MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_019751	T	6	6	1029935	1029940	0 %	100 %	0 %	0 %	428297609
16002	NC_019751	CAA	2	6	1029941	1029946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297609
16003	NC_019751	AGA	2	6	1029967	1029972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297609
16004	NC_019751	ATC	2	6	1030039	1030044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297609
16005	NC_019751	TGA	2	6	1030111	1030116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297609
16006	NC_019751	TG	3	6	1030235	1030240	0 %	50 %	50 %	0 %	428297609
16007	NC_019751	GAA	2	6	1030259	1030264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297609
16008	NC_019751	TGC	2	6	1030309	1030314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297609
16009	NC_019751	CAC	2	6	1030335	1030340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428297609
16010	NC_019751	TAG	2	6	1030341	1030346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297609
16011	NC_019751	TTTG	2	8	1030361	1030368	0 %	75 %	25 %	0 %	428297609
16012	NC_019751	CAT	2	6	1030451	1030456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297609
16013	NC_019751	CTA	2	6	1030560	1030565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297609
16014	NC_019751	ACC	2	6	1030579	1030584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428297609
16015	NC_019751	CAATT	2	10	1030602	1030611	40 %	40 %	0 %	20 %	428297609
16016	NC_019751	GGT	2	6	1030613	1030618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297609
16017	NC_019751	CA	3	6	1030716	1030721	50 %	0 %	0 %	50 %	428297609
16018	NC_019751	TGG	2	6	1030736	1030741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297609
16019	NC_019751	TAA	2	6	1030750	1030755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297609
16020	NC_019751	TGAT	2	8	1030767	1030774	25 %	50 %	25 %	0 %	428297609
16021	NC_019751	CAA	2	6	1030796	1030801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297609
16022	NC_019751	ATT	2	6	1030807	1030812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297609
16023	NC_019751	GCA	3	9	1030813	1030821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297609
16024	NC_019751	TGG	2	6	1030915	1030920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297609
16025	NC_019751	ACT	2	6	1030967	1030972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297609
16026	NC_019751	GTC	2	6	1030977	1030982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297609
16027	NC_019751	GTA	2	6	1031022	1031027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297609
16028	NC_019751	GTG	2	6	1031034	1031039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297609
16029	NC_019751	TTG	2	6	1031072	1031077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428297609
16030	NC_019751	GGA	2	6	1031177	1031182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428297609
16031	NC_019751	ATTTT	2	10	1031215	1031224	20 %	80 %	0 %	0 %	428297609
16032	NC_019751	TAT	2	6	1031447	1031452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297610
16033	NC_019751	TG	3	6	1031453	1031458	0 %	50 %	50 %	0 %	428297610
16034	NC_019751	GCT	2	6	1031525	1031530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297610
16035	NC_019751	CA	3	6	1031595	1031600	50 %	0 %	0 %	50 %	428297610
16036	NC_019751	AGCT	2	8	1031604	1031611	25 %	25 %	25 %	25 %	428297610
16037	NC_019751	CTC	2	6	1031631	1031636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428297610
16038	NC_019751	GCT	2	6	1031732	1031737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297610
16039	NC_019751	ACA	2	6	1031788	1031793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297610
16040	NC_019751	ATC	2	6	1031829	1031834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297610
16041	NC_019751	A	6	6	1031849	1031854	100 %	0 %	0 %	0 %	428297610
16042	NC_019751	GAT	2	6	1031875	1031880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297610
16043	NC_019751	TGA	2	6	1031901	1031906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297610
16044	NC_019751	CTG	2	6	1031979	1031984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297610
16045	NC_019751	A	7	7	1031996	1032002	100 %	0 %	0 %	0 %	428297610
16046	NC_019751	A	6	6	1032005	1032010	100 %	0 %	0 %	0 %	428297610
16047	NC_019751	TGA	2	6	1032043	1032048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297610
16048	NC_019751	AAGGG	2	10	1032256	1032265	40 %	0 %	60 %	0 %	428297610
16049	NC_019751	AGA	2	6	1032301	1032306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297610
16050	NC_019751	TAA	2	6	1032485	1032490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297611
16051	NC_019751	T	6	6	1032510	1032515	0 %	100 %	0 %	0 %	428297611
16052	NC_019751	TCT	2	6	1032593	1032598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297611
16053	NC_019751	AGT	2	6	1032709	1032714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297611
16054	NC_019751	GAT	2	6	1032811	1032816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297611
16055	NC_019751	ATG	2	6	1032854	1032859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297611
16056	NC_019751	CTT	2	6	1032903	1032908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297611
16057	NC_019751	CAC	2	6	1032954	1032959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428297611
16058	NC_019751	TGA	2	6	1032990	1032995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297611
16059	NC_019751	TTC	2	6	1033036	1033041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297611
16060	NC_019751	AGC	2	6	1033093	1033098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297611
16061	NC_019751	T	7	7	1033170	1033176	0 %	100 %	0 %	0 %	428297611
16062	NC_019751	TTA	2	6	1033259	1033264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297611
16063	NC_019751	TCG	2	6	1033322	1033327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297611
16064	NC_019751	CT	3	6	1033393	1033398	0 %	50 %	0 %	50 %	428297611
16065	NC_019751	TA	3	6	1033455	1033460	50 %	50 %	0 %	0 %	428297611
16066	NC_019751	TGC	2	6	1033528	1033533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297611
16067	NC_019751	AATT	2	8	1033536	1033543	50 %	50 %	0 %	0 %	428297611
16068	NC_019751	GGA	2	6	1033617	1033622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428297611
16069	NC_019751	GATTT	2	10	1033641	1033650	20 %	60 %	20 %	0 %	428297611
16070	NC_019751	CTA	2	6	1033668	1033673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297611
16071	NC_019751	TGT	2	6	1033885	1033890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428297612
16072	NC_019751	CTG	2	6	1033970	1033975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297612
16073	NC_019751	TGA	2	6	1033982	1033987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297612
16074	NC_019751	CAA	2	6	1034006	1034011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297612
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16077	NC_019751	ACC	2	6	1034088	1034093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428297612
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16084	NC_019751	AAT	2	6	1034374	1034379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297612
16085	NC_019751	TC	3	6	1034380	1034385	0 %	50 %	0 %	50 %	428297612
16086	NC_019751	ACA	2	6	1034482	1034487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297612
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16088	NC_019751	AATC	2	8	1034657	1034664	50 %	25 %	0 %	25 %	428297612
16089	NC_019751	AAT	2	6	1034703	1034708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297612
16090	NC_019751	ATA	4	12	1034740	1034751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297612
16091	NC_019751	A	7	7	1034805	1034811	100 %	0 %	0 %	0 %	428297612
16092	NC_019751	CAA	2	6	1034852	1034857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297612
16093	NC_019751	TTAA	2	8	1034863	1034870	50 %	50 %	0 %	0 %	428297612
16094	NC_019751	AAT	2	6	1034916	1034921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297612
16095	NC_019751	TGA	2	6	1035350	1035355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297613
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16099	NC_019751	GAT	2	6	1035595	1035600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297613
16100	NC_019751	CAA	2	6	1035669	1035674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297613
16101	NC_019751	TAT	2	6	1035695	1035700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297613
16102	NC_019751	CAA	2	6	1035710	1035715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297613
16103	NC_019751	CAAC	2	8	1035973	1035980	50 %	0 %	0 %	50 %	428297613
16104	NC_019751	CTG	2	6	1036016	1036021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297613
16105	NC_019751	AGC	2	6	1036026	1036031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297613
16106	NC_019751	TGT	2	6	1036109	1036114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428297613
16107	NC_019751	T	7	7	1036215	1036221	0 %	100 %	0 %	0 %	428297614
16108	NC_019751	T	7	7	1036223	1036229	0 %	100 %	0 %	0 %	428297614
16109	NC_019751	T	9	9	1036290	1036298	0 %	100 %	0 %	0 %	428297614
16110	NC_019751	TGCGGT	2	12	1036309	1036320	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428297614
16111	NC_019751	TTC	2	6	1036321	1036326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297614
16112	NC_019751	CTT	2	6	1036329	1036334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297614
16113	NC_019751	TCT	2	6	1036343	1036348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297614
16114	NC_019751	TCA	2	6	1036379	1036384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297614
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