MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_020134	GTTG	2	8	1070157	1070164	0 %	50 %	50 %	0 %	442804457
18002	NC_020134	AACA	2	8	1070178	1070185	75 %	0 %	0 %	25 %	442804457
18003	NC_020134	T	6	6	1070210	1070215	0 %	100 %	0 %	0 %	442804458
18004	NC_020134	TCG	2	6	1070220	1070225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804458
18005	NC_020134	AAT	2	6	1070232	1070237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804458
18006	NC_020134	AAG	2	6	1070330	1070335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804458
18007	NC_020134	TAT	2	6	1070366	1070371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804458
18008	NC_020134	CTG	2	6	1070474	1070479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804458
18009	NC_020134	T	7	7	1070510	1070516	0 %	100 %	0 %	0 %	442804458
18010	NC_020134	ATA	2	6	1070721	1070726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804458
18011	NC_020134	T	6	6	1070741	1070746	0 %	100 %	0 %	0 %	442804458
18012	NC_020134	GTG	2	6	1070769	1070774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804458
18013	NC_020134	TCC	2	6	1070905	1070910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442804459
18014	NC_020134	TTGAT	2	10	1070934	1070943	20 %	60 %	20 %	0 %	442804459
18015	NC_020134	TCA	2	6	1070950	1070955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804459
18016	NC_020134	AAT	2	6	1070970	1070975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804459
18017	NC_020134	ATCC	2	8	1071073	1071080	25 %	25 %	0 %	50 %	442804459
18018	NC_020134	CTG	2	6	1071107	1071112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804459
18019	NC_020134	TGCC	2	8	1071119	1071126	0 %	25 %	25 %	50 %	442804459
18020	NC_020134	GAA	2	6	1071143	1071148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804459
18021	NC_020134	GCT	2	6	1071191	1071196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804459
18022	NC_020134	T	6	6	1071269	1071274	0 %	100 %	0 %	0 %	442804459
18023	NC_020134	A	6	6	1071315	1071320	100 %	0 %	0 %	0 %	442804459
18024	NC_020134	A	6	6	1071326	1071331	100 %	0 %	0 %	0 %	442804459
18025	NC_020134	T	6	6	1071429	1071434	0 %	100 %	0 %	0 %	442804459
18026	NC_020134	T	6	6	1071471	1071476	0 %	100 %	0 %	0 %	442804459
18027	NC_020134	TTA	2	6	1071478	1071483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804459
18028	NC_020134	AT	3	6	1071516	1071521	50 %	50 %	0 %	0 %	442804459
18029	NC_020134	GTT	2	6	1071544	1071549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804459
18030	NC_020134	CCG	2	6	1071631	1071636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804459
18031	NC_020134	T	7	7	1071716	1071722	0 %	100 %	0 %	0 %	442804460
18032	NC_020134	ATT	2	6	1071777	1071782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804460
18033	NC_020134	CAG	2	6	1071788	1071793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804460
18034	NC_020134	ACT	2	6	1071909	1071914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804460
18035	NC_020134	GCG	2	6	1072068	1072073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804460
18036	NC_020134	TCC	2	6	1072080	1072085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442804460
18037	NC_020134	GAA	2	6	1072113	1072118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804460
18038	NC_020134	CCG	2	6	1072150	1072155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804460
18039	NC_020134	TAT	2	6	1072256	1072261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804460
18040	NC_020134	CGA	2	6	1072324	1072329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804460
18041	NC_020134	AGG	2	6	1072365	1072370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804460
18042	NC_020134	TAAT	2	8	1072408	1072415	50 %	50 %	0 %	0 %	442804460
18043	NC_020134	A	6	6	1072540	1072545	100 %	0 %	0 %	0 %	442804460
18044	NC_020134	TAT	2	6	1072607	1072612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804460
18045	NC_020134	TTA	2	6	1072627	1072632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804460
18046	NC_020134	T	6	6	1072644	1072649	0 %	100 %	0 %	0 %	442804460
18047	NC_020134	CTT	2	6	1072667	1072672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804460
18048	NC_020134	TC	4	8	1072687	1072694	0 %	50 %	0 %	50 %	442804461
18049	NC_020134	CGA	2	6	1072804	1072809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804461
18050	NC_020134	GCC	2	6	1072823	1072828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804461
18051	NC_020134	GTA	2	6	1072925	1072930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804461
18052	NC_020134	TA	3	6	1072929	1072934	50 %	50 %	0 %	0 %	442804461
18053	NC_020134	T	6	6	1073076	1073081	0 %	100 %	0 %	0 %	442804461
18054	NC_020134	AAC	2	6	1073108	1073113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442804461
18055	NC_020134	A	6	6	1073225	1073230	100 %	0 %	0 %	0 %	442804461
18056	NC_020134	TTG	2	6	1073233	1073238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804461
18057	NC_020134	TAAT	2	8	1073272	1073279	50 %	50 %	0 %	0 %	442804461
18058	NC_020134	AGGGA	2	10	1073370	1073379	40 %	0 %	60 %	0 %	442804461
18059	NC_020134	GGT	2	6	1073396	1073401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804461
18060	NC_020134	TAA	2	6	1073458	1073463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804461
18061	NC_020134	TGA	2	6	1073467	1073472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804461
18062	NC_020134	TGC	2	6	1073515	1073520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804461
18063	NC_020134	CTG	2	6	1073543	1073548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804461
18064	NC_020134	CAA	2	6	1073971	1073976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442804462
18065	NC_020134	T	6	6	1074017	1074022	0 %	100 %	0 %	0 %	442804462
18066	NC_020134	AAT	2	6	1074085	1074090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804462
18067	NC_020134	CCG	2	6	1074165	1074170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804462
18068	NC_020134	GTGC	2	8	1074195	1074202	0 %	25 %	50 %	25 %	442804462
18069	NC_020134	TAA	2	6	1074211	1074216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804462
18070	NC_020134	GTAA	2	8	1074241	1074248	50 %	25 %	25 %	0 %	442804462
18071	NC_020134	ATG	2	6	1074249	1074254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804462
18072	NC_020134	CAA	2	6	1074328	1074333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442804462
18073	NC_020134	GTT	2	6	1074368	1074373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804462
18074	NC_020134	T	6	6	1074422	1074427	0 %	100 %	0 %	0 %	442804462
18075	NC_020134	ATT	2	6	1074437	1074442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804462
18076	NC_020134	ATG	2	6	1074564	1074569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804462
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18079	NC_020134	T	7	7	1074727	1074733	0 %	100 %	0 %	0 %	442804462
18080	NC_020134	CCG	2	6	1074744	1074749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804462
18081	NC_020134	TCG	2	6	1074762	1074767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804462
18082	NC_020134	CCG	2	6	1074816	1074821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804462
18083	NC_020134	GAT	2	6	1074858	1074863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804462
18084	NC_020134	CGG	2	6	1074868	1074873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804462
18085	NC_020134	T	6	6	1074929	1074934	0 %	100 %	0 %	0 %	442804462
18086	NC_020134	ATT	2	6	1074936	1074941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804462
18087	NC_020134	AAATGG	2	12	1075166	1075177	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	442804463
18088	NC_020134	ACG	2	6	1075216	1075221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804463
18089	NC_020134	CTA	2	6	1075283	1075288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804463
18090	NC_020134	TCC	2	6	1075317	1075322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442804463
18091	NC_020134	GCC	2	6	1075365	1075370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804463
18092	NC_020134	TGA	2	6	1075406	1075411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804463
18093	NC_020134	CCG	2	6	1075417	1075422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804463
18094	NC_020134	CCG	2	6	1075429	1075434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804463
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18096	NC_020134	CT	3	6	1075506	1075511	0 %	50 %	0 %	50 %	442804463
18097	NC_020134	TCCT	2	8	1075572	1075579	0 %	50 %	0 %	50 %	442804463
18098	NC_020134	GCA	2	6	1075684	1075689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804463
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18100	NC_020134	CGT	2	6	1075901	1075906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804463
18101	NC_020134	AAT	2	6	1075974	1075979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804463
18102	NC_020134	CCA	2	6	1076093	1076098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442804463
18103	NC_020134	CAA	2	6	1076177	1076182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442804463
18104	NC_020134	TTC	2	6	1076194	1076199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804463
18105	NC_020134	TAA	2	6	1076234	1076239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804463
18106	NC_020134	ATGC	2	8	1076260	1076267	25 %	25 %	25 %	25 %	442804463
18107	NC_020134	CA	3	6	1076281	1076286	50 %	0 %	0 %	50 %	442804463
18108	NC_020134	CCG	2	6	1076297	1076302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804463
18109	NC_020134	TA	4	8	1076322	1076329	50 %	50 %	0 %	0 %	442804463
18110	NC_020134	GTG	3	9	1076335	1076343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804463
18111	NC_020134	CGGA	2	8	1076366	1076373	25 %	0 %	50 %	25 %	442804463
18112	NC_020134	GCA	2	6	1076434	1076439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804463
18113	NC_020134	CCG	2	6	1076467	1076472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804463
18114	NC_020134	AG	3	6	1076473	1076478	50 %	0 %	50 %	0 %	442804463
18115	NC_020134	TGC	2	6	1076493	1076498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804463
18116	NC_020134	GTC	2	6	1076601	1076606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804463
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18118	NC_020134	T	6	6	1076853	1076858	0 %	100 %	0 %	0 %	442804463
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18232	NC_020134	GTT	2	6	1084943	1084948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804470
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18236	NC_020134	TAAA	2	8	1085149	1085156	75 %	25 %	0 %	0 %	442804470
18237	NC_020134	TAT	2	6	1085264	1085269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804470
18238	NC_020134	AT	3	6	1085268	1085273	50 %	50 %	0 %	0 %	442804470
18239	NC_020134	TGC	2	6	1085276	1085281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804470
18240	NC_020134	GCT	2	6	1085313	1085318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804470
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18243	NC_020134	GCT	2	6	1085444	1085449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804470
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18335	NC_020134	A	6	6	1090206	1090211	100 %	0 %	0 %	0 %	442804473
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18342	NC_020134	T	6	6	1090449	1090454	0 %	100 %	0 %	0 %	442804473
18343	NC_020134	TAA	2	6	1090470	1090475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804473
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18346	NC_020134	ATA	2	6	1090625	1090630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804473
18347	NC_020134	T	6	6	1090699	1090704	0 %	100 %	0 %	0 %	442804473
18348	NC_020134	TTTC	2	8	1091077	1091084	0 %	75 %	0 %	25 %	442804474
18349	NC_020134	TGA	2	6	1091111	1091116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804474
18350	NC_020134	AT	3	6	1091135	1091140	50 %	50 %	0 %	0 %	442804474
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18471	NC_020134	GAG	2	6	1098335	1098340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804482
18472	NC_020134	AAC	2	6	1098403	1098408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442804482
18473	NC_020134	TAA	2	6	1098483	1098488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804482
18474	NC_020134	GAA	2	6	1098571	1098576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804482
18475	NC_020134	A	6	6	1098575	1098580	100 %	0 %	0 %	0 %	442804482
18476	NC_020134	AT	3	6	1098582	1098587	50 %	50 %	0 %	0 %	442804482
18477	NC_020134	GGA	2	6	1098588	1098593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804482
18478	NC_020134	T	7	7	1098595	1098601	0 %	100 %	0 %	0 %	442804482
18479	NC_020134	A	6	6	1098631	1098636	100 %	0 %	0 %	0 %	442804482
18480	NC_020134	ATT	2	6	1098692	1098697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804482
18481	NC_020134	ACAT	2	8	1098744	1098751	50 %	25 %	0 %	25 %	442804482
18482	NC_020134	CTG	2	6	1098759	1098764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804482
18483	NC_020134	CAA	2	6	1098772	1098777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442804482
18484	NC_020134	AAC	2	6	1098783	1098788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442804482
18485	NC_020134	TAT	2	6	1098875	1098880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804482
18486	NC_020134	CCT	2	6	1098887	1098892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442804482
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18488	NC_020134	CTT	2	6	1098978	1098983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804482
18489	NC_020134	TA	3	6	1099191	1099196	50 %	50 %	0 %	0 %	442804482
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18491	NC_020134	AGAA	2	8	1099260	1099267	75 %	0 %	25 %	0 %	442804482
18492	NC_020134	GA	3	6	1099288	1099293	50 %	0 %	50 %	0 %	442804482
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18494	NC_020134	A	6	6	1099375	1099380	100 %	0 %	0 %	0 %	442804482
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18498	NC_020134	ATG	2	6	1099673	1099678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804482
18499	NC_020134	AT	3	6	1099691	1099696	50 %	50 %	0 %	0 %	442804482
18500	NC_020134	TTG	2	6	1099851	1099856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804482

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