MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_019682	CCA	2	6	972160	972165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716233
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15004	NC_019682	AAT	2	6	972220	972225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716233
15005	NC_019682	CCA	2	6	972257	972262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716233
15006	NC_019682	AAT	2	6	972278	972283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716233
15007	NC_019682	ATTG	2	8	972307	972314	25 %	50 %	25 %	0 %	427716233
15008	NC_019682	CAT	2	6	972339	972344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716233
15009	NC_019682	CAA	2	6	972345	972350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716233
15010	NC_019682	GATT	2	8	972372	972379	25 %	50 %	25 %	0 %	427716233
15011	NC_019682	ACT	2	6	972410	972415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716233
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15015	NC_019682	TGT	2	6	972514	972519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716233
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15020	NC_019682	TGC	2	6	972819	972824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716233
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15022	NC_019682	ATA	2	6	973019	973024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716233
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15024	NC_019682	GA	3	6	973115	973120	50 %	0 %	50 %	0 %	427716234
15025	NC_019682	ACTG	2	8	973200	973207	25 %	25 %	25 %	25 %	427716234
15026	NC_019682	AACCA	2	10	973242	973251	60 %	0 %	0 %	40 %	427716234
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15033	NC_019682	TAG	2	6	973549	973554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716234
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15052	NC_019682	TTG	2	6	974239	974244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716234
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15054	NC_019682	GGC	2	6	974442	974447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427716234
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15060	NC_019682	TTGA	2	8	974825	974832	25 %	50 %	25 %	0 %	427716235
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15100	NC_019682	A	6	6	979357	979362	100 %	0 %	0 %	0 %	427716239
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15107	NC_019682	A	6	6	979729	979734	100 %	0 %	0 %	0 %	427716239
15108	NC_019682	AG	3	6	979768	979773	50 %	0 %	50 %	0 %	427716239
15109	NC_019682	AGC	2	6	979804	979809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716239
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15111	NC_019682	TTAG	2	8	980018	980025	25 %	50 %	25 %	0 %	427716239
15112	NC_019682	GGA	2	6	980035	980040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716239
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15120	NC_019682	ATC	2	6	983122	983127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716240
15121	NC_019682	TG	3	6	983194	983199	0 %	50 %	50 %	0 %	427716240
15122	NC_019682	T	6	6	983230	983235	0 %	100 %	0 %	0 %	427716240
15123	NC_019682	AGG	2	6	983248	983253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716240
15124	NC_019682	T	6	6	983340	983345	0 %	100 %	0 %	0 %	427716240
15125	NC_019682	CCT	2	6	983397	983402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716240
15126	NC_019682	A	6	6	983455	983460	100 %	0 %	0 %	0 %	427716240
15127	NC_019682	TTTC	2	8	983562	983569	0 %	75 %	0 %	25 %	427716240
15128	NC_019682	T	6	6	983658	983663	0 %	100 %	0 %	0 %	427716240
15129	NC_019682	CCA	2	6	983690	983695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716240
15130	NC_019682	ACC	2	6	983767	983772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716240
15131	NC_019682	TTC	2	6	983807	983812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716240
15132	NC_019682	A	6	6	983845	983850	100 %	0 %	0 %	0 %	427716240
15133	NC_019682	CCAC	2	8	983853	983860	25 %	0 %	0 %	75 %	427716240
15134	NC_019682	CAT	2	6	983940	983945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716241
15135	NC_019682	TATC	2	8	983954	983961	25 %	50 %	0 %	25 %	427716241
15136	NC_019682	CAT	2	6	983967	983972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716241
15137	NC_019682	TATC	2	8	983981	983988	25 %	50 %	0 %	25 %	427716241
15138	NC_019682	CAT	2	6	983994	983999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716241
15139	NC_019682	TATC	2	8	984008	984015	25 %	50 %	0 %	25 %	427716241
15140	NC_019682	AAATC	2	10	984647	984656	60 %	20 %	0 %	20 %	427716242
15141	NC_019682	CAC	2	6	984693	984698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716242
15142	NC_019682	CTC	2	6	984702	984707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716242
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15144	NC_019682	GAT	2	6	984807	984812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716242
15145	NC_019682	AT	3	6	984817	984822	50 %	50 %	0 %	0 %	427716242
15146	NC_019682	TTC	2	6	984923	984928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716242
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15149	NC_019682	CCAT	2	8	985069	985076	25 %	25 %	0 %	50 %	427716242
15150	NC_019682	GAT	2	6	985092	985097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716242
15151	NC_019682	CTG	2	6	985124	985129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716242
15152	NC_019682	T	7	7	985130	985136	0 %	100 %	0 %	0 %	427716242
15153	NC_019682	CA	3	6	985223	985228	50 %	0 %	0 %	50 %	427716242
15154	NC_019682	CTG	2	6	985262	985267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716242
15155	NC_019682	TGC	2	6	985281	985286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716242
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15158	NC_019682	CTTC	2	8	985451	985458	0 %	50 %	0 %	50 %	427716242
15159	NC_019682	CGG	2	6	985561	985566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427716242
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15161	NC_019682	AAT	3	9	986048	986056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716243
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15163	NC_019682	CA	3	6	986114	986119	50 %	0 %	0 %	50 %	427716243
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15176	NC_019682	TCA	2	6	986989	986994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716244
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15181	NC_019682	GTCT	2	8	987456	987463	0 %	50 %	25 %	25 %	427716244
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15187	NC_019682	GGT	2	6	987866	987871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716244
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15222	NC_019682	CAAT	2	8	989736	989743	50 %	25 %	0 %	25 %	427716245
15223	NC_019682	TCTT	2	8	989861	989868	0 %	75 %	0 %	25 %	427716245
15224	NC_019682	T	6	6	989905	989910	0 %	100 %	0 %	0 %	427716245
15225	NC_019682	CTA	2	6	990011	990016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716245
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15227	NC_019682	TCC	2	6	990216	990221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716245
15228	NC_019682	TCAA	2	8	990272	990279	50 %	25 %	0 %	25 %	427716245
15229	NC_019682	GTG	2	6	990330	990335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716245
15230	NC_019682	GCA	2	6	990428	990433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716245
15231	NC_019682	T	7	7	990725	990731	0 %	100 %	0 %	0 %	427716246
15232	NC_019682	CAG	2	6	990741	990746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716246
15233	NC_019682	CTGG	2	8	990762	990769	0 %	25 %	50 %	25 %	427716246
15234	NC_019682	A	7	7	990797	990803	100 %	0 %	0 %	0 %	427716246
15235	NC_019682	AGA	2	6	991216	991221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716247
15236	NC_019682	TGC	2	6	991252	991257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716247
15237	NC_019682	CGGTTT	2	12	991315	991326	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427716247
15238	NC_019682	CAA	2	6	991336	991341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716247
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15361	NC_019682	ATC	2	6	1000058	1000063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716255
15362	NC_019682	TG	3	6	1000077	1000082	0 %	50 %	50 %	0 %	427716255
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15364	NC_019682	AAT	2	6	1000152	1000157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716255
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15392	NC_019682	TCT	2	6	1002332	1002337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716257
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15465	NC_019682	ATT	2	6	1006000	1006005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716260
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15470	NC_019682	GAT	2	6	1006182	1006187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716260
15471	NC_019682	CTG	2	6	1006197	1006202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716260
15472	NC_019682	TTTGTA	2	12	1006236	1006247	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	427716260
15473	NC_019682	TGC	2	6	1006285	1006290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716260
15474	NC_019682	TAA	2	6	1006327	1006332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716260
15475	NC_019682	ATT	2	6	1006393	1006398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716260
15476	NC_019682	TAC	2	6	1006413	1006418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716260
15477	NC_019682	TAAAG	2	10	1006450	1006459	60 %	20 %	20 %	0 %	427716260
15478	NC_019682	TGT	2	6	1006582	1006587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716260
15479	NC_019682	TAAA	2	8	1006602	1006609	75 %	25 %	0 %	0 %	427716260
15480	NC_019682	T	6	6	1006660	1006665	0 %	100 %	0 %	0 %	427716260
15481	NC_019682	GAG	2	6	1006797	1006802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716260
15482	NC_019682	CAC	3	9	1006812	1006820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716260
15483	NC_019682	ATA	2	6	1006905	1006910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716260
15484	NC_019682	GAA	2	6	1006956	1006961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716260
15485	NC_019682	T	7	7	1007003	1007009	0 %	100 %	0 %	0 %	427716260
15486	NC_019682	CTT	2	6	1007034	1007039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716260
15487	NC_019682	GTA	2	6	1007042	1007047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716260
15488	NC_019682	T	6	6	1007197	1007202	0 %	100 %	0 %	0 %	427716260
15489	NC_019682	GTCATA	2	12	1007260	1007271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427716260
15490	NC_019682	ATT	2	6	1007353	1007358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716260
15491	NC_019682	CAG	2	6	1007424	1007429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716260
15492	NC_019682	AGT	2	6	1007482	1007487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716260
15493	NC_019682	CTG	2	6	1007496	1007501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716260
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15496	NC_019682	AGT	2	6	1007689	1007694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716261
15497	NC_019682	TGCC	2	8	1007709	1007716	0 %	25 %	25 %	50 %	427716261
15498	NC_019682	AATG	2	8	1007738	1007745	50 %	25 %	25 %	0 %	427716261
15499	NC_019682	CTT	2	6	1007792	1007797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716261
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