MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 2360

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019744	TGG	2	6	131614	131619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390053
2002	NC_019744	GGA	2	6	131710	131715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434390053
2003	NC_019744	GAC	2	6	132104	132109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390054
2004	NC_019744	GTT	2	6	132138	132143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390054
2005	NC_019744	CAG	2	6	132157	132162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390054
2006	NC_019744	ATT	2	6	132266	132271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390054
2007	NC_019744	CAC	2	6	132411	132416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434390054
2008	NC_019744	TAT	2	6	132427	132432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390054
2009	NC_019744	AGC	2	6	132463	132468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390054
2010	NC_019744	TGC	2	6	132559	132564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390054
2011	NC_019744	AG	4	8	132672	132679	50 %	0 %	50 %	0 %	434390054
2012	NC_019744	TTC	2	6	132697	132702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390054
2013	NC_019744	TCA	3	9	132736	132744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390055
2014	NC_019744	CAA	2	6	132752	132757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390055
2015	NC_019744	A	6	6	132772	132777	100 %	0 %	0 %	0 %	434390055
2016	NC_019744	GATT	2	8	132852	132859	25 %	50 %	25 %	0 %	434390055
2017	NC_019744	TCA	2	6	132868	132873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390055
2018	NC_019744	ATT	2	6	132938	132943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390055
2019	NC_019744	AT	3	6	132952	132957	50 %	50 %	0 %	0 %	434390055
2020	NC_019744	CAA	2	6	132958	132963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390055
2021	NC_019744	ATCA	2	8	133063	133070	50 %	25 %	0 %	25 %	434390055
2022	NC_019744	ATTTA	2	10	133132	133141	40 %	60 %	0 %	0 %	434390055
2023	NC_019744	ACAA	2	8	133156	133163	75 %	0 %	0 %	25 %	434390055
2024	NC_019744	AACT	2	8	133425	133432	50 %	25 %	0 %	25 %	434390055
2025	NC_019744	A	6	6	133449	133454	100 %	0 %	0 %	0 %	434390055
2026	NC_019744	TTG	2	6	133566	133571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390055
2027	NC_019744	AAG	2	6	133593	133598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390055
2028	NC_019744	ACAG	2	8	133608	133615	50 %	0 %	25 %	25 %	434390055
2029	NC_019744	AAC	2	6	133664	133669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390055
2030	NC_019744	CAGGTG	2	12	133689	133700	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434390055
2031	NC_019744	CAA	2	6	133736	133741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390055
2032	NC_019744	GGT	2	6	133748	133753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390055
2033	NC_019744	TGG	2	6	133777	133782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390055
2034	NC_019744	TG	3	6	133831	133836	0 %	50 %	50 %	0 %	434390055
2035	NC_019744	TTC	2	6	133877	133882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390055
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2037	NC_019744	T	6	6	133948	133953	0 %	100 %	0 %	0 %	434390055
2038	NC_019744	T	6	6	134094	134099	0 %	100 %	0 %	0 %	434390056
2039	NC_019744	TC	3	6	134151	134156	0 %	50 %	0 %	50 %	434390056
2040	NC_019744	A	6	6	134222	134227	100 %	0 %	0 %	0 %	434390056
2041	NC_019744	GGA	2	6	134252	134257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434390056
2042	NC_019744	AAAG	2	8	134281	134288	75 %	0 %	25 %	0 %	434390056
2043	NC_019744	CAAA	2	8	134293	134300	75 %	0 %	0 %	25 %	434390056
2044	NC_019744	CT	3	6	134328	134333	0 %	50 %	0 %	50 %	434390056
2045	NC_019744	GAT	2	6	134479	134484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390056
2046	NC_019744	ACCCA	2	10	134535	134544	40 %	0 %	0 %	60 %	434390056
2047	NC_019744	CAA	2	6	134692	134697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390056
2048	NC_019744	ATG	2	6	134708	134713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390056
2049	NC_019744	GCT	2	6	134714	134719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390056
2050	NC_019744	T	7	7	134734	134740	0 %	100 %	0 %	0 %	434390056
2051	NC_019744	CTG	2	6	134745	134750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390056
2052	NC_019744	AAAC	2	8	134786	134793	75 %	0 %	0 %	25 %	434390056
2053	NC_019744	TAG	2	6	134830	134835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390056
2054	NC_019744	GTT	2	6	134902	134907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390056
2055	NC_019744	TTG	2	6	135003	135008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390056
2056	NC_019744	ACT	2	6	135014	135019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390056
2057	NC_019744	GAT	2	6	135046	135051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390056
2058	NC_019744	ACG	2	6	135073	135078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390056
2059	NC_019744	A	6	6	135140	135145	100 %	0 %	0 %	0 %	434390056
2060	NC_019744	GTT	2	6	135161	135166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390056
2061	NC_019744	CCTT	2	8	135182	135189	0 %	50 %	0 %	50 %	434390056
2062	NC_019744	TACC	2	8	135191	135198	25 %	25 %	0 %	50 %	434390056
2063	NC_019744	TAC	2	6	135284	135289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390056
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2066	NC_019744	A	6	6	135468	135473	100 %	0 %	0 %	0 %	434390056
2067	NC_019744	GTT	2	6	135481	135486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390056
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2071	NC_019744	GAT	2	6	135695	135700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390056
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2081	NC_019744	GTC	2	6	136628	136633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390057
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2088	NC_019744	TTG	2	6	136766	136771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390057
2089	NC_019744	TTG	2	6	136820	136825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390057
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2092	NC_019744	GAAT	2	8	136890	136897	50 %	25 %	25 %	0 %	434390057
2093	NC_019744	ACC	2	6	136971	136976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434390057
2094	NC_019744	GAT	2	6	136981	136986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390057
2095	NC_019744	GAATG	2	10	136993	137002	40 %	20 %	40 %	0 %	434390057
2096	NC_019744	AGG	2	6	137045	137050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434390057
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2099	NC_019744	ACA	2	6	137176	137181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390057
2100	NC_019744	GAA	2	6	137185	137190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390057
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2103	NC_019744	CAG	2	6	137402	137407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390057
2104	NC_019744	GA	3	6	137429	137434	50 %	0 %	50 %	0 %	434390057
2105	NC_019744	A	6	6	137482	137487	100 %	0 %	0 %	0 %	434390057
2106	NC_019744	CCA	2	6	137508	137513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434390057
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2111	NC_019744	ATC	2	6	137903	137908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390057
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2118	NC_019744	ATG	2	6	138317	138322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390057
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2121	NC_019744	AGAT	2	8	138434	138441	50 %	25 %	25 %	0 %	434390057
2122	NC_019744	CTAT	2	8	138900	138907	25 %	50 %	0 %	25 %	434390058
2123	NC_019744	ATC	2	6	138995	139000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390058
2124	NC_019744	TTC	2	6	139010	139015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390058
2125	NC_019744	CAT	2	6	139106	139111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390058
2126	NC_019744	TTAA	2	8	139121	139128	50 %	50 %	0 %	0 %	434390058
2127	NC_019744	ATTT	2	8	139131	139138	25 %	75 %	0 %	0 %	434390058
2128	NC_019744	AGA	2	6	139255	139260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390058
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2130	NC_019744	TAC	2	6	139410	139415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390058
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2136	NC_019744	TTC	2	6	140232	140237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390059
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2138	NC_019744	C	6	6	140281	140286	0 %	0 %	0 %	100 %	434390059
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2146	NC_019744	CTT	2	6	140812	140817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390060
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2150	NC_019744	CCAA	2	8	140960	140967	50 %	0 %	0 %	50 %	434390060
2151	NC_019744	CAG	2	6	141035	141040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390060
2152	NC_019744	AGCA	2	8	141049	141056	50 %	0 %	25 %	25 %	434390060
2153	NC_019744	AAT	2	6	141140	141145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390060
2154	NC_019744	TGT	2	6	141156	141161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390060
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2180	NC_019744	TCAAAG	2	12	142599	142610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434390062
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2191	NC_019744	TGT	2	6	143411	143416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390062
2192	NC_019744	ATC	2	6	143426	143431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390062
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2202	NC_019744	TCA	2	6	144039	144044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390062
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2210	NC_019744	AATA	2	8	144419	144426	75 %	25 %	0 %	0 %	434390062
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2212	NC_019744	CCAG	3	12	144641	144652	25 %	0 %	25 %	50 %	434390062
2213	NC_019744	GAC	2	6	144730	144735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390062
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2216	NC_019744	GTTT	2	8	144885	144892	0 %	75 %	25 %	0 %	434390062
2217	NC_019744	GATA	2	8	144930	144937	50 %	25 %	25 %	0 %	434390062
2218	NC_019744	TGAC	2	8	144951	144958	25 %	25 %	25 %	25 %	434390062
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2220	NC_019744	CTGGAT	2	12	145048	145059	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434390062
2221	NC_019744	A	6	6	145083	145088	100 %	0 %	0 %	0 %	434390062
2222	NC_019744	GATC	2	8	145133	145140	25 %	25 %	25 %	25 %	434390062
2223	NC_019744	A	6	6	145239	145244	100 %	0 %	0 %	0 %	434390062
2224	NC_019744	CCTT	2	8	145352	145359	0 %	50 %	0 %	50 %	434390063
2225	NC_019744	ACTC	2	8	145400	145407	25 %	25 %	0 %	50 %	434390063
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2229	NC_019744	TTTC	2	8	145547	145554	0 %	75 %	0 %	25 %	434390063
2230	NC_019744	CAAA	2	8	145568	145575	75 %	0 %	0 %	25 %	434390063
2231	NC_019744	GCT	2	6	145691	145696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390063
2232	NC_019744	ACT	2	6	145764	145769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390063
2233	NC_019744	T	6	6	145802	145807	0 %	100 %	0 %	0 %	434390063
2234	NC_019744	AAG	2	6	145993	145998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390063
2235	NC_019744	AAG	2	6	146055	146060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390063
2236	NC_019744	AAT	2	6	146064	146069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390063
2237	NC_019744	T	6	6	146082	146087	0 %	100 %	0 %	0 %	434390063
2238	NC_019744	TTG	2	6	146132	146137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390063
2239	NC_019744	GCA	2	6	146249	146254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390063
2240	NC_019744	GGTA	2	8	146269	146276	25 %	25 %	50 %	0 %	434390063
2241	NC_019744	GTGAA	2	10	146299	146308	40 %	20 %	40 %	0 %	434390063
2242	NC_019744	AAT	2	6	146319	146324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390063
2243	NC_019744	TGCT	2	8	146487	146494	0 %	50 %	25 %	25 %	434390063
2244	NC_019744	CTG	2	6	146501	146506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390063
2245	NC_019744	TAA	2	6	146560	146565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390063
2246	NC_019744	GTG	2	6	146634	146639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390064
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2248	NC_019744	CCAT	2	8	146737	146744	25 %	25 %	0 %	50 %	434390064
2249	NC_019744	GCT	2	6	146756	146761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390064
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2268	NC_019744	TCCA	2	8	147638	147645	25 %	25 %	0 %	50 %	434390064
2269	NC_019744	AAACTC	2	12	149076	149087	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434390065
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