MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_019682	TG	3	6	1100234	1100239	0 %	50 %	50 %	0 %	427716349
17002	NC_019682	GCG	2	6	1100242	1100247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427716349
17003	NC_019682	CGG	2	6	1100252	1100257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427716349
17004	NC_019682	GTT	2	6	1100261	1100266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716349
17005	NC_019682	T	7	7	1100374	1100380	0 %	100 %	0 %	0 %	427716349
17006	NC_019682	TCA	2	6	1100417	1100422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716349
17007	NC_019682	ATT	2	6	1101280	1101285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716350
17008	NC_019682	AGA	2	6	1101318	1101323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716350
17009	NC_019682	AGT	2	6	1101378	1101383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716350
17010	NC_019682	AGA	2	6	1101387	1101392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716350
17011	NC_019682	CTG	2	6	1101401	1101406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716350
17012	NC_019682	T	7	7	1101433	1101439	0 %	100 %	0 %	0 %	427716350
17013	NC_019682	TAA	2	6	1101441	1101446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716350
17014	NC_019682	AT	3	6	1101469	1101474	50 %	50 %	0 %	0 %	427716350
17015	NC_019682	AATT	2	8	1101527	1101534	50 %	50 %	0 %	0 %	427716350
17016	NC_019682	GCA	2	6	1101553	1101558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716350
17017	NC_019682	TGA	2	6	1101575	1101580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716350
17018	NC_019682	AAT	2	6	1101673	1101678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716350
17019	NC_019682	ATT	2	6	1101687	1101692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716350
17020	NC_019682	AG	3	6	1101708	1101713	50 %	0 %	50 %	0 %	427716350
17021	NC_019682	AG	3	6	1101751	1101756	50 %	0 %	50 %	0 %	427716350
17022	NC_019682	A	7	7	1101804	1101810	100 %	0 %	0 %	0 %	427716350
17023	NC_019682	A	9	9	1101827	1101835	100 %	0 %	0 %	0 %	427716350
17024	NC_019682	ACAA	2	8	1101924	1101931	75 %	0 %	0 %	25 %	427716350
17025	NC_019682	TACC	2	8	1102036	1102043	25 %	25 %	0 %	50 %	427716350
17026	NC_019682	TTC	2	6	1102118	1102123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716350
17027	NC_019682	ATC	2	6	1102237	1102242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716350
17028	NC_019682	AGCA	3	12	1102258	1102269	50 %	0 %	25 %	25 %	427716350
17029	NC_019682	AAG	2	6	1102271	1102276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716350
17030	NC_019682	A	7	7	1102281	1102287	100 %	0 %	0 %	0 %	427716350
17031	NC_019682	GAA	2	6	1102315	1102320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716350
17032	NC_019682	TAC	2	6	1102355	1102360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716350
17033	NC_019682	GAA	2	6	1102387	1102392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716350
17034	NC_019682	TAC	2	6	1102428	1102433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716350
17035	NC_019682	ATCA	2	8	1102483	1102490	50 %	25 %	0 %	25 %	427716350
17036	NC_019682	TGT	2	6	1102518	1102523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716350
17037	NC_019682	TTTA	2	8	1102542	1102549	25 %	75 %	0 %	0 %	427716350
17038	NC_019682	ACA	2	6	1102559	1102564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716350
17039	NC_019682	ATA	2	6	1102571	1102576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716350
17040	NC_019682	TA	3	6	1102575	1102580	50 %	50 %	0 %	0 %	427716350
17041	NC_019682	ATA	2	6	1102654	1102659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716350
17042	NC_019682	A	6	6	1102733	1102738	100 %	0 %	0 %	0 %	427716350
17043	NC_019682	TAA	2	6	1102742	1102747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716350
17044	NC_019682	ATT	2	6	1102768	1102773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716350
17045	NC_019682	TGG	2	6	1102788	1102793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716350
17046	NC_019682	TTA	2	6	1102795	1102800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716350
17047	NC_019682	A	6	6	1102835	1102840	100 %	0 %	0 %	0 %	427716350
17048	NC_019682	AGA	2	6	1102848	1102853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716350
17049	NC_019682	TA	3	6	1102948	1102953	50 %	50 %	0 %	0 %	427716350
17050	NC_019682	TA	3	6	1103014	1103019	50 %	50 %	0 %	0 %	427716350
17051	NC_019682	AGA	3	9	1103052	1103060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716350
17052	NC_019682	TGA	2	6	1103076	1103081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716350
17053	NC_019682	TGA	2	6	1103103	1103108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716350
17054	NC_019682	TCAG	2	8	1103116	1103123	25 %	25 %	25 %	25 %	427716350
17055	NC_019682	TA	3	6	1103203	1103208	50 %	50 %	0 %	0 %	427716350
17056	NC_019682	CTC	2	6	1103230	1103235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716350
17057	NC_019682	GCAA	2	8	1103294	1103301	50 %	0 %	25 %	25 %	427716350
17058	NC_019682	ATC	2	6	1103319	1103324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716350
17059	NC_019682	AAT	2	6	1103374	1103379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716350
17060	NC_019682	TTA	2	6	1103398	1103403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716350
17061	NC_019682	AT	3	6	1103418	1103423	50 %	50 %	0 %	0 %	427716350
17062	NC_019682	GAT	2	6	1103484	1103489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716350
17063	NC_019682	TAA	2	6	1103559	1103564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716350
17064	NC_019682	ATT	2	6	1103662	1103667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716350
17065	NC_019682	TAA	2	6	1103712	1103717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716350
17066	NC_019682	TAG	2	6	1103855	1103860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716350
17067	NC_019682	GAAG	2	8	1103869	1103876	50 %	0 %	50 %	0 %	427716350
17068	NC_019682	ATT	2	6	1103901	1103906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716350
17069	NC_019682	GAAA	2	8	1103939	1103946	75 %	0 %	25 %	0 %	427716351
17070	NC_019682	A	6	6	1103944	1103949	100 %	0 %	0 %	0 %	427716351
17071	NC_019682	GTT	2	6	1103955	1103960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716351
17072	NC_019682	TGC	2	6	1104032	1104037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716351
17073	NC_019682	GCT	2	6	1104132	1104137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716351
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17075	NC_019682	TA	3	6	1104237	1104242	50 %	50 %	0 %	0 %	427716351
17076	NC_019682	AATT	2	8	1104265	1104272	50 %	50 %	0 %	0 %	427716351
17077	NC_019682	ACT	2	6	1104273	1104278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716351
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17080	NC_019682	A	6	6	1104468	1104473	100 %	0 %	0 %	0 %	427716351
17081	NC_019682	ATA	2	6	1104652	1104657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716351
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17085	NC_019682	TGT	2	6	1105028	1105033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716351
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17087	NC_019682	CCTG	2	8	1105182	1105189	0 %	25 %	25 %	50 %	427716352
17088	NC_019682	TTCT	2	8	1105274	1105281	0 %	75 %	0 %	25 %	427716352
17089	NC_019682	CTG	2	6	1105357	1105362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716352
17090	NC_019682	AAT	2	6	1105374	1105379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716352
17091	NC_019682	GTT	2	6	1105402	1105407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716352
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17093	NC_019682	CTG	2	6	1105465	1105470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716352
17094	NC_019682	AAGA	2	8	1105553	1105560	75 %	0 %	25 %	0 %	427716352
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17096	NC_019682	GTC	2	6	1105654	1105659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716353
17097	NC_019682	TTC	2	6	1105680	1105685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716353
17098	NC_019682	GCT	2	6	1105777	1105782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716353
17099	NC_019682	T	9	9	1105784	1105792	0 %	100 %	0 %	0 %	427716353
17100	NC_019682	TTTTC	2	10	1105796	1105805	0 %	80 %	0 %	20 %	427716353
17101	NC_019682	TCA	2	6	1106124	1106129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716354
17102	NC_019682	GC	3	6	1106197	1106202	0 %	0 %	50 %	50 %	427716354
17103	NC_019682	CCT	2	6	1106224	1106229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716354
17104	NC_019682	ACC	2	6	1106274	1106279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716354
17105	NC_019682	GCA	2	6	1106296	1106301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716354
17106	NC_019682	TAG	2	6	1106326	1106331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716354
17107	NC_019682	CT	3	6	1106369	1106374	0 %	50 %	0 %	50 %	427716354
17108	NC_019682	GCT	2	6	1106382	1106387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716354
17109	NC_019682	AGC	2	6	1106390	1106395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716354
17110	NC_019682	AT	3	6	1106399	1106404	50 %	50 %	0 %	0 %	427716354
17111	NC_019682	GCAA	2	8	1106417	1106424	50 %	0 %	25 %	25 %	427716354
17112	NC_019682	ACC	2	6	1106445	1106450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716354
17113	NC_019682	ACG	2	6	1106464	1106469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716354
17114	NC_019682	AAT	2	6	1106498	1106503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716354
17115	NC_019682	CGC	2	6	1106510	1106515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716354
17116	NC_019682	GTT	2	6	1106593	1106598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716354
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17118	NC_019682	A	7	7	1106856	1106862	100 %	0 %	0 %	0 %	427716355
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