MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 109689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019757	CAC	2	6	253331	253336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402412
4002	NC_019757	TTTTTC	2	12	253371	253382	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434402412
4003	NC_019757	AAC	2	6	253437	253442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402412
4004	NC_019757	CCA	2	6	253456	253461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402412
4005	NC_019757	AAG	2	6	253501	253506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402412
4006	NC_019757	TGG	2	6	253541	253546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402412
4007	NC_019757	GCC	2	6	253551	253556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402412
4008	NC_019757	ATCA	2	8	253596	253603	50 %	25 %	0 %	25 %	434402412
4009	NC_019757	CTG	2	6	253679	253684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402412
4010	NC_019757	CTT	2	6	253853	253858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402412
4011	NC_019757	A	6	6	253875	253880	100 %	0 %	0 %	0 %	434402412
4012	NC_019757	ATT	2	6	253987	253992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402414
4013	NC_019757	CTT	2	6	254008	254013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402414
4014	NC_019757	ACG	2	6	254088	254093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402414
4015	NC_019757	TG	3	6	254098	254103	0 %	50 %	50 %	0 %	434402414
4016	NC_019757	GCG	2	6	254114	254119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402414
4017	NC_019757	TTTGGA	2	12	254129	254140	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434402414
4018	NC_019757	TCT	2	6	254146	254151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402414
4019	NC_019757	GAG	3	9	254347	254355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402415
4020	NC_019757	TTG	2	6	254356	254361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402415
4021	NC_019757	TTGA	2	8	254405	254412	25 %	50 %	25 %	0 %	434402415
4022	NC_019757	AAGT	2	8	254460	254467	50 %	25 %	25 %	0 %	434402415
4023	NC_019757	ATT	2	6	254565	254570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402415
4024	NC_019757	AGC	2	6	254612	254617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402415
4025	NC_019757	AGC	2	6	254624	254629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402415
4026	NC_019757	G	6	6	254722	254727	0 %	0 %	100 %	0 %	434402415
4027	NC_019757	TAA	2	6	254815	254820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402415
4028	NC_019757	GAT	2	6	254831	254836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402415
4029	NC_019757	TGA	2	6	254837	254842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402415
4030	NC_019757	TGGT	2	8	254843	254850	0 %	50 %	50 %	0 %	434402415
4031	NC_019757	ATCA	2	8	255213	255220	50 %	25 %	0 %	25 %	434402416
4032	NC_019757	T	6	6	255299	255304	0 %	100 %	0 %	0 %	434402416
4033	NC_019757	CTGC	2	8	255314	255321	0 %	25 %	25 %	50 %	434402416
4034	NC_019757	CCG	2	6	255339	255344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402416
4035	NC_019757	ATC	2	6	255356	255361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402416
4036	NC_019757	CTA	2	6	255367	255372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402416
4037	NC_019757	GGA	2	6	255395	255400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402416
4038	NC_019757	GCA	2	6	255405	255410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
4039	NC_019757	ACC	2	6	255430	255435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402416
4040	NC_019757	TTC	2	6	255444	255449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402416
4041	NC_019757	GAA	2	6	255660	255665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
4042	NC_019757	GGC	2	6	255674	255679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402416
4043	NC_019757	ATT	2	6	255681	255686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402416
4044	NC_019757	CAG	2	6	255745	255750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
4045	NC_019757	GCA	2	6	255781	255786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
4046	NC_019757	TGG	2	6	255910	255915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402416
4047	NC_019757	TTAT	2	8	255946	255953	25 %	75 %	0 %	0 %	434402416
4048	NC_019757	AGA	2	6	255956	255961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
4049	NC_019757	C	7	7	255987	255993	0 %	0 %	0 %	100 %	434402416
4050	NC_019757	TGG	2	6	256035	256040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402416
4051	NC_019757	ACT	2	6	256062	256067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402416
4052	NC_019757	AAG	2	6	256092	256097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
4053	NC_019757	AAG	2	6	256108	256113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
4054	NC_019757	CTC	2	6	256217	256222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402416
4055	NC_019757	GTG	2	6	256297	256302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402416
4056	NC_019757	GCA	2	6	256303	256308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
4057	NC_019757	TGG	2	6	256309	256314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402416
4058	NC_019757	TAG	2	6	256315	256320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402416
4059	NC_019757	ACG	2	6	256395	256400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
4060	NC_019757	AGCG	2	8	256407	256414	25 %	0 %	50 %	25 %	434402416
4061	NC_019757	ACTC	2	8	256440	256447	25 %	25 %	0 %	50 %	434402416
4062	NC_019757	ACC	2	6	256458	256463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402416
4063	NC_019757	A	6	6	256478	256483	100 %	0 %	0 %	0 %	434402416
4064	NC_019757	CGA	2	6	256514	256519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
4065	NC_019757	CAAA	2	8	256568	256575	75 %	0 %	0 %	25 %	434402416
4066	NC_019757	AGA	2	6	256615	256620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
4067	NC_019757	ACAA	2	8	256642	256649	75 %	0 %	0 %	25 %	434402416
4068	NC_019757	GAT	2	6	256679	256684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402416
4069	NC_019757	GCC	2	6	256737	256742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402416
4070	NC_019757	CAAGCA	2	12	256779	256790	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434402416
4071	NC_019757	GGC	2	6	256804	256809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402416
4072	NC_019757	CAA	2	6	256832	256837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402416
4073	NC_019757	AGC	2	6	256850	256855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
4074	NC_019757	CTAC	2	8	256885	256892	25 %	25 %	0 %	50 %	434402416
4075	NC_019757	A	6	6	256914	256919	100 %	0 %	0 %	0 %	434402416
4076	NC_019757	ACC	2	6	256922	256927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402416
4077	NC_019757	TGC	2	6	256946	256951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402416
4078	NC_019757	A	6	6	256978	256983	100 %	0 %	0 %	0 %	434402416
4079	NC_019757	CGC	2	6	257006	257011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402416
4080	NC_019757	GCT	2	6	257043	257048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402416
4081	NC_019757	CGC	2	6	257245	257250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402417
4082	NC_019757	CTA	2	6	257290	257295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402417
4083	NC_019757	CTT	2	6	257296	257301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402417
4084	NC_019757	ATC	2	6	257394	257399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402417
4085	NC_019757	TTG	2	6	257417	257422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402417
4086	NC_019757	GACT	2	8	258076	258083	25 %	25 %	25 %	25 %	434402418
4087	NC_019757	CTA	2	6	258133	258138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402418
4088	NC_019757	TGAT	2	8	258205	258212	25 %	50 %	25 %	0 %	434402418
4089	NC_019757	ATG	2	6	258240	258245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402418
4090	NC_019757	T	6	6	258276	258281	0 %	100 %	0 %	0 %	434402418
4091	NC_019757	ATTG	2	8	258332	258339	25 %	50 %	25 %	0 %	434402418
4092	NC_019757	CT	3	6	258363	258368	0 %	50 %	0 %	50 %	434402418
4093	NC_019757	T	6	6	258372	258377	0 %	100 %	0 %	0 %	434402418
4094	NC_019757	T	6	6	258563	258568	0 %	100 %	0 %	0 %	434402418
4095	NC_019757	CTCAA	2	10	258647	258656	40 %	20 %	0 %	40 %	434402418
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4097	NC_019757	CT	3	6	258726	258731	0 %	50 %	0 %	50 %	434402418
4098	NC_019757	TAA	2	6	258782	258787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402418
4099	NC_019757	TGC	2	6	258860	258865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402418
4100	NC_019757	TTG	2	6	258870	258875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402418
4101	NC_019757	CTG	2	6	258930	258935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402418
4102	NC_019757	CA	3	6	258971	258976	50 %	0 %	0 %	50 %	434402418
4103	NC_019757	ATCTA	2	10	259052	259061	40 %	40 %	0 %	20 %	434402418
4104	NC_019757	TGC	2	6	259087	259092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402418
4105	NC_019757	TTG	2	6	259195	259200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402418
4106	NC_019757	GCG	2	6	259206	259211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402418
4107	NC_019757	TC	3	6	259547	259552	0 %	50 %	0 %	50 %	434402419
4108	NC_019757	GCA	2	6	259562	259567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402419
4109	NC_019757	TCT	2	6	259583	259588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402419
4110	NC_019757	CTT	2	6	259634	259639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402419
4111	NC_019757	AGC	2	6	259819	259824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402420
4112	NC_019757	GGT	2	6	259865	259870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402420
4113	NC_019757	CAA	2	6	259888	259893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402420
4114	NC_019757	GTTG	2	8	259901	259908	0 %	50 %	50 %	0 %	434402420
4115	NC_019757	TTGC	2	8	259956	259963	0 %	50 %	25 %	25 %	434402420
4116	NC_019757	CTG	2	6	259983	259988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402420
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4118	NC_019757	TGT	2	6	260048	260053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402420
4119	NC_019757	CAAT	2	8	260138	260145	50 %	25 %	0 %	25 %	434402420
4120	NC_019757	CGC	2	6	260146	260151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402420
4121	NC_019757	GTA	2	6	260228	260233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402420
4122	NC_019757	CCA	2	6	260235	260240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402420
4123	NC_019757	CAA	2	6	260265	260270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402420
4124	NC_019757	CGG	2	6	260331	260336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402420
4125	NC_019757	ATC	2	6	260429	260434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402420
4126	NC_019757	TCT	2	6	260444	260449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402420
4127	NC_019757	ACT	2	6	260495	260500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402420
4128	NC_019757	ATC	2	6	260513	260518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402420
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4133	NC_019757	CGAC	2	8	260792	260799	25 %	0 %	25 %	50 %	434402420
4134	NC_019757	AACA	2	8	260878	260885	75 %	0 %	0 %	25 %	434402420
4135	NC_019757	GA	3	6	260901	260906	50 %	0 %	50 %	0 %	434402420
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4139	NC_019757	AT	3	6	261152	261157	50 %	50 %	0 %	0 %	434402420
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4142	NC_019757	CATTGC	2	12	261259	261270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434402420
4143	NC_019757	GAT	2	6	261469	261474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402420
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4148	NC_019757	AACC	2	8	261935	261942	50 %	0 %	0 %	50 %	434402421
4149	NC_019757	ATC	2	6	262075	262080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402421
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4152	NC_019757	CAA	2	6	262253	262258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402421
4153	NC_019757	ACA	3	9	262331	262339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402421
4154	NC_019757	TGT	2	6	262406	262411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402421
4155	NC_019757	AAC	2	6	262419	262424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402421
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4158	NC_019757	ACAA	2	8	262549	262556	75 %	0 %	0 %	25 %	434402421
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4161	NC_019757	CCA	2	6	262610	262615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402421
4162	NC_019757	CTAG	2	8	262633	262640	25 %	25 %	25 %	25 %	434402421
4163	NC_019757	TGC	2	6	262644	262649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402421
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4166	NC_019757	T	7	7	262950	262956	0 %	100 %	0 %	0 %	434402422
4167	NC_019757	GA	3	6	263047	263052	50 %	0 %	50 %	0 %	434402422
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4230	NC_019757	AG	3	6	267581	267586	50 %	0 %	50 %	0 %	434402425
4231	NC_019757	CT	3	6	267780	267785	0 %	50 %	0 %	50 %	434402425
4232	NC_019757	TGC	2	6	267888	267893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402425
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4241	NC_019757	GCT	2	6	268417	268422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402425
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