MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_020134	TCA	2	6	1160204	1160209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804530
19502	NC_020134	GCCT	2	8	1160272	1160279	0 %	25 %	25 %	50 %	442804530
19503	NC_020134	CTA	2	6	1160325	1160330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804530
19504	NC_020134	TTTTA	2	10	1160434	1160443	20 %	80 %	0 %	0 %	442804531
19505	NC_020134	T	7	7	1160459	1160465	0 %	100 %	0 %	0 %	442804531
19506	NC_020134	ACC	2	6	1160482	1160487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442804531
19507	NC_020134	CCG	2	6	1160501	1160506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804531
19508	NC_020134	CAT	2	6	1160577	1160582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804531
19509	NC_020134	A	6	6	1160597	1160602	100 %	0 %	0 %	0 %	442804531
19510	NC_020134	TCC	2	6	1160683	1160688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442804531
19511	NC_020134	T	7	7	1160693	1160699	0 %	100 %	0 %	0 %	442804531
19512	NC_020134	CCA	2	6	1160708	1160713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442804531
19513	NC_020134	T	6	6	1160776	1160781	0 %	100 %	0 %	0 %	442804531
19514	NC_020134	AT	3	6	1160899	1160904	50 %	50 %	0 %	0 %	442804531
19515	NC_020134	GCT	2	6	1160909	1160914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804531
19516	NC_020134	GCC	2	6	1160923	1160928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804531
19517	NC_020134	TTC	2	6	1160976	1160981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804531
19518	NC_020134	GTC	2	6	1161003	1161008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804531
19519	NC_020134	TGA	2	6	1161133	1161138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804531
19520	NC_020134	AGA	2	6	1161280	1161285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804531
19521	NC_020134	GTT	2	6	1161328	1161333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804531
19522	NC_020134	A	6	6	1161344	1161349	100 %	0 %	0 %	0 %	442804531
19523	NC_020134	ATG	2	6	1161387	1161392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804531
19524	NC_020134	CCTGT	2	10	1161422	1161431	0 %	40 %	20 %	40 %	442804531
19525	NC_020134	TA	4	8	1161489	1161496	50 %	50 %	0 %	0 %	442804531
19526	NC_020134	A	6	6	1161532	1161537	100 %	0 %	0 %	0 %	442804531
19527	NC_020134	AT	3	6	1161561	1161566	50 %	50 %	0 %	0 %	442804531
19528	NC_020134	T	8	8	1161732	1161739	0 %	100 %	0 %	0 %	442804531
19529	NC_020134	GGC	2	6	1161762	1161767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804531
19530	NC_020134	GTG	2	6	1161796	1161801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804531
19531	NC_020134	AAAT	2	8	1161838	1161845	75 %	25 %	0 %	0 %	442804531
19532	NC_020134	T	6	6	1161921	1161926	0 %	100 %	0 %	0 %	442804531
19533	NC_020134	CGT	2	6	1161959	1161964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804531
19534	NC_020134	GGA	2	6	1161970	1161975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804531
19535	NC_020134	CGG	2	6	1162049	1162054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804531
19536	NC_020134	ATG	2	6	1162055	1162060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804531
19537	NC_020134	T	6	6	1162061	1162066	0 %	100 %	0 %	0 %	442804531
19538	NC_020134	TGCCGT	2	12	1162124	1162135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804531
19539	NC_020134	TTGTAT	2	12	1162136	1162147	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	442804531
19540	NC_020134	ATAA	2	8	1162201	1162208	75 %	25 %	0 %	0 %	442804531
19541	NC_020134	T	7	7	1162217	1162223	0 %	100 %	0 %	0 %	442804531
19542	NC_020134	GTTAT	2	10	1162658	1162667	20 %	60 %	20 %	0 %	442804532
19543	NC_020134	A	7	7	1162669	1162675	100 %	0 %	0 %	0 %	442804532
19544	NC_020134	TGG	2	6	1162676	1162681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804532
19545	NC_020134	GTT	2	6	1162700	1162705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804532
19546	NC_020134	ATT	2	6	1162709	1162714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804532
19547	NC_020134	ATA	3	9	1162733	1162741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804532
19548	NC_020134	GAT	2	6	1162793	1162798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804532
19549	NC_020134	CTG	2	6	1162799	1162804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804532
19550	NC_020134	A	6	6	1162817	1162822	100 %	0 %	0 %	0 %	442804532
19551	NC_020134	TCA	2	6	1162890	1162895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804532
19552	NC_020134	GTT	2	6	1162952	1162957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804532
19553	NC_020134	TCAA	2	8	1163003	1163010	50 %	25 %	0 %	25 %	442804532
19554	NC_020134	AAAT	2	8	1163028	1163035	75 %	25 %	0 %	0 %	442804532
19555	NC_020134	TGAAT	2	10	1163074	1163083	40 %	40 %	20 %	0 %	442804532
19556	NC_020134	TCCG	2	8	1163125	1163132	0 %	25 %	25 %	50 %	442804532
19557	NC_020134	TACAG	2	10	1163204	1163213	40 %	20 %	20 %	20 %	442804532
19558	NC_020134	GAT	2	6	1163279	1163284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804532
19559	NC_020134	TGA	2	6	1163554	1163559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804532
19560	NC_020134	GCC	2	6	1163708	1163713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804532
19561	NC_020134	GCG	2	6	1163721	1163726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804532
19562	NC_020134	TGG	2	6	1163787	1163792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804532
19563	NC_020134	TAT	2	6	1163813	1163818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804532
19564	NC_020134	ATGT	2	8	1163846	1163853	25 %	50 %	25 %	0 %	442804532
19565	NC_020134	TGA	2	6	1163896	1163901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804532
19566	NC_020134	TGAA	2	8	1163919	1163926	50 %	25 %	25 %	0 %	442804532
19567	NC_020134	CAG	2	6	1163960	1163965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804532
19568	NC_020134	AT	3	6	1163976	1163981	50 %	50 %	0 %	0 %	442804532
19569	NC_020134	GGA	2	6	1163983	1163988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804532
19570	NC_020134	AT	3	6	1164040	1164045	50 %	50 %	0 %	0 %	442804532
19571	NC_020134	TGG	2	6	1164063	1164068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804532
19572	NC_020134	GAT	2	6	1164104	1164109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804532
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19577	NC_020134	GAA	2	6	1164945	1164950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804533
19578	NC_020134	GTT	2	6	1164959	1164964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804533
19579	NC_020134	A	7	7	1164971	1164977	100 %	0 %	0 %	0 %	442804533
19580	NC_020134	TGAA	2	8	1165051	1165058	50 %	25 %	25 %	0 %	442804533
19581	NC_020134	GGA	2	6	1165073	1165078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804533
19582	NC_020134	GAA	2	6	1165113	1165118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804533
19583	NC_020134	AGAA	2	8	1165121	1165128	75 %	0 %	25 %	0 %	442804533
19584	NC_020134	ATT	2	6	1165279	1165284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804533
19585	NC_020134	GCC	2	6	1165418	1165423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804533
19586	NC_020134	CAT	2	6	1165611	1165616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804533
19587	NC_020134	GGA	2	6	1165668	1165673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804533
19588	NC_020134	GCTTT	2	10	1165783	1165792	0 %	60 %	20 %	20 %	442804533
19589	NC_020134	GCA	2	6	1166012	1166017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804534
19590	NC_020134	AAG	2	6	1166138	1166143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804534
19591	NC_020134	AAGG	2	8	1166176	1166183	50 %	0 %	50 %	0 %	442804534
19592	NC_020134	TGG	2	6	1166204	1166209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804534
19593	NC_020134	CGG	2	6	1166223	1166228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804534
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19596	NC_020134	ATTTC	2	10	1166546	1166555	20 %	60 %	0 %	20 %	442804534
19597	NC_020134	TGC	2	6	1166592	1166597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804534
19598	NC_020134	GGC	2	6	1166648	1166653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804534
19599	NC_020134	CGG	2	6	1166760	1166765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804534
19600	NC_020134	ATA	2	6	1166770	1166775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804534
19601	NC_020134	TTC	2	6	1166838	1166843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804534
19602	NC_020134	GA	3	6	1166900	1166905	50 %	0 %	50 %	0 %	442804534
19603	NC_020134	GAAGC	2	10	1167002	1167011	40 %	0 %	40 %	20 %	442804534
19604	NC_020134	GTT	2	6	1167106	1167111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804534
19605	NC_020134	GGA	2	6	1167321	1167326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804534
19606	NC_020134	GC	3	6	1167331	1167336	0 %	0 %	50 %	50 %	442804534
19607	NC_020134	AGA	2	6	1167413	1167418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804534
19608	NC_020134	GTT	2	6	1167544	1167549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804534
19609	NC_020134	A	6	6	1167552	1167557	100 %	0 %	0 %	0 %	442804534
19610	NC_020134	ACC	3	9	1167589	1167597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442804534
19611	NC_020134	GAG	2	6	1167646	1167651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804534
19612	NC_020134	A	7	7	1167713	1167719	100 %	0 %	0 %	0 %	442804534
19613	NC_020134	TAT	2	6	1167757	1167762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804534
19614	NC_020134	TTG	2	6	1167773	1167778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804534
19615	NC_020134	GTT	2	6	1167783	1167788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804534
19616	NC_020134	A	7	7	1167827	1167833	100 %	0 %	0 %	0 %	442804534
19617	NC_020134	GACA	2	8	1167878	1167885	50 %	0 %	25 %	25 %	442804534
19618	NC_020134	ACAT	2	8	1167949	1167956	50 %	25 %	0 %	25 %	442804534
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19965	NC_020134	TA	4	8	1187561	1187568	50 %	50 %	0 %	0 %	442804552
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19969	NC_020134	ACT	2	6	1187645	1187650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804552
19970	NC_020134	CAT	2	6	1187757	1187762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804552
19971	NC_020134	TCC	2	6	1187763	1187768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442804552
19972	NC_020134	TAA	2	6	1187777	1187782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804552
19973	NC_020134	TGAA	2	8	1187820	1187827	50 %	25 %	25 %	0 %	442804552
19974	NC_020134	GGTT	2	8	1187845	1187852	0 %	50 %	50 %	0 %	442804553
19975	NC_020134	TGG	2	6	1187887	1187892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804553
19976	NC_020134	TTGGA	2	10	1187904	1187913	20 %	40 %	40 %	0 %	442804553
19977	NC_020134	GGCA	2	8	1187954	1187961	25 %	0 %	50 %	25 %	442804553
19978	NC_020134	TTTGAG	2	12	1188066	1188077	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	442804553
19979	NC_020134	AGGA	2	8	1188157	1188164	50 %	0 %	50 %	0 %	442804553
19980	NC_020134	ATT	2	6	1188171	1188176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804553
19981	NC_020134	AGC	2	6	1188259	1188264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804553
19982	NC_020134	A	6	6	1188316	1188321	100 %	0 %	0 %	0 %	442804553
19983	NC_020134	A	6	6	1188431	1188436	100 %	0 %	0 %	0 %	442804553
19984	NC_020134	TGGGAG	2	12	1188451	1188462	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	442804553
19985	NC_020134	GACA	2	8	1188483	1188490	50 %	0 %	25 %	25 %	442804553
19986	NC_020134	CAGG	2	8	1188513	1188520	25 %	0 %	50 %	25 %	442804553
19987	NC_020134	CATTT	2	10	1188593	1188602	20 %	60 %	0 %	20 %	442804553
19988	NC_020134	ATA	2	6	1188604	1188609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804553
19989	NC_020134	TAAA	2	8	1188619	1188626	75 %	25 %	0 %	0 %	442804553
19990	NC_020134	GAT	2	6	1188627	1188632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804553
19991	NC_020134	ATG	2	6	1188652	1188657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804553
19992	NC_020134	GAC	2	6	1188921	1188926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804554
19993	NC_020134	ATG	2	6	1188970	1188975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804554
19994	NC_020134	GTA	2	6	1188984	1188989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804554
19995	NC_020134	GGGC	2	8	1188990	1188997	0 %	0 %	75 %	25 %	442804554
19996	NC_020134	AACC	2	8	1189034	1189041	50 %	0 %	0 %	50 %	442804554
19997	NC_020134	ATT	2	6	1189062	1189067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804554
19998	NC_020134	ATT	2	6	1189140	1189145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804554
19999	NC_020134	CAG	2	6	1189150	1189155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804554
20000	NC_020134	GGACA	2	10	1189158	1189167	40 %	0 %	40 %	20 %	442804554

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