MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 chromosome

Total Repeats: 76150

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019776	CAG	2	6	1158	1163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428768416
2	NC_019776	AAC	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768416
3	NC_019776	AATCT	2	10	1284	1293	40 %	40 %	0 %	20 %	428768416
4	NC_019776	CAA	2	6	1343	1348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768416
5	NC_019776	AATA	2	8	1481	1488	75 %	25 %	0 %	0 %	428768416
6	NC_019776	TGT	2	6	1504	1509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428768416
7	NC_019776	AC	3	6	1570	1575	50 %	0 %	0 %	50 %	428768416
8	NC_019776	TAC	2	6	1688	1693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768416
9	NC_019776	ATT	2	6	1712	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428768416
10	NC_019776	GAA	2	6	1721	1726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768416
11	NC_019776	CAAC	2	8	1733	1740	50 %	0 %	0 %	50 %	428768416
12	NC_019776	TTAA	2	8	1773	1780	50 %	50 %	0 %	0 %	428768416
13	NC_019776	ATT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428768417
14	NC_019776	TAA	2	6	2043	2048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768417
15	NC_019776	TAT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428768417
16	NC_019776	ATA	2	6	2156	2161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768417
17	NC_019776	ATA	2	6	2172	2177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768417
18	NC_019776	GAA	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768417
19	NC_019776	AAT	2	6	2289	2294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768417
20	NC_019776	ACTG	2	8	2300	2307	25 %	25 %	25 %	25 %	428768417
21	NC_019776	GAA	2	6	2308	2313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768417
22	NC_019776	A	6	6	2312	2317	100 %	0 %	0 %	0 %	428768417
23	NC_019776	T	7	7	2333	2339	0 %	100 %	0 %	0 %	428768417
24	NC_019776	ATT	2	6	2359	2364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428768417
25	NC_019776	GTA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428768417
26	NC_019776	ATTA	2	8	2419	2426	50 %	50 %	0 %	0 %	428768417
27	NC_019776	GTTA	2	8	2455	2462	25 %	50 %	25 %	0 %	428768417
28	NC_019776	CTT	2	6	2478	2483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768417
29	NC_019776	AAT	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768417
30	NC_019776	TCA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768417
31	NC_019776	T	6	6	2574	2579	0 %	100 %	0 %	0 %	428768417
32	NC_019776	CAG	2	6	2583	2588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428768417
33	NC_019776	CTT	2	6	2625	2630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768417
34	NC_019776	T	7	7	2647	2653	0 %	100 %	0 %	0 %	428768417
35	NC_019776	AAAT	2	8	2659	2666	75 %	25 %	0 %	0 %	428768417
36	NC_019776	T	6	6	2702	2707	0 %	100 %	0 %	0 %	428768417
37	NC_019776	AAT	2	6	2708	2713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768417
38	NC_019776	ATC	2	6	2806	2811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768417
39	NC_019776	ATC	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768417
40	NC_019776	T	7	7	2848	2854	0 %	100 %	0 %	0 %	428768417
41	NC_019776	AAT	2	6	2881	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768417
42	NC_019776	CTT	2	6	2964	2969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768417
43	NC_019776	ACA	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768417
44	NC_019776	GAT	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428768417
45	NC_019776	CAAAA	2	10	3097	3106	80 %	0 %	0 %	20 %	428768417
46	NC_019776	TAA	2	6	3136	3141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768417
47	NC_019776	CAC	2	6	3156	3161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428768417
48	NC_019776	TAA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768417
49	NC_019776	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	428768417
50	NC_019776	TCT	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
51	NC_019776	CTT	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
52	NC_019776	T	6	6	3502	3507	0 %	100 %	0 %	0 %	428768418
53	NC_019776	T	6	6	3525	3530	0 %	100 %	0 %	0 %	428768418
54	NC_019776	TTC	2	6	3541	3546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
55	NC_019776	TTC	2	6	3553	3558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
56	NC_019776	ATA	2	6	3597	3602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768418
57	NC_019776	TCT	2	6	3604	3609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
58	NC_019776	TTC	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
59	NC_019776	CTT	3	9	3618	3626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
60	NC_019776	T	6	6	3625	3630	0 %	100 %	0 %	0 %	428768418
61	NC_019776	CTT	2	6	3642	3647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
62	NC_019776	T	6	6	3666	3671	0 %	100 %	0 %	0 %	428768418
63	NC_019776	GTA	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428768418
64	NC_019776	TTG	2	6	3697	3702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428768418
65	NC_019776	T	8	8	3730	3737	0 %	100 %	0 %	0 %	428768418
66	NC_019776	ATA	2	6	3827	3832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768418
67	NC_019776	TCT	2	6	3836	3841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
68	NC_019776	CGC	2	6	3877	3882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428768418
69	NC_019776	AAG	2	6	3906	3911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768418
70	NC_019776	TTC	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
71	NC_019776	AAC	2	6	3928	3933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768418
72	NC_019776	AATT	2	8	3948	3955	50 %	50 %	0 %	0 %	428768418
73	NC_019776	ATT	2	6	4024	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428768418
74	NC_019776	CCG	2	6	4086	4091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428768418
75	NC_019776	CTT	2	6	4100	4105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
76	NC_019776	T	6	6	4104	4109	0 %	100 %	0 %	0 %	428768418
77	NC_019776	ATA	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768418
78	NC_019776	T	7	7	4159	4165	0 %	100 %	0 %	0 %	428768418
79	NC_019776	AT	3	6	4172	4177	50 %	50 %	0 %	0 %	428768418
80	NC_019776	TCA	2	6	4211	4216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768418
81	NC_019776	AAT	2	6	4249	4254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768418
82	NC_019776	AATTT	2	10	4263	4272	40 %	60 %	0 %	0 %	428768418
83	NC_019776	GAAA	2	8	4355	4362	75 %	0 %	25 %	0 %	428768418
84	NC_019776	CTA	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768418
85	NC_019776	AAC	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768418
86	NC_019776	TAA	2	6	4416	4421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768418
87	NC_019776	TATGAT	2	12	4452	4463	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768418
88	NC_019776	ATAA	2	8	4468	4475	75 %	25 %	0 %	0 %	428768418
89	NC_019776	T	6	6	4574	4579	0 %	100 %	0 %	0 %	428768418
90	NC_019776	AAT	2	6	4594	4599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768418
91	NC_019776	TCC	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428768418
92	NC_019776	AGG	2	6	4744	4749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428768418
93	NC_019776	AAT	2	6	4834	4839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768418
94	NC_019776	TGA	2	6	4953	4958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428768418
95	NC_019776	CTAACC	2	12	5037	5048	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428768418
96	NC_019776	TTC	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
97	NC_019776	TAA	2	6	5127	5132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768418
98	NC_019776	TCT	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
99	NC_019776	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428768418
100	NC_019776	T	6	6	5177	5182	0 %	100 %	0 %	0 %	428768418
101	NC_019776	A	9	9	5197	5205	100 %	0 %	0 %	0 %	428768418
102	NC_019776	TTC	3	9	5215	5223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768418
103	NC_019776	AAT	2	6	5237	5242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768418
104	NC_019776	ATTA	2	8	5257	5264	50 %	50 %	0 %	0 %	428768418
105	NC_019776	TCA	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768418
106	NC_019776	GAG	2	6	5379	5384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428768418
107	NC_019776	A	6	6	5444	5449	100 %	0 %	0 %	0 %	428768418
108	NC_019776	A	6	6	5455	5460	100 %	0 %	0 %	0 %	428768418
109	NC_019776	GAA	2	6	5472	5477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768418
110	NC_019776	AGA	2	6	5578	5583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768418
111	NC_019776	CTGA	2	8	5622	5629	25 %	25 %	25 %	25 %	428768418
112	NC_019776	GAG	2	6	5661	5666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428768418
113	NC_019776	TTG	2	6	5716	5721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428768418
114	NC_019776	GCGAT	2	10	5783	5792	20 %	20 %	40 %	20 %	428768418
115	NC_019776	TAAA	2	8	5821	5828	75 %	25 %	0 %	0 %	428768418
116	NC_019776	TAATT	2	10	5880	5889	40 %	60 %	0 %	0 %	428768418
117	NC_019776	GTTTCC	2	12	6190	6201	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428768419
118	NC_019776	GTT	2	6	6202	6207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428768419
119	NC_019776	CAA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768419
120	NC_019776	GCC	2	6	6316	6321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428768419
121	NC_019776	ACCTC	2	10	6346	6355	20 %	20 %	0 %	60 %	428768419
122	NC_019776	CCA	2	6	6443	6448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428768419
123	NC_019776	AAGA	2	8	6454	6461	75 %	0 %	25 %	0 %	428768419
124	NC_019776	AAT	2	6	6465	6470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768419
125	NC_019776	CAG	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428768419
126	NC_019776	ACAA	2	8	6534	6541	75 %	0 %	0 %	25 %	428768419
127	NC_019776	AAT	2	6	6573	6578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768419
128	NC_019776	TTC	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768419
129	NC_019776	TTCTT	2	10	6591	6600	0 %	80 %	0 %	20 %	428768419
130	NC_019776	TCTCTG	2	12	6602	6613	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428768419
131	NC_019776	CGC	2	6	6627	6632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428768419
132	NC_019776	AT	3	6	6673	6678	50 %	50 %	0 %	0 %	428768419
133	NC_019776	CTC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428768419
134	NC_019776	CTA	2	6	6749	6754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768419
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136	NC_019776	AAT	2	6	6885	6890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768419
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