MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_020134	GTCTCA	2	12	1953213	1953224	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442805231
33002	NC_020134	TTA	2	6	1953232	1953237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805231
33003	NC_020134	CATC	2	8	1953286	1953293	25 %	25 %	0 %	50 %	442805231
33004	NC_020134	GCA	2	6	1953321	1953326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805231
33005	NC_020134	TG	3	6	1953336	1953341	0 %	50 %	50 %	0 %	442805231
33006	NC_020134	CATT	2	8	1953423	1953430	25 %	50 %	0 %	25 %	442805231
33007	NC_020134	ATA	2	6	1953441	1953446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805231
33008	NC_020134	TCT	2	6	1953621	1953626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805231
33009	NC_020134	GTTT	2	8	1953658	1953665	0 %	75 %	25 %	0 %	442805231
33010	NC_020134	TGT	2	6	1953691	1953696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805231
33011	NC_020134	ATC	2	6	1953713	1953718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805231
33012	NC_020134	TGG	2	6	1953856	1953861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442805231
33013	NC_020134	AAT	2	6	1953894	1953899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805231
33014	NC_020134	TTC	2	6	1953911	1953916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805231
33015	NC_020134	TTC	2	6	1953971	1953976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805231
33016	NC_020134	ATC	2	6	1953999	1954004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805231
33017	NC_020134	CTT	2	6	1954040	1954045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805232
33018	NC_020134	TCG	2	6	1954090	1954095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805232
33019	NC_020134	TCATT	2	10	1954208	1954217	20 %	60 %	0 %	20 %	442805232
33020	NC_020134	TAT	2	6	1954233	1954238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805232
33021	NC_020134	TTC	2	6	1954246	1954251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805232
33022	NC_020134	TAA	2	6	1954322	1954327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805232
33023	NC_020134	CAT	2	6	1954467	1954472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805232
33024	NC_020134	TTTA	2	8	1954504	1954511	25 %	75 %	0 %	0 %	442805233
33025	NC_020134	TCC	2	6	1954529	1954534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805233
33026	NC_020134	CCTC	2	8	1954578	1954585	0 %	25 %	0 %	75 %	442805233
33027	NC_020134	CCAT	2	8	1954670	1954677	25 %	25 %	0 %	50 %	442805233
33028	NC_020134	T	7	7	1954729	1954735	0 %	100 %	0 %	0 %	442805233
33029	NC_020134	TCA	2	6	1954826	1954831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805233
33030	NC_020134	CT	3	6	1954842	1954847	0 %	50 %	0 %	50 %	442805233
33031	NC_020134	GCA	2	6	1955281	1955286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805234
33032	NC_020134	A	6	6	1955290	1955295	100 %	0 %	0 %	0 %	442805234
33033	NC_020134	A	7	7	1955298	1955304	100 %	0 %	0 %	0 %	442805234
33034	NC_020134	TGT	2	6	1955344	1955349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805234
33035	NC_020134	A	7	7	1955460	1955466	100 %	0 %	0 %	0 %	442805234
33036	NC_020134	A	7	7	1955478	1955484	100 %	0 %	0 %	0 %	442805234
33037	NC_020134	AG	4	8	1955506	1955513	50 %	0 %	50 %	0 %	442805234
33038	NC_020134	AGG	2	6	1955576	1955581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805234
33039	NC_020134	AGC	2	6	1955621	1955626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805234
33040	NC_020134	TTA	2	6	1955719	1955724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805234
33041	NC_020134	TA	3	6	1955766	1955771	50 %	50 %	0 %	0 %	442805234
33042	NC_020134	TTTGT	2	10	1956314	1956323	0 %	80 %	20 %	0 %	442805235
33043	NC_020134	T	6	6	1956323	1956328	0 %	100 %	0 %	0 %	442805235
33044	NC_020134	CAA	2	6	1956339	1956344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805235
33045	NC_020134	AT	3	6	1956375	1956380	50 %	50 %	0 %	0 %	442805235
33046	NC_020134	ATT	2	6	1956382	1956387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805235
33047	NC_020134	A	6	6	1956398	1956403	100 %	0 %	0 %	0 %	442805235
33048	NC_020134	ACGC	2	8	1956436	1956443	25 %	0 %	25 %	50 %	442805235
33049	NC_020134	TTA	2	6	1956467	1956472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805235
33050	NC_020134	T	6	6	1956514	1956519	0 %	100 %	0 %	0 %	442805235
33051	NC_020134	T	6	6	1956583	1956588	0 %	100 %	0 %	0 %	442805236
33052	NC_020134	A	6	6	1956618	1956623	100 %	0 %	0 %	0 %	442805236
33053	NC_020134	TTC	2	6	1956663	1956668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805236
33054	NC_020134	ATT	2	6	1956677	1956682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805236
33055	NC_020134	ATT	2	6	1956868	1956873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805237
33056	NC_020134	TA	3	6	1956893	1956898	50 %	50 %	0 %	0 %	442805237
33057	NC_020134	AGA	2	6	1956973	1956978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805237
33058	NC_020134	AAT	2	6	1957010	1957015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805237
33059	NC_020134	CTA	2	6	1957094	1957099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805237
33060	NC_020134	TCGCC	2	10	1957232	1957241	0 %	20 %	20 %	60 %	442805237
33061	NC_020134	TATT	2	8	1957267	1957274	25 %	75 %	0 %	0 %	442805237
33062	NC_020134	CATAT	2	10	1957308	1957317	40 %	40 %	0 %	20 %	442805237
33063	NC_020134	TCC	2	6	1957338	1957343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805237
33064	NC_020134	TA	3	6	1957371	1957376	50 %	50 %	0 %	0 %	442805237
33065	NC_020134	CCA	2	6	1957394	1957399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805237
33066	NC_020134	CA	3	6	1957436	1957441	50 %	0 %	0 %	50 %	442805237
33067	NC_020134	ATC	2	6	1957476	1957481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805237
33068	NC_020134	CCTG	2	8	1957596	1957603	0 %	25 %	25 %	50 %	442805237
33069	NC_020134	TCA	2	6	1957681	1957686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805237
33070	NC_020134	TTC	3	9	1957689	1957697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805237
33071	NC_020134	TA	3	6	1957714	1957719	50 %	50 %	0 %	0 %	442805237
33072	NC_020134	CTT	2	6	1957724	1957729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805237
33073	NC_020134	GAG	2	6	1957845	1957850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442805237
33074	NC_020134	CCTGT	2	10	1957861	1957870	0 %	40 %	20 %	40 %	442805237
33075	NC_020134	AT	3	6	1957949	1957954	50 %	50 %	0 %	0 %	442805237
33076	NC_020134	TTCC	2	8	1958038	1958045	0 %	50 %	0 %	50 %	442805238
33077	NC_020134	TTC	2	6	1958095	1958100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805238
33078	NC_020134	CAT	2	6	1958143	1958148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805238
33079	NC_020134	CGG	2	6	1958172	1958177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805238
33080	NC_020134	ATA	2	6	1958242	1958247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805238
33081	NC_020134	TTTTG	2	10	1958305	1958314	0 %	80 %	20 %	0 %	442805238
33082	NC_020134	ATG	2	6	1958521	1958526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805238
33083	NC_020134	AAAT	2	8	1958531	1958538	75 %	25 %	0 %	0 %	442805238
33084	NC_020134	TCA	2	6	1958732	1958737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805238
33085	NC_020134	AAT	2	6	1958739	1958744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805238
33086	NC_020134	TCTT	2	8	1958830	1958837	0 %	75 %	0 %	25 %	442805238
33087	NC_020134	TGA	2	6	1958970	1958975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805238
33088	NC_020134	T	6	6	1959076	1959081	0 %	100 %	0 %	0 %	442805238
33089	NC_020134	TTC	2	6	1959124	1959129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805238
33090	NC_020134	CAA	2	6	1959162	1959167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805238
33091	NC_020134	CTC	2	6	1959177	1959182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805238
33092	NC_020134	CT	3	6	1959328	1959333	0 %	50 %	0 %	50 %	442805239
33093	NC_020134	TGCA	2	8	1959342	1959349	25 %	25 %	25 %	25 %	442805239
33094	NC_020134	CGCTC	2	10	1959361	1959370	0 %	20 %	20 %	60 %	442805239
33095	NC_020134	GCG	2	6	1959378	1959383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805239
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33097	NC_020134	CCA	2	6	1959561	1959566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442805239
33098	NC_020134	TCCA	2	8	1959568	1959575	25 %	25 %	0 %	50 %	442805239
33099	NC_020134	TCC	2	6	1959629	1959634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805239
33100	NC_020134	CACC	2	8	1959675	1959682	25 %	0 %	0 %	75 %	442805239
33101	NC_020134	CGC	2	6	1959695	1959700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442805239
33102	NC_020134	AAT	2	6	1959769	1959774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805239
33103	NC_020134	T	6	6	1959790	1959795	0 %	100 %	0 %	0 %	442805239
33104	NC_020134	CGT	2	6	1959861	1959866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805239
33105	NC_020134	TTC	2	6	1959886	1959891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805239
33106	NC_020134	ATT	2	6	1959893	1959898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805239
33107	NC_020134	GC	3	6	1960077	1960082	0 %	0 %	50 %	50 %	442805239
33108	NC_020134	TAC	2	6	1960087	1960092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805239
33109	NC_020134	TTC	2	6	1960102	1960107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805239
33110	NC_020134	TTGC	2	8	1960133	1960140	0 %	50 %	25 %	25 %	442805239
33111	NC_020134	CAG	2	6	1960160	1960165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805240
33112	NC_020134	AAC	2	6	1960192	1960197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805240
33113	NC_020134	TAA	2	6	1960413	1960418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805240
33114	NC_020134	ATA	2	6	1960440	1960445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805240
33115	NC_020134	CT	3	6	1960484	1960489	0 %	50 %	0 %	50 %	442805240
33116	NC_020134	TAT	2	6	1960535	1960540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805240
33117	NC_020134	ATT	2	6	1960553	1960558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805240
33118	NC_020134	T	6	6	1960557	1960562	0 %	100 %	0 %	0 %	442805240
33119	NC_020134	AT	3	6	1960592	1960597	50 %	50 %	0 %	0 %	442805240
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33227	NC_020134	TAT	2	6	1970555	1970560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805251
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33230	NC_020134	TTA	2	6	1970592	1970597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805251
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33232	NC_020134	CCT	2	6	1970647	1970652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442805251
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33235	NC_020134	TCA	2	6	1970826	1970831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442805251
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33472	NC_020134	GCG	2	6	1984866	1984871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442805256
33473	NC_020134	TTA	2	6	1984939	1984944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805256
33474	NC_020134	TTTA	2	8	1985537	1985544	25 %	75 %	0 %	0 %	442805257
33475	NC_020134	TTG	2	6	1985597	1985602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442805257
33476	NC_020134	ATA	2	6	1985611	1985616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805257
33477	NC_020134	ATA	2	6	1985633	1985638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805257
33478	NC_020134	GA	3	6	1985652	1985657	50 %	0 %	50 %	0 %	442805257
33479	NC_020134	ACA	2	6	1985733	1985738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442805257
33480	NC_020134	CTG	2	6	1985750	1985755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805257
33481	NC_020134	CAG	2	6	1985801	1985806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442805257
33482	NC_020134	TGAA	2	8	1985884	1985891	50 %	25 %	25 %	0 %	442805257
33483	NC_020134	CTTAAG	2	12	1985905	1985916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442805257
33484	NC_020134	GAA	2	6	1985959	1985964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442805257
33485	NC_020134	TGTAT	2	10	1986002	1986011	20 %	60 %	20 %	0 %	442805257
33486	NC_020134	TTC	2	6	1986017	1986022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442805257
33487	NC_020134	AG	3	6	1986047	1986052	50 %	0 %	50 %	0 %	442805257
33488	NC_020134	CTTT	2	8	1986070	1986077	0 %	75 %	0 %	25 %	442805257
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33490	NC_020134	CAGC	2	8	1986120	1986127	25 %	0 %	25 %	50 %	442805257
33491	NC_020134	GTA	2	6	1986164	1986169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442805257
33492	NC_020134	GGCC	2	8	1986186	1986193	0 %	0 %	50 %	50 %	442805257
33493	NC_020134	TGC	2	6	1986231	1986236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442805257
33494	NC_020134	CT	3	6	1986283	1986288	0 %	50 %	0 %	50 %	442805257
33495	NC_020134	GACT	2	8	1986320	1986327	25 %	25 %	25 %	25 %	442805257
33496	NC_020134	TAT	3	9	1986345	1986353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442805257
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33499	NC_020134	CT	3	6	1986673	1986678	0 %	50 %	0 %	50 %	442805257
33500	NC_020134	ATA	2	6	1986739	1986744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442805257

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