MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019682	AAC	2	6	153	158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715355
2	NC_019682	GTA	2	6	234	239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715355
3	NC_019682	TGA	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715355
4	NC_019682	ACGA	2	8	310	317	50 %	0 %	25 %	25 %	427715355
5	NC_019682	ATC	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715355
6	NC_019682	ATC	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715355
7	NC_019682	A	6	6	379	384	100 %	0 %	0 %	0 %	427715355
8	NC_019682	AG	3	6	486	491	50 %	0 %	50 %	0 %	427715355
9	NC_019682	TGG	2	6	512	517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715355
10	NC_019682	AGC	2	6	680	685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715355
11	NC_019682	TGT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715355
12	NC_019682	TGA	2	6	701	706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715355
13	NC_019682	AAG	2	6	739	744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715355
14	NC_019682	T	6	6	747	752	0 %	100 %	0 %	0 %	427715355
15	NC_019682	GTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715355
16	NC_019682	A	6	6	921	926	100 %	0 %	0 %	0 %	427715355
17	NC_019682	GTGAT	2	10	955	964	20 %	40 %	40 %	0 %	427715355
18	NC_019682	GCC	2	6	1091	1096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715355
19	NC_019682	AGC	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715355
20	NC_019682	CGA	3	9	1188	1196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715355
21	NC_019682	GA	3	6	1195	1200	50 %	0 %	50 %	0 %	427715355
22	NC_019682	GTAT	2	8	1222	1229	25 %	50 %	25 %	0 %	427715355
23	NC_019682	GAA	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715355
24	NC_019682	GGT	2	6	1281	1286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715355
25	NC_019682	AAT	2	6	1411	1416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715355
26	NC_019682	GC	3	6	1859	1864	0 %	0 %	50 %	50 %	427715356
27	NC_019682	CGAC	2	8	1915	1922	25 %	0 %	25 %	50 %	427715356
28	NC_019682	GAT	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715356
29	NC_019682	TGG	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715356
30	NC_019682	GC	3	6	2202	2207	0 %	0 %	50 %	50 %	427715356
31	NC_019682	AAC	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715356
32	NC_019682	AGC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715356
33	NC_019682	TTGA	2	8	2281	2288	25 %	50 %	25 %	0 %	427715356
34	NC_019682	CTA	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715356
35	NC_019682	AGT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715356
36	NC_019682	GGT	4	12	2443	2454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715356
37	NC_019682	CCAG	2	8	2473	2480	25 %	0 %	25 %	50 %	427715356
38	NC_019682	AGA	2	6	2723	2728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715356
39	NC_019682	ATA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715356
40	NC_019682	CAA	2	6	2764	2769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715356
41	NC_019682	TCT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715357
42	NC_019682	AGCA	2	8	3385	3392	50 %	0 %	25 %	25 %	427715357
43	NC_019682	GTA	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
44	NC_019682	CAA	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715357
45	NC_019682	GTT	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715357
46	NC_019682	CGT	2	6	3602	3607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715357
47	NC_019682	TCT	2	6	3608	3613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715357
48	NC_019682	CTT	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715357
49	NC_019682	TAG	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
50	NC_019682	GTA	2	6	3693	3698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
51	NC_019682	GCA	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715357
52	NC_019682	ATT	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715357
53	NC_019682	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	427715357
54	NC_019682	GTG	2	6	3888	3893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
55	NC_019682	AGT	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
56	NC_019682	TAC	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715357
57	NC_019682	CAA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715357
58	NC_019682	AACCG	2	10	4066	4075	40 %	0 %	20 %	40 %	427715357
59	NC_019682	TGG	2	6	4111	4116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
60	NC_019682	CAA	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715357
61	NC_019682	GGC	2	6	4452	4457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715357
62	NC_019682	TGA	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
63	NC_019682	TGG	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
64	NC_019682	GAC	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715357
65	NC_019682	TGA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
66	NC_019682	ACC	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715357
67	NC_019682	CCA	2	6	4870	4875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715357
68	NC_019682	CCAGT	2	10	4974	4983	20 %	20 %	20 %	40 %	427715357
69	NC_019682	AGC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715357
70	NC_019682	ACC	2	6	5051	5056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715357
71	NC_019682	GGT	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
72	NC_019682	TAT	2	6	5188	5193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715357
73	NC_019682	GGT	2	6	5738	5743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715358
74	NC_019682	TCA	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715358
75	NC_019682	AGG	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715358
76	NC_019682	TGA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
77	NC_019682	AACG	2	8	5843	5850	50 %	0 %	25 %	25 %	427715358
78	NC_019682	ACA	2	6	5857	5862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715358
79	NC_019682	GTGA	2	8	5945	5952	25 %	25 %	50 %	0 %	427715358
80	NC_019682	T	6	6	5954	5959	0 %	100 %	0 %	0 %	427715358
81	NC_019682	CGC	3	9	6082	6090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715358
82	NC_019682	GTA	2	6	6098	6103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
83	NC_019682	AAT	2	6	6107	6112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
84	NC_019682	TGC	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715358
85	NC_019682	ATA	2	6	6141	6146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
86	NC_019682	TCC	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715358
87	NC_019682	AGG	2	6	6168	6173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715358
88	NC_019682	TAG	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
89	NC_019682	A	6	6	6384	6389	100 %	0 %	0 %	0 %	427715358
90	NC_019682	C	6	6	6396	6401	0 %	0 %	0 %	100 %	427715358
91	NC_019682	TGC	2	6	6424	6429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715358
92	NC_019682	TCAA	2	8	6432	6439	50 %	25 %	0 %	25 %	427715358
93	NC_019682	CAC	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715358
94	NC_019682	CA	3	6	6554	6559	50 %	0 %	0 %	50 %	427715358
95	NC_019682	CAT	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715358
96	NC_019682	GTG	2	6	6702	6707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715358
97	NC_019682	CCAG	2	8	6765	6772	25 %	0 %	25 %	50 %	427715358
98	NC_019682	ACG	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715358
99	NC_019682	TCG	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715358
100	NC_019682	ATA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
101	NC_019682	AAT	2	6	6971	6976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
102	NC_019682	TTC	2	6	7009	7014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715358
103	NC_019682	TCT	2	6	7082	7087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715358
104	NC_019682	GCC	2	6	7120	7125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715358
105	NC_019682	CACCAG	2	12	7146	7157	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427715358
106	NC_019682	A	6	6	7166	7171	100 %	0 %	0 %	0 %	427715358
107	NC_019682	TCC	2	6	7177	7182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715358
108	NC_019682	AGT	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
109	NC_019682	TGA	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
110	NC_019682	ATT	2	6	7255	7260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715358
111	NC_019682	AGT	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715359
112	NC_019682	TTAA	2	8	7967	7974	50 %	50 %	0 %	0 %	427715359
113	NC_019682	CTG	2	6	7980	7985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715359
114	NC_019682	TAA	2	6	8017	8022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715359
115	NC_019682	T	6	6	8023	8028	0 %	100 %	0 %	0 %	427715359
116	NC_019682	ATT	2	6	8079	8084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715359
117	NC_019682	A	9	9	8243	8251	100 %	0 %	0 %	0 %	427715360
118	NC_019682	GAT	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715360
119	NC_019682	T	6	6	8259	8264	0 %	100 %	0 %	0 %	427715360
120	NC_019682	AGA	2	6	8283	8288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715360
121	NC_019682	ATT	2	6	8351	8356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715360
122	NC_019682	AGA	2	6	8397	8402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715360
123	NC_019682	TGGC	2	8	8406	8413	0 %	25 %	50 %	25 %	427715360
124	NC_019682	GAGT	2	8	8414	8421	25 %	25 %	50 %	0 %	427715360
125	NC_019682	GTC	2	6	8450	8455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715360
126	NC_019682	ACC	2	6	8505	8510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715360
127	NC_019682	AAGC	2	8	8598	8605	50 %	0 %	25 %	25 %	427715360
128	NC_019682	TGGA	2	8	8683	8690	25 %	25 %	50 %	0 %	427715360
129	NC_019682	ATC	2	6	8732	8737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715360
130	NC_019682	AAG	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715360
131	NC_019682	TAG	2	6	8850	8855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715360
132	NC_019682	ATG	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715360
133	NC_019682	AC	3	6	9027	9032	50 %	0 %	0 %	50 %	427715360
134	NC_019682	GAT	2	6	9037	9042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715360
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136	NC_019682	GGT	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715360
137	NC_019682	ATGAA	2	10	9169	9178	60 %	20 %	20 %	0 %	427715361
138	NC_019682	A	6	6	9192	9197	100 %	0 %	0 %	0 %	427715361
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152	NC_019682	AGA	2	6	10379	10384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715362
153	NC_019682	T	6	6	10452	10457	0 %	100 %	0 %	0 %	427715362
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164	NC_019682	ATA	2	6	10904	10909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715363
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261	NC_019682	GCA	2	6	16989	16994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715369
262	NC_019682	GAC	2	6	17016	17021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715369
263	NC_019682	CAC	2	6	17023	17028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715369
264	NC_019682	AAC	2	6	17106	17111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715369
265	NC_019682	CTC	2	6	17136	17141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715369
266	NC_019682	AGA	2	6	17167	17172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715369
267	NC_019682	A	6	6	17229	17234	100 %	0 %	0 %	0 %	427715369
268	NC_019682	CCAG	2	8	17235	17242	25 %	0 %	25 %	50 %	427715369
269	NC_019682	ACT	2	6	17279	17284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715369
270	NC_019682	TCC	2	6	17428	17433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715369
271	NC_019682	AGA	2	6	17440	17445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715369
272	NC_019682	TCAA	2	8	17463	17470	50 %	25 %	0 %	25 %	427715369
273	NC_019682	TGA	2	6	17500	17505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715369
274	NC_019682	CCA	2	6	17574	17579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715369
275	NC_019682	TTAC	2	8	17661	17668	25 %	50 %	0 %	25 %	427715369
276	NC_019682	CT	3	6	17678	17683	0 %	50 %	0 %	50 %	427715369
277	NC_019682	CAA	2	6	17692	17697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715369
278	NC_019682	TTCA	2	8	17708	17715	25 %	50 %	0 %	25 %	427715369
279	NC_019682	GGT	2	6	17718	17723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715369
280	NC_019682	ACG	3	9	17779	17787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715369
281	NC_019682	TGT	2	6	17826	17831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715369
282	NC_019682	AGG	2	6	17854	17859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715369
283	NC_019682	A	6	6	18006	18011	100 %	0 %	0 %	0 %	427715369
284	NC_019682	CTG	2	6	18057	18062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715369
285	NC_019682	ATG	2	6	18063	18068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715369
286	NC_019682	TGC	2	6	18178	18183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715369
287	NC_019682	CA	3	6	18218	18223	50 %	0 %	0 %	50 %	427715369
288	NC_019682	AGT	2	6	18272	18277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715369
289	NC_019682	CGAAGT	2	12	18322	18333	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427715369
290	NC_019682	CTG	2	6	18389	18394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715369
291	NC_019682	AG	3	6	18404	18409	50 %	0 %	50 %	0 %	427715369
292	NC_019682	CTATCA	2	12	18481	18492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715369
293	NC_019682	TGA	2	6	18547	18552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715369
294	NC_019682	A	6	6	18599	18604	100 %	0 %	0 %	0 %	427715369
295	NC_019682	GTG	2	6	18610	18615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715369
296	NC_019682	CCG	2	6	18623	18628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715369
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299	NC_019682	GCT	2	6	18686	18691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715369
300	NC_019682	TAA	2	6	18775	18780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715369
301	NC_019682	GCT	2	6	18791	18796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715369
302	NC_019682	GCG	2	6	18845	18850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715369
303	NC_019682	ATT	2	6	18908	18913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715369
304	NC_019682	ACC	2	6	18917	18922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715369
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329	NC_019682	AAC	2	6	21097	21102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715370
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343	NC_019682	TTC	2	6	22165	22170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715371
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355	NC_019682	TTG	2	6	23368	23373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715372
356	NC_019682	GTT	2	6	23425	23430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715372
357	NC_019682	TAG	2	6	23441	23446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715372
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372	NC_019682	TGGAA	2	10	24678	24687	40 %	20 %	40 %	0 %	427715373
373	NC_019682	GA	3	6	24723	24728	50 %	0 %	50 %	0 %	427715373
374	NC_019682	TTA	2	6	24851	24856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715373
375	NC_019682	ATC	2	6	24861	24866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715373
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378	NC_019682	AAG	3	9	24960	24968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715373
379	NC_019682	ACA	2	6	25007	25012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715373
380	NC_019682	TTG	2	6	25074	25079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715373
381	NC_019682	GGC	3	9	25081	25089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715373
382	NC_019682	GCA	2	6	25160	25165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715373
383	NC_019682	ATT	2	6	25191	25196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715373
384	NC_019682	CT	3	6	25494	25499	0 %	50 %	0 %	50 %	427715374
385	NC_019682	ACG	2	6	25500	25505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715374
386	NC_019682	TTC	2	6	25569	25574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715374
387	NC_019682	AAC	2	6	25596	25601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715374
388	NC_019682	TTC	2	6	25610	25615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715374
389	NC_019682	GTA	2	6	25628	25633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715374
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392	NC_019682	GGT	2	6	25700	25705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715374
393	NC_019682	TGG	2	6	25706	25711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715374
394	NC_019682	TGT	2	6	25728	25733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715374
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403	NC_019682	TGG	2	6	26098	26103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715374
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497	NC_019682	AGGG	2	8	30764	30771	25 %	0 %	75 %	0 %	427715377
498	NC_019682	TGCCAT	2	12	30831	30842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427715377
499	NC_019682	ACA	2	6	30895	30900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715377
500	NC_019682	TAC	3	9	30902	30910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715377

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