MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
89001	NC_019751	CACT	2	8	5623534	5623541	25 %	25 %	0 %	50 %	428301230
89002	NC_019751	GAC	2	6	5623583	5623588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428301230
89003	NC_019751	CAACC	2	10	5623589	5623598	40 %	0 %	0 %	60 %	428301230
89004	NC_019751	ATC	2	6	5623611	5623616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428301230
89005	NC_019751	ACC	2	6	5623696	5623701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428301230
89006	NC_019751	GAC	2	6	5623727	5623732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428301230
89007	NC_019751	G	6	6	5623748	5623753	0 %	0 %	100 %	0 %	428301230
89008	NC_019751	AACGCT	2	12	5623788	5623799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428301230
89009	NC_019751	GGTT	2	8	5623815	5623822	0 %	50 %	50 %	0 %	428301230
89010	NC_019751	GGT	2	6	5623837	5623842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428301230
89011	NC_019751	TAG	3	9	5623905	5623913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428301230
89012	NC_019751	CT	3	6	5623927	5623932	0 %	50 %	0 %	50 %	428301230
89013	NC_019751	TCTG	2	8	5623984	5623991	0 %	50 %	25 %	25 %	428301231
89014	NC_019751	CCA	2	6	5624034	5624039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428301231
89015	NC_019751	AAAAC	2	10	5624065	5624074	80 %	0 %	0 %	20 %	428301231
89016	NC_019751	TA	5	10	5624139	5624148	50 %	50 %	0 %	0 %	428301231
89017	NC_019751	A	6	6	5624201	5624206	100 %	0 %	0 %	0 %	428301231
89018	NC_019751	ACCAA	2	10	5624238	5624247	60 %	0 %	0 %	40 %	428301231
89019	NC_019751	A	6	6	5624274	5624279	100 %	0 %	0 %	0 %	428301231
89020	NC_019751	CAG	2	6	5624350	5624355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428301231
89021	NC_019751	GCC	2	6	5624393	5624398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428301231
89022	NC_019751	CAA	2	6	5624568	5624573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428301231
89023	NC_019751	CTG	2	6	5624597	5624602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428301231
89024	NC_019751	AT	3	6	5624649	5624654	50 %	50 %	0 %	0 %	428301231
89025	NC_019751	ATA	2	6	5624677	5624682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428301231
89026	NC_019751	CAA	2	6	5624684	5624689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428301231
89027	NC_019751	CTA	2	6	5624783	5624788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428301231
89028	NC_019751	ATA	2	6	5624854	5624859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428301231
89029	NC_019751	ACC	2	6	5625096	5625101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428301232
89030	NC_019751	CTTT	2	8	5625117	5625124	0 %	75 %	0 %	25 %	428301232
89031	NC_019751	TCA	2	6	5625328	5625333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428301232
89032	NC_019751	TGC	2	6	5625467	5625472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428301232
89033	NC_019751	TTTGA	2	10	5625526	5625535	20 %	60 %	20 %	0 %	428301232
89034	NC_019751	TTA	2	6	5625604	5625609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428301233
89035	NC_019751	CA	3	6	5625690	5625695	50 %	0 %	0 %	50 %	428301233
89036	NC_019751	AAG	2	6	5625702	5625707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428301233
89037	NC_019751	TA	3	6	5625727	5625732	50 %	50 %	0 %	0 %	428301233
89038	NC_019751	TTA	2	6	5625782	5625787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428301233
89039	NC_019751	TAT	2	6	5625810	5625815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428301233
89040	NC_019751	GAA	2	6	5625821	5625826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428301233
89041	NC_019751	T	8	8	5625869	5625876	0 %	100 %	0 %	0 %	428301233
89042	NC_019751	AGA	2	6	5625877	5625882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428301233
89043	NC_019751	AGC	2	6	5625925	5625930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428301233
89044	NC_019751	TAAA	2	8	5625970	5625977	75 %	25 %	0 %	0 %	428301233
89045	NC_019751	GGA	2	6	5626273	5626278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428301234
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89048	NC_019751	T	6	6	5626499	5626504	0 %	100 %	0 %	0 %	428301235
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89050	NC_019751	TACCTT	2	12	5626517	5626528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428301235
89051	NC_019751	TCA	2	6	5626591	5626596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428301235
89052	NC_019751	CTT	2	6	5626647	5626652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428301235
89053	NC_019751	CAAA	2	8	5626661	5626668	75 %	0 %	0 %	25 %	428301235
89054	NC_019751	AAT	2	6	5626858	5626863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428301235
89055	NC_019751	TCA	2	6	5626891	5626896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428301235
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89057	NC_019751	TAA	2	6	5627339	5627344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428301236
89058	NC_019751	AAT	2	6	5627426	5627431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428301236
89059	NC_019751	CTG	2	6	5627473	5627478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428301236
89060	NC_019751	CT	3	6	5627530	5627535	0 %	50 %	0 %	50 %	428301236
89061	NC_019751	GAC	2	6	5627562	5627567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428301236
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89071	NC_019751	C	6	6	5628363	5628368	0 %	0 %	0 %	100 %	428301237
89072	NC_019751	AAAG	2	8	5628431	5628438	75 %	0 %	25 %	0 %	428301237
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89097	NC_019751	AAT	2	6	5629753	5629758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428301238
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89101	NC_019751	CGTC	2	8	5629936	5629943	0 %	25 %	25 %	50 %	428301238
89102	NC_019751	TGA	2	6	5629960	5629965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428301238
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89104	NC_019751	CAC	2	6	5630009	5630014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428301238
89105	NC_019751	GCA	2	6	5630041	5630046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428301238
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89107	NC_019751	T	6	6	5630136	5630141	0 %	100 %	0 %	0 %	428301238
89108	NC_019751	AAT	2	6	5630234	5630239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428301238
89109	NC_019751	GTA	2	6	5630359	5630364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428301238
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89111	NC_019751	T	6	6	5630437	5630442	0 %	100 %	0 %	0 %	428301238
89112	NC_019751	GAC	2	6	5630447	5630452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428301238
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89114	NC_019751	CATCGG	2	12	5630519	5630530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428301238
89115	NC_019751	TGC	2	6	5630538	5630543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428301238
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89468	NC_019751	TAT	2	6	5654282	5654287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428301260
89469	NC_019751	ATTG	2	8	5654298	5654305	25 %	50 %	25 %	0 %	428301260
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