MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.03

Total Repeats: 782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019754	AAG	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308169
2	NC_019754	CAA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308169
3	NC_019754	CAGT	2	8	171	178	25 %	25 %	25 %	25 %	428308169
4	NC_019754	AC	4	8	193	200	50 %	0 %	0 %	50 %	428308169
5	NC_019754	AAG	2	6	204	209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308169
6	NC_019754	A	6	6	249	254	100 %	0 %	0 %	0 %	428308169
7	NC_019754	CAAA	2	8	515	522	75 %	0 %	0 %	25 %	428308170
8	NC_019754	GAA	2	6	526	531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
9	NC_019754	AATA	2	8	667	674	75 %	25 %	0 %	0 %	428308170
10	NC_019754	CACATT	2	12	709	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
11	NC_019754	AGA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
12	NC_019754	GT	3	6	753	758	0 %	50 %	50 %	0 %	428308170
13	NC_019754	AAG	2	6	780	785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
14	NC_019754	A	6	6	799	804	100 %	0 %	0 %	0 %	428308170
15	NC_019754	AACACC	2	12	825	836	50 %	0 %	0 %	50 %	428308170
16	NC_019754	AGC	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308170
17	NC_019754	ACT	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
18	NC_019754	CAA	2	6	955	960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308170
19	NC_019754	CCT	2	6	984	989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308170
20	NC_019754	CACT	2	8	1080	1087	25 %	25 %	0 %	50 %	428308170
21	NC_019754	GTC	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
22	NC_019754	TAA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
23	NC_019754	TAC	2	6	1292	1297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
24	NC_019754	TGA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
25	NC_019754	TAG	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
26	NC_019754	TGA	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
27	NC_019754	ATG	3	9	1367	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
28	NC_019754	AAATT	2	10	1378	1387	60 %	40 %	0 %	0 %	428308170
29	NC_019754	GAT	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
30	NC_019754	AGC	2	6	1479	1484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308170
31	NC_019754	CGT	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
32	NC_019754	AGA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
33	NC_019754	AAT	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
34	NC_019754	AAT	2	6	1570	1575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
35	NC_019754	TTTG	2	8	1614	1621	0 %	75 %	25 %	0 %	428308170
36	NC_019754	ATG	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
37	NC_019754	GAT	3	9	1837	1845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
38	NC_019754	AAT	2	6	1846	1851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
39	NC_019754	CTG	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
40	NC_019754	CTG	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
41	NC_019754	ATG	3	9	1976	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
42	NC_019754	AATG	2	8	2062	2069	50 %	25 %	25 %	0 %	428308170
43	NC_019754	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
44	NC_019754	TAA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
45	NC_019754	TGT	2	6	2307	2312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308170
46	NC_019754	TGA	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
47	NC_019754	AGA	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
48	NC_019754	GGCT	2	8	2403	2410	0 %	25 %	50 %	25 %	428308170
49	NC_019754	ACA	2	6	2424	2429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308170
50	NC_019754	CAC	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308170
51	NC_019754	ACT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308171
52	NC_019754	TGA	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308171
53	NC_019754	A	6	6	3423	3428	100 %	0 %	0 %	0 %	428308171
54	NC_019754	TA	3	6	3448	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	428308171
55	NC_019754	AACT	2	8	3475	3482	50 %	25 %	0 %	25 %	428308171
56	NC_019754	TCT	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
57	NC_019754	TCT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
58	NC_019754	CA	3	6	3603	3608	50 %	0 %	0 %	50 %	428308171
59	NC_019754	TGT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
60	NC_019754	GTAA	2	8	3638	3645	50 %	25 %	25 %	0 %	428308171
61	NC_019754	AAG	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308171
62	NC_019754	T	6	6	3708	3713	0 %	100 %	0 %	0 %	428308171
63	NC_019754	GTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
64	NC_019754	T	6	6	3779	3784	0 %	100 %	0 %	0 %	428308171
65	NC_019754	GCTACA	2	12	3831	3842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428308171
66	NC_019754	TTA	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
67	NC_019754	GTT	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
68	NC_019754	AGC	3	9	3983	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308171
69	NC_019754	CATA	2	8	4039	4046	50 %	25 %	0 %	25 %	428308171
70	NC_019754	TC	3	6	4077	4082	0 %	50 %	0 %	50 %	428308171
71	NC_019754	CTG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308171
72	NC_019754	GTC	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308171
73	NC_019754	TAAA	3	12	4150	4161	75 %	25 %	0 %	0 %	428308171
74	NC_019754	TAAATA	2	12	4211	4222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
75	NC_019754	TAT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
76	NC_019754	TCA	2	6	4323	4328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308171
77	NC_019754	TTA	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
78	NC_019754	T	6	6	4361	4366	0 %	100 %	0 %	0 %	428308171
79	NC_019754	ATA	2	6	4380	4385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
80	NC_019754	GATG	2	8	4446	4453	25 %	25 %	50 %	0 %	428308171
81	NC_019754	TAA	2	6	4457	4462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
82	NC_019754	TCT	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
83	NC_019754	AGA	2	6	4515	4520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308171
84	NC_019754	A	6	6	4579	4584	100 %	0 %	0 %	0 %	428308171
85	NC_019754	CAG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308171
86	NC_019754	ATT	2	6	4667	4672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
87	NC_019754	GAT	2	6	4673	4678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308171
88	NC_019754	AT	3	6	4701	4706	50 %	50 %	0 %	0 %	428308171
89	NC_019754	CA	3	6	5551	5556	50 %	0 %	0 %	50 %	428308172
90	NC_019754	TAA	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308172
91	NC_019754	ACTGC	2	10	5595	5604	20 %	20 %	20 %	40 %	428308172
92	NC_019754	ATCA	2	8	5656	5663	50 %	25 %	0 %	25 %	428308172
93	NC_019754	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308173
94	NC_019754	TAT	2	6	6251	6256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308173
95	NC_019754	AGAT	2	8	6262	6269	50 %	25 %	25 %	0 %	428308173
96	NC_019754	CAGAAA	2	12	6276	6287	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428308173
97	NC_019754	ATC	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308173
98	NC_019754	ACA	2	6	6350	6355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308173
99	NC_019754	A	7	7	6368	6374	100 %	0 %	0 %	0 %	428308173
100	NC_019754	GTA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308173
101	NC_019754	TGA	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
102	NC_019754	ATC	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308174
103	NC_019754	CGC	2	6	7601	7606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308174
104	NC_019754	GCA	2	6	7621	7626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308174
105	NC_019754	T	6	6	7662	7667	0 %	100 %	0 %	0 %	428308174
106	NC_019754	AGT	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
107	NC_019754	TAA	2	6	7757	7762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308174
108	NC_019754	CGT	2	6	7789	7794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308174
109	NC_019754	CTTC	2	8	7847	7854	0 %	50 %	0 %	50 %	428308174
110	NC_019754	GAT	2	6	7924	7929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
111	NC_019754	CAA	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308174
112	NC_019754	AGT	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
113	NC_019754	CTC	2	6	8143	8148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308174
114	NC_019754	AGC	2	6	8151	8156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308174
115	NC_019754	ATAGCC	2	12	8224	8235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428308174
116	NC_019754	TTG	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308174
117	NC_019754	GTT	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308174
118	NC_019754	A	6	6	8305	8310	100 %	0 %	0 %	0 %	428308174
119	NC_019754	ATC	2	6	8439	8444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308174
120	NC_019754	ATT	2	6	8479	8484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308174
121	NC_019754	T	6	6	8491	8496	0 %	100 %	0 %	0 %	428308174
122	NC_019754	AAG	2	6	8501	8506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308174
123	NC_019754	AAT	2	6	8516	8521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308174
124	NC_019754	CGC	2	6	8545	8550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308174
125	NC_019754	GTT	2	6	8950	8955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308175
126	NC_019754	ACT	2	6	9005	9010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308175
127	NC_019754	AAAG	2	8	9066	9073	75 %	0 %	25 %	0 %	428308175
128	NC_019754	GTA	2	6	9081	9086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308175
129	NC_019754	AAC	2	6	9132	9137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308175
130	NC_019754	TTC	2	6	9940	9945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308176
131	NC_019754	CTC	2	6	9946	9951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308176
132	NC_019754	TAC	2	6	9998	10003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308176
133	NC_019754	AC	3	6	10060	10065	50 %	0 %	0 %	50 %	428308176
134	NC_019754	ATTA	2	8	10095	10102	50 %	50 %	0 %	0 %	428308176
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141	NC_019754	A	6	6	10604	10609	100 %	0 %	0 %	0 %	428308177
142	NC_019754	TCAA	2	8	10621	10628	50 %	25 %	0 %	25 %	428308177
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263	NC_019754	CCA	2	6	17984	17989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308184
264	NC_019754	GTA	2	6	18042	18047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308184
265	NC_019754	GAA	2	6	18111	18116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308184
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267	NC_019754	TCT	2	6	18133	18138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308184
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272	NC_019754	TTG	2	6	18292	18297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308184
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283	NC_019754	AGT	2	6	18952	18957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308184
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291	NC_019754	AAG	2	6	19381	19386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308184
292	NC_019754	ACTC	2	8	19571	19578	25 %	25 %	0 %	50 %	428308185
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300	NC_019754	CATT	2	8	20094	20101	25 %	50 %	0 %	25 %	428308186
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302	NC_019754	T	6	6	20137	20142	0 %	100 %	0 %	0 %	428308186
303	NC_019754	TAA	2	6	20160	20165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308186
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331	NC_019754	ATC	2	6	21298	21303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308187
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373	NC_019754	CCCT	2	8	24109	24116	0 %	25 %	0 %	75 %	428308188
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380	NC_019754	A	6	6	25190	25195	100 %	0 %	0 %	0 %	428308189
381	NC_019754	A	7	7	25217	25223	100 %	0 %	0 %	0 %	428308189
382	NC_019754	GGT	2	6	25252	25257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308189
383	NC_019754	GTT	2	6	25270	25275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308189
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385	NC_019754	GCT	2	6	25325	25330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308189
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387	NC_019754	T	6	6	25781	25786	0 %	100 %	0 %	0 %	428308190
388	NC_019754	TC	3	6	25792	25797	0 %	50 %	0 %	50 %	428308190
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390	NC_019754	TCT	2	6	25998	26003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308190
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