MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_019682	TAG	2	6	168837	168842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715524
2503	NC_019682	AGT	2	6	168919	168924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715524
2504	NC_019682	GGC	2	6	168929	168934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715524
2505	NC_019682	TTC	2	6	168938	168943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715524
2506	NC_019682	A	6	6	169013	169018	100 %	0 %	0 %	0 %	427715524
2507	NC_019682	TGG	2	6	169060	169065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715524
2508	NC_019682	AAG	2	6	169304	169309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715525
2509	NC_019682	A	6	6	169339	169344	100 %	0 %	0 %	0 %	427715525
2510	NC_019682	AGAAAA	2	12	169428	169439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	427715525
2511	NC_019682	GAA	2	6	169444	169449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715525
2512	NC_019682	AAG	2	6	169529	169534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715525
2513	NC_019682	TAA	2	6	169545	169550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715525
2514	NC_019682	AAG	2	6	169565	169570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715525
2515	NC_019682	AGTTT	2	10	169645	169654	20 %	60 %	20 %	0 %	427715525
2516	NC_019682	A	6	6	169672	169677	100 %	0 %	0 %	0 %	427715525
2517	NC_019682	TGA	2	6	169689	169694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715525
2518	NC_019682	GA	3	6	169781	169786	50 %	0 %	50 %	0 %	427715526
2519	NC_019682	TGA	2	6	169792	169797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715526
2520	NC_019682	CGC	2	6	169924	169929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715526
2521	NC_019682	AAC	2	6	169995	170000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715526
2522	NC_019682	ACTA	2	8	170023	170030	50 %	25 %	0 %	25 %	427715526
2523	NC_019682	TGG	2	6	170065	170070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715526
2524	NC_019682	AAC	2	6	170097	170102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715526
2525	NC_019682	CAA	2	6	170126	170131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715526
2526	NC_019682	TTA	2	6	170345	170350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715526
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2529	NC_019682	CGA	2	6	170473	170478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715526
2530	NC_019682	GAA	2	6	170489	170494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715526
2531	NC_019682	GTC	2	6	170540	170545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715526
2532	NC_019682	A	6	6	170684	170689	100 %	0 %	0 %	0 %	427715526
2533	NC_019682	AAC	2	6	170918	170923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715526
2534	NC_019682	AAGATG	2	12	171021	171032	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	427715526
2535	NC_019682	AAG	2	6	171165	171170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715526
2536	NC_019682	GA	3	6	171236	171241	50 %	0 %	50 %	0 %	427715526
2537	NC_019682	T	6	6	171259	171264	0 %	100 %	0 %	0 %	427715526
2538	NC_019682	ACA	2	6	171323	171328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715527
2539	NC_019682	AAG	2	6	171447	171452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715527
2540	NC_019682	TGA	2	6	171520	171525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715527
2541	NC_019682	AAC	2	6	171569	171574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715527
2542	NC_019682	A	6	6	171636	171641	100 %	0 %	0 %	0 %	427715527
2543	NC_019682	TTA	2	6	171689	171694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715527
2544	NC_019682	A	6	6	171751	171756	100 %	0 %	0 %	0 %	427715527
2545	NC_019682	TAG	2	6	171798	171803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715527
2546	NC_019682	ATT	2	6	171811	171816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715527
2547	NC_019682	GAT	2	6	171821	171826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715527
2548	NC_019682	AT	3	6	171839	171844	50 %	50 %	0 %	0 %	427715527
2549	NC_019682	TCT	2	6	171875	171880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715527
2550	NC_019682	TGA	2	6	171946	171951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715527
2551	NC_019682	CAG	2	6	171959	171964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715527
2552	NC_019682	CTG	2	6	172053	172058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715527
2553	NC_019682	AACA	2	8	172092	172099	75 %	0 %	0 %	25 %	427715527
2554	NC_019682	ATTT	2	8	172125	172132	25 %	75 %	0 %	0 %	427715527
2555	NC_019682	CAG	2	6	172179	172184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715527
2556	NC_019682	T	6	6	172223	172228	0 %	100 %	0 %	0 %	427715527
2557	NC_019682	T	6	6	172282	172287	0 %	100 %	0 %	0 %	427715527
2558	NC_019682	ATT	2	6	172298	172303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715527
2559	NC_019682	CAAAA	2	10	172307	172316	80 %	0 %	0 %	20 %	427715527
2560	NC_019682	TTTA	2	8	172372	172379	25 %	75 %	0 %	0 %	427715527
2561	NC_019682	TG	3	6	172557	172562	0 %	50 %	50 %	0 %	427715527
2562	NC_019682	AGA	2	6	172624	172629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715527
2563	NC_019682	ATT	2	6	172645	172650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715527
2564	NC_019682	AAG	2	6	172677	172682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715527
2565	NC_019682	GAAA	2	8	172870	172877	75 %	0 %	25 %	0 %	427715527
2566	NC_019682	T	6	6	173192	173197	0 %	100 %	0 %	0 %	427715528
2567	NC_019682	CGA	2	6	173222	173227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715528
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2569	NC_019682	ATC	2	6	173257	173262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715528
2570	NC_019682	CA	3	6	173331	173336	50 %	0 %	0 %	50 %	427715528
2571	NC_019682	AAC	2	6	173562	173567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715529
2572	NC_019682	GTAGC	2	10	173590	173599	20 %	20 %	40 %	20 %	427715529
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2574	NC_019682	TAA	2	6	173683	173688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715529
2575	NC_019682	GA	3	6	173790	173795	50 %	0 %	50 %	0 %	427715529
2576	NC_019682	TGC	2	6	173796	173801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715529
2577	NC_019682	CGA	2	6	173803	173808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715529
2578	NC_019682	CATCT	2	10	173937	173946	20 %	40 %	0 %	40 %	427715529
2579	NC_019682	AGA	2	6	173982	173987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715529
2580	NC_019682	CCA	2	6	174148	174153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715529
2581	NC_019682	GCA	2	6	174196	174201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715529
2582	NC_019682	ATC	2	6	174231	174236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715529
2583	NC_019682	GCC	2	6	174249	174254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715529
2584	NC_019682	CGTAC	2	10	174262	174271	20 %	20 %	20 %	40 %	427715529
2585	NC_019682	T	6	6	174324	174329	0 %	100 %	0 %	0 %	427715529
2586	NC_019682	GGAA	2	8	174433	174440	50 %	0 %	50 %	0 %	427715529
2587	NC_019682	ACG	2	6	174450	174455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715529
2588	NC_019682	ACC	2	6	174468	174473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715529
2589	NC_019682	CCAA	2	8	174507	174514	50 %	0 %	0 %	50 %	427715529
2590	NC_019682	CGC	2	6	174593	174598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715529
2591	NC_019682	CAG	2	6	174615	174620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715529
2592	NC_019682	GTATTG	2	12	174631	174642	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	427715529
2593	NC_019682	ACT	2	6	174688	174693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715529
2594	NC_019682	GAT	2	6	174719	174724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715529
2595	NC_019682	CGT	2	6	174761	174766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715529
2596	NC_019682	AT	3	6	174847	174852	50 %	50 %	0 %	0 %	427715529
2597	NC_019682	ATA	2	6	174861	174866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715529
2598	NC_019682	TCT	2	6	174916	174921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715529
2599	NC_019682	T	6	6	174944	174949	0 %	100 %	0 %	0 %	427715529
2600	NC_019682	GCA	3	9	175066	175074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715529
2601	NC_019682	ATG	2	6	175105	175110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715529
2602	NC_019682	TGC	2	6	175140	175145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715529
2603	NC_019682	GCG	2	6	175150	175155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715529
2604	NC_019682	CCA	3	9	175162	175170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715529
2605	NC_019682	CAG	2	6	175184	175189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715529
2606	NC_019682	ACA	2	6	175270	175275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715529
2607	NC_019682	AT	3	6	175750	175755	50 %	50 %	0 %	0 %	427715530
2608	NC_019682	GTACAT	2	12	175827	175838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427715530
2609	NC_019682	ACA	2	6	175863	175868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715531
2610	NC_019682	A	6	6	175891	175896	100 %	0 %	0 %	0 %	427715531
2611	NC_019682	TGCT	2	8	175921	175928	0 %	50 %	25 %	25 %	427715531
2612	NC_019682	TGC	2	6	175987	175992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715531
2613	NC_019682	CAGATG	2	12	176011	176022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427715531
2614	NC_019682	ACCA	2	8	176046	176053	50 %	0 %	0 %	50 %	427715531
2615	NC_019682	TACTG	2	10	176155	176164	20 %	40 %	20 %	20 %	427715531
2616	NC_019682	TTA	2	6	176423	176428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715532
2617	NC_019682	ACG	2	6	176459	176464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715532
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2619	NC_019682	ACA	2	6	176504	176509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715532
2620	NC_019682	ATC	2	6	176589	176594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715532
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2744	NC_019682	AGA	2	6	185079	185084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715542
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2747	NC_019682	GAG	2	6	185159	185164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715542
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2857	NC_019682	GGAA	2	8	192212	192219	50 %	0 %	50 %	0 %	427715551
2858	NC_019682	TGA	3	9	192224	192232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715551
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2863	NC_019682	ATCA	2	8	192381	192388	50 %	25 %	0 %	25 %	427715552
2864	NC_019682	GTT	2	6	192434	192439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715552
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