MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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83002	NC_019751	GTA	2	6	5242215	5242220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300938
83003	NC_019751	TTC	2	6	5242339	5242344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428300938
83004	NC_019751	AAT	2	6	5242346	5242351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428300938
83005	NC_019751	CAG	2	6	5242392	5242397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428300938
83006	NC_019751	TAA	2	6	5242468	5242473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428300938
83007	NC_019751	CAT	2	6	5242557	5242562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428300938
83008	NC_019751	ATC	3	9	5242612	5242620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428300938
83009	NC_019751	TCCA	2	8	5242708	5242715	25 %	25 %	0 %	50 %	428300938
83010	NC_019751	T	6	6	5242722	5242727	0 %	100 %	0 %	0 %	428300938
83011	NC_019751	TAT	2	6	5242759	5242764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428300938
83012	NC_019751	TCT	2	6	5242786	5242791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428300938
83013	NC_019751	TCA	2	6	5243292	5243297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428300939
83014	NC_019751	TAA	2	6	5243359	5243364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428300939
83015	NC_019751	CAG	2	6	5243374	5243379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428300939
83016	NC_019751	T	6	6	5243416	5243421	0 %	100 %	0 %	0 %	428300939
83017	NC_019751	ATC	2	6	5243493	5243498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428300939
83018	NC_019751	TTC	2	6	5243570	5243575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428300939
83019	NC_019751	TTC	2	6	5243771	5243776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428300939
83020	NC_019751	TGA	2	6	5243878	5243883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300939
83021	NC_019751	T	6	6	5243911	5243916	0 %	100 %	0 %	0 %	428300939
83022	NC_019751	GAA	2	6	5243925	5243930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428300939
83023	NC_019751	A	6	6	5243929	5243934	100 %	0 %	0 %	0 %	428300939
83024	NC_019751	ATGTA	2	10	5243939	5243948	40 %	40 %	20 %	0 %	428300939
83025	NC_019751	TGAA	2	8	5244005	5244012	50 %	25 %	25 %	0 %	428300939
83026	NC_019751	ATG	2	6	5244023	5244028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300939
83027	NC_019751	CTG	2	6	5244032	5244037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428300939
83028	NC_019751	TGATG	2	10	5244134	5244143	20 %	40 %	40 %	0 %	428300939
83029	NC_019751	CGA	2	6	5244180	5244185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428300939
83030	NC_019751	CCA	2	6	5244225	5244230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428300939
83031	NC_019751	AGG	2	6	5244239	5244244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428300939
83032	NC_019751	GCA	2	6	5245461	5245466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428300940
83033	NC_019751	TAG	2	6	5245556	5245561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300940
83034	NC_019751	AT	3	6	5245566	5245571	50 %	50 %	0 %	0 %	428300940
83035	NC_019751	A	6	6	5245621	5245626	100 %	0 %	0 %	0 %	428300940
83036	NC_019751	GAT	2	6	5245641	5245646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300940
83037	NC_019751	TAG	2	6	5245669	5245674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300940
83038	NC_019751	AAT	2	6	5245683	5245688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428300940
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83040	NC_019751	TTA	2	6	5245842	5245847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428300940
83041	NC_019751	AAC	2	6	5245903	5245908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428300940
83042	NC_019751	A	6	6	5245929	5245934	100 %	0 %	0 %	0 %	428300940
83043	NC_019751	CAAG	2	8	5246025	5246032	50 %	0 %	25 %	25 %	428300940
83044	NC_019751	GCC	2	6	5246067	5246072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428300940
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83046	NC_019751	AAG	2	6	5246137	5246142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428300940
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83048	NC_019751	TGA	2	6	5246219	5246224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300940
83049	NC_019751	CCA	2	6	5246230	5246235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428300940
83050	NC_019751	AAT	2	6	5246298	5246303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428300940
83051	NC_019751	GAA	2	6	5246313	5246318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428300940
83052	NC_019751	GTT	2	6	5246319	5246324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428300940
83053	NC_019751	TCA	2	6	5246374	5246379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428300940
83054	NC_019751	TAG	2	6	5246401	5246406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300940
83055	NC_019751	TTG	2	6	5246460	5246465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428300940
83056	NC_019751	AAT	2	6	5246468	5246473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428300940
83057	NC_019751	ATT	2	6	5246482	5246487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428300940
83058	NC_019751	CAC	2	6	5246558	5246563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428300940
83059	NC_019751	CAAC	2	8	5246603	5246610	50 %	0 %	0 %	50 %	428300940
83060	NC_019751	GTA	2	6	5246635	5246640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300940
83061	NC_019751	C	6	6	5246674	5246679	0 %	0 %	0 %	100 %	428300940
83062	NC_019751	GTTT	2	8	5246694	5246701	0 %	75 %	25 %	0 %	428300940
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83064	NC_019751	CGAA	2	8	5246777	5246784	50 %	0 %	25 %	25 %	428300940
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83072	NC_019751	A	7	7	5247407	5247413	100 %	0 %	0 %	0 %	428300941
83073	NC_019751	TAC	3	9	5247415	5247423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428300941
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83085	NC_019751	A	7	7	5247716	5247722	100 %	0 %	0 %	0 %	428300941
83086	NC_019751	A	7	7	5247797	5247803	100 %	0 %	0 %	0 %	428300941
83087	NC_019751	TAA	2	6	5247856	5247861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428300941
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83090	NC_019751	ACT	3	9	5248082	5248090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428300941
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83099	NC_019751	AT	3	6	5248893	5248898	50 %	50 %	0 %	0 %	428300942
83100	NC_019751	TCAA	2	8	5249003	5249010	50 %	25 %	0 %	25 %	428300942
83101	NC_019751	GAT	2	6	5249017	5249022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428300942
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83104	NC_019751	GCCCC	2	10	5249577	5249586	0 %	0 %	20 %	80 %	428300943
83105	NC_019751	A	7	7	5249734	5249740	100 %	0 %	0 %	0 %	428300943
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83107	NC_019751	CA	3	6	5249865	5249870	50 %	0 %	0 %	50 %	428300943
83108	NC_019751	GTG	2	6	5249950	5249955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428300943
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83111	NC_019751	GGA	2	6	5250201	5250206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428300943
83112	NC_019751	CCA	2	6	5250223	5250228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428300943
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83114	NC_019751	TGT	2	6	5250364	5250369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428300943
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