MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_019682	GAT	2	6	6415585	6415590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720818
100002	NC_019682	CCA	2	6	6415728	6415733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427720818
100003	NC_019682	TTGA	2	8	6415800	6415807	25 %	50 %	25 %	0 %	427720818
100004	NC_019682	AAAG	2	8	6415882	6415889	75 %	0 %	25 %	0 %	427720818
100005	NC_019682	ATG	2	6	6415904	6415909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720818
100006	NC_019682	AAC	2	6	6415978	6415983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427720818
100007	NC_019682	TCA	2	6	6415988	6415993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720818
100008	NC_019682	TGAT	2	8	6416048	6416055	25 %	50 %	25 %	0 %	427720819
100009	NC_019682	TGT	2	6	6416059	6416064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720819
100010	NC_019682	GTT	2	6	6416202	6416207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720819
100011	NC_019682	TA	3	6	6416258	6416263	50 %	50 %	0 %	0 %	427720819
100012	NC_019682	TGAATG	2	12	6416281	6416292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720819
100013	NC_019682	CTC	2	6	6416313	6416318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427720819
100014	NC_019682	A	6	6	6416332	6416337	100 %	0 %	0 %	0 %	427720819
100015	NC_019682	TGG	2	6	6416343	6416348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720819
100016	NC_019682	A	7	7	6416409	6416415	100 %	0 %	0 %	0 %	427720819
100017	NC_019682	GTT	2	6	6416429	6416434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720819
100018	NC_019682	T	6	6	6416699	6416704	0 %	100 %	0 %	0 %	427720819
100019	NC_019682	AC	3	6	6416717	6416722	50 %	0 %	0 %	50 %	427720819
100020	NC_019682	ATC	2	6	6416793	6416798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720819
100021	NC_019682	CAG	2	6	6416942	6416947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720819
100022	NC_019682	GGC	2	6	6416987	6416992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427720819
100023	NC_019682	C	8	8	6417304	6417311	0 %	0 %	0 %	100 %	427720819
100024	NC_019682	TAGCCT	2	12	6417424	6417435	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427720820
100025	NC_019682	CAG	2	6	6417465	6417470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720820
100026	NC_019682	AGAAAT	2	12	6417524	6417535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	427720820
100027	NC_019682	TGAG	2	8	6417539	6417546	25 %	25 %	50 %	0 %	427720820
100028	NC_019682	GTC	2	6	6417560	6417565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720820
100029	NC_019682	GTA	2	6	6417640	6417645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720820
100030	NC_019682	T	7	7	6417697	6417703	0 %	100 %	0 %	0 %	427720820
100031	NC_019682	AGT	2	6	6417785	6417790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720820
100032	NC_019682	TCT	2	6	6417829	6417834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720820
100033	NC_019682	GAC	2	6	6418005	6418010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720820
100034	NC_019682	ATC	2	6	6418090	6418095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720820
100035	NC_019682	T	6	6	6418104	6418109	0 %	100 %	0 %	0 %	427720820
100036	NC_019682	GTG	2	6	6418162	6418167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720820
100037	NC_019682	TCTG	2	8	6418197	6418204	0 %	50 %	25 %	25 %	427720820
100038	NC_019682	AG	3	6	6418359	6418364	50 %	0 %	50 %	0 %	427720820
100039	NC_019682	GCA	2	6	6418376	6418381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720820
100040	NC_019682	A	6	6	6418381	6418386	100 %	0 %	0 %	0 %	427720820
100041	NC_019682	GA	3	6	6418532	6418537	50 %	0 %	50 %	0 %	427720820
100042	NC_019682	T	6	6	6418539	6418544	0 %	100 %	0 %	0 %	427720820
100043	NC_019682	TTC	2	6	6418635	6418640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720820
100044	NC_019682	T	6	6	6418740	6418745	0 %	100 %	0 %	0 %	427720820
100045	NC_019682	T	6	6	6418815	6418820	0 %	100 %	0 %	0 %	427720820
100046	NC_019682	ATTA	2	8	6419454	6419461	50 %	50 %	0 %	0 %	427720821
100047	NC_019682	ATC	2	6	6419516	6419521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720821
100048	NC_019682	TG	3	6	6419569	6419574	0 %	50 %	50 %	0 %	427720821
100049	NC_019682	ATC	2	6	6419614	6419619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720821
100050	NC_019682	GAT	2	6	6419698	6419703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720821
100051	NC_019682	TTGA	2	8	6419705	6419712	25 %	50 %	25 %	0 %	427720821
100052	NC_019682	A	6	6	6419749	6419754	100 %	0 %	0 %	0 %	427720821
100053	NC_019682	T	6	6	6419782	6419787	0 %	100 %	0 %	0 %	427720821
100054	NC_019682	ATG	2	6	6419807	6419812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720821
100055	NC_019682	CTGA	2	8	6419981	6419988	25 %	25 %	25 %	25 %	427720822
100056	NC_019682	CCT	2	6	6420081	6420086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427720822
100057	NC_019682	TCC	2	6	6420101	6420106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427720822
100058	NC_019682	CAG	3	9	6420109	6420117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720822
100059	NC_019682	CAG	2	6	6420121	6420126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720822
100060	NC_019682	CAA	2	6	6420130	6420135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427720822
100061	NC_019682	AACC	2	8	6420147	6420154	50 %	0 %	0 %	50 %	427720822
100062	NC_019682	ATG	2	6	6420183	6420188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720822
100063	NC_019682	AATA	2	8	6420206	6420213	75 %	25 %	0 %	0 %	427720822
100064	NC_019682	CCG	2	6	6420246	6420251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427720822
100065	NC_019682	ACC	2	6	6420269	6420274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427720822
100066	NC_019682	GGT	2	6	6420332	6420337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720822
100067	NC_019682	AAT	2	6	6420353	6420358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720822
100068	NC_019682	TTCTGC	2	12	6420410	6420421	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	427720822
100069	NC_019682	CAA	2	6	6420439	6420444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427720822
100070	NC_019682	ATT	2	6	6420501	6420506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720823
100071	NC_019682	CTG	2	6	6420519	6420524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720823
100072	NC_019682	TGG	2	6	6420585	6420590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720823
100073	NC_019682	AAG	2	6	6420599	6420604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427720823
100074	NC_019682	ACTTC	2	10	6420693	6420702	20 %	40 %	0 %	40 %	427720823
100075	NC_019682	ATC	2	6	6420745	6420750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720823
100076	NC_019682	T	6	6	6420757	6420762	0 %	100 %	0 %	0 %	427720823
100077	NC_019682	TCA	2	6	6420788	6420793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720823
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100079	NC_019682	TC	3	6	6420845	6420850	0 %	50 %	0 %	50 %	427720823
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100085	NC_019682	ACCG	2	8	6421720	6421727	25 %	0 %	25 %	50 %	427720824
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100087	NC_019682	AAT	2	6	6421789	6421794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427720824
100088	NC_019682	CAG	2	6	6421800	6421805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720824
100089	NC_019682	GCA	2	6	6422044	6422049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720825
100090	NC_019682	TG	3	6	6422079	6422084	0 %	50 %	50 %	0 %	427720825
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100093	NC_019682	GAT	2	6	6422254	6422259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720825
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100096	NC_019682	TGA	2	6	6422361	6422366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720825
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100099	NC_019682	GCCA	2	8	6422529	6422536	25 %	0 %	25 %	50 %	427720825
100100	NC_019682	AGTTG	2	10	6422580	6422589	20 %	40 %	40 %	0 %	427720825
100101	NC_019682	GAT	2	6	6422656	6422661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720825
100102	NC_019682	TTTC	2	8	6422696	6422703	0 %	75 %	0 %	25 %	427720825
100103	NC_019682	CTG	2	6	6422798	6422803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720825
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100105	NC_019682	TAAAAG	2	12	6422924	6422935	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	427720825
100106	NC_019682	CCA	2	6	6423050	6423055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427720826
100107	NC_019682	TGA	2	6	6423250	6423255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720826
100108	NC_019682	AG	3	6	6423334	6423339	50 %	0 %	50 %	0 %	427720826
100109	NC_019682	ATCA	2	8	6423341	6423348	50 %	25 %	0 %	25 %	427720826
100110	NC_019682	CAC	2	6	6423349	6423354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427720826
100111	NC_019682	CCT	2	6	6423448	6423453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427720826
100112	NC_019682	ATTG	2	8	6423528	6423535	25 %	50 %	25 %	0 %	427720826
100113	NC_019682	CA	3	6	6423773	6423778	50 %	0 %	0 %	50 %	427720827
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100231	NC_019682	TGC	2	6	6429590	6429595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720829
100232	NC_019682	TGT	2	6	6429647	6429652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427720829
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100331	NC_019682	CGT	2	6	6436804	6436809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720834
100332	NC_019682	ATT	2	6	6436825	6436830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427720834
100333	NC_019682	GTTGGT	4	24	6436834	6436857	0 %	50 %	50 %	0 %	427720834
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100336	NC_019682	GTC	2	6	6436877	6436882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720834
100337	NC_019682	TGG	2	6	6436893	6436898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427720834
100338	NC_019682	CTT	2	6	6436916	6436921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427720834
100339	NC_019682	CTG	2	6	6436922	6436927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427720834
100340	NC_019682	TGA	2	6	6437047	6437052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427720834
100341	NC_019682	AACC	2	8	6437150	6437157	50 %	0 %	0 %	50 %	427720834
100342	NC_019682	CAT	2	6	6437202	6437207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427720834
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100344	NC_019682	GAC	3	9	6437261	6437269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427720834
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