MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 109689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_019757	GAC	2	6	1035261	1035266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434403009
16003	NC_019757	AATA	2	8	1035288	1035295	75 %	25 %	0 %	0 %	434403009
16004	NC_019757	GAA	2	6	1035387	1035392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434403009
16005	NC_019757	AGTT	2	8	1035484	1035491	25 %	50 %	25 %	0 %	434403009
16006	NC_019757	CAG	2	6	1035567	1035572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434403009
16007	NC_019757	T	8	8	1035579	1035586	0 %	100 %	0 %	0 %	434403009
16008	NC_019757	CTAT	2	8	1035626	1035633	25 %	50 %	0 %	25 %	434403009
16009	NC_019757	G	6	6	1035671	1035676	0 %	0 %	100 %	0 %	434403009
16010	NC_019757	GC	3	6	1035690	1035695	0 %	0 %	50 %	50 %	434403009
16011	NC_019757	CTG	2	6	1035722	1035727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403009
16012	NC_019757	ACT	2	6	1035729	1035734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434403009
16013	NC_019757	TTG	2	6	1035753	1035758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434403009
16014	NC_019757	ACA	2	6	1035767	1035772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434403009
16015	NC_019757	A	7	7	1035797	1035803	100 %	0 %	0 %	0 %	434403009
16016	NC_019757	TGC	2	6	1035950	1035955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403010
16017	NC_019757	TGC	2	6	1036006	1036011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403010
16018	NC_019757	TTTC	2	8	1036012	1036019	0 %	75 %	0 %	25 %	434403010
16019	NC_019757	AGG	2	6	1036039	1036044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434403010
16020	NC_019757	TGC	2	6	1036184	1036189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403010
16021	NC_019757	CCG	2	6	1036294	1036299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434403010
16022	NC_019757	ACTA	2	8	1036438	1036445	50 %	25 %	0 %	25 %	434403010
16023	NC_019757	GCG	2	6	1036519	1036524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434403010
16024	NC_019757	CAT	3	9	1036537	1036545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434403010
16025	NC_019757	AGCC	2	8	1036561	1036568	25 %	0 %	25 %	50 %	434403010
16026	NC_019757	C	6	6	1036567	1036572	0 %	0 %	0 %	100 %	434403010
16027	NC_019757	TGAA	2	8	1036682	1036689	50 %	25 %	25 %	0 %	434403010
16028	NC_019757	ACT	2	6	1037125	1037130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434403011
16029	NC_019757	GGT	2	6	1037171	1037176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434403011
16030	NC_019757	AT	3	6	1037389	1037394	50 %	50 %	0 %	0 %	434403011
16031	NC_019757	AGA	2	6	1037443	1037448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434403011
16032	NC_019757	CCA	2	6	1037497	1037502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434403011
16033	NC_019757	AAT	2	6	1037534	1037539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434403011
16034	NC_019757	GGA	2	6	1037553	1037558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434403011
16035	NC_019757	AAG	2	6	1037562	1037567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434403011
16036	NC_019757	TA	3	6	1037724	1037729	50 %	50 %	0 %	0 %	434403011
16037	NC_019757	ACC	2	6	1037788	1037793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434403011
16038	NC_019757	AAAT	2	8	1037794	1037801	75 %	25 %	0 %	0 %	434403011
16039	NC_019757	ATG	2	6	1037829	1037834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434403011
16040	NC_019757	GGA	2	6	1037998	1038003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434403011
16041	NC_019757	TGA	2	6	1038076	1038081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434403011
16042	NC_019757	AGA	2	6	1038142	1038147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434403011
16043	NC_019757	AG	3	6	1038266	1038271	50 %	0 %	50 %	0 %	434403011
16044	NC_019757	ATA	2	6	1038324	1038329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434403011
16045	NC_019757	TAC	2	6	1038338	1038343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434403011
16046	NC_019757	CTTCAC	2	12	1038550	1038561	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	434403012
16047	NC_019757	AG	4	8	1038577	1038584	50 %	0 %	50 %	0 %	434403012
16048	NC_019757	AGC	2	6	1038629	1038634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434403012
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16050	NC_019757	ATC	2	6	1038874	1038879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434403012
16051	NC_019757	AT	3	6	1038905	1038910	50 %	50 %	0 %	0 %	434403012
16052	NC_019757	AGT	2	6	1038960	1038965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434403012
16053	NC_019757	CACC	2	8	1039068	1039075	25 %	0 %	0 %	75 %	434403012
16054	NC_019757	TC	3	6	1039132	1039137	0 %	50 %	0 %	50 %	434403012
16055	NC_019757	ACG	2	6	1039170	1039175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434403012
16056	NC_019757	TGAT	2	8	1039238	1039245	25 %	50 %	25 %	0 %	434403012
16057	NC_019757	TGC	2	6	1039256	1039261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403012
16058	NC_019757	GCA	2	6	1039283	1039288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434403012
16059	NC_019757	CGC	2	6	1039301	1039306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434403012
16060	NC_019757	AT	3	6	1039334	1039339	50 %	50 %	0 %	0 %	434403012
16061	NC_019757	ACCAA	2	10	1039346	1039355	60 %	0 %	0 %	40 %	434403012
16062	NC_019757	TGC	2	6	1039388	1039393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403012
16063	NC_019757	T	6	6	1039456	1039461	0 %	100 %	0 %	0 %	434403012
16064	NC_019757	TCAA	2	8	1039493	1039500	50 %	25 %	0 %	25 %	434403012
16065	NC_019757	GAGG	2	8	1039591	1039598	25 %	0 %	75 %	0 %	434403012
16066	NC_019757	TGA	2	6	1039657	1039662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434403012
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16070	NC_019757	GCA	3	9	1039728	1039736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434403012
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16072	NC_019757	GTTC	2	8	1039779	1039786	0 %	50 %	25 %	25 %	434403012
16073	NC_019757	TTCA	2	8	1039825	1039832	25 %	50 %	0 %	25 %	434403012
16074	NC_019757	ACCA	2	8	1039888	1039895	50 %	0 %	0 %	50 %	434403012
16075	NC_019757	CTGG	2	8	1040059	1040066	0 %	25 %	50 %	25 %	434403013
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16085	NC_019757	GCGA	2	8	1040853	1040860	25 %	0 %	50 %	25 %	434403013
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16091	NC_019757	CTT	2	6	1041373	1041378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434403014
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16095	NC_019757	AT	3	6	1041650	1041655	50 %	50 %	0 %	0 %	434403014
16096	NC_019757	TCA	2	6	1041679	1041684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434403014
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16102	NC_019757	CGT	2	6	1041981	1041986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403014
16103	NC_019757	GCT	2	6	1042002	1042007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403014
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16105	NC_019757	CTG	2	6	1042068	1042073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403014
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16107	NC_019757	GACT	2	8	1042108	1042115	25 %	25 %	25 %	25 %	434403014
16108	NC_019757	GCT	2	6	1042242	1042247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403014
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16112	NC_019757	GTC	2	6	1042423	1042428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434403014
16113	NC_019757	ATT	2	6	1042526	1042531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434403014
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16115	NC_019757	GAG	2	6	1042620	1042625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434403014
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