MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_019751	CAG	2	6	255229	255234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296990
4003	NC_019751	CA	3	6	255249	255254	50 %	0 %	0 %	50 %	428296990
4004	NC_019751	T	6	6	255300	255305	0 %	100 %	0 %	0 %	428296990
4005	NC_019751	GTT	2	6	255546	255551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296991
4006	NC_019751	ACTTCT	2	12	255585	255596	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428296991
4007	NC_019751	CCA	2	6	255666	255671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296991
4008	NC_019751	GT	3	6	255816	255821	0 %	50 %	50 %	0 %	428296991
4009	NC_019751	GCA	2	6	255858	255863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296991
4010	NC_019751	TAC	2	6	256296	256301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296992
4011	NC_019751	TGC	2	6	256445	256450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296992
4012	NC_019751	ATC	2	6	256463	256468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296992
4013	NC_019751	TATT	2	8	256567	256574	25 %	75 %	0 %	0 %	428296993
4014	NC_019751	ATGA	2	8	256598	256605	50 %	25 %	25 %	0 %	428296993
4015	NC_019751	GTC	2	6	256689	256694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296993
4016	NC_019751	AATT	2	8	256718	256725	50 %	50 %	0 %	0 %	428296993
4017	NC_019751	ATT	2	6	256764	256769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296993
4018	NC_019751	AT	3	6	256839	256844	50 %	50 %	0 %	0 %	428296993
4019	NC_019751	GGTTTT	2	12	256847	256858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296993
4020	NC_019751	TCCC	2	8	256882	256889	0 %	25 %	0 %	75 %	428296993
4021	NC_019751	TTAA	2	8	256905	256912	50 %	50 %	0 %	0 %	428296993
4022	NC_019751	CTAA	2	8	257010	257017	50 %	25 %	0 %	25 %	428296993
4023	NC_019751	ATTA	2	8	257036	257043	50 %	50 %	0 %	0 %	428296993
4024	NC_019751	T	6	6	257063	257068	0 %	100 %	0 %	0 %	428296993
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4027	NC_019751	GGA	2	6	257313	257318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428296993
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4031	NC_019751	TCA	2	6	257562	257567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296993
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4033	NC_019751	ATCAT	2	10	257796	257805	40 %	40 %	0 %	20 %	428296994
4034	NC_019751	GTT	2	6	257813	257818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296994
4035	NC_019751	CTG	2	6	257834	257839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296994
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4037	NC_019751	TAA	2	6	257856	257861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296994
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4039	NC_019751	T	7	7	258070	258076	0 %	100 %	0 %	0 %	428296994
4040	NC_019751	CCG	2	6	258079	258084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428296994
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4042	NC_019751	TA	3	6	258128	258133	50 %	50 %	0 %	0 %	428296994
4043	NC_019751	CGA	2	6	258144	258149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296994
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4049	NC_019751	T	8	8	258307	258314	0 %	100 %	0 %	0 %	428296994
4050	NC_019751	T	7	7	258322	258328	0 %	100 %	0 %	0 %	428296994
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4055	NC_019751	GAA	2	6	259298	259303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296995
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4092	NC_019751	GAATG	2	10	261406	261415	40 %	20 %	40 %	0 %	428296996
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4114	NC_019751	AACTT	2	10	262778	262787	40 %	40 %	0 %	20 %	428296997
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4121	NC_019751	CATA	2	8	263181	263188	50 %	25 %	0 %	25 %	428296997
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4124	NC_019751	GCA	2	6	263352	263357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296998
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4489	NC_019751	T	6	6	291621	291626	0 %	100 %	0 %	0 %	428297016
4490	NC_019751	TTTC	2	8	291642	291649	0 %	75 %	0 %	25 %	428297016
4491	NC_019751	TAC	2	6	291685	291690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297016
4492	NC_019751	TAAG	2	8	291720	291727	50 %	25 %	25 %	0 %	428297016
4493	NC_019751	TTCTGA	2	12	291778	291789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428297016
4494	NC_019751	CTT	3	9	291818	291826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297016
4495	NC_019751	ATCT	2	8	291879	291886	25 %	50 %	0 %	25 %	428297016
4496	NC_019751	ACT	2	6	291890	291895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297016
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4498	NC_019751	TTC	2	6	292023	292028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297016
4499	NC_019751	CTA	2	6	292065	292070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297016
4500	NC_019751	CCTTTG	2	12	292088	292099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428297016

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