MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019751	ACA	2	6	393379	393384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297082
6002	NC_019751	TGC	2	6	393418	393423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6003	NC_019751	GTAAC	2	10	393450	393459	40 %	20 %	20 %	20 %	428297082
6004	NC_019751	CAA	2	6	393515	393520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297082
6005	NC_019751	CAA	2	6	393545	393550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297082
6006	NC_019751	ATCG	2	8	393586	393593	25 %	25 %	25 %	25 %	428297082
6007	NC_019751	TTGA	2	8	393674	393681	25 %	50 %	25 %	0 %	428297082
6008	NC_019751	GTG	2	6	393713	393718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297082
6009	NC_019751	CCG	2	6	393732	393737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428297082
6010	NC_019751	TCGA	2	8	393744	393751	25 %	25 %	25 %	25 %	428297082
6011	NC_019751	TAA	2	6	393790	393795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297082
6012	NC_019751	TCAGGC	2	12	393808	393819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6013	NC_019751	GAT	2	6	393850	393855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297082
6014	NC_019751	TCGA	2	8	393870	393877	25 %	25 %	25 %	25 %	428297082
6015	NC_019751	AGC	2	6	393912	393917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6016	NC_019751	TAATT	2	10	393982	393991	40 %	60 %	0 %	0 %	428297082
6017	NC_019751	GCA	2	6	394000	394005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6018	NC_019751	CAG	2	6	394138	394143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6019	NC_019751	GCG	2	6	394188	394193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428297082
6020	NC_019751	TGA	2	6	394447	394452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297082
6021	NC_019751	CGA	2	6	394471	394476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6022	NC_019751	TCA	2	6	394660	394665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297082
6023	NC_019751	GAC	2	6	394724	394729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6024	NC_019751	TCA	2	6	394951	394956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297082
6025	NC_019751	GCTA	2	8	395101	395108	25 %	25 %	25 %	25 %	428297082
6026	NC_019751	GGC	2	6	395120	395125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428297082
6027	NC_019751	ATA	2	6	395202	395207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297082
6028	NC_019751	ATT	2	6	395279	395284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297082
6029	NC_019751	TGC	2	6	395312	395317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6030	NC_019751	AGT	2	6	395387	395392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297082
6031	NC_019751	GGT	2	6	395633	395638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297082
6032	NC_019751	TCA	2	6	395704	395709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297082
6033	NC_019751	GT	3	6	395841	395846	0 %	50 %	50 %	0 %	428297082
6034	NC_019751	GTT	2	6	395896	395901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428297082
6035	NC_019751	CCA	2	6	395922	395927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428297082
6036	NC_019751	CGC	2	6	395976	395981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428297082
6037	NC_019751	CTG	2	6	396024	396029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6038	NC_019751	CAG	2	6	396032	396037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297082
6039	NC_019751	AAC	2	6	396195	396200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297083
6040	NC_019751	ATC	3	9	396210	396218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297083
6041	NC_019751	TCC	2	6	396220	396225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428297084
6042	NC_019751	TCT	2	6	396269	396274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297084
6043	NC_019751	TGGC	2	8	396327	396334	0 %	25 %	50 %	25 %	428297084
6044	NC_019751	GAA	2	6	396385	396390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297084
6045	NC_019751	AAAG	2	8	396453	396460	75 %	0 %	25 %	0 %	428297084
6046	NC_019751	A	6	6	396494	396499	100 %	0 %	0 %	0 %	428297084
6047	NC_019751	GT	3	6	396728	396733	0 %	50 %	50 %	0 %	428297085
6048	NC_019751	AGCC	2	8	396813	396820	25 %	0 %	25 %	50 %	428297085
6049	NC_019751	GACC	2	8	396867	396874	25 %	0 %	25 %	50 %	428297085
6050	NC_019751	AGC	2	6	396914	396919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297085
6051	NC_019751	CGG	2	6	396990	396995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428297085
6052	NC_019751	CG	3	6	397029	397034	0 %	0 %	50 %	50 %	428297085
6053	NC_019751	TCGC	2	8	397090	397097	0 %	25 %	25 %	50 %	428297085
6054	NC_019751	CTG	2	6	397105	397110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297085
6055	NC_019751	GAG	2	6	397188	397193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428297085
6056	NC_019751	TCGA	2	8	397213	397220	25 %	25 %	25 %	25 %	428297085
6057	NC_019751	TCG	2	6	397461	397466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297086
6058	NC_019751	CAG	2	6	397659	397664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297087
6059	NC_019751	CACAG	2	10	397666	397675	40 %	0 %	20 %	40 %	428297087
6060	NC_019751	TCGA	2	8	397738	397745	25 %	25 %	25 %	25 %	428297087
6061	NC_019751	GCT	2	6	397777	397782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297087
6062	NC_019751	CGG	2	6	397806	397811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428297087
6063	NC_019751	GATGG	2	10	397868	397877	20 %	20 %	60 %	0 %	428297087
6064	NC_019751	GCC	2	6	397917	397922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428297087
6065	NC_019751	CTA	2	6	397988	397993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297087
6066	NC_019751	CAAA	2	8	398036	398043	75 %	0 %	0 %	25 %	428297087
6067	NC_019751	GCCC	2	8	398096	398103	0 %	0 %	25 %	75 %	428297087
6068	NC_019751	CGA	2	6	398114	398119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297087
6069	NC_019751	ACC	2	6	398122	398127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428297087
6070	NC_019751	CAG	2	6	398157	398162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297087
6071	NC_019751	GTAA	2	8	398165	398172	50 %	25 %	25 %	0 %	428297087
6072	NC_019751	TCCA	2	8	398207	398214	25 %	25 %	0 %	50 %	428297087
6073	NC_019751	GTG	2	6	398265	398270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297087
6074	NC_019751	GAG	2	6	398281	398286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428297087
6075	NC_019751	AG	3	6	398285	398290	50 %	0 %	50 %	0 %	428297087
6076	NC_019751	CCG	2	6	398291	398296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428297087
6077	NC_019751	CAG	2	6	398338	398343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297087
6078	NC_019751	TCG	2	6	398436	398441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297087
6079	NC_019751	ACT	2	6	398587	398592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297088
6080	NC_019751	GGC	2	6	398617	398622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428297088
6081	NC_019751	AAC	2	6	398623	398628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297088
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6083	NC_019751	CGAAA	2	10	398885	398894	60 %	0 %	20 %	20 %	428297088
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6085	NC_019751	CGA	2	6	400202	400207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297089
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6087	NC_019751	GCC	2	6	400251	400256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428297089
6088	NC_019751	TCT	2	6	400363	400368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297089
6089	NC_019751	CG	3	6	400450	400455	0 %	0 %	50 %	50 %	428297089
6090	NC_019751	CTA	2	6	400478	400483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297089
6091	NC_019751	GCT	2	6	400502	400507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297089
6092	NC_019751	TCGA	2	8	400515	400522	25 %	25 %	25 %	25 %	428297089
6093	NC_019751	CTA	2	6	400526	400531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297089
6094	NC_019751	AAT	2	6	400628	400633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297089
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6096	NC_019751	AAT	2	6	400729	400734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297089
6097	NC_019751	CGAT	2	8	401553	401560	25 %	25 %	25 %	25 %	428297090
6098	NC_019751	CGC	3	9	401572	401580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428297090
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6101	NC_019751	TAC	2	6	401628	401633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297090
6102	NC_019751	TGC	3	9	401698	401706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297090
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6104	NC_019751	CAAAAT	2	12	401763	401774	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428297090
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6106	NC_019751	CG	3	6	401797	401802	0 %	0 %	50 %	50 %	428297090
6107	NC_019751	CCGTTG	2	12	401811	401822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297090
6108	NC_019751	C	7	7	401823	401829	0 %	0 %	0 %	100 %	428297090
6109	NC_019751	CGA	2	6	401969	401974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297090
6110	NC_019751	TCGA	2	8	401975	401982	25 %	25 %	25 %	25 %	428297090
6111	NC_019751	ACC	2	6	402013	402018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428297090
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6113	NC_019751	CAAATC	2	12	402180	402191	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428297090
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6117	NC_019751	CATC	2	8	402308	402315	25 %	25 %	0 %	50 %	428297090
6118	NC_019751	GAAT	2	8	402350	402357	50 %	25 %	25 %	0 %	428297090
6119	NC_019751	CAA	2	6	402423	402428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297090
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6485	NC_019751	TGC	2	6	427598	427603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297112
6486	NC_019751	ATTT	2	8	427683	427690	25 %	75 %	0 %	0 %	428297112
6487	NC_019751	AAT	2	6	427714	427719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297112
6488	NC_019751	AAT	2	6	427792	427797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297112
6489	NC_019751	GTC	2	6	427861	427866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297112
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6491	NC_019751	TTC	2	6	428015	428020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297112
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