 %	451822675
2068	NC_020292	AT	4	8	86563	86570	50 %	50 %	0 %	0 %	451822675
2069	NC_020292	TGA	2	6	86596	86601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822675
2070	NC_020292	AATG	2	8	86620	86627	50 %	25 %	25 %	0 %	451822675
2071	NC_020292	AT	3	6	86723	86728	50 %	50 %	0 %	0 %	451822675
2072	NC_020292	AT	3	6	86739	86744	50 %	50 %	0 %	0 %	451822675
2073	NC_020292	TAAAAG	2	12	86763	86774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451822675
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2097	NC_020292	CTA	2	6	87963	87968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822676
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2099	NC_020292	CAA	2	6	88011	88016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822676
2100	NC_020292	TA	3	6	88037	88042	50 %	50 %	0 %	0 %	451822676
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2111	NC_020292	TAA	2	6	88491	88496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822676
2112	NC_020292	AGA	2	6	88549	88554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822676
2113	NC_020292	TTA	2	6	88567	88572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822676
2114	NC_020292	ATT	2	6	88578	88583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822676
2115	NC_020292	TTTG	2	8	88609	88616	0 %	75 %	25 %	0 %	451822676
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2117	NC_020292	GAT	2	6	88655	88660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822676
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