MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_020134	CAG	2	6	2805391	2805396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442806024
47003	NC_020134	GCCG	2	8	2805418	2805425	0 %	0 %	50 %	50 %	442806024
47004	NC_020134	C	6	6	2805512	2805517	0 %	0 %	0 %	100 %	442806024
47005	NC_020134	AAC	2	6	2805662	2805667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442806024
47006	NC_020134	AAG	2	6	2805775	2805780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442806024
47007	NC_020134	TAT	2	6	2805829	2805834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442806024
47008	NC_020134	TTTC	2	8	2805884	2805891	0 %	75 %	0 %	25 %	442806024
47009	NC_020134	T	6	6	2805926	2805931	0 %	100 %	0 %	0 %	442806024
47010	NC_020134	CTG	2	6	2805998	2806003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806024
47011	NC_020134	CAA	2	6	2806005	2806010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442806024
47012	NC_020134	CAG	2	6	2806021	2806026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442806024
47013	NC_020134	CT	3	6	2806165	2806170	0 %	50 %	0 %	50 %	442806024
47014	NC_020134	GGC	2	6	2806228	2806233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442806024
47015	NC_020134	ATG	2	6	2806243	2806248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442806024
47016	NC_020134	TCC	2	6	2806274	2806279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442806024
47017	NC_020134	CCT	2	6	2806412	2806417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442806024
47018	NC_020134	ATG	2	6	2806435	2806440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442806024
47019	NC_020134	CT	3	6	2806482	2806487	0 %	50 %	0 %	50 %	442806024
47020	NC_020134	CGT	2	6	2806549	2806554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806024
47021	NC_020134	CAA	2	6	2806557	2806562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442806024
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47023	NC_020134	TTC	2	6	2806722	2806727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806024
47024	NC_020134	AT	3	6	2806767	2806772	50 %	50 %	0 %	0 %	442806024
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47026	NC_020134	TAAA	2	8	2806810	2806817	75 %	25 %	0 %	0 %	442806024
47027	NC_020134	TTAT	2	8	2806973	2806980	25 %	75 %	0 %	0 %	442806025
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47030	NC_020134	ATC	2	6	2807161	2807166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442806025
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47032	NC_020134	CAA	2	6	2807231	2807236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442806025
47033	NC_020134	GTT	2	6	2807410	2807415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442806025
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47035	NC_020134	CATA	2	8	2807426	2807433	50 %	25 %	0 %	25 %	442806025
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47050	NC_020134	GCA	2	6	2808302	2808307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442806026
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47099	NC_020134	ATGCC	2	10	2811393	2811402	20 %	20 %	20 %	40 %	442806034
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47102	NC_020134	AT	3	6	2811605	2811610	50 %	50 %	0 %	0 %	442806034
47103	NC_020134	CTT	2	6	2811640	2811645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806034
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47105	NC_020134	AAG	2	6	2811751	2811756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442806034
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47110	NC_020134	CAA	2	6	2811938	2811943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442806035
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47115	NC_020134	T	6	6	2812042	2812047	0 %	100 %	0 %	0 %	442806035
47116	NC_020134	TTC	2	6	2812079	2812084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806035
47117	NC_020134	TCG	3	9	2812089	2812097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806035
47118	NC_020134	CGC	2	6	2812114	2812119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442806035
47119	NC_020134	GGA	2	6	2812146	2812151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442806035
47120	NC_020134	ACA	2	6	2812158	2812163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442806035
47121	NC_020134	TCT	2	6	2812181	2812186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806035
47122	NC_020134	CTGC	2	8	2812197	2812204	0 %	25 %	25 %	50 %	442806035
47123	NC_020134	GCT	2	6	2812291	2812296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806035
47124	NC_020134	TGC	2	6	2812342	2812347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806035
47125	NC_020134	TCG	2	6	2812392	2812397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806035
47126	NC_020134	TA	3	6	2812418	2812423	50 %	50 %	0 %	0 %	442806035
47127	NC_020134	CTTT	2	8	2812432	2812439	0 %	75 %	0 %	25 %	442806035
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47130	NC_020134	TCC	2	6	2812902	2812907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442806036
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47147	NC_020134	CAAA	2	8	2813765	2813772	75 %	0 %	0 %	25 %	442806036
47148	NC_020134	TGC	2	6	2813802	2813807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806036
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47154	NC_020134	TCT	2	6	2813979	2813984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806037
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47156	NC_020134	T	7	7	2814068	2814074	0 %	100 %	0 %	0 %	442806037
47157	NC_020134	TTTC	2	8	2814087	2814094	0 %	75 %	0 %	25 %	442806037
47158	NC_020134	T	6	6	2814166	2814171	0 %	100 %	0 %	0 %	442806037
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47166	NC_020134	TCTT	2	8	2814523	2814530	0 %	75 %	0 %	25 %	442806038
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47171	NC_020134	TTG	2	6	2814693	2814698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442806039
47172	NC_020134	TTCC	2	8	2814781	2814788	0 %	50 %	0 %	50 %	442806039
47173	NC_020134	TTG	2	6	2814847	2814852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442806039
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47180	NC_020134	CTTT	2	8	2815199	2815206	0 %	75 %	0 %	25 %	442806040
47181	NC_020134	AATT	2	8	2815233	2815240	50 %	50 %	0 %	0 %	442806040
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47184	NC_020134	AC	3	6	2815384	2815389	50 %	0 %	0 %	50 %	442806040
47185	NC_020134	T	7	7	2815418	2815424	0 %	100 %	0 %	0 %	442806040
47186	NC_020134	TCT	2	6	2815442	2815447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806040
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47189	NC_020134	TGC	2	6	2815594	2815599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806041
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47193	NC_020134	TGTCA	2	10	2815919	2815928	20 %	40 %	20 %	20 %	442806041
47194	NC_020134	TGAG	2	8	2815941	2815948	25 %	25 %	50 %	0 %	442806041
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47200	NC_020134	TCCT	2	8	2816427	2816434	0 %	50 %	0 %	50 %	442806042
47201	NC_020134	CATT	2	8	2816552	2816559	25 %	50 %	0 %	25 %	442806042
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47217	NC_020134	T	7	7	2817669	2817675	0 %	100 %	0 %	0 %	442806045
47218	NC_020134	CT	3	6	2817710	2817715	0 %	50 %	0 %	50 %	442806045
47219	NC_020134	CCTGTT	2	12	2817734	2817745	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	442806045
47220	NC_020134	TA	3	6	2817794	2817799	50 %	50 %	0 %	0 %	442806046
47221	NC_020134	AAT	2	6	2817817	2817822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442806046
47222	NC_020134	AT	3	6	2817932	2817937	50 %	50 %	0 %	0 %	442806046
47223	NC_020134	AAC	2	6	2817988	2817993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442806046
47224	NC_020134	CTTT	2	8	2817999	2818006	0 %	75 %	0 %	25 %	442806046
47225	NC_020134	ACA	2	6	2818007	2818012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442806046
47226	NC_020134	CCG	2	6	2818013	2818018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442806046
47227	NC_020134	AACA	2	8	2818038	2818045	75 %	0 %	0 %	25 %	442806046
47228	NC_020134	TAT	2	6	2818122	2818127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442806046
47229	NC_020134	ATT	2	6	2818271	2818276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442806047
47230	NC_020134	T	6	6	2818293	2818298	0 %	100 %	0 %	0 %	442806047
47231	NC_020134	ATT	2	6	2818354	2818359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442806047
47232	NC_020134	TCA	2	6	2818361	2818366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442806047
47233	NC_020134	CAA	3	9	2818437	2818445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442806047
47234	NC_020134	TTG	2	6	2818635	2818640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442806048
47235	NC_020134	CTG	2	6	2818690	2818695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806048
47236	NC_020134	T	6	6	2818710	2818715	0 %	100 %	0 %	0 %	442806048
47237	NC_020134	ACCT	2	8	2818745	2818752	25 %	25 %	0 %	50 %	442806049
47238	NC_020134	CTA	2	6	2818762	2818767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442806049
47239	NC_020134	CTT	3	9	2818819	2818827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806049
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47241	NC_020134	CTT	2	6	2818980	2818985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806049
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47247	NC_020134	AACT	2	8	2819473	2819480	50 %	25 %	0 %	25 %	442806050
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47266	NC_020134	ATTT	2	8	2820413	2820420	25 %	75 %	0 %	0 %	442806052
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47268	NC_020134	T	6	6	2820432	2820437	0 %	100 %	0 %	0 %	442806052
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47275	NC_020134	CAG	2	6	2820649	2820654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442806052
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47312	NC_020134	TA	3	6	2822602	2822607	50 %	50 %	0 %	0 %	442806055
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47324	NC_020134	TC	3	6	2823545	2823550	0 %	50 %	0 %	50 %	442806057
47325	NC_020134	T	6	6	2823612	2823617	0 %	100 %	0 %	0 %	442806057
47326	NC_020134	TGA	2	6	2823638	2823643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442806057
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47339	NC_020134	CG	3	6	2824900	2824905	0 %	0 %	50 %	50 %	442806059
47340	NC_020134	TGG	2	6	2825116	2825121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442806059
47341	NC_020134	ATC	2	6	2825122	2825127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442806059
47342	NC_020134	TCT	2	6	2825295	2825300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806060
47343	NC_020134	CGG	2	6	2825330	2825335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442806060
47344	NC_020134	T	6	6	2825343	2825348	0 %	100 %	0 %	0 %	442806060
47345	NC_020134	TCG	2	6	2825427	2825432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806060
47346	NC_020134	AAT	2	6	2825594	2825599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442806060
47347	NC_020134	T	6	6	2825606	2825611	0 %	100 %	0 %	0 %	442806060
47348	NC_020134	TC	3	6	2825629	2825634	0 %	50 %	0 %	50 %	442806060
47349	NC_020134	TCCAT	2	10	2825688	2825697	20 %	40 %	0 %	40 %	442806060
47350	NC_020134	T	6	6	2825803	2825808	0 %	100 %	0 %	0 %	442806061
47351	NC_020134	CGGGC	2	10	2825869	2825878	0 %	0 %	60 %	40 %	442806061
47352	NC_020134	A	6	6	2825908	2825913	100 %	0 %	0 %	0 %	442806061
47353	NC_020134	ATC	2	6	2825969	2825974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442806061
47354	NC_020134	TCC	2	6	2826010	2826015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442806061
47355	NC_020134	TAA	2	6	2826070	2826075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442806061
47356	NC_020134	AT	3	6	2826120	2826125	50 %	50 %	0 %	0 %	442806061
47357	NC_020134	CGC	2	6	2826133	2826138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442806061
47358	NC_020134	GCCGA	2	10	2826195	2826204	20 %	0 %	40 %	40 %	442806061
47359	NC_020134	ATA	2	6	2826242	2826247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442806061
47360	NC_020134	TTTC	2	8	2826261	2826268	0 %	75 %	0 %	25 %	442806061
47361	NC_020134	T	6	6	2826297	2826302	0 %	100 %	0 %	0 %	442806061
47362	NC_020134	ATA	2	6	2826303	2826308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442806061
47363	NC_020134	AG	3	6	2826334	2826339	50 %	0 %	50 %	0 %	442806061
47364	NC_020134	A	6	6	2826354	2826359	100 %	0 %	0 %	0 %	442806061
47365	NC_020134	GC	3	6	2826458	2826463	0 %	0 %	50 %	50 %	442806061
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47368	NC_020134	GTC	2	6	2826548	2826553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442806061
47369	NC_020134	GTAA	2	8	2826554	2826561	50 %	25 %	25 %	0 %	442806061
47370	NC_020134	CGC	2	6	2826664	2826669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442806061
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47372	NC_020134	CGA	2	6	2826739	2826744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442806061
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47378	NC_020134	GTT	2	6	2827144	2827149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442806062
47379	NC_020134	TA	3	6	2827177	2827182	50 %	50 %	0 %	0 %	442806062
47380	NC_020134	CGC	2	6	2827198	2827203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442806062
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47390	NC_020134	GTA	2	6	2828103	2828108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442806063
47391	NC_020134	TTG	2	6	2828197	2828202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442806063
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47393	NC_020134	GAT	2	6	2828248	2828253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442806063
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47422	NC_020134	TTGT	2	8	2830178	2830185	0 %	75 %	25 %	0 %	442806065
47423	NC_020134	GCAA	2	8	2830304	2830311	50 %	0 %	25 %	25 %	442806065
47424	NC_020134	ATC	2	6	2830322	2830327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442806065
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47430	NC_020134	GAA	2	6	2830477	2830482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442806065
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47433	NC_020134	CAGGA	2	10	2830619	2830628	40 %	0 %	40 %	20 %	442806065
47434	NC_020134	T	6	6	2830669	2830674	0 %	100 %	0 %	0 %	442806065
47435	NC_020134	TCA	2	6	2830689	2830694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442806065
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47442	NC_020134	GGTT	2	8	2830999	2831006	0 %	50 %	50 %	0 %	442806065
47443	NC_020134	CAT	2	6	2831038	2831043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442806065
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47445	NC_020134	ACACC	2	10	2831125	2831134	40 %	0 %	0 %	60 %	442806065
47446	NC_020134	TCGG	2	8	2831285	2831292	0 %	25 %	50 %	25 %	442806066
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47455	NC_020134	TGT	2	6	2831682	2831687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442806066
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47457	NC_020134	TA	3	6	2831761	2831766	50 %	50 %	0 %	0 %	442806066
47458	NC_020134	TAA	2	6	2831769	2831774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442806066
47459	NC_020134	T	6	6	2831834	2831839	0 %	100 %	0 %	0 %	442806066
47460	NC_020134	TCA	2	6	2831856	2831861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442806066
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47462	NC_020134	A	6	6	2831964	2831969	100 %	0 %	0 %	0 %	442806066
47463	NC_020134	TC	3	6	2831998	2832003	0 %	50 %	0 %	50 %	442806066
47464	NC_020134	AAG	2	6	2832103	2832108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442806066
47465	NC_020134	TTA	2	6	2832135	2832140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442806066
47466	NC_020134	CTTTTC	2	12	2832151	2832162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442806066
47467	NC_020134	TCC	2	6	2832166	2832171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442806066
47468	NC_020134	ACAGAT	2	12	2832267	2832278	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442806066
47469	NC_020134	T	7	7	2832278	2832284	0 %	100 %	0 %	0 %	442806066
47470	NC_020134	T	6	6	2832298	2832303	0 %	100 %	0 %	0 %	442806066
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