MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 141713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020291	A	6	6	115	120	100 %	0 %	0 %	0 %	451816899
2	NC_020291	CTAT	2	8	203	210	25 %	50 %	0 %	25 %	451816899
3	NC_020291	TTC	2	6	211	216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816899
4	NC_020291	GT	3	6	308	313	0 %	50 %	50 %	0 %	451816899
5	NC_020291	TA	3	6	321	326	50 %	50 %	0 %	0 %	451816899
6	NC_020291	AAT	2	6	389	394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
7	NC_020291	ATT	2	6	410	415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816899
8	NC_020291	ATG	2	6	420	425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
9	NC_020291	GCA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816899
10	NC_020291	ATT	2	6	547	552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816899
11	NC_020291	TA	3	6	553	558	50 %	50 %	0 %	0 %	451816899
12	NC_020291	TGG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816899
13	NC_020291	ATGC	2	8	590	597	25 %	25 %	25 %	25 %	451816899
14	NC_020291	GGAA	2	8	616	623	50 %	0 %	50 %	0 %	451816899
15	NC_020291	GTT	2	6	638	643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816899
16	NC_020291	TCT	2	6	650	655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816899
17	NC_020291	AATT	2	8	672	679	50 %	50 %	0 %	0 %	451816899
18	NC_020291	GAT	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
19	NC_020291	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
20	NC_020291	AAAT	2	8	715	722	75 %	25 %	0 %	0 %	451816899
21	NC_020291	GAA	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
22	NC_020291	ATG	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
23	NC_020291	TAA	2	6	826	831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
24	NC_020291	ATTAT	2	10	836	845	40 %	60 %	0 %	0 %	451816899
25	NC_020291	ACC	2	6	856	861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816899
26	NC_020291	AGA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
27	NC_020291	A	6	6	964	969	100 %	0 %	0 %	0 %	451816899
28	NC_020291	AAAAT	2	10	1028	1037	80 %	20 %	0 %	0 %	451816899
29	NC_020291	TAA	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
30	NC_020291	AAT	2	6	1072	1077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
31	NC_020291	TTC	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816899
32	NC_020291	ATA	2	6	1142	1147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
33	NC_020291	A	6	6	1151	1156	100 %	0 %	0 %	0 %	451816899
34	NC_020291	GTA	2	6	1193	1198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
35	NC_020291	AGA	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
36	NC_020291	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
37	NC_020291	GAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
38	NC_020291	TGG	2	6	1336	1341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816899
39	NC_020291	A	6	6	1374	1379	100 %	0 %	0 %	0 %	451816899
40	NC_020291	GAT	2	6	1400	1405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
41	NC_020291	ACA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816899
42	NC_020291	A	6	6	1435	1440	100 %	0 %	0 %	0 %	451816899
43	NC_020291	A	6	6	1740	1745	100 %	0 %	0 %	0 %	451816900
44	NC_020291	AT	4	8	1814	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	451816900
45	NC_020291	TAG	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816900
46	NC_020291	AGA	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
47	NC_020291	ATA	2	6	1946	1951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
48	NC_020291	ATT	2	6	1985	1990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816900
49	NC_020291	AAAT	2	8	2076	2083	75 %	25 %	0 %	0 %	451816900
50	NC_020291	A	6	6	2119	2124	100 %	0 %	0 %	0 %	451816900
51	NC_020291	AAG	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
52	NC_020291	TAG	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816900
53	NC_020291	GTT	2	6	2288	2293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816900
54	NC_020291	ATTG	2	8	2308	2315	25 %	50 %	25 %	0 %	451816900
55	NC_020291	AGA	2	6	2332	2337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
56	NC_020291	TGA	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816900
57	NC_020291	AAT	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
58	NC_020291	A	6	6	2394	2399	100 %	0 %	0 %	0 %	451816900
59	NC_020291	ATA	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
60	NC_020291	ATTA	2	8	2435	2442	50 %	50 %	0 %	0 %	451816900
61	NC_020291	TTA	2	6	2450	2455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816900
62	NC_020291	ATT	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816900
63	NC_020291	TGTAAA	2	12	2476	2487	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451816900
64	NC_020291	TAA	2	6	2553	2558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
65	NC_020291	TAA	3	9	2583	2591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
66	NC_020291	GAA	2	6	2621	2626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
67	NC_020291	A	6	6	2695	2700	100 %	0 %	0 %	0 %	451816900
68	NC_020291	GTT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816900
69	NC_020291	GAA	3	9	2759	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
70	NC_020291	AAT	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
71	NC_020291	AGG	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816900
72	NC_020291	CTT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816901
73	NC_020291	TA	3	6	2948	2953	50 %	50 %	0 %	0 %	451816901
74	NC_020291	A	7	7	3001	3007	100 %	0 %	0 %	0 %	451816901
75	NC_020291	TAA	2	6	3024	3029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816901
76	NC_020291	TGA	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816901
77	NC_020291	TATG	2	8	3132	3139	25 %	50 %	25 %	0 %	451816902
78	NC_020291	AATT	2	8	3191	3198	50 %	50 %	0 %	0 %	451816902
79	NC_020291	AATGTT	2	12	3202	3213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451816902
80	NC_020291	TATT	2	8	3258	3265	25 %	75 %	0 %	0 %	451816902
81	NC_020291	GAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816902
82	NC_020291	TAGAT	2	10	3363	3372	40 %	40 %	20 %	0 %	451816902
83	NC_020291	A	7	7	3373	3379	100 %	0 %	0 %	0 %	451816902
84	NC_020291	A	6	6	3405	3410	100 %	0 %	0 %	0 %	451816902
85	NC_020291	ATA	2	6	3425	3430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
86	NC_020291	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
87	NC_020291	AGA	2	6	3489	3494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816902
88	NC_020291	TAA	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
89	NC_020291	CTA	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816902
90	NC_020291	AGA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816902
91	NC_020291	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
92	NC_020291	ATA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
93	NC_020291	ATATT	2	10	3617	3626	40 %	60 %	0 %	0 %	451816902
94	NC_020291	AATT	2	8	3674	3681	50 %	50 %	0 %	0 %	451816902
95	NC_020291	AT	3	6	3717	3722	50 %	50 %	0 %	0 %	451816902
96	NC_020291	AGATA	2	10	3723	3732	60 %	20 %	20 %	0 %	451816902
97	NC_020291	T	6	6	3736	3741	0 %	100 %	0 %	0 %	451816902
98	NC_020291	TGA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816902
99	NC_020291	A	6	6	3779	3784	100 %	0 %	0 %	0 %	451816902
100	NC_020291	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
101	NC_020291	CAA	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816902
102	NC_020291	ATA	2	6	4009	4014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
103	NC_020291	TTA	3	9	4042	4050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
104	NC_020291	GAT	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816902
105	NC_020291	AT	3	6	4089	4094	50 %	50 %	0 %	0 %	451816902
106	NC_020291	ACAG	2	8	4116	4123	50 %	0 %	25 %	25 %	451816902
107	NC_020291	ATT	2	6	4157	4162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
108	NC_020291	TGT	2	6	4253	4258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816903
109	NC_020291	ATACA	2	10	4318	4327	60 %	20 %	0 %	20 %	451816903
110	NC_020291	AGA	3	9	4343	4351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816903
111	NC_020291	TGA	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816903
112	NC_020291	TAT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816903
113	NC_020291	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816903
114	NC_020291	TCA	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816903
115	NC_020291	ACA	2	6	4449	4454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816903
116	NC_020291	ATA	3	9	4553	4561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816904
117	NC_020291	ATG	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
118	NC_020291	GTAT	2	8	4622	4629	25 %	50 %	25 %	0 %	451816904
119	NC_020291	TCA	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816904
120	NC_020291	ATA	2	6	4682	4687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816904
121	NC_020291	CAATT	2	10	4746	4755	40 %	40 %	0 %	20 %	451816904
122	NC_020291	GAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
123	NC_020291	TGG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816904
124	NC_020291	GGT	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816904
125	NC_020291	GGA	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816904
126	NC_020291	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
127	NC_020291	TACAGT	2	12	4938	4949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816904
128	NC_020291	CAA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816904
129	NC_020291	TACT	2	8	4997	5004	25 %	50 %	0 %	25 %	451816904
130	NC_020291	TGA	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
131	NC_020291	TTTGAT	2	12	5089	5100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451816904
132	NC_020291	T	6	6	5130	5135	0 %	100 %	0 %	0 %	451816904
133	NC_020291	TA	3	6	5149	5154	50 %	50 %	0 %	0 %	451816904
134	NC_020291	A	6	6	5179	5184	100 %	0 %	0 %	0 %	451816904
135	NC_020291	GAA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
136	NC_020291	AT	4	8	5266	5273	50 %	50 %	0 %	0 %	451816904
137	NC_020291	ATG	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
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