MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020134	GCT	2	6	201079	201084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803674
3502	NC_020134	TGT	2	6	201117	201122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803674
3503	NC_020134	ATA	2	6	201149	201154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803674
3504	NC_020134	AGA	2	6	201214	201219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803674
3505	NC_020134	CGG	2	6	201247	201252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803674
3506	NC_020134	GGA	2	6	201287	201292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803674
3507	NC_020134	CTTACC	2	12	201299	201310	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	442803674
3508	NC_020134	TGG	2	6	201341	201346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803674
3509	NC_020134	GGA	2	6	201358	201363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803674
3510	NC_020134	ACCG	2	8	201371	201378	25 %	0 %	25 %	50 %	442803674
3511	NC_020134	CAG	2	6	201395	201400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803674
3512	NC_020134	AGA	2	6	201442	201447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803674
3513	NC_020134	A	6	6	201447	201452	100 %	0 %	0 %	0 %	442803674
3514	NC_020134	AGAAAA	2	12	201465	201476	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442803674
3515	NC_020134	A	6	6	201473	201478	100 %	0 %	0 %	0 %	442803674
3516	NC_020134	GCT	2	6	201514	201519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803674
3517	NC_020134	GAA	2	6	201536	201541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803674
3518	NC_020134	AATA	2	8	201692	201699	75 %	25 %	0 %	0 %	442803675
3519	NC_020134	TGA	2	6	201765	201770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803675
3520	NC_020134	A	7	7	201848	201854	100 %	0 %	0 %	0 %	442803675
3521	NC_020134	GAA	2	6	201860	201865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803675
3522	NC_020134	GGAAGC	2	12	201910	201921	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	442803675
3523	NC_020134	TGA	2	6	201957	201962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803675
3524	NC_020134	GAA	2	6	201985	201990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803675
3525	NC_020134	CGG	2	6	202009	202014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803675
3526	NC_020134	GAA	2	6	202025	202030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803675
3527	NC_020134	CGG	2	6	202044	202049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803675
3528	NC_020134	ATT	2	6	202103	202108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803675
3529	NC_020134	CAG	2	6	202177	202182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803675
3530	NC_020134	CACCGT	2	12	202258	202269	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	442803675
3531	NC_020134	GAT	2	6	202289	202294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803675
3532	NC_020134	CGG	2	6	202357	202362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803675
3533	NC_020134	TAA	2	6	202372	202377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803675
3534	NC_020134	TTG	2	6	202419	202424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803675
3535	NC_020134	GA	3	6	202439	202444	50 %	0 %	50 %	0 %	442803675
3536	NC_020134	AGGT	2	8	202551	202558	25 %	25 %	50 %	0 %	442803675
3537	NC_020134	ATC	2	6	202744	202749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803676
3538	NC_020134	T	7	7	202760	202766	0 %	100 %	0 %	0 %	442803676
3539	NC_020134	ACC	2	6	202821	202826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442803676
3540	NC_020134	T	6	6	202933	202938	0 %	100 %	0 %	0 %	442803677
3541	NC_020134	AGG	2	6	203009	203014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803677
3542	NC_020134	CCG	2	6	203030	203035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803677
3543	NC_020134	TTG	2	6	203106	203111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803677
3544	NC_020134	TTG	2	6	203310	203315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803677
3545	NC_020134	AAT	2	6	203320	203325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803677
3546	NC_020134	TAT	2	6	203329	203334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803677
3547	NC_020134	TTC	2	6	203383	203388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803677
3548	NC_020134	CAC	2	6	203466	203471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442803677
3549	NC_020134	TAA	2	6	203568	203573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803677
3550	NC_020134	ATC	2	6	203581	203586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803677
3551	NC_020134	A	6	6	203672	203677	100 %	0 %	0 %	0 %	442803677
3552	NC_020134	TA	3	6	203696	203701	50 %	50 %	0 %	0 %	442803677
3553	NC_020134	TTC	2	6	203711	203716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803677
3554	NC_020134	T	7	7	203730	203736	0 %	100 %	0 %	0 %	442803677
3555	NC_020134	TTCC	2	8	203884	203891	0 %	50 %	0 %	50 %	442803678
3556	NC_020134	CGA	2	6	203898	203903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803678
3557	NC_020134	T	7	7	203913	203919	0 %	100 %	0 %	0 %	442803678
3558	NC_020134	CAA	2	6	203952	203957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803678
3559	NC_020134	TTC	2	6	204031	204036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803678
3560	NC_020134	T	6	6	204057	204062	0 %	100 %	0 %	0 %	442803678
3561	NC_020134	TTC	2	6	204064	204069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803678
3562	NC_020134	TTC	2	6	204103	204108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803678
3563	NC_020134	TGT	2	6	204230	204235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803678
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3565	NC_020134	GAA	2	6	207344	207349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803679
3566	NC_020134	TGA	2	6	207381	207386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803679
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3568	NC_020134	A	7	7	207408	207414	100 %	0 %	0 %	0 %	442803679
3569	NC_020134	TAA	2	6	207474	207479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803679
3570	NC_020134	A	7	7	207478	207484	100 %	0 %	0 %	0 %	442803679
3571	NC_020134	GAAC	2	8	207576	207583	50 %	0 %	25 %	25 %	442803679
3572	NC_020134	AGAA	2	8	207606	207613	75 %	0 %	25 %	0 %	442803679
3573	NC_020134	GAA	2	6	207616	207621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803679
3574	NC_020134	GCT	2	6	207673	207678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803679
3575	NC_020134	AAT	2	6	207682	207687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803679
3576	NC_020134	ATT	2	6	207692	207697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803679
3577	NC_020134	ACA	2	6	207713	207718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803679
3578	NC_020134	GC	3	6	207797	207802	0 %	0 %	50 %	50 %	442803679
3579	NC_020134	ATTT	2	8	207915	207922	25 %	75 %	0 %	0 %	442803679
3580	NC_020134	GAA	2	6	207934	207939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803679
3581	NC_020134	GAT	2	6	207985	207990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803679
3582	NC_020134	GCAT	2	8	208006	208013	25 %	25 %	25 %	25 %	442803679
3583	NC_020134	GACG	2	8	208119	208126	25 %	0 %	50 %	25 %	442803679
3584	NC_020134	ATG	2	6	208219	208224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803679
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3586	NC_020134	ATA	2	6	208352	208357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803679
3587	NC_020134	TAT	2	6	208360	208365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803679
3588	NC_020134	AT	3	6	209427	209432	50 %	50 %	0 %	0 %	442803680
3589	NC_020134	TTC	2	6	209470	209475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803680
3590	NC_020134	TTG	2	6	209521	209526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803680
3591	NC_020134	TTC	2	6	209542	209547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803680
3592	NC_020134	CCTTT	2	10	209565	209574	0 %	60 %	0 %	40 %	442803680
3593	NC_020134	TAA	2	6	209589	209594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803680
3594	NC_020134	CT	3	6	209619	209624	0 %	50 %	0 %	50 %	442803680
3595	NC_020134	CTA	2	6	209690	209695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803680
3596	NC_020134	CTT	2	6	209931	209936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803680
3597	NC_020134	GTTT	2	8	209970	209977	0 %	75 %	25 %	0 %	442803680
3598	NC_020134	TTTTA	2	10	209989	209998	20 %	80 %	0 %	0 %	442803680
3599	NC_020134	TA	3	6	210058	210063	50 %	50 %	0 %	0 %	442803680
3600	NC_020134	TACA	2	8	210081	210088	50 %	25 %	0 %	25 %	442803680
3601	NC_020134	TAG	2	6	210090	210095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803680
3602	NC_020134	TC	3	6	210113	210118	0 %	50 %	0 %	50 %	442803680
3603	NC_020134	CAA	2	6	210129	210134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803680
3604	NC_020134	GTA	2	6	210159	210164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803680
3605	NC_020134	TCT	2	6	210170	210175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803680
3606	NC_020134	CTGC	2	8	210249	210256	0 %	25 %	25 %	50 %	442803680
3607	NC_020134	TTG	2	6	210309	210314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803680
3608	NC_020134	GCGA	2	8	210348	210355	25 %	0 %	50 %	25 %	442803680
3609	NC_020134	TTA	2	6	210362	210367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803680
3610	NC_020134	CTT	2	6	210390	210395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803680
3611	NC_020134	ATT	2	6	210552	210557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803681
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3613	NC_020134	CTT	2	6	210623	210628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803681
3614	NC_020134	TA	3	6	210631	210636	50 %	50 %	0 %	0 %	442803681
3615	NC_020134	A	6	6	211042	211047	100 %	0 %	0 %	0 %	442803682
3616	NC_020134	CGG	2	6	211103	211108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803682
3617	NC_020134	ATG	2	6	211122	211127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803682
3618	NC_020134	CATTC	2	10	211130	211139	20 %	40 %	0 %	40 %	442803682
3619	NC_020134	CA	3	6	211140	211145	50 %	0 %	0 %	50 %	442803682
3620	NC_020134	CAT	2	6	211148	211153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803682
3621	NC_020134	CAT	2	6	211199	211204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803682
3622	NC_020134	TGAA	2	8	211220	211227	50 %	25 %	25 %	0 %	442803682
3623	NC_020134	CAA	2	6	211267	211272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803682
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3651	NC_020134	AT	4	8	212625	212632	50 %	50 %	0 %	0 %	442803683
3652	NC_020134	CAG	2	6	212654	212659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803683
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3656	NC_020134	TGTT	2	8	212888	212895	0 %	75 %	25 %	0 %	442803684
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3991	NC_020134	CAG	2	6	232996	233001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803701
3992	NC_020134	T	6	6	233082	233087	0 %	100 %	0 %	0 %	442803701
3993	NC_020134	GGT	2	6	233164	233169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803701
3994	NC_020134	A	7	7	233179	233185	100 %	0 %	0 %	0 %	442803701
3995	NC_020134	TTC	2	6	233239	233244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803701
3996	NC_020134	GGC	2	6	233254	233259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803701
3997	NC_020134	ATATC	2	10	233291	233300	40 %	40 %	0 %	20 %	442803701
3998	NC_020134	GTCTT	2	10	233574	233583	0 %	60 %	20 %	20 %	442803702
3999	NC_020134	CGA	2	6	233698	233703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803702
4000	NC_020134	TGA	2	6	233763	233768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803702

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