MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_020134	TTC	2	6	2389514	2389519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805623
40003	NC_020134	TAT	2	6	2389558	2389563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805623
40004	NC_020134	TTCC	2	8	2389568	2389575	0 %	50 %	0 %	50 %	442805623
40005	NC_020134	TCT	2	6	2389606	2389611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805623
40006	NC_020134	TA	3	6	2389712	2389717	50 %	50 %	0 %	0 %	442805623
40007	NC_020134	TTTC	2	8	2389745	2389752	0 %	75 %	0 %	25 %	442805624
40008	NC_020134	A	6	6	2389798	2389803	100 %	0 %	0 %	0 %	442805624
40009	NC_020134	GGGC	2	8	2389812	2389819	0 %	0 %	75 %	25 %	442805624
40010	NC_020134	CGC	2	6	2389876	2389881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805624
40011	NC_020134	CCG	2	6	2390049	2390054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805624
40012	NC_020134	GCT	2	6	2390072	2390077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805624
40013	NC_020134	TAT	2	6	2390107	2390112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805624
40014	NC_020134	AAGAA	2	10	2390158	2390167	80 %	0 %	20 %	0 %	442805624
40015	NC_020134	GGC	2	6	2390204	2390209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805625
40016	NC_020134	CTT	2	6	2390245	2390250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805625
40017	NC_020134	GCT	2	6	2390263	2390268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805625
40018	NC_020134	GCC	2	6	2390280	2390285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805625
40019	NC_020134	CTT	2	6	2390451	2390456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805625
40020	NC_020134	CGG	2	6	2390650	2390655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805625
40021	NC_020134	ATA	2	6	2390738	2390743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805625
40022	NC_020134	TAA	2	6	2390982	2390987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805625
40023	NC_020134	TAC	2	6	2390989	2390994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805625
40024	NC_020134	TA	3	6	2391040	2391045	50 %	50 %	0 %	0 %	442805626
40025	NC_020134	T	6	6	2391077	2391082	0 %	100 %	0 %	0 %	442805626
40026	NC_020134	CAG	2	6	2391303	2391308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805627
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40028	NC_020134	A	6	6	2391337	2391342	100 %	0 %	0 %	0 %	442805627
40029	NC_020134	A	6	6	2391397	2391402	100 %	0 %	0 %	0 %	442805627
40030	NC_020134	CAA	2	6	2391451	2391456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805627
40031	NC_020134	GTT	2	6	2391467	2391472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805627
40032	NC_020134	ATGC	2	8	2391492	2391499	25 %	25 %	25 %	25 %	442805627
40033	NC_020134	ACG	2	6	2391678	2391683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805627
40034	NC_020134	ACC	2	6	2391701	2391706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805627
40035	NC_020134	ATCC	2	8	2391794	2391801	25 %	25 %	0 %	50 %	442805627
40036	NC_020134	CAA	2	6	2391810	2391815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805627
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40039	NC_020134	TAAA	2	8	2391885	2391892	75 %	25 %	0 %	0 %	442805627
40040	NC_020134	GAA	2	6	2391974	2391979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805627
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40042	NC_020134	TGT	2	6	2392041	2392046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805627
40043	NC_020134	CAA	2	6	2392077	2392082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805627
40044	NC_020134	GAA	2	6	2392203	2392208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805627
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40051	NC_020134	TA	3	6	2392813	2392818	50 %	50 %	0 %	0 %	442805628
40052	NC_020134	TGA	2	6	2392826	2392831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805628
40053	NC_020134	AAT	2	6	2392914	2392919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805628
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40055	NC_020134	TGA	2	6	2393078	2393083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805628
40056	NC_020134	TC	3	6	2393108	2393113	0 %	50 %	0 %	50 %	442805628
40057	NC_020134	CGA	2	6	2393115	2393120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805628
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40059	NC_020134	TCA	2	6	2393141	2393146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805628
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40061	NC_020134	CTG	2	6	2393335	2393340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805629
40062	NC_020134	TG	3	6	2393339	2393344	0 %	50 %	50 %	0 %	442805629
40063	NC_020134	GTTTTT	2	12	2393347	2393358	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	442805629
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40065	NC_020134	AGCC	2	8	2393479	2393486	25 %	0 %	25 %	50 %	442805629
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40067	NC_020134	TGGT	2	8	2393660	2393667	0 %	50 %	50 %	0 %	442805629
40068	NC_020134	T	7	7	2393667	2393673	0 %	100 %	0 %	0 %	442805629
40069	NC_020134	GAG	2	6	2393701	2393706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805629
40070	NC_020134	A	7	7	2393721	2393727	100 %	0 %	0 %	0 %	442805629
40071	NC_020134	TGA	2	6	2394031	2394036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805630
40072	NC_020134	TGGCCA	2	12	2394039	2394050	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442805630
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40079	NC_020134	CGT	2	6	2394309	2394314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805630
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40086	NC_020134	TTG	2	6	2394884	2394889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805630
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40090	NC_020134	ATTT	2	8	2395063	2395070	25 %	75 %	0 %	0 %	442805630
40091	NC_020134	TTTTC	2	10	2395129	2395138	0 %	80 %	0 %	20 %	442805630
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40095	NC_020134	AT	3	6	2395260	2395265	50 %	50 %	0 %	0 %	442805630
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40100	NC_020134	TA	3	6	2395528	2395533	50 %	50 %	0 %	0 %	442805630
40101	NC_020134	CAA	2	6	2395543	2395548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805630
40102	NC_020134	TGC	2	6	2395564	2395569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805630
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40105	NC_020134	ATT	2	6	2395914	2395919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805631
40106	NC_020134	CG	3	6	2395996	2396001	0 %	0 %	50 %	50 %	442805631
40107	NC_020134	TCA	2	6	2396058	2396063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805631
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40109	NC_020134	GCA	2	6	2396272	2396277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805631
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40112	NC_020134	AGTTG	2	10	2396438	2396447	20 %	40 %	40 %	0 %	442805631
40113	NC_020134	GCG	2	6	2396463	2396468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805631
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40118	NC_020134	GC	3	6	2396736	2396741	0 %	0 %	50 %	50 %	442805632
40119	NC_020134	GTACC	2	10	2396858	2396867	20 %	20 %	20 %	40 %	442805632
40120	NC_020134	ATTCT	2	10	2396967	2396976	20 %	60 %	0 %	20 %	442805632
40121	NC_020134	CAT	2	6	2397076	2397081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805632
40122	NC_020134	CAC	2	6	2397136	2397141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805632
40123	NC_020134	TTC	2	6	2397223	2397228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805632
40124	NC_020134	TCT	2	6	2397313	2397318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805632
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40126	NC_020134	A	6	6	2397569	2397574	100 %	0 %	0 %	0 %	442805632
40127	NC_020134	AAC	2	6	2397602	2397607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805632
40128	NC_020134	TC	3	6	2397709	2397714	0 %	50 %	0 %	50 %	442805632
40129	NC_020134	CGT	2	6	2397717	2397722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805632
40130	NC_020134	ATG	2	6	2397724	2397729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805632
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40132	NC_020134	ATT	2	6	2397763	2397768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805632
40133	NC_020134	AAC	2	6	2397898	2397903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805632
40134	NC_020134	ATCCCC	2	12	2397914	2397925	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	442805632
40135	NC_020134	ATTA	2	8	2398119	2398126	50 %	50 %	0 %	0 %	442805633
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40143	NC_020134	TCG	2	6	2398528	2398533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805633
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40153	NC_020134	CAG	2	6	2399123	2399128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805633
40154	NC_020134	CT	3	6	2399182	2399187	0 %	50 %	0 %	50 %	442805633
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40172	NC_020134	TTCC	2	8	2400055	2400062	0 %	50 %	0 %	50 %	442805633
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40183	NC_020134	TTAT	2	8	2402923	2402930	25 %	75 %	0 %	0 %	442805635
40184	NC_020134	GTT	2	6	2402939	2402944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805635
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40187	NC_020134	AT	3	6	2403225	2403230	50 %	50 %	0 %	0 %	442805635
40188	NC_020134	ACAG	2	8	2403279	2403286	50 %	0 %	25 %	25 %	442805635
40189	NC_020134	TAGG	2	8	2403333	2403340	25 %	25 %	50 %	0 %	442805635
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40219	NC_020134	CAT	2	6	2405204	2405209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805636
40220	NC_020134	CACAT	2	10	2405220	2405229	40 %	20 %	0 %	40 %	442805636
40221	NC_020134	ACC	2	6	2405398	2405403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805637
40222	NC_020134	CCG	2	6	2405420	2405425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805637
40223	NC_020134	GAA	2	6	2405473	2405478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805637
40224	NC_020134	TA	3	6	2405510	2405515	50 %	50 %	0 %	0 %	442805637
40225	NC_020134	ATT	2	6	2405521	2405526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805637
40226	NC_020134	T	6	6	2405525	2405530	0 %	100 %	0 %	0 %	442805637
40227	NC_020134	CTG	2	6	2405619	2405624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805637
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40230	NC_020134	TGC	2	6	2405685	2405690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805637
40231	NC_020134	AAT	2	6	2405844	2405849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805637
40232	NC_020134	ACA	2	6	2405860	2405865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805637
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40342	NC_020134	AAACC	2	10	2412103	2412112	60 %	0 %	0 %	40 %	442805642
40343	NC_020134	TGA	2	6	2412186	2412191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805642
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40345	NC_020134	CCTC	2	8	2412203	2412210	0 %	25 %	0 %	75 %	442805642
40346	NC_020134	AGC	2	6	2412216	2412221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805642
40347	NC_020134	A	7	7	2412250	2412256	100 %	0 %	0 %	0 %	442805642
40348	NC_020134	GCA	2	6	2412279	2412284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805642
40349	NC_020134	TTGCA	2	10	2412294	2412303	20 %	40 %	20 %	20 %	442805642
40350	NC_020134	TTC	2	6	2412329	2412334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805642
40351	NC_020134	GATG	2	8	2412336	2412343	25 %	25 %	50 %	0 %	442805642
40352	NC_020134	TTG	2	6	2412422	2412427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805642
40353	NC_020134	ATA	2	6	2412437	2412442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805642
40354	NC_020134	GCA	2	6	2412444	2412449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805642
40355	NC_020134	CAGA	2	8	2412464	2412471	50 %	0 %	25 %	25 %	442805642
40356	NC_020134	T	6	6	2412478	2412483	0 %	100 %	0 %	0 %	442805642
40357	NC_020134	GAG	2	6	2412584	2412589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805643
40358	NC_020134	CGA	2	6	2412596	2412601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805643
40359	NC_020134	TG	3	6	2412646	2412651	0 %	50 %	50 %	0 %	442805643
40360	NC_020134	AAG	2	6	2412652	2412657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805643
40361	NC_020134	GCT	2	6	2412776	2412781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805643
40362	NC_020134	CAG	3	9	2412786	2412794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805643
40363	NC_020134	GCC	2	6	2412825	2412830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805643
40364	NC_020134	GGC	2	6	2412869	2412874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805643
40365	NC_020134	ATT	2	6	2412894	2412899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805643
40366	NC_020134	TA	4	8	2412928	2412935	50 %	50 %	0 %	0 %	442805643
40367	NC_020134	GAC	2	6	2413032	2413037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805643
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40370	NC_020134	CAGG	2	8	2413204	2413211	25 %	0 %	50 %	25 %	442805643
40371	NC_020134	GAG	2	6	2413216	2413221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805643
40372	NC_020134	GAT	2	6	2413250	2413255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805644
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40376	NC_020134	CTG	2	6	2413373	2413378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805644
40377	NC_020134	CGA	2	6	2413519	2413524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805644
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40380	NC_020134	GCT	2	6	2413705	2413710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805644
40381	NC_020134	GATTT	2	10	2413776	2413785	20 %	60 %	20 %	0 %	442805644
40382	NC_020134	A	7	7	2413831	2413837	100 %	0 %	0 %	0 %	442805644
40383	NC_020134	ATGA	2	8	2413897	2413904	50 %	25 %	25 %	0 %	442805644
40384	NC_020134	A	7	7	2413907	2413913	100 %	0 %	0 %	0 %	442805645
40385	NC_020134	GCC	2	6	2413943	2413948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805645
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40388	NC_020134	TCA	2	6	2414045	2414050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805645
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40392	NC_020134	TAT	3	9	2414270	2414278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805645
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40442	NC_020134	T	6	6	2416694	2416699	0 %	100 %	0 %	0 %	442805646
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40446	NC_020134	T	6	6	2416810	2416815	0 %	100 %	0 %	0 %	442805647
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40448	NC_020134	ATTGT	2	10	2416828	2416837	20 %	60 %	20 %	0 %	442805647
40449	NC_020134	GCA	2	6	2416841	2416846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805647
40450	NC_020134	CAT	2	6	2416916	2416921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805647
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40453	NC_020134	A	6	6	2417378	2417383	100 %	0 %	0 %	0 %	442805648
40454	NC_020134	TCC	2	6	2417435	2417440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805648
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40456	NC_020134	A	7	7	2417475	2417481	100 %	0 %	0 %	0 %	442805648
40457	NC_020134	AGG	2	6	2417512	2417517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805648
40458	NC_020134	TCA	2	6	2417520	2417525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805648
40459	NC_020134	GGA	2	6	2417599	2417604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805648
40460	NC_020134	ATTG	2	8	2417665	2417672	25 %	50 %	25 %	0 %	442805648
40461	NC_020134	GGCA	2	8	2417737	2417744	25 %	0 %	50 %	25 %	442805648
40462	NC_020134	CAA	2	6	2417752	2417757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805648
40463	NC_020134	AAG	2	6	2417782	2417787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805648
40464	NC_020134	A	6	6	2417826	2417831	100 %	0 %	0 %	0 %	442805648
40465	NC_020134	ATC	2	6	2417886	2417891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805648
40466	NC_020134	CATG	2	8	2417951	2417958	25 %	25 %	25 %	25 %	442805648
40467	NC_020134	CTG	2	6	2418007	2418012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805649
40468	NC_020134	T	6	6	2418033	2418038	0 %	100 %	0 %	0 %	442805649
40469	NC_020134	CTT	2	6	2418080	2418085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805649
40470	NC_020134	CTT	2	6	2418107	2418112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805649
40471	NC_020134	CCG	2	6	2418121	2418126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805649
40472	NC_020134	AGA	2	6	2418148	2418153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805649
40473	NC_020134	AAC	2	6	2418204	2418209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805649
40474	NC_020134	ATT	2	6	2418250	2418255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805649
40475	NC_020134	TGG	2	6	2418262	2418267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442805649
40476	NC_020134	AGG	2	6	2418298	2418303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805649
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40479	NC_020134	TCT	2	6	2418439	2418444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805649
40480	NC_020134	CAT	2	6	2418486	2418491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805649
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40483	NC_020134	AAG	2	6	2418816	2418821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805650
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40488	NC_020134	CGA	2	6	2419010	2419015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805650
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40490	NC_020134	GCC	2	6	2419045	2419050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805650
40491	NC_020134	TTC	2	6	2419081	2419086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805650
40492	NC_020134	TCC	2	6	2419123	2419128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805650
40493	NC_020134	ACAGTA	2	12	2419160	2419171	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442805650
40494	NC_020134	GGTG	2	8	2419350	2419357	0 %	25 %	75 %	0 %	442805650
40495	NC_020134	TAT	2	6	2419382	2419387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805650
40496	NC_020134	AAC	2	6	2419389	2419394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805650
40497	NC_020134	A	6	6	2419450	2419455	100 %	0 %	0 %	0 %	442805650
40498	NC_020134	TTG	2	6	2419484	2419489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805650
40499	NC_020134	CGG	2	6	2419574	2419579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805650
40500	NC_020134	ATG	2	6	2419636	2419641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805650

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