MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_019751	CAATA	2	10	1525760	1525769	60 %	20 %	0 %	20 %	428298033
24002	NC_019751	GAA	2	6	1525779	1525784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428298033
24003	NC_019751	AGA	2	6	1525850	1525855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428298033
24004	NC_019751	CAA	2	6	1525859	1525864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428298033
24005	NC_019751	ATC	2	6	1526055	1526060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298033
24006	NC_019751	ACATC	2	10	1526124	1526133	40 %	20 %	0 %	40 %	428298033
24007	NC_019751	GAT	2	6	1526174	1526179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298033
24008	NC_019751	CAT	2	6	1526201	1526206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298033
24009	NC_019751	ATG	2	6	1526209	1526214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298033
24010	NC_019751	TA	3	6	1526221	1526226	50 %	50 %	0 %	0 %	428298033
24011	NC_019751	GAC	3	9	1526245	1526253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428298033
24012	NC_019751	GAA	2	6	1526259	1526264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428298033
24013	NC_019751	CAG	2	6	1526314	1526319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428298033
24014	NC_019751	ATTA	2	8	1526363	1526370	50 %	50 %	0 %	0 %	428298033
24015	NC_019751	CCAA	2	8	1526399	1526406	50 %	0 %	0 %	50 %	428298033
24016	NC_019751	TCA	3	9	1526479	1526487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298033
24017	NC_019751	GAT	2	6	1526490	1526495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298033
24018	NC_019751	ACC	2	6	1526511	1526516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428298033
24019	NC_019751	CACC	2	8	1526591	1526598	25 %	0 %	0 %	75 %	428298033
24020	NC_019751	TTA	2	6	1526603	1526608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298033
24021	NC_019751	AC	3	6	1526623	1526628	50 %	0 %	0 %	50 %	428298033
24022	NC_019751	AATT	2	8	1526635	1526642	50 %	50 %	0 %	0 %	428298033
24023	NC_019751	GGAA	2	8	1526711	1526718	50 %	0 %	50 %	0 %	428298033
24024	NC_019751	AGA	2	6	1526723	1526728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428298033
24025	NC_019751	TGCT	2	8	1526759	1526766	0 %	50 %	25 %	25 %	428298033
24026	NC_019751	TAA	2	6	1526908	1526913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428298034
24027	NC_019751	CAA	2	6	1526934	1526939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428298034
24028	NC_019751	TTTCAA	2	12	1527015	1527026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428298034
24029	NC_019751	CAA	2	6	1527069	1527074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428298034
24030	NC_019751	T	6	6	1527307	1527312	0 %	100 %	0 %	0 %	428298034
24031	NC_019751	CGT	2	6	1527324	1527329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298034
24032	NC_019751	TAG	2	6	1527487	1527492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298034
24033	NC_019751	TAA	2	6	1527686	1527691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428298035
24034	NC_019751	CTG	2	6	1527765	1527770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298035
24035	NC_019751	GCA	2	6	1527809	1527814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428298035
24036	NC_019751	TA	3	6	1527833	1527838	50 %	50 %	0 %	0 %	428298035
24037	NC_019751	T	6	6	1527906	1527911	0 %	100 %	0 %	0 %	428298035
24038	NC_019751	TCT	2	6	1527968	1527973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428298035
24039	NC_019751	TGA	2	6	1528040	1528045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298035
24040	NC_019751	T	6	6	1528065	1528070	0 %	100 %	0 %	0 %	428298035
24041	NC_019751	TTC	2	6	1528174	1528179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428298035
24042	NC_019751	TCG	2	6	1528187	1528192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298035
24043	NC_019751	TTG	2	6	1528194	1528199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428298035
24044	NC_019751	AATT	2	8	1528231	1528238	50 %	50 %	0 %	0 %	428298035
24045	NC_019751	AATCA	2	10	1528333	1528342	60 %	20 %	0 %	20 %	428298035
24046	NC_019751	TCA	2	6	1528367	1528372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298035
24047	NC_019751	TTA	2	6	1528388	1528393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298035
24048	NC_019751	GTT	2	6	1528406	1528411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428298035
24049	NC_019751	CAAA	2	8	1528585	1528592	75 %	0 %	0 %	25 %	428298035
24050	NC_019751	TCG	2	6	1528613	1528618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298035
24051	NC_019751	TTG	2	6	1528693	1528698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428298035
24052	NC_019751	T	6	6	1528705	1528710	0 %	100 %	0 %	0 %	428298035
24053	NC_019751	T	6	6	1528713	1528718	0 %	100 %	0 %	0 %	428298035
24054	NC_019751	AGT	2	6	1528720	1528725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298035
24055	NC_019751	CT	3	6	1528789	1528794	0 %	50 %	0 %	50 %	428298035
24056	NC_019751	AAC	2	6	1528888	1528893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428298035
24057	NC_019751	TAT	2	6	1528909	1528914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298035
24058	NC_019751	TGC	2	6	1528918	1528923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428298035
24059	NC_019751	GAGC	2	8	1528982	1528989	25 %	0 %	50 %	25 %	428298035
24060	NC_019751	ACT	2	6	1528997	1529002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298035
24061	NC_019751	TTGG	2	8	1529109	1529116	0 %	50 %	50 %	0 %	428298035
24062	NC_019751	CAT	2	6	1529200	1529205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298035
24063	NC_019751	ATT	2	6	1529219	1529224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298035
24064	NC_019751	GGC	2	6	1529235	1529240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428298035
24065	NC_019751	TCAT	2	8	1529255	1529262	25 %	50 %	0 %	25 %	428298035
24066	NC_019751	T	6	6	1529317	1529322	0 %	100 %	0 %	0 %	428298035
24067	NC_019751	ATT	2	6	1529419	1529424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298035
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24071	NC_019751	GTGAG	2	10	1529634	1529643	20 %	20 %	60 %	0 %	428298035
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24085	NC_019751	TTAA	2	8	1530595	1530602	50 %	50 %	0 %	0 %	428298036
24086	NC_019751	TAAA	2	8	1530626	1530633	75 %	25 %	0 %	0 %	428298036
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24089	NC_019751	ATC	2	6	1530813	1530818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298036
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24091	NC_019751	GT	3	6	1531334	1531339	0 %	50 %	50 %	0 %	428298037
24092	NC_019751	GTTA	2	8	1531341	1531348	25 %	50 %	25 %	0 %	428298037
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24101	NC_019751	AACT	2	8	1531595	1531602	50 %	25 %	0 %	25 %	428298037
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24104	NC_019751	TGG	2	6	1531784	1531789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428298037
24105	NC_019751	AT	3	6	1531829	1531834	50 %	50 %	0 %	0 %	428298037
24106	NC_019751	TTA	2	6	1531855	1531860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298037
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24111	NC_019751	AT	3	6	1532120	1532125	50 %	50 %	0 %	0 %	428298037
24112	NC_019751	TGA	2	6	1532138	1532143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428298037
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24115	NC_019751	TAC	2	6	1532297	1532302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298037
24116	NC_019751	A	6	6	1532329	1532334	100 %	0 %	0 %	0 %	428298037
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24464	NC_019751	GA	3	6	1552534	1552539	50 %	0 %	50 %	0 %	428298051
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24469	NC_019751	AG	3	6	1552717	1552722	50 %	0 %	50 %	0 %	428298051
24470	NC_019751	GAG	2	6	1552729	1552734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428298051
24471	NC_019751	TCA	2	6	1552773	1552778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428298051
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24475	NC_019751	ATCAA	2	10	1553200	1553209	60 %	20 %	0 %	20 %	428298052
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24491	NC_019751	TTTA	2	8	1554015	1554022	25 %	75 %	0 %	0 %	428298052
24492	NC_019751	A	6	6	1554062	1554067	100 %	0 %	0 %	0 %	428298052
24493	NC_019751	T	7	7	1554125	1554131	0 %	100 %	0 %	0 %	428298052
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24499	NC_019751	TAT	2	6	1554326	1554331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428298052
24500	NC_019751	AGTG	2	8	1554430	1554437	25 %	25 %	50 %	0 %	428298052

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