MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019682	GAC	2	6	266169	266174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715607
4002	NC_019682	GCAA	2	8	266187	266194	50 %	0 %	25 %	25 %	427715607
4003	NC_019682	ACTAA	2	10	266266	266275	60 %	20 %	0 %	20 %	427715607
4004	NC_019682	GCA	2	6	266281	266286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715607
4005	NC_019682	TGA	2	6	266349	266354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715607
4006	NC_019682	AAG	2	6	266875	266880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715608
4007	NC_019682	ACC	2	6	266929	266934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715608
4008	NC_019682	TGC	2	6	267018	267023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715608
4009	NC_019682	GC	4	8	267080	267087	0 %	0 %	50 %	50 %	427715608
4010	NC_019682	GCG	2	6	267191	267196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715608
4011	NC_019682	GCA	2	6	267304	267309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715608
4012	NC_019682	GCTG	2	8	267322	267329	0 %	25 %	50 %	25 %	427715608
4013	NC_019682	ATC	2	6	267392	267397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715608
4014	NC_019682	GGACA	2	10	267434	267443	40 %	0 %	40 %	20 %	427715608
4015	NC_019682	AAC	2	6	267469	267474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715608
4016	NC_019682	TGA	2	6	267542	267547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715608
4017	NC_019682	TTC	2	6	267598	267603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715608
4018	NC_019682	GGT	2	6	267646	267651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715608
4019	NC_019682	GGC	2	6	267667	267672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715608
4020	NC_019682	CAT	3	9	267694	267702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715608
4021	NC_019682	GAT	2	6	267787	267792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715608
4022	NC_019682	TGC	2	6	267809	267814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715608
4023	NC_019682	CTT	2	6	267872	267877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715608
4024	NC_019682	CAAT	2	8	267893	267900	50 %	25 %	0 %	25 %	427715608
4025	NC_019682	GCC	2	6	267954	267959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715608
4026	NC_019682	TCAC	2	8	268004	268011	25 %	25 %	0 %	50 %	427715608
4027	NC_019682	TG	3	6	268014	268019	0 %	50 %	50 %	0 %	427715608
4028	NC_019682	TTG	2	6	268037	268042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715608
4029	NC_019682	CAA	2	6	268101	268106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715608
4030	NC_019682	TAC	2	6	268121	268126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715608
4031	NC_019682	GT	3	6	268162	268167	0 %	50 %	50 %	0 %	427715608
4032	NC_019682	GTC	2	6	268229	268234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715608
4033	NC_019682	TC	3	6	268327	268332	0 %	50 %	0 %	50 %	427715608
4034	NC_019682	GCT	2	6	268336	268341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715608
4035	NC_019682	CGG	2	6	268362	268367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715608
4036	NC_019682	CTG	2	6	268400	268405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715608
4037	NC_019682	GTGG	2	8	268459	268466	0 %	25 %	75 %	0 %	427715608
4038	NC_019682	GAT	2	6	268476	268481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715608
4039	NC_019682	CAC	2	6	268516	268521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715608
4040	NC_019682	CTG	2	6	268558	268563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715608
4041	NC_019682	GT	3	6	268568	268573	0 %	50 %	50 %	0 %	427715608
4042	NC_019682	ATC	2	6	268824	268829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715608
4043	NC_019682	GGTT	2	8	268843	268850	0 %	50 %	50 %	0 %	427715608
4044	NC_019682	CAA	2	6	269025	269030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715608
4045	NC_019682	GGA	2	6	269113	269118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715608
4046	NC_019682	CAC	2	6	269124	269129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715608
4047	NC_019682	TTC	2	6	269137	269142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715608
4048	NC_019682	AAAG	2	8	269168	269175	75 %	0 %	25 %	0 %	427715608
4049	NC_019682	ACG	2	6	269324	269329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715609
4050	NC_019682	GAA	2	6	269390	269395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715609
4051	NC_019682	CATA	2	8	269518	269525	50 %	25 %	0 %	25 %	427715609
4052	NC_019682	TGG	2	6	269642	269647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715609
4053	NC_019682	AAT	2	6	269669	269674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715609
4054	NC_019682	GGC	2	6	269710	269715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715609
4055	NC_019682	GGTT	2	8	269771	269778	0 %	50 %	50 %	0 %	427715609
4056	NC_019682	ACC	2	6	269802	269807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715609
4057	NC_019682	GTTT	2	8	269817	269824	0 %	75 %	25 %	0 %	427715609
4058	NC_019682	CTTG	2	8	269837	269844	0 %	50 %	25 %	25 %	427715609
4059	NC_019682	CTT	2	6	269908	269913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715609
4060	NC_019682	CAC	2	6	269922	269927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715609
4061	NC_019682	G	6	6	269964	269969	0 %	0 %	100 %	0 %	427715609
4062	NC_019682	GGT	2	6	270050	270055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715609
4063	NC_019682	TTG	2	6	270129	270134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715609
4064	NC_019682	GAT	2	6	270184	270189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715609
4065	NC_019682	TAA	2	6	270211	270216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715609
4066	NC_019682	CCA	2	6	270241	270246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715609
4067	NC_019682	TAA	2	6	270265	270270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715609
4068	NC_019682	GCG	2	6	270329	270334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715609
4069	NC_019682	GCC	2	6	270352	270357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715609
4070	NC_019682	GGC	2	6	270391	270396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715609
4071	NC_019682	AC	4	8	270402	270409	50 %	0 %	0 %	50 %	427715609
4072	NC_019682	TGG	2	6	270435	270440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715609
4073	NC_019682	TCT	2	6	270462	270467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715609
4074	NC_019682	ATT	2	6	270539	270544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715609
4075	NC_019682	ATG	2	6	270606	270611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715609
4076	NC_019682	GCG	2	6	270629	270634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715609
4077	NC_019682	ATTG	2	8	270646	270653	25 %	50 %	25 %	0 %	427715609
4078	NC_019682	GCT	2	6	270715	270720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715609
4079	NC_019682	GTTG	2	8	270783	270790	0 %	50 %	50 %	0 %	427715609
4080	NC_019682	AAC	2	6	270800	270805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715609
4081	NC_019682	ATT	2	6	270817	270822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715609
4082	NC_019682	CAT	2	6	270854	270859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715609
4083	NC_019682	CAC	2	6	270883	270888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715609
4084	NC_019682	A	6	6	270944	270949	100 %	0 %	0 %	0 %	427715609
4085	NC_019682	TTGG	2	8	271056	271063	0 %	50 %	50 %	0 %	427715609
4086	NC_019682	GGCAA	2	10	271101	271110	40 %	0 %	40 %	20 %	427715609
4087	NC_019682	TCT	2	6	271130	271135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715609
4088	NC_019682	GA	3	6	271372	271377	50 %	0 %	50 %	0 %	427715609
4089	NC_019682	TCACT	2	10	271426	271435	20 %	40 %	0 %	40 %	427715609
4090	NC_019682	AAT	2	6	271889	271894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715610
4091	NC_019682	GAA	3	9	271935	271943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715610
4092	NC_019682	TTAG	2	8	272013	272020	25 %	50 %	25 %	0 %	427715610
4093	NC_019682	TGGT	2	8	272128	272135	0 %	50 %	50 %	0 %	427715610
4094	NC_019682	TA	5	10	272186	272195	50 %	50 %	0 %	0 %	427715610
4095	NC_019682	TAC	2	6	272234	272239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715610
4096	NC_019682	CTG	2	6	272286	272291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715610
4097	NC_019682	GAA	2	6	272310	272315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715610
4098	NC_019682	G	6	6	272354	272359	0 %	0 %	100 %	0 %	427715610
4099	NC_019682	CTA	2	6	272379	272384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715610
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4101	NC_019682	GAA	2	6	272659	272664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715611
4102	NC_019682	GAG	2	6	273035	273040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715612
4103	NC_019682	CAC	2	6	273141	273146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715612
4104	NC_019682	ACC	2	6	273183	273188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715612
4105	NC_019682	ACC	2	6	273539	273544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715613
4106	NC_019682	CA	3	6	273559	273564	50 %	0 %	0 %	50 %	427715613
4107	NC_019682	GA	3	6	273603	273608	50 %	0 %	50 %	0 %	427715613
4108	NC_019682	TTAT	2	8	273619	273626	25 %	75 %	0 %	0 %	427715613
4109	NC_019682	GAT	2	6	273699	273704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715613
4110	NC_019682	TGT	2	6	273940	273945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715614
4111	NC_019682	TAAAC	2	10	273973	273982	60 %	20 %	0 %	20 %	427715614
4112	NC_019682	ATA	2	6	274042	274047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715614
4113	NC_019682	CAC	2	6	274077	274082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715614
4114	NC_019682	ACC	2	6	274086	274091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715614
4115	NC_019682	CTT	2	6	274124	274129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715614
4116	NC_019682	T	7	7	274240	274246	0 %	100 %	0 %	0 %	427715614
4117	NC_019682	TGT	2	6	274311	274316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715614
4118	NC_019682	TAA	2	6	274317	274322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715614
4119	NC_019682	CTA	2	6	274370	274375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715614
4120	NC_019682	CAT	2	6	274376	274381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715614
4121	NC_019682	TTTAA	2	10	274387	274396	40 %	60 %	0 %	0 %	427715614
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4123	NC_019682	GTT	2	6	274418	274423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715614
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4245	NC_019682	ACCT	2	8	280428	280435	25 %	25 %	0 %	50 %	427715617
4246	NC_019682	ATC	2	6	280439	280444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715617
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4248	NC_019682	AAAT	2	8	280550	280557	75 %	25 %	0 %	0 %	427715617
4249	NC_019682	GCTG	2	8	280711	280718	0 %	25 %	50 %	25 %	427715618
4250	NC_019682	AGT	2	6	280725	280730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715618
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4278	NC_019682	TGT	2	6	282113	282118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715619
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4342	NC_019682	CAATC	2	10	286585	286594	40 %	20 %	0 %	40 %	427715623
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4356	NC_019682	AAT	2	6	287692	287697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715624
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4358	NC_019682	A	7	7	288032	288038	100 %	0 %	0 %	0 %	427715625
4359	NC_019682	AACG	2	8	288062	288069	50 %	0 %	25 %	25 %	427715625
4360	NC_019682	AGA	2	6	288154	288159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715625
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4489	NC_019682	TTC	2	6	295062	295067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715630
4490	NC_019682	GCTTCT	2	12	295132	295143	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	427715630
4491	NC_019682	CAC	4	12	295181	295192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715630
4492	NC_019682	CTCG	2	8	295254	295261	0 %	25 %	25 %	50 %	427715630
4493	NC_019682	ATG	2	6	295310	295315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715630
4494	NC_019682	GCT	2	6	295345	295350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715630
4495	NC_019682	ATG	2	6	295402	295407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715630
4496	NC_019682	CTGT	2	8	295838	295845	0 %	50 %	25 %	25 %	427715631
4497	NC_019682	GCA	2	6	295876	295881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715631
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4499	NC_019682	GCAA	2	8	295934	295941	50 %	0 %	25 %	25 %	427715631
4500	NC_019682	A	7	7	295940	295946	100 %	0 %	0 %	0 %	427715631

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