MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 109689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_019757	TACA	2	8	937089	937096	50 %	25 %	0 %	25 %	434402935
14502	NC_019757	ATTCTC	2	12	937195	937206	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434402936
14503	NC_019757	AAC	2	6	937227	937232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402936
14504	NC_019757	CAA	2	6	937264	937269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402936
14505	NC_019757	TGA	2	6	937275	937280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402936
14506	NC_019757	TGT	2	6	937287	937292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402936
14507	NC_019757	AAG	2	6	937337	937342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402936
14508	NC_019757	TCT	2	6	937407	937412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402936
14509	NC_019757	GTA	2	6	937459	937464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402936
14510	NC_019757	GTG	2	6	937472	937477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402936
14511	NC_019757	A	6	6	937504	937509	100 %	0 %	0 %	0 %	434402936
14512	NC_019757	TGA	2	6	937580	937585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402936
14513	NC_019757	GAT	2	6	937701	937706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402936
14514	NC_019757	GCC	2	6	937729	937734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402936
14515	NC_019757	AT	3	6	937776	937781	50 %	50 %	0 %	0 %	434402936
14516	NC_019757	AGA	2	6	937923	937928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402936
14517	NC_019757	AGGCA	2	10	937935	937944	40 %	0 %	40 %	20 %	434402936
14518	NC_019757	TTA	2	6	938005	938010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402936
14519	NC_019757	TGC	2	6	938017	938022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402936
14520	NC_019757	GAT	2	6	938079	938084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402936
14521	NC_019757	GCA	2	6	938100	938105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402936
14522	NC_019757	TGT	2	6	938160	938165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402936
14523	NC_019757	TAC	2	6	938169	938174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402936
14524	NC_019757	TTA	2	6	938227	938232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402936
14525	NC_019757	AGA	2	6	938479	938484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402937
14526	NC_019757	TCT	2	6	938494	938499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402937
14527	NC_019757	TCTG	2	8	938684	938691	0 %	50 %	25 %	25 %	434402937
14528	NC_019757	GCGATC	2	12	938807	938818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434402937
14529	NC_019757	TCAG	2	8	938849	938856	25 %	25 %	25 %	25 %	434402937
14530	NC_019757	GGA	2	6	939281	939286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402938
14531	NC_019757	AGCCG	2	10	939410	939419	20 %	0 %	40 %	40 %	434402938
14532	NC_019757	AGC	2	6	939550	939555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402938
14533	NC_019757	CTA	2	6	939645	939650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402938
14534	NC_019757	TCA	2	6	939738	939743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402938
14535	NC_019757	TCG	2	6	939815	939820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402938
14536	NC_019757	AAG	2	6	939945	939950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402938
14537	NC_019757	ATTG	2	8	940036	940043	25 %	50 %	25 %	0 %	434402938
14538	NC_019757	GTTG	2	8	940047	940054	0 %	50 %	50 %	0 %	434402938
14539	NC_019757	TTG	2	6	940180	940185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402938
14540	NC_019757	CAG	2	6	940195	940200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402938
14541	NC_019757	CTC	2	6	940294	940299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402938
14542	NC_019757	TAG	2	6	940302	940307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402938
14543	NC_019757	CTA	2	6	940413	940418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402938
14544	NC_019757	CCA	2	6	940452	940457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402938
14545	NC_019757	TGC	2	6	940489	940494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402938
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14547	NC_019757	TTA	2	6	940577	940582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402938
14548	NC_019757	TGG	2	6	940597	940602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402938
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14550	NC_019757	CCG	2	6	940663	940668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402938
14551	NC_019757	CAG	2	6	940762	940767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402938
14552	NC_019757	AGC	2	6	940771	940776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402938
14553	NC_019757	TGC	2	6	940890	940895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402938
14554	NC_019757	CCA	2	6	940921	940926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402938
14555	NC_019757	AGC	2	6	941048	941053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402938
14556	NC_019757	AC	3	6	941067	941072	50 %	0 %	0 %	50 %	434402938
14557	NC_019757	AACC	2	8	941119	941126	50 %	0 %	0 %	50 %	434402938
14558	NC_019757	GATT	2	8	941225	941232	25 %	50 %	25 %	0 %	434402938
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14561	NC_019757	CAA	2	6	941395	941400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402939
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14565	NC_019757	GAG	2	6	941566	941571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402939
14566	NC_019757	TCT	3	9	941628	941636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402939
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14568	NC_019757	GTT	2	6	942131	942136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402940
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14571	NC_019757	G	6	6	942386	942391	0 %	0 %	100 %	0 %	434402940
14572	NC_019757	TGG	2	6	942421	942426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402940
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14578	NC_019757	GACAG	2	10	943020	943029	40 %	0 %	40 %	20 %	434402941
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14584	NC_019757	ATG	2	6	943148	943153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402941
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14589	NC_019757	GAA	2	6	943393	943398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402942
14590	NC_019757	CGT	3	9	943486	943494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402942
14591	NC_019757	TAGA	2	8	943532	943539	50 %	25 %	25 %	0 %	434402942
14592	NC_019757	ATA	2	6	943566	943571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402942
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14599	NC_019757	GCA	2	6	944266	944271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402942
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14602	NC_019757	TGC	2	6	944426	944431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402942
14603	NC_019757	GA	3	6	944569	944574	50 %	0 %	50 %	0 %	434402943
14604	NC_019757	GCCC	2	8	944590	944597	0 %	0 %	25 %	75 %	434402943
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14609	NC_019757	GTT	2	6	945100	945105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402944
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14611	NC_019757	TGCTAA	2	12	945156	945167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434402944
14612	NC_019757	TTG	2	6	945240	945245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402944
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