MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_019682	AAAC	2	8	6685640	6685647	75 %	0 %	0 %	25 %	427721044
104002	NC_019682	TGC	2	6	6686225	6686230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427721045
104003	NC_019682	CGA	2	6	6686231	6686236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427721045
104004	NC_019682	ATC	2	6	6686288	6686293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427721045
104005	NC_019682	TAT	2	6	6686467	6686472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427721045
104006	NC_019682	A	6	6	6686495	6686500	100 %	0 %	0 %	0 %	427721045
104007	NC_019682	CAA	4	12	6686539	6686550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427721045
104008	NC_019682	TGT	2	6	6686568	6686573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427721045
104009	NC_019682	GTG	2	6	6686602	6686607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427721045
104010	NC_019682	CAA	2	6	6686664	6686669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427721045
104011	NC_019682	AGCAGT	2	12	6686784	6686795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427721045
104012	NC_019682	CAGAA	2	10	6686798	6686807	60 %	0 %	20 %	20 %	427721045
104013	NC_019682	GAA	2	6	6686818	6686823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427721045
104014	NC_019682	CAA	2	6	6686860	6686865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427721045
104015	NC_019682	ATG	2	6	6686891	6686896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427721045
104016	NC_019682	CAA	2	6	6687031	6687036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427721045
104017	NC_019682	CAA	2	6	6687052	6687057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427721045
104018	NC_019682	ACA	2	6	6687217	6687222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427721046
104019	NC_019682	GAT	2	6	6687266	6687271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427721046
104020	NC_019682	GTA	2	6	6687279	6687284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427721046
104021	NC_019682	GTT	2	6	6687543	6687548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427721047
104022	NC_019682	TCACT	2	10	6687554	6687563	20 %	40 %	0 %	40 %	427721047
104023	NC_019682	ACAT	2	8	6687631	6687638	50 %	25 %	0 %	25 %	427721047
104024	NC_019682	GTT	2	6	6687671	6687676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427721047
104025	NC_019682	TCA	2	6	6687733	6687738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427721047
104026	NC_019682	T	6	6	6687765	6687770	0 %	100 %	0 %	0 %	427721047
104027	NC_019682	AGTTA	2	10	6687810	6687819	40 %	40 %	20 %	0 %	427721047
104028	NC_019682	TCCT	2	8	6687848	6687855	0 %	50 %	0 %	50 %	427721048
104029	NC_019682	CT	3	6	6687854	6687859	0 %	50 %	0 %	50 %	427721048
104030	NC_019682	ATC	2	6	6687875	6687880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427721048
104031	NC_019682	AT	3	6	6687903	6687908	50 %	50 %	0 %	0 %	427721048
104032	NC_019682	A	6	6	6687985	6687990	100 %	0 %	0 %	0 %	427721048
104033	NC_019682	CGC	2	6	6688003	6688008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427721048
104034	NC_019682	TC	3	6	6688026	6688031	0 %	50 %	0 %	50 %	427721048
104035	NC_019682	TCT	2	6	6688095	6688100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427721048
104036	NC_019682	AAC	2	6	6688109	6688114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427721048
104037	NC_019682	TTG	2	6	6688130	6688135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427721048
104038	NC_019682	CCA	2	6	6688154	6688159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427721048
104039	NC_019682	A	6	6	6688901	6688906	100 %	0 %	0 %	0 %	427721049
104040	NC_019682	ACTGC	2	10	6688940	6688949	20 %	20 %	20 %	40 %	427721049
104041	NC_019682	GTTA	2	8	6688978	6688985	25 %	50 %	25 %	0 %	427721049
104042	NC_019682	AAT	2	6	6689018	6689023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427721049
104043	NC_019682	ATT	2	6	6689087	6689092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427721049
104044	NC_019682	GCA	2	6	6689160	6689165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427721049
104045	NC_019682	TTG	2	6	6689192	6689197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427721049
104046	NC_019682	ATCT	2	8	6689243	6689250	25 %	50 %	0 %	25 %	427721049
104047	NC_019682	AGG	2	6	6689277	6689282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427721049
104048	NC_019682	TGA	2	6	6689299	6689304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427721049
104049	NC_019682	TTC	2	6	6689359	6689364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427721049
104050	NC_019682	ATGT	2	8	6689369	6689376	25 %	50 %	25 %	0 %	427721049
104051	NC_019682	GGC	2	6	6689395	6689400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427721049
104052	NC_019682	GGTG	2	8	6689443	6689450	0 %	25 %	75 %	0 %	427721049
104053	NC_019682	AGA	2	6	6689463	6689468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427721049
104054	NC_019682	GAAG	2	8	6689497	6689504	50 %	0 %	50 %	0 %	427721049
104055	NC_019682	GTCA	2	8	6689522	6689529	25 %	25 %	25 %	25 %	427721049
104056	NC_019682	TTC	2	6	6689616	6689621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427721049
104057	NC_019682	TTAC	2	8	6689626	6689633	25 %	50 %	0 %	25 %	427721049
104058	NC_019682	ATT	2	6	6689652	6689657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427721049
104059	NC_019682	CAT	2	6	6689692	6689697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427721049
104060	NC_019682	AAATTC	2	12	6689739	6689750	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	427721049
104061	NC_019682	TAT	2	6	6689926	6689931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427721049
104062	NC_019682	TAT	2	6	6690139	6690144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427721050
104063	NC_019682	ACA	2	6	6690258	6690263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427721050
104064	NC_019682	TTCCC	2	10	6690296	6690305	0 %	40 %	0 %	60 %	427721050
104065	NC_019682	CGAACC	2	12	6690325	6690336	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427721050
104066	NC_019682	ATT	2	6	6690340	6690345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427721050
104067	NC_019682	GCAA	2	8	6690433	6690440	50 %	0 %	25 %	25 %	427721050
104068	NC_019682	TGA	2	6	6690454	6690459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427721050
104069	NC_019682	ACC	2	6	6690511	6690516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427721050
104070	NC_019682	ATC	2	6	6690543	6690548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427721050
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104073	NC_019682	T	7	7	6690940	6690946	0 %	100 %	0 %	0 %	427721050
104074	NC_019682	A	8	8	6690967	6690974	100 %	0 %	0 %	0 %	427721050
104075	NC_019682	A	6	6	6691003	6691008	100 %	0 %	0 %	0 %	427721050
104076	NC_019682	A	6	6	6691114	6691119	100 %	0 %	0 %	0 %	427721050
104077	NC_019682	AAAT	2	8	6691146	6691153	75 %	25 %	0 %	0 %	427721050
104078	NC_019682	TTAC	2	8	6691174	6691181	25 %	50 %	0 %	25 %	427721051
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104081	NC_019682	A	6	6	6691368	6691373	100 %	0 %	0 %	0 %	427721051
104082	NC_019682	AGA	2	6	6691487	6691492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427721051
104083	NC_019682	TTG	2	6	6691552	6691557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427721051
104084	NC_019682	GCAA	2	8	6691571	6691578	50 %	0 %	25 %	25 %	427721051
104085	NC_019682	ATT	2	6	6691631	6691636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427721052
104086	NC_019682	A	8	8	6691648	6691655	100 %	0 %	0 %	0 %	427721052
104087	NC_019682	CTGG	2	8	6691678	6691685	0 %	25 %	50 %	25 %	427721052
104088	NC_019682	AGC	2	6	6691711	6691716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427721052
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104090	NC_019682	TGC	2	6	6691730	6691735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427721052
104091	NC_019682	TGC	2	6	6691790	6691795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427721052
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104097	NC_019682	CAT	2	6	6691976	6691981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427721052
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104099	NC_019682	TGC	2	6	6692066	6692071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427721052
104100	NC_019682	AAT	2	6	6692177	6692182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427721052
104101	NC_019682	GAA	2	6	6692265	6692270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427721052
104102	NC_019682	AGC	2	6	6692303	6692308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427721052
104103	NC_019682	TTA	2	6	6692385	6692390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427721052
104104	NC_019682	AC	3	6	6692395	6692400	50 %	0 %	0 %	50 %	427721052
104105	NC_019682	GACT	2	8	6692426	6692433	25 %	25 %	25 %	25 %	427721052
104106	NC_019682	TCT	2	6	6692545	6692550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427721052
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104108	NC_019682	CGT	2	6	6692631	6692636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427721052
104109	NC_019682	GAA	2	6	6692670	6692675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427721052
104110	NC_019682	TCA	2	6	6692797	6692802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427721053
104111	NC_019682	AAG	2	6	6692886	6692891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427721053
104112	NC_019682	TCC	2	6	6692962	6692967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427721053
104113	NC_019682	TGT	2	6	6693037	6693042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427721053
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