MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42010	NC_020134	CCG	2	6	2506277	2506282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805735
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42117	NC_020134	GCC	2	6	2512371	2512376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805740
42118	NC_020134	TCC	2	6	2512409	2512414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805740
42119	NC_020134	AGA	2	6	2512472	2512477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805740
42120	NC_020134	CTT	2	6	2512541	2512546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805741
42121	NC_020134	TCC	2	6	2512685	2512690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805741
42122	NC_020134	ATC	2	6	2512795	2512800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805741
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42124	NC_020134	ATTAT	2	10	2512862	2512871	40 %	60 %	0 %	0 %	442805741
42125	NC_020134	TTTG	2	8	2512873	2512880	0 %	75 %	25 %	0 %	442805741
42126	NC_020134	CCG	2	6	2512902	2512907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805741
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42130	NC_020134	GC	3	6	2513007	2513012	0 %	0 %	50 %	50 %	442805741
42131	NC_020134	ATT	2	6	2513075	2513080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805741
42132	NC_020134	AAT	2	6	2513096	2513101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805741
42133	NC_020134	TTTA	2	8	2513119	2513126	25 %	75 %	0 %	0 %	442805741
42134	NC_020134	TCA	2	6	2513135	2513140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805741
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42150	NC_020134	GTCT	2	8	2513711	2513718	0 %	50 %	25 %	25 %	442805742
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42154	NC_020134	TCA	2	6	2513778	2513783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805742
42155	NC_020134	TCCCT	2	10	2513790	2513799	0 %	40 %	0 %	60 %	442805742
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42201	NC_020134	TC	3	6	2516983	2516988	0 %	50 %	0 %	50 %	442805747
42202	NC_020134	CCT	2	6	2517027	2517032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805747
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42220	NC_020134	TA	4	8	2518116	2518123	50 %	50 %	0 %	0 %	442805749
42221	NC_020134	CCCTG	2	10	2518140	2518149	0 %	20 %	20 %	60 %	442805749
42222	NC_020134	ATA	2	6	2518150	2518155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805749
42223	NC_020134	T	7	7	2518222	2518228	0 %	100 %	0 %	0 %	442805749
42224	NC_020134	TGA	2	6	2518260	2518265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805749
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42226	NC_020134	T	7	7	2518344	2518350	0 %	100 %	0 %	0 %	442805749
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42228	NC_020134	TTCAAT	2	12	2518360	2518371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	442805749
42229	NC_020134	AATATT	2	12	2518378	2518389	50 %	50 %	0 %	0 %	442805749
42230	NC_020134	TTTA	2	8	2518625	2518632	25 %	75 %	0 %	0 %	442805750
42231	NC_020134	TC	3	6	2518718	2518723	0 %	50 %	0 %	50 %	442805750
42232	NC_020134	ATT	2	6	2519099	2519104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805751
42233	NC_020134	GAA	2	6	2519132	2519137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805751
42234	NC_020134	A	7	7	2519234	2519240	100 %	0 %	0 %	0 %	442805751
42235	NC_020134	GAA	2	6	2519246	2519251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805751
42236	NC_020134	TGC	2	6	2519271	2519276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805751
42237	NC_020134	ATG	2	6	2519364	2519369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805751
42238	NC_020134	GGTATC	2	12	2519392	2519403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	442805751
42239	NC_020134	A	6	6	2519429	2519434	100 %	0 %	0 %	0 %	442805751
42240	NC_020134	TGT	2	6	2519509	2519514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805751
42241	NC_020134	CGG	2	6	2519521	2519526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805751
42242	NC_020134	TCCG	2	8	2519578	2519585	0 %	25 %	25 %	50 %	442805751
42243	NC_020134	CAG	2	6	2519591	2519596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805751
42244	NC_020134	TGC	2	6	2519644	2519649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805751
42245	NC_020134	GAT	2	6	2519669	2519674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805751
42246	NC_020134	CGA	2	6	2519767	2519772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805751
42247	NC_020134	CTT	2	6	2519777	2519782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805751
42248	NC_020134	CGGA	2	8	2519787	2519794	25 %	0 %	50 %	25 %	442805751
42249	NC_020134	GAA	2	6	2519837	2519842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805751
42250	NC_020134	TTA	2	6	2519898	2519903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805751
42251	NC_020134	GAT	2	6	2519926	2519931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805751
42252	NC_020134	ACCC	2	8	2519944	2519951	25 %	0 %	0 %	75 %	442805751
42253	NC_020134	ACT	2	6	2520096	2520101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805751
42254	NC_020134	GCA	2	6	2520121	2520126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805751
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42257	NC_020134	ATT	2	6	2520269	2520274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805751
42258	NC_020134	GTTCC	2	10	2520329	2520338	0 %	40 %	20 %	40 %	442805751
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42262	NC_020134	AAATG	2	10	2520628	2520637	60 %	20 %	20 %	0 %	442805751
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42272	NC_020134	A	6	6	2521162	2521167	100 %	0 %	0 %	0 %	442805752
42273	NC_020134	TAC	2	6	2521203	2521208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805752
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42280	NC_020134	AT	3	6	2521863	2521868	50 %	50 %	0 %	0 %	442805752
42281	NC_020134	T	6	6	2521995	2522000	0 %	100 %	0 %	0 %	442805753
42282	NC_020134	ATC	2	6	2522033	2522038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805753
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42300	NC_020134	ACC	2	6	2523126	2523131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805753
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42303	NC_020134	CTT	2	6	2523175	2523180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805753
42304	NC_020134	TCG	2	6	2523201	2523206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805753
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42323	NC_020134	ATC	2	6	2525036	2525041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805755
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42328	NC_020134	CTG	2	6	2525274	2525279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805755
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42337	NC_020134	GTC	2	6	2526039	2526044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805755
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42340	NC_020134	CTA	2	6	2526139	2526144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805755
42341	NC_020134	T	6	6	2526266	2526271	0 %	100 %	0 %	0 %	442805755
42342	NC_020134	CGGTT	2	10	2526356	2526365	0 %	40 %	40 %	20 %	442805755
42343	NC_020134	GCG	2	6	2526390	2526395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805755
42344	NC_020134	GTAT	2	8	2526398	2526405	25 %	50 %	25 %	0 %	442805755
42345	NC_020134	ATC	2	6	2526455	2526460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805755
42346	NC_020134	TGTA	2	8	2526466	2526473	25 %	50 %	25 %	0 %	442805755
42347	NC_020134	TAA	2	6	2526508	2526513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805755
42348	NC_020134	ATA	2	6	2526520	2526525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805755
42349	NC_020134	A	7	7	2526527	2526533	100 %	0 %	0 %	0 %	442805755
42350	NC_020134	TAT	2	6	2527457	2527462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805756
42351	NC_020134	GCCCT	2	10	2527530	2527539	0 %	20 %	20 %	60 %	442805756
42352	NC_020134	GGA	2	6	2527552	2527557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805756
42353	NC_020134	TGT	2	6	2527575	2527580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805756
42354	NC_020134	ATCT	2	8	2527592	2527599	25 %	50 %	0 %	25 %	442805756
42355	NC_020134	CTT	2	6	2527760	2527765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805756
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42357	NC_020134	TCT	2	6	2527796	2527801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805756
42358	NC_020134	CT	3	6	2527800	2527805	0 %	50 %	0 %	50 %	442805756
42359	NC_020134	CCTT	2	8	2527828	2527835	0 %	50 %	0 %	50 %	442805756
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42454	NC_020134	ATGT	2	8	2533502	2533509	25 %	50 %	25 %	0 %	442805761
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42460	NC_020134	CT	3	6	2533704	2533709	0 %	50 %	0 %	50 %	442805761
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42464	NC_020134	AAGTA	2	10	2533774	2533783	60 %	20 %	20 %	0 %	442805761
42465	NC_020134	TGCT	2	8	2533821	2533828	0 %	50 %	25 %	25 %	442805761
42466	NC_020134	TTC	2	6	2533950	2533955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805761
42467	NC_020134	TTTA	2	8	2533993	2534000	25 %	75 %	0 %	0 %	442805761
42468	NC_020134	ATC	2	6	2534094	2534099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805762
42469	NC_020134	TCA	2	6	2534125	2534130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805762
42470	NC_020134	AT	3	6	2534248	2534253	50 %	50 %	0 %	0 %	442805762
42471	NC_020134	T	6	6	2534255	2534260	0 %	100 %	0 %	0 %	442805762
42472	NC_020134	TTC	2	6	2534301	2534306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805762
42473	NC_020134	A	7	7	2534791	2534797	100 %	0 %	0 %	0 %	442805763
42474	NC_020134	AGA	2	6	2534803	2534808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805763
42475	NC_020134	A	6	6	2534863	2534868	100 %	0 %	0 %	0 %	442805763
42476	NC_020134	CTT	2	6	2534890	2534895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805763
42477	NC_020134	TGC	2	6	2534921	2534926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805763
42478	NC_020134	T	6	6	2534948	2534953	0 %	100 %	0 %	0 %	442805763
42479	NC_020134	A	6	6	2535008	2535013	100 %	0 %	0 %	0 %	442805763
42480	NC_020134	A	6	6	2535016	2535021	100 %	0 %	0 %	0 %	442805763
42481	NC_020134	ATA	2	6	2535178	2535183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805763
42482	NC_020134	T	6	6	2535251	2535256	0 %	100 %	0 %	0 %	442805763
42483	NC_020134	AAT	2	6	2535300	2535305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805763
42484	NC_020134	ATA	2	6	2535451	2535456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805763
42485	NC_020134	TA	3	6	2535463	2535468	50 %	50 %	0 %	0 %	442805763
42486	NC_020134	TAT	2	6	2535539	2535544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805764
42487	NC_020134	TAT	2	6	2535617	2535622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805764
42488	NC_020134	A	7	7	2535988	2535994	100 %	0 %	0 %	0 %	442805765
42489	NC_020134	TA	3	6	2536111	2536116	50 %	50 %	0 %	0 %	442805765
42490	NC_020134	TA	3	6	2536133	2536138	50 %	50 %	0 %	0 %	442805765
42491	NC_020134	TTTC	2	8	2536203	2536210	0 %	75 %	0 %	25 %	442805766
42492	NC_020134	ATG	2	6	2536225	2536230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805766
42493	NC_020134	AAGT	2	8	2536257	2536264	50 %	25 %	25 %	0 %	442805766
42494	NC_020134	AAG	2	6	2536354	2536359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805766
42495	NC_020134	GCT	2	6	2536363	2536368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805766
42496	NC_020134	CAC	2	6	2536372	2536377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805766
42497	NC_020134	GAATAA	2	12	2536386	2536397	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442805766
42498	NC_020134	ATC	2	6	2536399	2536404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805766
42499	NC_020134	T	6	6	2536414	2536419	0 %	100 %	0 %	0 %	442805766
42500	NC_020134	GGC	2	6	2536490	2536495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805766

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