MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_019682	AAT	2	6	1007901	1007906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716261
15502	NC_019682	CAAA	2	8	1007999	1008006	75 %	0 %	0 %	25 %	427716261
15503	NC_019682	ATC	2	6	1008027	1008032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716261
15504	NC_019682	TCG	2	6	1008154	1008159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716261
15505	NC_019682	TCT	2	6	1008190	1008195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716261
15506	NC_019682	GCA	2	6	1008205	1008210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716261
15507	NC_019682	TAA	2	6	1008556	1008561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716262
15508	NC_019682	TGGG	2	8	1008578	1008585	0 %	25 %	75 %	0 %	427716262
15509	NC_019682	TGA	2	6	1008640	1008645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716262
15510	NC_019682	CTA	2	6	1008729	1008734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716262
15511	NC_019682	CTGA	2	8	1008847	1008854	25 %	25 %	25 %	25 %	427716262
15512	NC_019682	TC	3	6	1008912	1008917	0 %	50 %	0 %	50 %	427716262
15513	NC_019682	TGC	2	6	1008932	1008937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716262
15514	NC_019682	CGT	2	6	1008986	1008991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716262
15515	NC_019682	CAG	2	6	1009008	1009013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716262
15516	NC_019682	AAG	2	6	1009079	1009084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716262
15517	NC_019682	TAA	2	6	1009128	1009133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716262
15518	NC_019682	TGGG	2	8	1009145	1009152	0 %	25 %	75 %	0 %	427716262
15519	NC_019682	CTT	2	6	1009206	1009211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716262
15520	NC_019682	AGC	2	6	1009249	1009254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716262
15521	NC_019682	TCT	2	6	1009280	1009285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716262
15522	NC_019682	ACTT	2	8	1009288	1009295	25 %	50 %	0 %	25 %	427716262
15523	NC_019682	CAT	2	6	1009309	1009314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716262
15524	NC_019682	AGTC	2	8	1009467	1009474	25 %	25 %	25 %	25 %	427716262
15525	NC_019682	CTG	2	6	1009481	1009486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716262
15526	NC_019682	TAA	2	6	1009601	1009606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716262
15527	NC_019682	CTG	2	6	1009615	1009620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716262
15528	NC_019682	GGT	2	6	1009798	1009803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716262
15529	NC_019682	TAG	2	6	1009876	1009881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716262
15530	NC_019682	CAC	2	6	1009888	1009893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716262
15531	NC_019682	GCC	2	6	1009928	1009933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716262
15532	NC_019682	CAAC	2	8	1009950	1009957	50 %	0 %	0 %	50 %	427716262
15533	NC_019682	TTC	2	6	1010047	1010052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716262
15534	NC_019682	TAG	2	6	1010253	1010258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716262
15535	NC_019682	GTT	2	6	1010382	1010387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716262
15536	NC_019682	CTG	2	6	1010404	1010409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716262
15537	NC_019682	CAC	2	6	1010430	1010435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716262
15538	NC_019682	CTG	2	6	1010488	1010493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716262
15539	NC_019682	TTTC	2	8	1010534	1010541	0 %	75 %	0 %	25 %	427716262
15540	NC_019682	ATC	2	6	1010738	1010743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716263
15541	NC_019682	TAA	2	6	1010819	1010824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716263
15542	NC_019682	GTT	2	6	1010842	1010847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716263
15543	NC_019682	ACGCA	2	10	1010849	1010858	40 %	0 %	20 %	40 %	427716263
15544	NC_019682	ATA	2	6	1010912	1010917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716263
15545	NC_019682	CCA	2	6	1010928	1010933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716263
15546	NC_019682	ACA	2	6	1011023	1011028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716263
15547	NC_019682	ATT	2	6	1011116	1011121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716263
15548	NC_019682	CAA	2	6	1011149	1011154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716263
15549	NC_019682	ATTA	2	8	1011185	1011192	50 %	50 %	0 %	0 %	427716263
15550	NC_019682	CCA	2	6	1011201	1011206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716263
15551	NC_019682	AATA	2	8	1011211	1011218	75 %	25 %	0 %	0 %	427716263
15552	NC_019682	T	7	7	1011256	1011262	0 %	100 %	0 %	0 %	427716263
15553	NC_019682	CTA	2	6	1011274	1011279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716263
15554	NC_019682	ATTG	2	8	1011307	1011314	25 %	50 %	25 %	0 %	427716263
15555	NC_019682	GGC	3	9	1011321	1011329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427716263
15556	NC_019682	TAC	2	6	1011337	1011342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716263
15557	NC_019682	TGT	2	6	1011350	1011355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716263
15558	NC_019682	CAC	2	6	1011416	1011421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716263
15559	NC_019682	TAAT	2	8	1011442	1011449	50 %	50 %	0 %	0 %	427716263
15560	NC_019682	T	6	6	1011463	1011468	0 %	100 %	0 %	0 %	427716263
15561	NC_019682	TGG	2	6	1011536	1011541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716263
15562	NC_019682	GCA	2	6	1011567	1011572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716263
15563	NC_019682	TGA	2	6	1011612	1011617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716263
15564	NC_019682	ATA	2	6	1011687	1011692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716263
15565	NC_019682	ACAA	2	8	1011764	1011771	75 %	0 %	0 %	25 %	427716263
15566	NC_019682	CAG	2	6	1011781	1011786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716263
15567	NC_019682	A	6	6	1011822	1011827	100 %	0 %	0 %	0 %	427716263
15568	NC_019682	AAGT	2	8	1011898	1011905	50 %	25 %	25 %	0 %	427716263
15569	NC_019682	GAT	2	6	1011925	1011930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716263
15570	NC_019682	CGCAT	2	10	1011939	1011948	20 %	20 %	20 %	40 %	427716263
15571	NC_019682	CAG	2	6	1011952	1011957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716263
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15573	NC_019682	GATA	2	8	1011997	1012004	50 %	25 %	25 %	0 %	427716263
15574	NC_019682	TTC	2	6	1012016	1012021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716263
15575	NC_019682	TGAG	2	8	1012101	1012108	25 %	25 %	50 %	0 %	427716263
15576	NC_019682	AT	3	6	1012116	1012121	50 %	50 %	0 %	0 %	427716263
15577	NC_019682	CTC	2	6	1012145	1012150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716263
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15582	NC_019682	TCA	2	6	1012386	1012391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716263
15583	NC_019682	TAA	2	6	1012448	1012453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716263
15584	NC_019682	ATGCCA	2	12	1012538	1012549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427716263
15585	NC_019682	ATTA	2	8	1012601	1012608	50 %	50 %	0 %	0 %	427716263
15586	NC_019682	TGC	2	6	1012688	1012693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716263
15587	NC_019682	GCT	2	6	1012764	1012769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716263
15588	NC_019682	TGGGC	2	10	1012773	1012782	0 %	20 %	60 %	20 %	427716263
15589	NC_019682	TGA	2	6	1012800	1012805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716263
15590	NC_019682	AT	3	6	1012809	1012814	50 %	50 %	0 %	0 %	427716263
15591	NC_019682	AT	3	6	1012843	1012848	50 %	50 %	0 %	0 %	427716263
15592	NC_019682	GC	3	6	1013110	1013115	0 %	0 %	50 %	50 %	427716264
15593	NC_019682	GCT	2	6	1013223	1013228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716264
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15598	NC_019682	TGGC	2	8	1013657	1013664	0 %	25 %	50 %	25 %	427716264
15599	NC_019682	CAG	2	6	1013698	1013703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716264
15600	NC_019682	ATTT	2	8	1013710	1013717	25 %	75 %	0 %	0 %	427716264
15601	NC_019682	TACC	2	8	1013725	1013732	25 %	25 %	0 %	50 %	427716264
15602	NC_019682	ATT	2	6	1013798	1013803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716264
15603	NC_019682	ATTTA	2	10	1013822	1013831	40 %	60 %	0 %	0 %	427716264
15604	NC_019682	TCA	2	6	1013940	1013945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716264
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15607	NC_019682	TAA	2	6	1014206	1014211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716264
15608	NC_019682	GACAG	2	10	1014338	1014347	40 %	0 %	40 %	20 %	427716264
15609	NC_019682	TTAA	2	8	1014362	1014369	50 %	50 %	0 %	0 %	427716264
15610	NC_019682	ACC	3	9	1014644	1014652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716265
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15616	NC_019682	ACT	2	6	1014786	1014791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716265
15617	NC_019682	AGC	2	6	1014803	1014808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716265
15618	NC_019682	ATC	2	6	1014813	1014818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716265
15619	NC_019682	AGT	2	6	1014839	1014844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716265
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15621	NC_019682	AAT	2	6	1014981	1014986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716265
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15626	NC_019682	TA	3	6	1015153	1015158	50 %	50 %	0 %	0 %	427716265
15627	NC_019682	A	6	6	1015158	1015163	100 %	0 %	0 %	0 %	427716265
15628	NC_019682	GAA	2	6	1015233	1015238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716265
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15630	NC_019682	CGAT	2	8	1015252	1015259	25 %	25 %	25 %	25 %	427716265
15631	NC_019682	TTG	2	6	1015288	1015293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716265
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15635	NC_019682	CAAG	2	8	1015484	1015491	50 %	0 %	25 %	25 %	427716265
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15637	NC_019682	TAA	2	6	1015580	1015585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716265
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15643	NC_019682	GCG	2	6	1015845	1015850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427716265
15644	NC_019682	TA	3	6	1015867	1015872	50 %	50 %	0 %	0 %	427716265
15645	NC_019682	AC	3	6	1015882	1015887	50 %	0 %	0 %	50 %	427716265
15646	NC_019682	AACC	2	8	1015910	1015917	50 %	0 %	0 %	50 %	427716265
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15648	NC_019682	AAT	2	6	1015989	1015994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716265
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15651	NC_019682	TACA	2	8	1016194	1016201	50 %	25 %	0 %	25 %	427716266
15652	NC_019682	AT	3	6	1016231	1016236	50 %	50 %	0 %	0 %	427716266
15653	NC_019682	GACT	2	8	1016238	1016245	25 %	25 %	25 %	25 %	427716266
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15720	NC_019682	GGTTG	2	10	1020102	1020111	0 %	40 %	60 %	0 %	427716268
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15729	NC_019682	TTC	2	6	1020567	1020572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716268
15730	NC_019682	GAACTA	2	12	1020640	1020651	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427716268
15731	NC_019682	CTCG	2	8	1020658	1020665	0 %	25 %	25 %	50 %	427716268
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15968	NC_019682	AAT	2	6	1034548	1034553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716281
15969	NC_019682	C	6	6	1034564	1034569	0 %	0 %	0 %	100 %	427716281
15970	NC_019682	GATGGG	2	12	1034642	1034653	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	427716281
15971	NC_019682	CCG	2	6	1034774	1034779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716281
15972	NC_019682	ACT	2	6	1034848	1034853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716281
15973	NC_019682	GC	3	6	1034871	1034876	0 %	0 %	50 %	50 %	427716281
15974	NC_019682	GAT	2	6	1034986	1034991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716281
15975	NC_019682	T	6	6	1034993	1034998	0 %	100 %	0 %	0 %	427716281
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15980	NC_019682	GTG	2	6	1035326	1035331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716281
15981	NC_019682	AG	3	6	1035457	1035462	50 %	0 %	50 %	0 %	427716281
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15992	NC_019682	TAC	2	6	1036215	1036220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716282
15993	NC_019682	AAG	2	6	1036222	1036227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716282
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15995	NC_019682	A	7	7	1036262	1036268	100 %	0 %	0 %	0 %	427716282
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15999	NC_019682	AGT	2	6	1037288	1037293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716284
16000	NC_019682	AG	3	6	1037304	1037309	50 %	0 %	50 %	0 %	427716284

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