MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 99311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019695	CGC	2	6	248421	248426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205287
4002	NC_019695	AGTAC	2	10	248494	248503	40 %	20 %	20 %	20 %	428205287
4003	NC_019695	CAC	2	6	248508	248513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205287
4004	NC_019695	TGC	2	6	248535	248540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4005	NC_019695	TCTG	2	8	248557	248564	0 %	50 %	25 %	25 %	428205287
4006	NC_019695	ACC	2	6	248641	248646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205287
4007	NC_019695	TCT	2	6	248756	248761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205287
4008	NC_019695	GAC	2	6	248764	248769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4009	NC_019695	T	6	6	248787	248792	0 %	100 %	0 %	0 %	428205287
4010	NC_019695	CAT	2	6	248823	248828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205287
4011	NC_019695	TTGC	2	8	248879	248886	0 %	50 %	25 %	25 %	428205287
4012	NC_019695	CTG	2	6	248891	248896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4013	NC_019695	CTT	2	6	248996	249001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205287
4014	NC_019695	TCG	2	6	249032	249037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4015	NC_019695	GCG	2	6	249213	249218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205287
4016	NC_019695	CAA	2	6	249252	249257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205287
4017	NC_019695	TCT	2	6	249316	249321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205287
4018	NC_019695	TGT	2	6	249424	249429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
4019	NC_019695	GTC	2	6	249534	249539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4020	NC_019695	AAC	2	6	249627	249632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205287
4021	NC_019695	GCTT	2	8	249754	249761	0 %	50 %	25 %	25 %	428205287
4022	NC_019695	TCT	2	6	249832	249837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205287
4023	NC_019695	TG	3	6	249846	249851	0 %	50 %	50 %	0 %	428205287
4024	NC_019695	TAA	2	6	249876	249881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205287
4025	NC_019695	TGGA	2	8	249963	249970	25 %	25 %	50 %	0 %	428205287
4026	NC_019695	CGC	2	6	249975	249980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205287
4027	NC_019695	TAG	2	6	249992	249997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205287
4028	NC_019695	ACG	2	6	250000	250005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4029	NC_019695	TTC	2	6	250020	250025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205287
4030	NC_019695	GTT	2	6	250031	250036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
4031	NC_019695	GC	3	6	250072	250077	0 %	0 %	50 %	50 %	428205287
4032	NC_019695	GAC	3	9	250140	250148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4033	NC_019695	ACC	2	6	250218	250223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205287
4034	NC_019695	GA	3	6	250246	250251	50 %	0 %	50 %	0 %	428205287
4035	NC_019695	TTG	2	6	250260	250265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
4036	NC_019695	GTT	2	6	250292	250297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
4037	NC_019695	TCT	2	6	250348	250353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205287
4038	NC_019695	AGC	2	6	250452	250457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4039	NC_019695	TTG	2	6	250518	250523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
4040	NC_019695	TTC	2	6	250623	250628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205287
4041	NC_019695	GTT	2	6	250651	250656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
4042	NC_019695	GCT	2	6	250672	250677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4043	NC_019695	TTG	2	6	250683	250688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
4044	NC_019695	CTT	2	6	250712	250717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205287
4045	NC_019695	GCA	2	6	250729	250734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4046	NC_019695	A	6	6	250773	250778	100 %	0 %	0 %	0 %	428205287
4047	NC_019695	GC	3	6	250840	250845	0 %	0 %	50 %	50 %	428205287
4048	NC_019695	AAT	2	6	250854	250859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205287
4049	NC_019695	TC	3	6	250876	250881	0 %	50 %	0 %	50 %	428205287
4050	NC_019695	GCG	2	6	250888	250893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205287
4051	NC_019695	CTG	2	6	250913	250918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4052	NC_019695	CAC	2	6	251022	251027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205287
4053	NC_019695	AT	3	6	251083	251088	50 %	50 %	0 %	0 %	428205287
4054	NC_019695	CTA	2	6	251129	251134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205287
4055	NC_019695	CGT	2	6	251225	251230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4056	NC_019695	TTG	2	6	251268	251273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
4057	NC_019695	GAA	2	6	251280	251285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205287
4058	NC_019695	ACTGCT	2	12	251332	251343	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428205287
4059	NC_019695	T	6	6	251370	251375	0 %	100 %	0 %	0 %	428205287
4060	NC_019695	GTT	2	6	251390	251395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
4061	NC_019695	GCT	2	6	251459	251464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205287
4062	NC_019695	TTGG	2	8	251531	251538	0 %	50 %	50 %	0 %	428205287
4063	NC_019695	GAT	2	6	251681	251686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205288
4064	NC_019695	ACC	2	6	251703	251708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205288
4065	NC_019695	CAG	2	6	251770	251775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205288
4066	NC_019695	GAG	2	6	251782	251787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205288
4067	NC_019695	TAA	2	6	251837	251842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205288
4068	NC_019695	T	6	6	251852	251857	0 %	100 %	0 %	0 %	428205288
4069	NC_019695	CTG	2	6	251891	251896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205288
4070	NC_019695	CTG	2	6	251914	251919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205288
4071	NC_019695	TTG	2	6	251942	251947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205288
4072	NC_019695	TCGCC	2	10	252000	252009	0 %	20 %	20 %	60 %	428205288
4073	NC_019695	TGG	2	6	252122	252127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205288
4074	NC_019695	CTG	2	6	252146	252151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205288
4075	NC_019695	CAG	2	6	252160	252165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205288
4076	NC_019695	CTT	2	6	252166	252171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205288
4077	NC_019695	CTA	2	6	252190	252195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205288
4078	NC_019695	AGT	2	6	252314	252319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205289
4079	NC_019695	ACA	2	6	252413	252418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205289
4080	NC_019695	AAT	2	6	252499	252504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205289
4081	NC_019695	CTT	2	6	252540	252545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205289
4082	NC_019695	CCG	2	6	252575	252580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205289
4083	NC_019695	TGA	2	6	252597	252602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205289
4084	NC_019695	CGA	2	6	252627	252632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205289
4085	NC_019695	TCT	2	6	252763	252768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205290
4086	NC_019695	TCGA	2	8	252873	252880	25 %	25 %	25 %	25 %	428205290
4087	NC_019695	CAT	2	6	252887	252892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205290
4088	NC_019695	ATA	2	6	252904	252909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205290
4089	NC_019695	A	7	7	252991	252997	100 %	0 %	0 %	0 %	428205290
4090	NC_019695	CAA	2	6	253017	253022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205290
4091	NC_019695	CG	3	6	253032	253037	0 %	0 %	50 %	50 %	428205290
4092	NC_019695	GA	3	6	253038	253043	50 %	0 %	50 %	0 %	428205290
4093	NC_019695	A	6	6	253056	253061	100 %	0 %	0 %	0 %	428205290
4094	NC_019695	ATC	2	6	253116	253121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205290
4095	NC_019695	GCAA	2	8	253125	253132	50 %	0 %	25 %	25 %	428205290
4096	NC_019695	GGC	2	6	253162	253167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205290
4097	NC_019695	TGGC	2	8	253172	253179	0 %	25 %	50 %	25 %	428205290
4098	NC_019695	GCT	2	6	253180	253185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205290
4099	NC_019695	ATCA	2	8	253215	253222	50 %	25 %	0 %	25 %	428205290
4100	NC_019695	ACT	2	6	253291	253296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205290
4101	NC_019695	TTAG	2	8	253333	253340	25 %	50 %	25 %	0 %	428205290
4102	NC_019695	CAG	2	6	253352	253357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205290
4103	NC_019695	TGGT	2	8	253383	253390	0 %	50 %	50 %	0 %	428205290
4104	NC_019695	TAA	2	6	253391	253396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205290
4105	NC_019695	GCGA	2	8	253412	253419	25 %	0 %	50 %	25 %	428205290
4106	NC_019695	TTG	2	6	253455	253460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205290
4107	NC_019695	ATA	2	6	253469	253474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205290
4108	NC_019695	AGT	2	6	253489	253494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205290
4109	NC_019695	CGC	2	6	253584	253589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205290
4110	NC_019695	TGCT	2	8	253602	253609	0 %	50 %	25 %	25 %	428205290
4111	NC_019695	CT	3	6	253608	253613	0 %	50 %	0 %	50 %	428205290
4112	NC_019695	AG	3	6	253689	253694	50 %	0 %	50 %	0 %	428205290
4113	NC_019695	TTC	2	6	253799	253804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205290
4114	NC_019695	ATAA	2	8	253815	253822	75 %	25 %	0 %	0 %	428205290
4115	NC_019695	TAA	2	6	253851	253856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205290
4116	NC_019695	CT	3	6	253870	253875	0 %	50 %	0 %	50 %	428205290
4117	NC_019695	TGAC	2	8	253894	253901	25 %	25 %	25 %	25 %	428205290
4118	NC_019695	TCA	2	6	253928	253933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205290
4119	NC_019695	CTGG	2	8	254831	254838	0 %	25 %	50 %	25 %	428205291
4120	NC_019695	TGAG	2	8	254856	254863	25 %	25 %	50 %	0 %	428205291
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4122	NC_019695	TGG	2	6	254889	254894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205291
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4356	NC_019695	T	7	7	269964	269970	0 %	100 %	0 %	0 %	428205304
4357	NC_019695	TCAA	2	8	270006	270013	50 %	25 %	0 %	25 %	428205304
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4361	NC_019695	GATC	2	8	270262	270269	25 %	25 %	25 %	25 %	428205304
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4364	NC_019695	CGA	2	6	270363	270368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205304
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4488	NC_019695	TGG	2	6	277446	277451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205310
4489	NC_019695	TCA	2	6	277478	277483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205310
4490	NC_019695	ACC	2	6	277554	277559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205310
4491	NC_019695	GAC	3	9	277560	277568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205310
4492	NC_019695	GCC	2	6	277583	277588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205310
4493	NC_019695	AGC	2	6	277834	277839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205310
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