MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_020134	TGAAT	2	10	2258569	2258578	40 %	40 %	20 %	0 %	442805516
38002	NC_020134	CCTT	2	8	2258599	2258606	0 %	50 %	0 %	50 %	442805516
38003	NC_020134	GAG	2	6	2258660	2258665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805516
38004	NC_020134	TCC	2	6	2258755	2258760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805516
38005	NC_020134	CGA	2	6	2258772	2258777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805516
38006	NC_020134	A	7	7	2258779	2258785	100 %	0 %	0 %	0 %	442805516
38007	NC_020134	GAA	2	6	2258822	2258827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805516
38008	NC_020134	TCTG	2	8	2258912	2258919	0 %	50 %	25 %	25 %	442805516
38009	NC_020134	TAA	2	6	2258924	2258929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805516
38010	NC_020134	T	6	6	2258955	2258960	0 %	100 %	0 %	0 %	442805516
38011	NC_020134	AT	3	6	2259092	2259097	50 %	50 %	0 %	0 %	442805517
38012	NC_020134	AT	3	6	2259148	2259153	50 %	50 %	0 %	0 %	442805517
38013	NC_020134	TGC	2	6	2259162	2259167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805517
38014	NC_020134	GAA	2	6	2259241	2259246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805517
38015	NC_020134	T	6	6	2259247	2259252	0 %	100 %	0 %	0 %	442805517
38016	NC_020134	CCT	2	6	2259291	2259296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805517
38017	NC_020134	TA	3	6	2259386	2259391	50 %	50 %	0 %	0 %	442805517
38018	NC_020134	AAG	2	6	2259421	2259426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805517
38019	NC_020134	T	6	6	2259517	2259522	0 %	100 %	0 %	0 %	442805517
38020	NC_020134	GAAA	2	8	2259597	2259604	75 %	0 %	25 %	0 %	442805517
38021	NC_020134	GTT	2	6	2259833	2259838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805517
38022	NC_020134	TTC	2	6	2259890	2259895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805517
38023	NC_020134	AAC	2	6	2259952	2259957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805517
38024	NC_020134	AT	4	8	2259962	2259969	50 %	50 %	0 %	0 %	442805517
38025	NC_020134	TGGA	2	8	2260061	2260068	25 %	25 %	50 %	0 %	442805517
38026	NC_020134	ATA	2	6	2260326	2260331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805518
38027	NC_020134	CAG	2	6	2260334	2260339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805518
38028	NC_020134	T	6	6	2260366	2260371	0 %	100 %	0 %	0 %	442805518
38029	NC_020134	TTTTCA	2	12	2260381	2260392	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442805518
38030	NC_020134	GAAT	2	8	2260396	2260403	50 %	25 %	25 %	0 %	442805518
38031	NC_020134	ATC	2	6	2260416	2260421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805518
38032	NC_020134	T	6	6	2260606	2260611	0 %	100 %	0 %	0 %	442805518
38033	NC_020134	AT	3	6	2260622	2260627	50 %	50 %	0 %	0 %	442805518
38034	NC_020134	AAG	2	6	2260646	2260651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805518
38035	NC_020134	ACG	2	6	2260696	2260701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805518
38036	NC_020134	ACC	2	6	2260713	2260718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805518
38037	NC_020134	CACTCA	2	12	2260746	2260757	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	442805518
38038	NC_020134	T	6	6	2260772	2260777	0 %	100 %	0 %	0 %	442805518
38039	NC_020134	AT	3	6	2260834	2260839	50 %	50 %	0 %	0 %	442805518
38040	NC_020134	GA	3	6	2260847	2260852	50 %	0 %	50 %	0 %	442805518
38041	NC_020134	A	6	6	2260857	2260862	100 %	0 %	0 %	0 %	442805518
38042	NC_020134	TCA	2	6	2260863	2260868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805518
38043	NC_020134	GCT	2	6	2260873	2260878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805518
38044	NC_020134	GCT	2	6	2260901	2260906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805518
38045	NC_020134	AAACCG	2	12	2260948	2260959	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	442805518
38046	NC_020134	TTC	2	6	2260988	2260993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805518
38047	NC_020134	GCA	2	6	2261029	2261034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805518
38048	NC_020134	TTA	2	6	2261041	2261046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805518
38049	NC_020134	A	7	7	2261090	2261096	100 %	0 %	0 %	0 %	442805518
38050	NC_020134	TTTC	2	8	2261112	2261119	0 %	75 %	0 %	25 %	442805518
38051	NC_020134	T	6	6	2261129	2261134	0 %	100 %	0 %	0 %	442805518
38052	NC_020134	GTTC	2	8	2261137	2261144	0 %	50 %	25 %	25 %	442805518
38053	NC_020134	T	6	6	2261152	2261157	0 %	100 %	0 %	0 %	442805518
38054	NC_020134	TAT	2	6	2261184	2261189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805519
38055	NC_020134	CGAC	2	8	2261290	2261297	25 %	0 %	25 %	50 %	442805519
38056	NC_020134	A	6	6	2261325	2261330	100 %	0 %	0 %	0 %	442805519
38057	NC_020134	GCG	2	6	2261450	2261455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805520
38058	NC_020134	CA	3	6	2261569	2261574	50 %	0 %	0 %	50 %	442805520
38059	NC_020134	AGCA	2	8	2261706	2261713	50 %	0 %	25 %	25 %	442805520
38060	NC_020134	CGCAC	2	10	2261721	2261730	20 %	0 %	20 %	60 %	442805520
38061	NC_020134	TTCC	2	8	2261765	2261772	0 %	50 %	0 %	50 %	442805520
38062	NC_020134	GCA	2	6	2261797	2261802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805520
38063	NC_020134	TCT	2	6	2261828	2261833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805520
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38067	NC_020134	ATA	2	6	2262028	2262033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805520
38068	NC_020134	A	6	6	2262059	2262064	100 %	0 %	0 %	0 %	442805520
38069	NC_020134	GCC	2	6	2262216	2262221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805520
38070	NC_020134	CTT	2	6	2262326	2262331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805520
38071	NC_020134	AATC	2	8	2262703	2262710	50 %	25 %	0 %	25 %	442805521
38072	NC_020134	CCGCT	2	10	2262785	2262794	0 %	20 %	20 %	60 %	442805521
38073	NC_020134	TA	3	6	2262804	2262809	50 %	50 %	0 %	0 %	442805521
38074	NC_020134	CTT	2	6	2262818	2262823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805521
38075	NC_020134	TCA	2	6	2262847	2262852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805521
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38079	NC_020134	TAT	2	6	2263082	2263087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805521
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38085	NC_020134	A	6	6	2263603	2263608	100 %	0 %	0 %	0 %	442805521
38086	NC_020134	ATA	2	6	2263644	2263649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805521
38087	NC_020134	ACA	2	6	2263801	2263806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805521
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38089	NC_020134	AAG	2	6	2263851	2263856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805521
38090	NC_020134	CCTG	2	8	2263918	2263925	0 %	25 %	25 %	50 %	442805521
38091	NC_020134	T	6	6	2263985	2263990	0 %	100 %	0 %	0 %	442805521
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38093	NC_020134	AGA	2	6	2264206	2264211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805521
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38098	NC_020134	AT	3	6	2264461	2264466	50 %	50 %	0 %	0 %	442805521
38099	NC_020134	T	6	6	2264502	2264507	0 %	100 %	0 %	0 %	442805521
38100	NC_020134	T	6	6	2264519	2264524	0 %	100 %	0 %	0 %	442805521
38101	NC_020134	CCA	2	6	2264525	2264530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805521
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38103	NC_020134	T	6	6	2264677	2264682	0 %	100 %	0 %	0 %	442805521
38104	NC_020134	CTTC	2	8	2264706	2264713	0 %	50 %	0 %	50 %	442805521
38105	NC_020134	TCC	2	6	2264722	2264727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805521
38106	NC_020134	T	6	6	2264738	2264743	0 %	100 %	0 %	0 %	442805521
38107	NC_020134	TA	3	6	2264796	2264801	50 %	50 %	0 %	0 %	442805521
38108	NC_020134	GTT	2	6	2264817	2264822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805521
38109	NC_020134	ATA	2	6	2264826	2264831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805521
38110	NC_020134	CTTT	2	8	2264934	2264941	0 %	75 %	0 %	25 %	442805521
38111	NC_020134	GAAAA	2	10	2264955	2264964	80 %	0 %	20 %	0 %	442805521
38112	NC_020134	TTG	2	6	2264966	2264971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805521
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38114	NC_020134	ATG	2	6	2265000	2265005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805521
38115	NC_020134	CAAG	2	8	2265013	2265020	50 %	0 %	25 %	25 %	442805521
38116	NC_020134	GCA	2	6	2265053	2265058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805521
38117	NC_020134	TCA	2	6	2265068	2265073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805521
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38119	NC_020134	AT	3	6	2265209	2265214	50 %	50 %	0 %	0 %	442805522
38120	NC_020134	ACAT	2	8	2265222	2265229	50 %	25 %	0 %	25 %	442805522
38121	NC_020134	T	7	7	2265278	2265284	0 %	100 %	0 %	0 %	442805522
38122	NC_020134	TTTC	2	8	2265331	2265338	0 %	75 %	0 %	25 %	442805522
38123	NC_020134	TTCA	2	8	2265419	2265426	25 %	50 %	0 %	25 %	442805522
38124	NC_020134	CCTG	2	8	2265446	2265453	0 %	25 %	25 %	50 %	442805522
38125	NC_020134	CTTC	2	8	2265507	2265514	0 %	50 %	0 %	50 %	442805522
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38132	NC_020134	TCC	2	6	2265785	2265790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805523
38133	NC_020134	TTTTC	2	10	2266008	2266017	0 %	80 %	0 %	20 %	442805523
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38157	NC_020134	GCT	2	6	2267148	2267153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805524
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38219	NC_020134	A	6	6	2270911	2270916	100 %	0 %	0 %	0 %	442805527
38220	NC_020134	CAT	2	6	2270935	2270940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805527
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38226	NC_020134	T	6	6	2271305	2271310	0 %	100 %	0 %	0 %	442805527
38227	NC_020134	TA	4	8	2271313	2271320	50 %	50 %	0 %	0 %	442805527
38228	NC_020134	T	6	6	2271338	2271343	0 %	100 %	0 %	0 %	442805527
38229	NC_020134	C	6	6	2271423	2271428	0 %	0 %	0 %	100 %	442805528
38230	NC_020134	TCA	2	6	2271435	2271440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805528
38231	NC_020134	CTT	2	6	2271456	2271461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805528
38232	NC_020134	CTA	2	6	2271462	2271467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805528
38233	NC_020134	TCCG	2	8	2271468	2271475	0 %	25 %	25 %	50 %	442805528
38234	NC_020134	TAT	2	6	2271487	2271492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805528
38235	NC_020134	CATT	2	8	2271501	2271508	25 %	50 %	0 %	25 %	442805528
38236	NC_020134	TTTCGG	2	12	2271585	2271596	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	442805528
38237	NC_020134	GTC	2	6	2271616	2271621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805528
38238	NC_020134	T	6	6	2271641	2271646	0 %	100 %	0 %	0 %	442805528
38239	NC_020134	CAC	2	6	2271712	2271717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805528
38240	NC_020134	ATC	2	6	2271748	2271753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805528
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38269	NC_020134	CGG	2	6	2273866	2273871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805529
38270	NC_020134	CGCC	2	8	2273936	2273943	0 %	0 %	25 %	75 %	442805529
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38336	NC_020134	ACGC	2	8	2278432	2278439	25 %	0 %	25 %	50 %	442805533
38337	NC_020134	TCCC	2	8	2278495	2278502	0 %	25 %	0 %	75 %	442805533
38338	NC_020134	CAG	2	6	2278506	2278511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805533
38339	NC_020134	ATA	2	6	2278514	2278519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805533
38340	NC_020134	TTA	2	6	2278559	2278564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805533
38341	NC_020134	CCACG	2	10	2278601	2278610	20 %	0 %	20 %	60 %	442805533
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38343	NC_020134	AAC	2	6	2278711	2278716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805533
38344	NC_020134	T	7	7	2278720	2278726	0 %	100 %	0 %	0 %	442805533
38345	NC_020134	CAT	2	6	2278778	2278783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805533
38346	NC_020134	GAT	2	6	2278884	2278889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805533
38347	NC_020134	CTG	2	6	2278906	2278911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805533
38348	NC_020134	TAT	2	6	2278926	2278931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805533
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38350	NC_020134	TGGG	2	8	2278996	2279003	0 %	25 %	75 %	0 %	442805533
38351	NC_020134	AT	3	6	2279203	2279208	50 %	50 %	0 %	0 %	442805533
38352	NC_020134	GCC	2	6	2279212	2279217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805533
38353	NC_020134	A	6	6	2279255	2279260	100 %	0 %	0 %	0 %	442805533
38354	NC_020134	T	6	6	2279394	2279399	0 %	100 %	0 %	0 %	442805533
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38356	NC_020134	GAT	2	6	2279903	2279908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805535
38357	NC_020134	A	6	6	2279913	2279918	100 %	0 %	0 %	0 %	442805535
38358	NC_020134	CTG	2	6	2279949	2279954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805535
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38472	NC_020134	T	6	6	2285546	2285551	0 %	100 %	0 %	0 %	442805541
38473	NC_020134	ATCAA	2	10	2285662	2285671	60 %	20 %	0 %	20 %	442805541
38474	NC_020134	ATA	2	6	2285920	2285925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805541
38475	NC_020134	AATC	2	8	2285987	2285994	50 %	25 %	0 %	25 %	442805541
38476	NC_020134	TTC	2	6	2286026	2286031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805541
38477	NC_020134	CCA	2	6	2286044	2286049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805541
38478	NC_020134	CCG	3	9	2286058	2286066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805541
38479	NC_020134	AGA	2	6	2286124	2286129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805541
38480	NC_020134	CTG	2	6	2286183	2286188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805541
38481	NC_020134	T	6	6	2286585	2286590	0 %	100 %	0 %	0 %	442805542
38482	NC_020134	A	6	6	2286605	2286610	100 %	0 %	0 %	0 %	442805542
38483	NC_020134	A	6	6	2286618	2286623	100 %	0 %	0 %	0 %	442805542
38484	NC_020134	AAAC	2	8	2286638	2286645	75 %	0 %	0 %	25 %	442805542
38485	NC_020134	TGGG	2	8	2286718	2286725	0 %	25 %	75 %	0 %	442805542
38486	NC_020134	AT	3	6	2286803	2286808	50 %	50 %	0 %	0 %	442805542
38487	NC_020134	TTTA	2	8	2286864	2286871	25 %	75 %	0 %	0 %	442805542
38488	NC_020134	GATT	2	8	2286926	2286933	25 %	50 %	25 %	0 %	442805542
38489	NC_020134	TA	3	6	2286966	2286971	50 %	50 %	0 %	0 %	442805542
38490	NC_020134	AC	3	6	2287070	2287075	50 %	0 %	0 %	50 %	442805542
38491	NC_020134	A	6	6	2287112	2287117	100 %	0 %	0 %	0 %	442805542
38492	NC_020134	GAT	2	6	2287131	2287136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805542
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38495	NC_020134	AT	3	6	2287254	2287259	50 %	50 %	0 %	0 %	442805542
38496	NC_020134	TTA	2	6	2287283	2287288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805542
38497	NC_020134	A	8	8	2287386	2287393	100 %	0 %	0 %	0 %	442805542
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38499	NC_020134	TTG	2	6	2287546	2287551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805542
38500	NC_020134	AT	3	6	2287647	2287652	50 %	50 %	0 %	0 %	442805542

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