MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_019751	TGT	2	6	1656381	1656386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428298125
26003	NC_019751	AGT	2	6	1656388	1656393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298125
26004	NC_019751	GCTAT	2	10	1656448	1656457	20 %	40 %	20 %	20 %	428298125
26005	NC_019751	ACA	2	6	1656501	1656506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428298125
26006	NC_019751	CA	3	6	1656570	1656575	50 %	0 %	0 %	50 %	428298125
26007	NC_019751	CAAC	2	8	1656583	1656590	50 %	0 %	0 %	50 %	428298125
26008	NC_019751	ATT	2	6	1656676	1656681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298125
26009	NC_019751	ATT	2	6	1656712	1656717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298125
26010	NC_019751	AC	3	6	1656719	1656724	50 %	0 %	0 %	50 %	428298125
26011	NC_019751	CAC	3	9	1656722	1656730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428298125
26012	NC_019751	GAA	2	6	1656761	1656766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428298125
26013	NC_019751	TAT	2	6	1656779	1656784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298125
26014	NC_019751	TGC	2	6	1656818	1656823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298125
26015	NC_019751	GTG	2	6	1656871	1656876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428298125
26016	NC_019751	ATGA	2	8	1656877	1656884	50 %	25 %	25 %	0 %	428298125
26017	NC_019751	GTG	2	6	1657132	1657137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428298126
26018	NC_019751	TGG	2	6	1657324	1657329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428298126
26019	NC_019751	GCC	2	6	1657336	1657341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428298126
26020	NC_019751	CGC	2	6	1657438	1657443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428298126
26021	NC_019751	TC	3	6	1657524	1657529	0 %	50 %	0 %	50 %	428298126
26022	NC_019751	GTA	2	6	1657534	1657539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298126
26023	NC_019751	AAT	2	6	1657542	1657547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428298126
26024	NC_019751	TGA	2	6	1657631	1657636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298126
26025	NC_019751	TGG	2	6	1657648	1657653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428298126
26026	NC_019751	CA	3	6	1657667	1657672	50 %	0 %	0 %	50 %	428298126
26027	NC_019751	ACTAA	2	10	1657783	1657792	60 %	20 %	0 %	20 %	428298126
26028	NC_019751	CTT	2	6	1657794	1657799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428298126
26029	NC_019751	AAT	2	6	1657803	1657808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428298126
26030	NC_019751	TAT	2	6	1657833	1657838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298126
26031	NC_019751	AAT	2	6	1657932	1657937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428298126
26032	NC_019751	TGG	2	6	1658076	1658081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428298126
26033	NC_019751	ATT	2	6	1658142	1658147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298126
26034	NC_019751	TGC	2	6	1658160	1658165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298126
26035	NC_019751	TTTA	2	8	1658174	1658181	25 %	75 %	0 %	0 %	428298126
26036	NC_019751	GCTA	2	8	1658253	1658260	25 %	25 %	25 %	25 %	428298126
26037	NC_019751	AAT	2	6	1658281	1658286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428298126
26038	NC_019751	TGG	2	6	1658317	1658322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428298126
26039	NC_019751	TTA	2	6	1658597	1658602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298127
26040	NC_019751	TAAT	2	8	1658687	1658694	50 %	50 %	0 %	0 %	428298127
26041	NC_019751	GCA	2	6	1658699	1658704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428298127
26042	NC_019751	AT	3	6	1658823	1658828	50 %	50 %	0 %	0 %	428298127
26043	NC_019751	TGA	2	6	1658844	1658849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298127
26044	NC_019751	CAA	2	6	1658861	1658866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428298127
26045	NC_019751	GTTTA	2	10	1658912	1658921	20 %	60 %	20 %	0 %	428298127
26046	NC_019751	TGA	2	6	1658940	1658945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298127
26047	NC_019751	TCA	2	6	1658971	1658976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298127
26048	NC_019751	AATT	2	8	1659020	1659027	50 %	50 %	0 %	0 %	428298127
26049	NC_019751	TCG	2	6	1659051	1659056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298127
26050	NC_019751	TGA	2	6	1659066	1659071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298127
26051	NC_019751	AGA	2	6	1659105	1659110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428298127
26052	NC_019751	A	6	6	1659136	1659141	100 %	0 %	0 %	0 %	428298127
26053	NC_019751	AAG	2	6	1659161	1659166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428298127
26054	NC_019751	TGC	2	6	1659221	1659226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298127
26055	NC_019751	AT	3	6	1659308	1659313	50 %	50 %	0 %	0 %	428298127
26056	NC_019751	CAA	2	6	1659376	1659381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428298127
26057	NC_019751	T	6	6	1659406	1659411	0 %	100 %	0 %	0 %	428298127
26058	NC_019751	ATG	2	6	1659476	1659481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298127
26059	NC_019751	GAT	2	6	1659697	1659702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298128
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26061	NC_019751	CAA	2	6	1659797	1659802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428298128
26062	NC_019751	A	6	6	1659830	1659835	100 %	0 %	0 %	0 %	428298128
26063	NC_019751	TCA	2	6	1659839	1659844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298128
26064	NC_019751	GAT	2	6	1659889	1659894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298128
26065	NC_019751	CTA	2	6	1659935	1659940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298128
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26067	NC_019751	GAT	2	6	1660096	1660101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298128
26068	NC_019751	GT	3	6	1660175	1660180	0 %	50 %	50 %	0 %	428298128
26069	NC_019751	GGAA	2	8	1660182	1660189	50 %	0 %	50 %	0 %	428298128
26070	NC_019751	GGT	2	6	1660220	1660225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428298128
26071	NC_019751	ATT	2	6	1660242	1660247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298128
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26077	NC_019751	CTG	2	6	1660448	1660453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298129
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26083	NC_019751	ATATCC	2	12	1660666	1660677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298129
26084	NC_019751	AATT	2	8	1660689	1660696	50 %	50 %	0 %	0 %	428298129
26085	NC_019751	T	6	6	1660721	1660726	0 %	100 %	0 %	0 %	428298129
26086	NC_019751	TTTC	2	8	1660742	1660749	0 %	75 %	0 %	25 %	428298129
26087	NC_019751	AATT	2	8	1660941	1660948	50 %	50 %	0 %	0 %	428298129
26088	NC_019751	ACT	2	6	1661136	1661141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298130
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26090	NC_019751	ATC	2	6	1661217	1661222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298130
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26099	NC_019751	GCT	2	6	1661500	1661505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298130
26100	NC_019751	GGA	2	6	1661518	1661523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428298130
26101	NC_019751	CAT	2	6	1661564	1661569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298130
26102	NC_019751	TCA	2	6	1661575	1661580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298130
26103	NC_019751	AAAACT	2	12	1661608	1661619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428298130
26104	NC_019751	CAG	2	6	1661624	1661629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428298130
26105	NC_019751	A	6	6	1661683	1661688	100 %	0 %	0 %	0 %	428298130
26106	NC_019751	TAGA	2	8	1661988	1661995	50 %	25 %	25 %	0 %	428298131
26107	NC_019751	TAC	2	6	1662075	1662080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298131
26108	NC_019751	TCGC	2	8	1662090	1662097	0 %	25 %	25 %	50 %	428298131
26109	NC_019751	CTA	2	6	1662122	1662127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298131
26110	NC_019751	CAG	2	6	1662131	1662136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428298131
26111	NC_019751	A	7	7	1662139	1662145	100 %	0 %	0 %	0 %	428298131
26112	NC_019751	GTGG	2	8	1662302	1662309	0 %	25 %	75 %	0 %	428298131
26113	NC_019751	GATA	2	8	1662422	1662429	50 %	25 %	25 %	0 %	428298131
26114	NC_019751	CGA	2	6	1662511	1662516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428298131
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26116	NC_019751	CAG	2	6	1662539	1662544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428298131
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26466	NC_019751	TTA	2	6	1688622	1688627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298150
26467	NC_019751	TGC	2	6	1688656	1688661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298150
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