MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 5517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019699	TGC	2	6	337519	337524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205041
5002	NC_019699	GCT	2	6	337545	337550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205041
5003	NC_019699	ACT	2	6	337565	337570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205041
5004	NC_019699	AGT	2	6	337610	337615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205041
5005	NC_019699	TGG	2	6	337685	337690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205041
5006	NC_019699	CGT	2	6	337737	337742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205041
5007	NC_019699	AGCC	2	8	337780	337787	25 %	0 %	25 %	50 %	428205041
5008	NC_019699	TTGAA	2	10	337852	337861	40 %	40 %	20 %	0 %	428205041
5009	NC_019699	TGC	2	6	338121	338126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205042
5010	NC_019699	GTT	3	9	338230	338238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205042
5011	NC_019699	TGC	2	6	338262	338267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205042
5012	NC_019699	GTA	2	6	338289	338294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205042
5013	NC_019699	AGC	2	6	338349	338354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205042
5014	NC_019699	GCT	2	6	338486	338491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205042
5015	NC_019699	GTT	2	6	338538	338543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205042
5016	NC_019699	ATC	2	6	338610	338615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205042
5017	NC_019699	CTT	2	6	338654	338659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205042
5018	NC_019699	TTCG	2	8	338730	338737	0 %	50 %	25 %	25 %	428205042
5019	NC_019699	AGC	3	9	338820	338828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205042
5020	NC_019699	GCT	2	6	339296	339301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205043
5021	NC_019699	T	6	6	339305	339310	0 %	100 %	0 %	0 %	428205043
5022	NC_019699	AAC	2	6	339339	339344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205043
5023	NC_019699	AAC	2	6	339375	339380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205043
5024	NC_019699	GCT	2	6	339454	339459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205043
5025	NC_019699	CCGC	2	8	339463	339470	0 %	0 %	25 %	75 %	428205043
5026	NC_019699	ACT	2	6	339526	339531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205043
5027	NC_019699	GAA	2	6	339597	339602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205043
5028	NC_019699	GAA	2	6	339714	339719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205043
5029	NC_019699	CTG	2	6	339783	339788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205043
5030	NC_019699	CGC	2	6	339852	339857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205043
5031	NC_019699	AGA	2	6	339865	339870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205043
5032	NC_019699	GTAC	2	8	339882	339889	25 %	25 %	25 %	25 %	428205043
5033	NC_019699	GC	3	6	340061	340066	0 %	0 %	50 %	50 %	428205044
5034	NC_019699	GATC	2	8	340075	340082	25 %	25 %	25 %	25 %	428205044
5035	NC_019699	AACA	2	8	340180	340187	75 %	0 %	0 %	25 %	428205044
5036	NC_019699	CAA	3	9	340194	340202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205044
5037	NC_019699	T	6	6	340232	340237	0 %	100 %	0 %	0 %	428205044
5038	NC_019699	T	6	6	340245	340250	0 %	100 %	0 %	0 %	428205044
5039	NC_019699	CAA	2	6	340254	340259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205044
5040	NC_019699	GCG	2	6	340284	340289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205044
5041	NC_019699	GAAAA	2	10	340350	340359	80 %	0 %	20 %	0 %	428205044
5042	NC_019699	CTG	2	6	340423	340428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205044
5043	NC_019699	TCT	2	6	340538	340543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205044
5044	NC_019699	TGA	2	6	340562	340567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205044
5045	NC_019699	GGC	2	6	340583	340588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205044
5046	NC_019699	CCT	2	6	340641	340646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205044
5047	NC_019699	AGA	2	6	340715	340720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205044
5048	NC_019699	GCA	2	6	340781	340786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205044
5049	NC_019699	AGC	2	6	340788	340793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205044
5050	NC_019699	ATG	2	6	340891	340896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205044
5051	NC_019699	GCTACT	2	12	340917	340928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428205044
5052	NC_019699	ACA	2	6	340998	341003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205044
5053	NC_019699	CCA	2	6	341033	341038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205044
5054	NC_019699	GCGA	2	8	341093	341100	25 %	0 %	50 %	25 %	428205044
5055	NC_019699	CGG	2	6	341108	341113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205044
5056	NC_019699	TTG	2	6	341173	341178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205044
5057	NC_019699	ACA	2	6	341182	341187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205044
5058	NC_019699	CTA	2	6	341237	341242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205044
5059	NC_019699	A	6	6	341250	341255	100 %	0 %	0 %	0 %	428205044
5060	NC_019699	TCT	2	6	341262	341267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205044
5061	NC_019699	ATT	2	6	341302	341307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205044
5062	NC_019699	TTG	2	6	341308	341313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205044
5063	NC_019699	CTA	2	6	341344	341349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205044
5064	NC_019699	CTC	2	6	341370	341375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205044
5065	NC_019699	TCGC	2	8	341462	341469	0 %	25 %	25 %	50 %	428205044
5066	NC_019699	ATA	2	6	341521	341526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205044
5067	NC_019699	AAC	2	6	341543	341548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205044
5068	NC_019699	ACGAA	2	10	341683	341692	60 %	0 %	20 %	20 %	428205044
5069	NC_019699	CT	3	6	341765	341770	0 %	50 %	0 %	50 %	428205044
5070	NC_019699	TTC	2	6	341886	341891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205044
5071	NC_019699	CAT	2	6	341957	341962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205044
5072	NC_019699	CAT	2	6	341984	341989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205044
5073	NC_019699	GGTC	2	8	342052	342059	0 %	25 %	50 %	25 %	428205044
5074	NC_019699	TAT	2	6	342072	342077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205044
5075	NC_019699	TG	3	6	342091	342096	0 %	50 %	50 %	0 %	428205044
5076	NC_019699	ATTTC	2	10	342108	342117	20 %	60 %	0 %	20 %	428205044
5077	NC_019699	AAC	2	6	342151	342156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205044
5078	NC_019699	AAC	2	6	342283	342288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205045
5079	NC_019699	CAG	2	6	342358	342363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205045
5080	NC_019699	AAC	2	6	342398	342403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205045
5081	NC_019699	TGC	2	6	342410	342415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205045
5082	NC_019699	ATT	2	6	342420	342425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205045
5083	NC_019699	GCC	2	6	342508	342513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205045
5084	NC_019699	GGA	2	6	342575	342580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205045
5085	NC_019699	ATT	2	6	342606	342611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205045
5086	NC_019699	ATC	2	6	342628	342633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205045
5087	NC_019699	AGA	2	6	342656	342661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205045
5088	NC_019699	GAA	2	6	342843	342848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205045
5089	NC_019699	TAGA	2	8	342895	342902	50 %	25 %	25 %	0 %	428205045
5090	NC_019699	CAG	2	6	342922	342927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205045
5091	NC_019699	CGCT	2	8	342979	342986	0 %	25 %	25 %	50 %	428205045
5092	NC_019699	GTTT	2	8	343032	343039	0 %	75 %	25 %	0 %	428205045
5093	NC_019699	ATT	2	6	343043	343048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205045
5094	NC_019699	AAC	2	6	343051	343056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205045
5095	NC_019699	AAG	2	6	343068	343073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205045
5096	NC_019699	TTA	2	6	343080	343085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205045
5097	NC_019699	CAG	2	6	343183	343188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205045
5098	NC_019699	TAAA	2	8	343189	343196	75 %	25 %	0 %	0 %	428205045
5099	NC_019699	AATC	2	8	343223	343230	50 %	25 %	0 %	25 %	428205045
5100	NC_019699	AC	3	6	343337	343342	50 %	0 %	0 %	50 %	428205045
5101	NC_019699	AGA	2	6	343352	343357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205045
5102	NC_019699	T	7	7	343367	343373	0 %	100 %	0 %	0 %	428205045
5103	NC_019699	CAGA	2	8	343404	343411	50 %	0 %	25 %	25 %	428205045
5104	NC_019699	CAAC	2	8	343420	343427	50 %	0 %	0 %	50 %	428205045
5105	NC_019699	AGG	2	6	343545	343550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205046
5106	NC_019699	ATT	2	6	343570	343575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205046
5107	NC_019699	TAC	2	6	343608	343613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205046
5108	NC_019699	TTTA	2	8	343639	343646	25 %	75 %	0 %	0 %	428205046
5109	NC_019699	TATG	2	8	343689	343696	25 %	50 %	25 %	0 %	428205046
5110	NC_019699	TTTC	2	8	343705	343712	0 %	75 %	0 %	25 %	428205046
5111	NC_019699	GGTT	3	12	343756	343767	0 %	50 %	50 %	0 %	428205046
5112	NC_019699	TACTT	2	10	343791	343800	20 %	60 %	0 %	20 %	428205046
5113	NC_019699	CAG	2	6	343802	343807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205046
5114	NC_019699	ACA	2	6	343830	343835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205046
5115	NC_019699	ATAA	2	8	343837	343844	75 %	25 %	0 %	0 %	428205046
5116	NC_019699	TTTTA	2	10	343884	343893	20 %	80 %	0 %	0 %	428205046
5117	NC_019699	GTTT	2	8	343907	343914	0 %	75 %	25 %	0 %	428205046
5118	NC_019699	ATA	2	6	343972	343977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205046
5119	NC_019699	TA	3	6	344005	344010	50 %	50 %	0 %	0 %	428205046
5120	NC_019699	ATTTA	2	10	344027	344036	40 %	60 %	0 %	0 %	428205046
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5122	NC_019699	TGC	2	6	344082	344087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205046
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5242	NC_019699	TCT	2	6	350425	350430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205053
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5244	NC_019699	TAT	2	6	350505	350510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205053
5245	NC_019699	T	6	6	350553	350558	0 %	100 %	0 %	0 %	428205053
5246	NC_019699	CAT	2	6	350603	350608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205053
5247	NC_019699	CAA	2	6	350611	350616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205053
5248	NC_019699	GATC	2	8	350649	350656	25 %	25 %	25 %	25 %	428205053
5249	NC_019699	TAC	2	6	350727	350732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205053
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5251	NC_019699	CAGC	2	8	350887	350894	25 %	0 %	25 %	50 %	428205053
5252	NC_019699	CCT	2	6	350945	350950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205053
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5259	NC_019699	TAC	2	6	351778	351783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205054
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5263	NC_019699	CTGT	2	8	351951	351958	0 %	50 %	25 %	25 %	428205054
5264	NC_019699	AAG	2	6	352003	352008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205054
5265	NC_019699	ACGC	2	8	352046	352053	25 %	0 %	25 %	50 %	428205054
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5269	NC_019699	CTT	2	6	352423	352428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205054
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5273	NC_019699	CAAC	2	8	352761	352768	50 %	0 %	0 %	50 %	428205054
5274	NC_019699	GTA	2	6	352822	352827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205054
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5277	NC_019699	GTA	2	6	352978	352983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205054
5278	NC_019699	GGAGAA	2	12	353001	353012	50 %	0 %	50 %	0 %	428205054
5279	NC_019699	GCAG	2	8	353036	353043	25 %	0 %	50 %	25 %	428205054
5280	NC_019699	GC	3	6	353083	353088	0 %	0 %	50 %	50 %	428205054
5281	NC_019699	TGC	2	6	353099	353104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205054
5282	NC_019699	CAG	2	6	353123	353128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205054
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5286	NC_019699	A	7	7	353810	353816	100 %	0 %	0 %	0 %	428205055
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5352	NC_019699	CATTT	2	10	357638	357647	20 %	60 %	0 %	20 %	428205058
5353	NC_019699	ATG	2	6	357734	357739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205058
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5356	NC_019699	TGAC	2	8	357833	357840	25 %	25 %	25 %	25 %	428205058
5357	NC_019699	CTG	2	6	357878	357883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205058
5358	NC_019699	G	6	6	358033	358038	0 %	0 %	100 %	0 %	428205058
5359	NC_019699	CTA	2	6	358057	358062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205058
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5361	NC_019699	GTTA	2	8	358119	358126	25 %	50 %	25 %	0 %	428205058
5362	NC_019699	GTT	2	6	358191	358196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205058
5363	NC_019699	GCG	2	6	358204	358209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205058
5364	NC_019699	ATTT	2	8	358667	358674	25 %	75 %	0 %	0 %	428205059
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5489	NC_019699	TTG	2	6	367548	367553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205068
5490	NC_019699	A	6	6	368518	368523	100 %	0 %	0 %	0 %	428205069
5491	NC_019699	GTA	2	6	368601	368606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205069
5492	NC_019699	GAG	2	6	368734	368739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205069
5493	NC_019699	ATT	2	6	368902	368907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205070
5494	NC_019699	GTA	2	6	368921	368926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205070
5495	NC_019699	GCTA	2	8	369058	369065	25 %	25 %	25 %	25 %	428205070
5496	NC_019699	CGG	2	6	369097	369102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205070
5497	NC_019699	CAGATC	2	12	369135	369146	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428205070
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