MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 109689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019757	GCA	2	6	221770	221775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402378
3502	NC_019757	AGC	2	6	221783	221788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402378
3503	NC_019757	ACT	2	6	222288	222293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402379
3504	NC_019757	AGG	2	6	222323	222328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402379
3505	NC_019757	CGA	2	6	222412	222417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402379
3506	NC_019757	ATT	2	6	222476	222481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402379
3507	NC_019757	CAG	2	6	222634	222639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402379
3508	NC_019757	TCG	2	6	222652	222657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402379
3509	NC_019757	GCC	2	6	222669	222674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402379
3510	NC_019757	TGT	2	6	222686	222691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402379
3511	NC_019757	GCC	2	6	222705	222710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402379
3512	NC_019757	TGT	2	6	222722	222727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402379
3513	NC_019757	TGG	2	6	222809	222814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402379
3514	NC_019757	TGC	4	12	222851	222862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402379
3515	NC_019757	CAG	3	9	222880	222888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402379
3516	NC_019757	AAC	2	6	223017	223022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402379
3517	NC_019757	G	6	6	223049	223054	0 %	0 %	100 %	0 %	434402379
3518	NC_019757	A	6	6	223244	223249	100 %	0 %	0 %	0 %	434402379
3519	NC_019757	CCT	2	6	223257	223262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402379
3520	NC_019757	AGC	2	6	223377	223382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402379
3521	NC_019757	ATTC	2	8	223415	223422	25 %	50 %	0 %	25 %	434402379
3522	NC_019757	TAA	2	6	223495	223500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402380
3523	NC_019757	TCA	2	6	223526	223531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402380
3524	NC_019757	TTCTG	2	10	223622	223631	0 %	60 %	20 %	20 %	434402380
3525	NC_019757	TTG	2	6	223654	223659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402380
3526	NC_019757	AT	3	6	223660	223665	50 %	50 %	0 %	0 %	434402380
3527	NC_019757	TAG	2	6	223669	223674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402380
3528	NC_019757	CCG	2	6	223696	223701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402380
3529	NC_019757	AGCA	2	8	223710	223717	50 %	0 %	25 %	25 %	434402380
3530	NC_019757	GCG	2	6	223756	223761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402380
3531	NC_019757	TAA	2	6	223821	223826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402380
3532	NC_019757	TTTC	2	8	223827	223834	0 %	75 %	0 %	25 %	434402380
3533	NC_019757	ACC	2	6	223873	223878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402380
3534	NC_019757	ATC	2	6	223982	223987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402380
3535	NC_019757	CATT	2	8	224037	224044	25 %	50 %	0 %	25 %	434402380
3536	NC_019757	ACC	2	6	224527	224532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402381
3537	NC_019757	GT	3	6	224586	224591	0 %	50 %	50 %	0 %	434402381
3538	NC_019757	CAG	3	9	224714	224722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402381
3539	NC_019757	ACAG	2	8	224755	224762	50 %	0 %	25 %	25 %	434402381
3540	NC_019757	GAT	2	6	224815	224820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402381
3541	NC_019757	AGA	2	6	224867	224872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402381
3542	NC_019757	TAT	2	6	224901	224906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402381
3543	NC_019757	TC	3	6	224957	224962	0 %	50 %	0 %	50 %	434402381
3544	NC_019757	AAAC	2	8	225110	225117	75 %	0 %	0 %	25 %	434402382
3545	NC_019757	TGT	2	6	225197	225202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402382
3546	NC_019757	TAT	2	6	225225	225230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402382
3547	NC_019757	GA	3	6	225289	225294	50 %	0 %	50 %	0 %	434402382
3548	NC_019757	AGC	2	6	225308	225313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402382
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3550	NC_019757	GCT	2	6	225514	225519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402382
3551	NC_019757	TCAA	2	8	225521	225528	50 %	25 %	0 %	25 %	434402382
3552	NC_019757	TCA	2	6	225590	225595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402382
3553	NC_019757	GTG	2	6	225932	225937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402382
3554	NC_019757	CATT	2	8	225938	225945	25 %	50 %	0 %	25 %	434402382
3555	NC_019757	GTGCT	2	10	226043	226052	0 %	40 %	40 %	20 %	434402382
3556	NC_019757	TGC	2	6	226082	226087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402382
3557	NC_019757	GCT	2	6	226093	226098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402382
3558	NC_019757	AGA	2	6	226116	226121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402382
3559	NC_019757	TGT	2	6	226144	226149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402383
3560	NC_019757	TAT	2	6	226158	226163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402383
3561	NC_019757	ATG	2	6	226252	226257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402383
3562	NC_019757	GCA	2	6	226412	226417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402383
3563	NC_019757	TCA	2	6	226487	226492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402384
3564	NC_019757	TA	3	6	226539	226544	50 %	50 %	0 %	0 %	434402384
3565	NC_019757	TGT	2	6	226553	226558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402384
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3568	NC_019757	TTTAA	2	10	226610	226619	40 %	60 %	0 %	0 %	434402384
3569	NC_019757	TTTTCA	2	12	226634	226645	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434402384
3570	NC_019757	AGA	2	6	226651	226656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402384
3571	NC_019757	ACA	2	6	226742	226747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402384
3572	NC_019757	CATTAT	2	12	226758	226769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434402384
3573	NC_019757	TGA	2	6	226865	226870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402384
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3575	NC_019757	CGG	2	6	226953	226958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402384
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3577	NC_019757	AT	3	6	227052	227057	50 %	50 %	0 %	0 %	434402385
3578	NC_019757	TTTTCT	2	12	227086	227097	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434402385
3579	NC_019757	CTTT	2	8	227107	227114	0 %	75 %	0 %	25 %	434402385
3580	NC_019757	TAG	2	6	227241	227246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402385
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3585	NC_019757	TTG	2	6	227411	227416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402386
3586	NC_019757	TAA	2	6	227418	227423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402386
3587	NC_019757	GCAA	2	8	227431	227438	50 %	0 %	25 %	25 %	434402386
3588	NC_019757	GA	3	6	227499	227504	50 %	0 %	50 %	0 %	434402386
3589	NC_019757	AAC	2	6	227505	227510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402386
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3591	NC_019757	TCT	2	6	227852	227857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402387
3592	NC_019757	TTCC	2	8	227862	227869	0 %	50 %	0 %	50 %	434402387
3593	NC_019757	GTT	2	6	227901	227906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402387
3594	NC_019757	TGG	2	6	227928	227933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402387
3595	NC_019757	GTATCG	2	12	227954	227965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434402387
3596	NC_019757	G	7	7	227993	227999	0 %	0 %	100 %	0 %	434402387
3597	NC_019757	ATC	2	6	228085	228090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402387
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3599	NC_019757	T	6	6	228206	228211	0 %	100 %	0 %	0 %	434402387
3600	NC_019757	GCA	2	6	228260	228265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402387
3601	NC_019757	CGC	2	6	228329	228334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402387
3602	NC_019757	TA	3	6	228354	228359	50 %	50 %	0 %	0 %	434402387
3603	NC_019757	AGG	2	6	228450	228455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402387
3604	NC_019757	AACT	2	8	228478	228485	50 %	25 %	0 %	25 %	434402387
3605	NC_019757	AAT	2	6	228520	228525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402387
3606	NC_019757	CTT	2	6	228723	228728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402387
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3608	NC_019757	TG	3	6	228834	228839	0 %	50 %	50 %	0 %	434402387
3609	NC_019757	TCT	2	6	229103	229108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402387
3610	NC_019757	CTT	2	6	229140	229145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402387
3611	NC_019757	ATC	2	6	229192	229197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402387
3612	NC_019757	GAAT	2	8	229208	229215	50 %	25 %	25 %	0 %	434402387
3613	NC_019757	GTG	2	6	229426	229431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402388
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3617	NC_019757	C	6	6	229768	229773	0 %	0 %	0 %	100 %	434402388
3618	NC_019757	ACCC	2	8	229798	229805	25 %	0 %	0 %	75 %	434402388
3619	NC_019757	CAA	2	6	229880	229885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402388
3620	NC_019757	CAATT	2	10	229920	229929	40 %	40 %	0 %	20 %	434402388
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3989	NC_019757	A	6	6	252726	252731	100 %	0 %	0 %	0 %	434402411
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3991	NC_019757	T	6	6	252784	252789	0 %	100 %	0 %	0 %	434402411
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