MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E

Total Repeats: 19418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020283	AAT	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811148
2	NC_020283	AAAT	2	8	59	66	75 %	25 %	0 %	0 %	451811148
3	NC_020283	GAA	2	6	162	167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811148
4	NC_020283	TCA	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811148
5	NC_020283	TTTC	2	8	277	284	0 %	75 %	0 %	25 %	451811148
6	NC_020283	ATA	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811148
7	NC_020283	ATG	2	6	326	331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811148
8	NC_020283	ATA	2	6	335	340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811148
9	NC_020283	TA	3	6	343	348	50 %	50 %	0 %	0 %	451811148
10	NC_020283	AAT	2	6	382	387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811148
11	NC_020283	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811148
12	NC_020283	GCT	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451811148
13	NC_020283	GT	3	6	539	544	0 %	50 %	50 %	0 %	451811148
14	NC_020283	TGT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451811148
15	NC_020283	AAGG	2	8	699	706	50 %	0 %	50 %	0 %	451811148
16	NC_020283	TGA	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811148
17	NC_020283	TTA	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811148
18	NC_020283	T	7	7	769	775	0 %	100 %	0 %	0 %	451811148
19	NC_020283	A	6	6	780	785	100 %	0 %	0 %	0 %	451811148
20	NC_020283	GAA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811148
21	NC_020283	ATT	3	9	844	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811148
22	NC_020283	ATAG	2	8	886	893	50 %	25 %	25 %	0 %	451811148
23	NC_020283	ACC	2	6	939	944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451811148
24	NC_020283	AGA	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811148
25	NC_020283	T	7	7	1020	1026	0 %	100 %	0 %	0 %	451811148
26	NC_020283	AGA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811148
27	NC_020283	AGA	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811148
28	NC_020283	TTTG	2	8	1338	1345	0 %	75 %	25 %	0 %	451811148
29	NC_020283	TAC	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811148
30	NC_020283	GAAAT	2	10	1461	1470	60 %	20 %	20 %	0 %	451811148
31	NC_020283	ACAA	2	8	1475	1482	75 %	0 %	0 %	25 %	451811149
32	NC_020283	GA	3	6	1486	1491	50 %	0 %	50 %	0 %	451811149
33	NC_020283	TAA	2	6	1495	1500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811149
34	NC_020283	GTT	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451811149
35	NC_020283	TAT	2	6	1552	1557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811149
36	NC_020283	AGT	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811149
37	NC_020283	TCAT	2	8	1593	1600	25 %	50 %	0 %	25 %	451811149
38	NC_020283	TAC	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811149
39	NC_020283	TGA	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811149
40	NC_020283	ACT	2	6	1668	1673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811149
41	NC_020283	ATT	2	6	1731	1736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811149
42	NC_020283	AGA	2	6	1771	1776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811149
43	NC_020283	TGA	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811149
44	NC_020283	GTTT	2	8	1879	1886	0 %	75 %	25 %	0 %	451811149
45	NC_020283	CAA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451811149
46	NC_020283	ATT	2	6	2084	2089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811149
47	NC_020283	ATG	3	9	2098	2106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811149
48	NC_020283	AG	3	6	2272	2277	50 %	0 %	50 %	0 %	451811149
49	NC_020283	ATC	3	9	2345	2353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811149
50	NC_020283	GAA	2	6	2367	2372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811149
51	NC_020283	GTTA	2	8	2430	2437	25 %	50 %	25 %	0 %	451811149
52	NC_020283	A	6	6	2638	2643	100 %	0 %	0 %	0 %	451811150
53	NC_020283	TA	3	6	2735	2740	50 %	50 %	0 %	0 %	451811150
54	NC_020283	CAT	2	6	2768	2773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811150
55	NC_020283	TTG	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451811150
56	NC_020283	TCA	2	6	2905	2910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811150
57	NC_020283	GAT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811150
58	NC_020283	GCA	2	6	2933	2938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451811150
59	NC_020283	TGA	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811150
60	NC_020283	AGG	2	6	2965	2970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451811150
61	NC_020283	TGG	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451811150
62	NC_020283	T	6	6	3169	3174	0 %	100 %	0 %	0 %	451811150
63	NC_020283	T	6	6	3189	3194	0 %	100 %	0 %	0 %	451811150
64	NC_020283	TCTA	2	8	3220	3227	25 %	50 %	0 %	25 %	451811150
65	NC_020283	GA	3	6	3235	3240	50 %	0 %	50 %	0 %	451811150
66	NC_020283	T	6	6	3247	3252	0 %	100 %	0 %	0 %	451811150
67	NC_020283	AAT	2	6	3254	3259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811150
68	NC_020283	TAAAAA	2	12	3289	3300	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451811150
69	NC_020283	GGA	2	6	3320	3325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451811150
70	NC_020283	TA	3	6	3344	3349	50 %	50 %	0 %	0 %	451811150
71	NC_020283	TCAT	2	8	3366	3373	25 %	50 %	0 %	25 %	451811150
72	NC_020283	GTC	2	6	3400	3405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451811150
73	NC_020283	TGT	3	9	3421	3429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451811150
74	NC_020283	TAA	2	6	3484	3489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811150
75	NC_020283	GGA	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451811150
76	NC_020283	GCT	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451811150
77	NC_020283	AATA	2	8	3554	3561	75 %	25 %	0 %	0 %	451811150
78	NC_020283	AAG	2	6	3584	3589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811150
79	NC_020283	TGA	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811150
80	NC_020283	GTAT	2	8	3632	3639	25 %	50 %	25 %	0 %	451811150
81	NC_020283	AGT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811150
82	NC_020283	CAAA	2	8	3677	3684	75 %	0 %	0 %	25 %	451811150
83	NC_020283	CAG	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451811150
84	NC_020283	AAGCAA	2	12	3774	3785	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451811150
85	NC_020283	AGC	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451811150
86	NC_020283	CTT	2	6	3918	3923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451811150
87	NC_020283	TA	3	6	3933	3938	50 %	50 %	0 %	0 %	451811150
88	NC_020283	CTG	2	6	3954	3959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451811150
89	NC_020283	GTT	2	6	4054	4059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451811150
90	NC_020283	AAC	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451811150
91	NC_020283	TTA	3	9	4149	4157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811150
92	NC_020283	CTGATG	2	12	4161	4172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811150
93	NC_020283	TTA	2	6	4232	4237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811150
94	NC_020283	AT	4	8	4250	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	451811150
95	NC_020283	CCT	2	6	4265	4270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451811150
96	NC_020283	TA	3	6	4272	4277	50 %	50 %	0 %	0 %	451811150
97	NC_020283	GAA	2	6	4295	4300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811150
98	NC_020283	GAT	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811150
99	NC_020283	GAA	3	9	4319	4327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811150
100	NC_020283	AAAT	2	8	4423	4430	75 %	25 %	0 %	0 %	451811150
101	NC_020283	A	6	6	4443	4448	100 %	0 %	0 %	0 %	451811150
102	NC_020283	GAA	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811150
103	NC_020283	TAT	2	6	4540	4545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811150
104	NC_020283	AAT	2	6	4553	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811150
105	NC_020283	AAT	2	6	4592	4597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811150
106	NC_020283	TTA	2	6	4614	4619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811150
107	NC_020283	TGA	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811150
108	NC_020283	A	6	6	4674	4679	100 %	0 %	0 %	0 %	451811150
109	NC_020283	GTT	2	6	4680	4685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451811150
110	NC_020283	AAT	2	6	4751	4756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811150
111	NC_020283	TGA	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811150
112	NC_020283	TTG	2	6	4776	4781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451811150
113	NC_020283	AAAAG	2	10	4799	4808	80 %	0 %	20 %	0 %	451811150
114	NC_020283	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811150
115	NC_020283	AAG	2	6	4854	4859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811150
116	NC_020283	CAAT	2	8	4865	4872	50 %	25 %	0 %	25 %	451811150
117	NC_020283	AAC	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451811150
118	NC_020283	CAA	2	6	4926	4931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451811150
119	NC_020283	AGA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811150
120	NC_020283	TTG	2	6	4983	4988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451811150
121	NC_020283	TGA	2	6	5017	5022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811150
122	NC_020283	CTC	2	6	5028	5033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451811150
123	NC_020283	AGA	2	6	5047	5052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811150
124	NC_020283	TAA	2	6	5068	5073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811150
125	NC_020283	TA	3	6	5089	5094	50 %	50 %	0 %	0 %	451811151
126	NC_020283	T	6	6	5095	5100	0 %	100 %	0 %	0 %	451811151
127	NC_020283	TGTT	2	8	5172	5179	0 %	75 %	25 %	0 %	451811151
128	NC_020283	ACTG	2	8	5190	5197	25 %	25 %	25 %	25 %	451811151
129	NC_020283	T	8	8	5225	5232	0 %	100 %	0 %	0 %	451811151
130	NC_020283	A	7	7	5256	5262	100 %	0 %	0 %	0 %	451811151
131	NC_020283	T	8	8	5273	5280	0 %	100 %	0 %	0 %	451811151
132	NC_020283	TGCT	2	8	5291	5298	0 %	50 %	25 %	25 %	451811151
133	NC_020283	TAT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811151
134	NC_020283	TTA	2	6	5350	5355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811151
135	NC_020283	TTC	2	6	5361	5366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451811151
136	NC_020283	ATATTT	2	12	5446	5457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811151
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269	NC_020283	A	8	8	10562	10569	100 %	0 %	0 %	0 %	451811154
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278	NC_020283	T	7	7	11006	11012	0 %	100 %	0 %	0 %	451811155
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394	NC_020283	T	6	6	15718	15723	0 %	100 %	0 %	0 %	451811158
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