MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_020134	ACA	2	6	981621	981626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442804377
16502	NC_020134	TAAGGT	2	12	981628	981639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804377
16503	NC_020134	TTAC	2	8	981645	981652	25 %	50 %	0 %	25 %	442804377
16504	NC_020134	AAT	2	6	981721	981726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804377
16505	NC_020134	AGA	2	6	981727	981732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804377
16506	NC_020134	ATAA	2	8	981737	981744	75 %	25 %	0 %	0 %	442804377
16507	NC_020134	TAA	2	6	981746	981751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804377
16508	NC_020134	TAT	2	6	982005	982010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804378
16509	NC_020134	GAT	2	6	982013	982018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804378
16510	NC_020134	ATA	2	6	982209	982214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804379
16511	NC_020134	ATTG	2	8	982217	982224	25 %	50 %	25 %	0 %	442804379
16512	NC_020134	GAA	2	6	982328	982333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804379
16513	NC_020134	T	6	6	982363	982368	0 %	100 %	0 %	0 %	442804379
16514	NC_020134	CTG	2	6	982374	982379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804379
16515	NC_020134	AAT	2	6	982436	982441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804379
16516	NC_020134	GCA	2	6	982481	982486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804379
16517	NC_020134	ATA	2	6	982500	982505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804379
16518	NC_020134	TA	4	8	982522	982529	50 %	50 %	0 %	0 %	442804379
16519	NC_020134	GGC	2	6	982577	982582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804379
16520	NC_020134	TTGA	2	8	982611	982618	25 %	50 %	25 %	0 %	442804379
16521	NC_020134	TGGA	2	8	982752	982759	25 %	25 %	50 %	0 %	442804379
16522	NC_020134	A	6	6	982759	982764	100 %	0 %	0 %	0 %	442804379
16523	NC_020134	T	6	6	982788	982793	0 %	100 %	0 %	0 %	442804379
16524	NC_020134	GGAT	2	8	982803	982810	25 %	25 %	50 %	0 %	442804379
16525	NC_020134	TTGC	2	8	982893	982900	0 %	50 %	25 %	25 %	442804379
16526	NC_020134	TTG	2	6	982915	982920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804379
16527	NC_020134	CTG	2	6	983010	983015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804379
16528	NC_020134	CTT	2	6	983016	983021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804379
16529	NC_020134	TAT	2	6	983024	983029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804379
16530	NC_020134	ATC	2	6	983064	983069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804379
16531	NC_020134	CAG	2	6	983073	983078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804379
16532	NC_020134	ATT	2	6	983245	983250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804379
16533	NC_020134	AAGG	2	8	983315	983322	50 %	0 %	50 %	0 %	442804379
16534	NC_020134	A	6	6	983329	983334	100 %	0 %	0 %	0 %	442804379
16535	NC_020134	TCT	2	6	983395	983400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804380
16536	NC_020134	T	6	6	983503	983508	0 %	100 %	0 %	0 %	442804380
16537	NC_020134	T	7	7	983533	983539	0 %	100 %	0 %	0 %	442804380
16538	NC_020134	T	6	6	983546	983551	0 %	100 %	0 %	0 %	442804380
16539	NC_020134	TCA	2	6	983577	983582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804380
16540	NC_020134	CTT	2	6	983629	983634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804380
16541	NC_020134	T	6	6	983678	983683	0 %	100 %	0 %	0 %	442804380
16542	NC_020134	GC	3	6	983688	983693	0 %	0 %	50 %	50 %	442804380
16543	NC_020134	ATATC	2	10	983806	983815	40 %	40 %	0 %	20 %	442804380
16544	NC_020134	TAT	2	6	983836	983841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804380
16545	NC_020134	T	7	7	983843	983849	0 %	100 %	0 %	0 %	442804380
16546	NC_020134	TTTC	2	8	983874	983881	0 %	75 %	0 %	25 %	442804380
16547	NC_020134	T	6	6	983933	983938	0 %	100 %	0 %	0 %	442804380
16548	NC_020134	CTC	3	9	983939	983947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442804380
16549	NC_020134	AT	3	6	983985	983990	50 %	50 %	0 %	0 %	442804380
16550	NC_020134	TTCA	2	8	984017	984024	25 %	50 %	0 %	25 %	442804380
16551	NC_020134	T	7	7	984140	984146	0 %	100 %	0 %	0 %	442804381
16552	NC_020134	GCT	2	6	984204	984209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804381
16553	NC_020134	ATG	2	6	984261	984266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804381
16554	NC_020134	A	7	7	984325	984331	100 %	0 %	0 %	0 %	442804382
16555	NC_020134	A	6	6	984357	984362	100 %	0 %	0 %	0 %	442804382
16556	NC_020134	GAA	2	6	984417	984422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804382
16557	NC_020134	GCAAT	2	10	984427	984436	40 %	20 %	20 %	20 %	442804382
16558	NC_020134	TGCG	2	8	984471	984478	0 %	25 %	50 %	25 %	442804382
16559	NC_020134	TG	3	6	984537	984542	0 %	50 %	50 %	0 %	442804382
16560	NC_020134	CCG	2	6	984567	984572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804382
16561	NC_020134	GCA	2	6	984885	984890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804382
16562	NC_020134	G	6	6	984914	984919	0 %	0 %	100 %	0 %	442804382
16563	NC_020134	TCA	2	6	984987	984992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442804382
16564	NC_020134	GCG	2	6	985006	985011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804382
16565	NC_020134	AAACA	2	10	985024	985033	80 %	0 %	0 %	20 %	442804382
16566	NC_020134	TAA	2	6	985114	985119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804383
16567	NC_020134	TGA	2	6	985124	985129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804383
16568	NC_020134	TTGA	2	8	985132	985139	25 %	50 %	25 %	0 %	442804383
16569	NC_020134	GCAGA	2	10	985149	985158	40 %	0 %	40 %	20 %	442804383
16570	NC_020134	ATT	2	6	985183	985188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804383
16571	NC_020134	A	6	6	985291	985296	100 %	0 %	0 %	0 %	442804383
16572	NC_020134	CGC	2	6	985337	985342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442804383
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16575	NC_020134	CGGC	2	8	985391	985398	0 %	0 %	50 %	50 %	442804383
16576	NC_020134	TGC	2	6	985408	985413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804383
16577	NC_020134	GCTG	2	8	985435	985442	0 %	25 %	50 %	25 %	442804383
16578	NC_020134	GCA	2	6	985445	985450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804383
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16580	NC_020134	GAG	2	6	985465	985470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442804383
16581	NC_020134	TGC	2	6	985492	985497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804383
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16583	NC_020134	TTTG	2	8	985541	985548	0 %	75 %	25 %	0 %	442804383
16584	NC_020134	T	6	6	985613	985618	0 %	100 %	0 %	0 %	442804383
16585	NC_020134	TTAT	2	8	985652	985659	25 %	75 %	0 %	0 %	442804384
16586	NC_020134	TTG	2	6	985807	985812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804384
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16588	NC_020134	ATT	2	6	986002	986007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804384
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16593	NC_020134	CATG	2	8	986410	986417	25 %	25 %	25 %	25 %	442804385
16594	NC_020134	T	8	8	986594	986601	0 %	100 %	0 %	0 %	442804385
16595	NC_020134	AT	3	6	986838	986843	50 %	50 %	0 %	0 %	442804385
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16600	NC_020134	A	7	7	987175	987181	100 %	0 %	0 %	0 %	442804386
16601	NC_020134	GTTC	2	8	987244	987251	0 %	50 %	25 %	25 %	442804386
16602	NC_020134	TGTT	2	8	987474	987481	0 %	75 %	25 %	0 %	442804387
16603	NC_020134	AAT	2	6	987559	987564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442804387
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16606	NC_020134	GTA	2	6	987647	987652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804387
16607	NC_020134	TCGG	2	8	987975	987982	0 %	25 %	50 %	25 %	442804387
16608	NC_020134	ATT	2	6	988017	988022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804387
16609	NC_020134	AGC	2	6	988032	988037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804387
16610	NC_020134	CTG	2	6	988067	988072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442804387
16611	NC_020134	TTC	2	6	988073	988078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804387
16612	NC_020134	CAC	2	6	988137	988142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442804387
16613	NC_020134	GTT	2	6	988229	988234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804387
16614	NC_020134	TAT	2	6	988349	988354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804387
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16616	NC_020134	GTT	2	6	988421	988426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442804387
16617	NC_020134	TTCG	2	8	988432	988439	0 %	50 %	25 %	25 %	442804387
16618	NC_020134	T	6	6	988583	988588	0 %	100 %	0 %	0 %	442804387
16619	NC_020134	GTTT	2	8	988591	988598	0 %	75 %	25 %	0 %	442804387
16620	NC_020134	TTTTC	2	10	988616	988625	0 %	80 %	0 %	20 %	442804387
16621	NC_020134	CGTT	2	8	988780	988787	0 %	50 %	25 %	25 %	442804387
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16866	NC_020134	GAC	2	6	1002498	1002503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804403
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16972	NC_020134	GAA	2	6	1008545	1008550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804408
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16974	NC_020134	AT	3	6	1008566	1008571	50 %	50 %	0 %	0 %	442804408
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16978	NC_020134	TGG	2	6	1008803	1008808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442804408
16979	NC_020134	AG	4	8	1008816	1008823	50 %	0 %	50 %	0 %	442804408
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16981	NC_020134	ATT	2	6	1008899	1008904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804408
16982	NC_020134	CAA	2	6	1008940	1008945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442804408
16983	NC_020134	CATAAC	2	12	1009123	1009134	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	442804408
16984	NC_020134	CGG	2	6	1009159	1009164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804408
16985	NC_020134	TG	3	6	1009193	1009198	0 %	50 %	50 %	0 %	442804408
16986	NC_020134	CGG	2	6	1009273	1009278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442804408
16987	NC_020134	AGA	2	6	1009285	1009290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804408
16988	NC_020134	GAA	2	6	1009315	1009320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442804408
16989	NC_020134	TAT	2	6	1009349	1009354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442804408
16990	NC_020134	AT	3	6	1009452	1009457	50 %	50 %	0 %	0 %	442804408
16991	NC_020134	TCT	2	6	1009488	1009493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442804408
16992	NC_020134	ATG	2	6	1009533	1009538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442804408
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16997	NC_020134	ACG	2	6	1010271	1010276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442804409
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16999	NC_020134	AT	4	8	1010298	1010305	50 %	50 %	0 %	0 %	442804409
17000	NC_020134	A	9	9	1010346	1010354	100 %	0 %	0 %	0 %	442804409

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