MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 141713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
140001	NC_020291	AAAT	2	8	6450657	6450664	75 %	25 %	0 %	0 %	451822540
140002	NC_020291	TCA	2	6	6450705	6450710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822540
140003	NC_020291	A	6	6	6450760	6450765	100 %	0 %	0 %	0 %	451822540
140004	NC_020291	CAT	2	6	6450778	6450783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822540
140005	NC_020291	TTTA	2	8	6450851	6450858	25 %	75 %	0 %	0 %	451822540
140006	NC_020291	TTC	2	6	6450861	6450866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822540
140007	NC_020291	ATT	2	6	6450867	6450872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822540
140008	NC_020291	CAG	2	6	6451197	6451202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822541
140009	NC_020291	ATC	2	6	6451225	6451230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822541
140010	NC_020291	AGA	2	6	6451234	6451239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822541
140011	NC_020291	TGT	2	6	6451307	6451312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822541
140012	NC_020291	GCAGAT	2	12	6451373	6451384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451822541
140013	NC_020291	TGT	2	6	6451444	6451449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822541
140014	NC_020291	ACA	2	6	6451454	6451459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822541
140015	NC_020291	CAA	2	6	6451461	6451466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822541
140016	NC_020291	A	6	6	6451471	6451476	100 %	0 %	0 %	0 %	451822541
140017	NC_020291	TAAAAA	2	12	6451500	6451511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451822541
140018	NC_020291	AT	3	6	6451539	6451544	50 %	50 %	0 %	0 %	451822541
140019	NC_020291	TTG	2	6	6451551	6451556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822541
140020	NC_020291	A	6	6	6451629	6451634	100 %	0 %	0 %	0 %	451822541
140021	NC_020291	A	6	6	6451646	6451651	100 %	0 %	0 %	0 %	451822541
140022	NC_020291	GAA	2	6	6451682	6451687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822541
140023	NC_020291	TGG	2	6	6451702	6451707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822541
140024	NC_020291	AACT	2	8	6451747	6451754	50 %	25 %	0 %	25 %	451822541
140025	NC_020291	AGT	2	6	6451757	6451762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822541
140026	NC_020291	TA	3	6	6451913	6451918	50 %	50 %	0 %	0 %	451822541
140027	NC_020291	ACA	2	6	6451928	6451933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822541
140028	NC_020291	AGAT	2	8	6451966	6451973	50 %	25 %	25 %	0 %	451822541
140029	NC_020291	A	6	6	6451991	6451996	100 %	0 %	0 %	0 %	451822541
140030	NC_020291	TAG	2	6	6452031	6452036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822541
140031	NC_020291	AAT	2	6	6452111	6452116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822541
140032	NC_020291	GGT	2	6	6452144	6452149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822541
140033	NC_020291	GAT	2	6	6452237	6452242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822541
140034	NC_020291	TA	3	6	6452267	6452272	50 %	50 %	0 %	0 %	451822541
140035	NC_020291	AGA	2	6	6452345	6452350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822541
140036	NC_020291	ATG	3	9	6452388	6452396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822541
140037	NC_020291	AG	3	6	6452574	6452579	50 %	0 %	50 %	0 %	451822541
140038	NC_020291	CTG	2	6	6452595	6452600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822541
140039	NC_020291	TTC	2	6	6452605	6452610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822541
140040	NC_020291	AGG	2	6	6452611	6452616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822541
140041	NC_020291	TGC	2	6	6452647	6452652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822541
140042	NC_020291	AAG	2	6	6452676	6452681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822541
140043	NC_020291	TAT	2	6	6452808	6452813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822541
140044	NC_020291	AGCA	2	8	6452835	6452842	50 %	0 %	25 %	25 %	451822541
140045	NC_020291	TGC	2	6	6452851	6452856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822541
140046	NC_020291	TGT	2	6	6452920	6452925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822541
140047	NC_020291	AGA	3	9	6452938	6452946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822541
140048	NC_020291	GGT	2	6	6452963	6452968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822541
140049	NC_020291	GAA	2	6	6452981	6452986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822541
140050	NC_020291	AGC	2	6	6452998	6453003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822541
140051	NC_020291	TGA	2	6	6453004	6453009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822541
140052	NC_020291	A	6	6	6453015	6453020	100 %	0 %	0 %	0 %	451822541
140053	NC_020291	TGG	2	6	6453356	6453361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822542
140054	NC_020291	GAA	2	6	6453393	6453398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822542
140055	NC_020291	AAG	2	6	6453436	6453441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822542
140056	NC_020291	TATTT	2	10	6453443	6453452	20 %	80 %	0 %	0 %	451822542
140057	NC_020291	AGG	2	6	6453455	6453460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822542
140058	NC_020291	TAAA	2	8	6453523	6453530	75 %	25 %	0 %	0 %	451822542
140059	NC_020291	TA	3	6	6453582	6453587	50 %	50 %	0 %	0 %	451822542
140060	NC_020291	TAA	2	6	6453724	6453729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822542
140061	NC_020291	TAT	2	6	6453767	6453772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822542
140062	NC_020291	TTC	2	6	6453818	6453823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822542
140063	NC_020291	TGA	2	6	6453872	6453877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822542
140064	NC_020291	AAAAG	2	10	6453893	6453902	80 %	0 %	20 %	0 %	451822542
140065	NC_020291	GAT	2	6	6453975	6453980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822542
140066	NC_020291	TTA	2	6	6453988	6453993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822542
140067	NC_020291	GCT	2	6	6454083	6454088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822542
140068	NC_020291	GGAATG	2	12	6454140	6454151	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451822542
140069	NC_020291	TAA	2	6	6454186	6454191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822542
140070	NC_020291	ACT	3	9	6454203	6454211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822542
140071	NC_020291	A	7	7	6454297	6454303	100 %	0 %	0 %	0 %	451822542
140072	NC_020291	TAA	2	6	6454310	6454315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822542
140073	NC_020291	A	6	6	6454314	6454319	100 %	0 %	0 %	0 %	451822542
140074	NC_020291	GTA	2	6	6454336	6454341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822542
140075	NC_020291	AGA	2	6	6454433	6454438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822542
140076	NC_020291	TG	3	6	6454445	6454450	0 %	50 %	50 %	0 %	451822542
140077	NC_020291	AAC	2	6	6454485	6454490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822542
140078	NC_020291	GAAAAT	2	12	6454506	6454517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451822542
140079	NC_020291	AAAT	2	8	6454616	6454623	75 %	25 %	0 %	0 %	451822542
140080	NC_020291	GTA	2	6	6454709	6454714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822543
140081	NC_020291	TAG	2	6	6454769	6454774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822543
140082	NC_020291	ATC	2	6	6454796	6454801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822543
140083	NC_020291	GATTG	2	10	6454816	6454825	20 %	40 %	40 %	0 %	451822543
140084	NC_020291	TAC	2	6	6454869	6454874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822543
140085	NC_020291	TAT	2	6	6454875	6454880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822543
140086	NC_020291	A	6	6	6454888	6454893	100 %	0 %	0 %	0 %	451822543
140087	NC_020291	ATT	2	6	6454927	6454932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822543
140088	NC_020291	AT	3	6	6454988	6454993	50 %	50 %	0 %	0 %	451822543
140089	NC_020291	TAC	2	6	6455019	6455024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822543
140090	NC_020291	ATT	3	9	6455029	6455037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822543
140091	NC_020291	GCT	2	6	6455044	6455049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822543
140092	NC_020291	AAATGA	2	12	6455091	6455102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451822543
140093	NC_020291	TGA	3	9	6455100	6455108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822543
140094	NC_020291	ATA	3	9	6455125	6455133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822543
140095	NC_020291	TCTAAT	2	12	6455167	6455178	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451822543
140096	NC_020291	CTA	2	6	6455197	6455202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822543
140097	NC_020291	GAA	2	6	6455215	6455220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822543
140098	NC_020291	AT	3	6	6455266	6455271	50 %	50 %	0 %	0 %	451822543
140099	NC_020291	ATT	2	6	6455295	6455300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822543
140100	NC_020291	AAT	2	6	6455314	6455319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822543
140101	NC_020291	TGA	2	6	6455349	6455354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822543
140102	NC_020291	TTA	2	6	6455366	6455371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822543
140103	NC_020291	AGG	2	6	6455406	6455411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822543
140104	NC_020291	CAA	2	6	6455430	6455435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822544
140105	NC_020291	TTATT	2	10	6455495	6455504	20 %	80 %	0 %	0 %	451822544
140106	NC_020291	GTG	2	6	6455548	6455553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822544
140107	NC_020291	AAT	2	6	6455561	6455566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822544
140108	NC_020291	TAC	2	6	6455569	6455574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822544
140109	NC_020291	TA	3	6	6455606	6455611	50 %	50 %	0 %	0 %	451822544
140110	NC_020291	CTT	2	6	6455683	6455688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822544
140111	NC_020291	CAAT	2	8	6455715	6455722	50 %	25 %	0 %	25 %	451822544
140112	NC_020291	T	6	6	6455766	6455771	0 %	100 %	0 %	0 %	451822544
140113	NC_020291	AT	3	6	6455780	6455785	50 %	50 %	0 %	0 %	451822544
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