MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 2360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019744	TCA	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389957
2	NC_019744	CAA	2	6	628	633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389957
3	NC_019744	TTG	2	6	638	643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389957
4	NC_019744	AAC	2	6	660	665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389957
5	NC_019744	TTTAG	2	10	689	698	20 %	60 %	20 %	0 %	434389957
6	NC_019744	ATT	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389957
7	NC_019744	GCC	2	6	824	829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389957
8	NC_019744	TCAC	2	8	834	841	25 %	25 %	0 %	50 %	434389957
9	NC_019744	GTT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389957
10	NC_019744	ATT	2	6	961	966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389957
11	NC_019744	TGC	2	6	967	972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389957
12	NC_019744	ATG	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389957
13	NC_019744	AGC	3	9	1039	1047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389957
14	NC_019744	TAC	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389957
15	NC_019744	ATT	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389957
16	NC_019744	TTG	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389957
17	NC_019744	CAA	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389957
18	NC_019744	GGT	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389957
19	NC_019744	CAAC	3	12	1612	1623	50 %	0 %	0 %	50 %	434389957
20	NC_019744	ATT	2	6	1634	1639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389957
21	NC_019744	TCAA	2	8	1659	1666	50 %	25 %	0 %	25 %	434389957
22	NC_019744	GCT	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389957
23	NC_019744	GAA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389957
24	NC_019744	AGC	2	6	1783	1788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389957
25	NC_019744	CTT	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389957
26	NC_019744	CCT	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389957
27	NC_019744	A	6	6	1873	1878	100 %	0 %	0 %	0 %	434389957
28	NC_019744	CTA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
29	NC_019744	TC	3	6	2235	2240	0 %	50 %	0 %	50 %	434389958
30	NC_019744	TGC	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389958
31	NC_019744	ATT	2	6	2379	2384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389958
32	NC_019744	CAT	2	6	2396	2401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
33	NC_019744	GTTT	2	8	2426	2433	0 %	75 %	25 %	0 %	434389958
34	NC_019744	GAA	2	6	2490	2495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389958
35	NC_019744	CCA	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389958
36	NC_019744	A	6	6	2501	2506	100 %	0 %	0 %	0 %	434389958
37	NC_019744	CAC	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389958
38	NC_019744	CGA	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389958
39	NC_019744	GGA	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389958
40	NC_019744	ACA	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389958
41	NC_019744	AATT	2	8	2641	2648	50 %	50 %	0 %	0 %	434389958
42	NC_019744	TCT	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389958
43	NC_019744	GTT	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389958
44	NC_019744	TGG	2	6	2776	2781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389958
45	NC_019744	TGG	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389958
46	NC_019744	AAT	2	6	2846	2851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389958
47	NC_019744	TAT	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389958
48	NC_019744	CAA	2	6	2994	2999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389958
49	NC_019744	GCA	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389958
50	NC_019744	TAC	2	6	3130	3135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
51	NC_019744	CTA	2	6	3139	3144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
52	NC_019744	CTG	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389958
53	NC_019744	ACA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389958
54	NC_019744	ATC	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
55	NC_019744	ATTA	2	8	3833	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	434389959
56	NC_019744	ATC	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389959
57	NC_019744	GAT	2	6	3917	3922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389959
58	NC_019744	ATGA	2	8	4049	4056	50 %	25 %	25 %	0 %	434389959
59	NC_019744	ATTT	2	8	4111	4118	25 %	75 %	0 %	0 %	434389959
60	NC_019744	GATTTT	2	12	4169	4180	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434389959
61	NC_019744	AATC	2	8	4238	4245	50 %	25 %	0 %	25 %	434389959
62	NC_019744	TCA	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389959
63	NC_019744	TTG	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389959
64	NC_019744	AGA	2	6	4525	4530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389959
65	NC_019744	AATT	2	8	4536	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	434389959
66	NC_019744	TTCC	2	8	4557	4564	0 %	50 %	0 %	50 %	434389959
67	NC_019744	ACA	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389959
68	NC_019744	G	6	6	4705	4710	0 %	0 %	100 %	0 %	434389959
69	NC_019744	CGA	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389959
70	NC_019744	GACTCA	2	12	4863	4874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434389959
71	NC_019744	AGC	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389959
72	NC_019744	AAGCTG	2	12	4911	4922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434389959
73	NC_019744	GTT	2	6	4945	4950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389959
74	NC_019744	GCT	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389959
75	NC_019744	TGAT	2	8	5040	5047	25 %	50 %	25 %	0 %	434389959
76	NC_019744	GT	3	6	5094	5099	0 %	50 %	50 %	0 %	434389959
77	NC_019744	TCT	2	6	5100	5105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389959
78	NC_019744	CTG	2	6	5120	5125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389959
79	NC_019744	TGTT	2	8	5196	5203	0 %	75 %	25 %	0 %	434389959
80	NC_019744	TAT	2	6	5227	5232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389959
81	NC_019744	TAC	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389959
82	NC_019744	ACT	2	6	5316	5321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389959
83	NC_019744	TCT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389959
84	NC_019744	TTCTGG	2	12	5454	5465	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434389959
85	NC_019744	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389959
86	NC_019744	GACT	2	8	5508	5515	25 %	25 %	25 %	25 %	434389959
87	NC_019744	TAT	2	6	5540	5545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389959
88	NC_019744	A	6	6	5561	5566	100 %	0 %	0 %	0 %	434389959
89	NC_019744	GTT	2	6	5585	5590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389959
90	NC_019744	TAT	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389960
91	NC_019744	TAT	2	6	5835	5840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
92	NC_019744	T	6	6	5840	5845	0 %	100 %	0 %	0 %	434389961
93	NC_019744	AGA	2	6	5879	5884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389961
94	NC_019744	TAAC	2	8	5902	5909	50 %	25 %	0 %	25 %	434389961
95	NC_019744	T	6	6	5920	5925	0 %	100 %	0 %	0 %	434389961
96	NC_019744	A	6	6	5967	5972	100 %	0 %	0 %	0 %	434389961
97	NC_019744	ATT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
98	NC_019744	TGA	2	6	6027	6032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389961
99	NC_019744	TAG	2	6	6061	6066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389961
100	NC_019744	TAAT	2	8	6070	6077	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
101	NC_019744	TGTA	2	8	6100	6107	25 %	50 %	25 %	0 %	434389961
102	NC_019744	ACC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389961
103	NC_019744	ATT	2	6	6128	6133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
104	NC_019744	CAGTTT	2	12	6142	6153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434389961
105	NC_019744	AAAAT	2	10	6198	6207	80 %	20 %	0 %	0 %	434389961
106	NC_019744	CAC	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389961
107	NC_019744	TC	4	8	6255	6262	0 %	50 %	0 %	50 %	434389961
108	NC_019744	CTT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
109	NC_019744	ATC	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389961
110	NC_019744	TCA	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389961
111	NC_019744	TTC	2	6	6380	6385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
112	NC_019744	TA	3	6	6440	6445	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
113	NC_019744	TAAT	2	8	6459	6466	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
114	NC_019744	CTT	2	6	6469	6474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
115	NC_019744	ATT	4	12	6488	6499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
116	NC_019744	T	6	6	6511	6516	0 %	100 %	0 %	0 %	434389961
117	NC_019744	TCT	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
118	NC_019744	ATT	2	6	6618	6623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
119	NC_019744	T	6	6	6622	6627	0 %	100 %	0 %	0 %	434389961
120	NC_019744	TCT	2	6	6672	6677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
121	NC_019744	T	8	8	6680	6687	0 %	100 %	0 %	0 %	434389961
122	NC_019744	TAG	2	6	6733	6738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389961
123	NC_019744	T	6	6	6751	6756	0 %	100 %	0 %	0 %	434389961
124	NC_019744	ATTG	2	8	6796	6803	25 %	50 %	25 %	0 %	434389961
125	NC_019744	ACA	2	6	6816	6821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389961
126	NC_019744	GTT	3	9	6829	6837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389961
127	NC_019744	T	8	8	6836	6843	0 %	100 %	0 %	0 %	434389961
128	NC_019744	TTC	2	6	6851	6856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
129	NC_019744	CTATTT	2	12	6883	6894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434389961
130	NC_019744	TTGT	2	8	6901	6908	0 %	75 %	25 %	0 %	434389961
131	NC_019744	ATTT	2	8	6919	6926	25 %	75 %	0 %	0 %	434389961
132	NC_019744	TAA	2	6	6940	6945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389961
133	NC_019744	T	6	6	7027	7032	0 %	100 %	0 %	0 %	434389961
134	NC_019744	TTC	3	9	7073	7081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
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261	NC_019744	TGG	2	6	13582	13587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389967
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392	NC_019744	TCAT	2	8	23128	23135	25 %	50 %	0 %	25 %	434389974
393	NC_019744	ATT	3	9	23195	23203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389974
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