MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019682	TGA	2	6	359687	359692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715690
5502	NC_019682	CAC	2	6	359748	359753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715690
5503	NC_019682	TGT	2	6	359834	359839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715690
5504	NC_019682	TTA	2	6	359999	360004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715691
5505	NC_019682	T	7	7	360008	360014	0 %	100 %	0 %	0 %	427715691
5506	NC_019682	GCG	2	6	360043	360048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715691
5507	NC_019682	T	6	6	360088	360093	0 %	100 %	0 %	0 %	427715691
5508	NC_019682	CGG	3	9	360098	360106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715691
5509	NC_019682	GCT	2	6	360108	360113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715691
5510	NC_019682	TTG	2	6	360124	360129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715691
5511	NC_019682	TTA	2	6	360175	360180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715691
5512	NC_019682	GCT	2	6	360190	360195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715691
5513	NC_019682	CTG	2	6	360223	360228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715691
5514	NC_019682	CTT	2	6	360437	360442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715692
5515	NC_019682	CTA	2	6	360473	360478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715692
5516	NC_019682	ACC	2	6	360507	360512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715692
5517	NC_019682	CTG	2	6	360548	360553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715692
5518	NC_019682	A	6	6	360598	360603	100 %	0 %	0 %	0 %	427715692
5519	NC_019682	CAG	3	9	360710	360718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715692
5520	NC_019682	ATA	2	6	360719	360724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715692
5521	NC_019682	A	6	6	360746	360751	100 %	0 %	0 %	0 %	427715692
5522	NC_019682	CTG	2	6	360761	360766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715692
5523	NC_019682	TCA	2	6	360785	360790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715692
5524	NC_019682	TTG	3	9	361159	361167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715693
5525	NC_019682	TTGT	2	8	361489	361496	0 %	75 %	25 %	0 %	427715694
5526	NC_019682	CAC	2	6	361569	361574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715694
5527	NC_019682	CAGCA	2	10	361582	361591	40 %	0 %	20 %	40 %	427715694
5528	NC_019682	GGC	2	6	361630	361635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715694
5529	NC_019682	ACT	2	6	361642	361647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715694
5530	NC_019682	CT	3	6	361646	361651	0 %	50 %	0 %	50 %	427715694
5531	NC_019682	TCT	2	6	361787	361792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715694
5532	NC_019682	GTA	2	6	361893	361898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715694
5533	NC_019682	GA	3	6	362093	362098	50 %	0 %	50 %	0 %	427715695
5534	NC_019682	TTC	2	6	362132	362137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715695
5535	NC_019682	GAA	2	6	362145	362150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715695
5536	NC_019682	GTA	2	6	362289	362294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715695
5537	NC_019682	GGA	2	6	362385	362390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715695
5538	NC_019682	ATA	2	6	362423	362428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715695
5539	NC_019682	CAG	2	6	362440	362445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715695
5540	NC_019682	TTC	2	6	362450	362455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715695
5541	NC_019682	AG	3	6	362508	362513	50 %	0 %	50 %	0 %	427715695
5542	NC_019682	AAT	2	6	362534	362539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715695
5543	NC_019682	CTA	2	6	362563	362568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715695
5544	NC_019682	A	7	7	362573	362579	100 %	0 %	0 %	0 %	427715695
5545	NC_019682	T	6	6	362585	362590	0 %	100 %	0 %	0 %	427715695
5546	NC_019682	GACT	3	12	362660	362671	25 %	25 %	25 %	25 %	427715696
5547	NC_019682	T	8	8	362687	362694	0 %	100 %	0 %	0 %	427715696
5548	NC_019682	CTG	2	6	362703	362708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715696
5549	NC_019682	GCT	2	6	362766	362771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715696
5550	NC_019682	CCA	2	6	362856	362861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715696
5551	NC_019682	CAG	2	6	362874	362879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715696
5552	NC_019682	CAC	2	6	362917	362922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715696
5553	NC_019682	AAG	2	6	362976	362981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715696
5554	NC_019682	A	6	6	362989	362994	100 %	0 %	0 %	0 %	427715696
5555	NC_019682	GCA	2	6	363006	363011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715696
5556	NC_019682	GAT	2	6	363074	363079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715696
5557	NC_019682	TTC	2	6	363086	363091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715696
5558	NC_019682	ATTC	2	8	363093	363100	25 %	50 %	0 %	25 %	427715696
5559	NC_019682	CAA	2	6	363181	363186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715696
5560	NC_019682	T	6	6	363196	363201	0 %	100 %	0 %	0 %	427715696
5561	NC_019682	GAAA	2	8	363215	363222	75 %	0 %	25 %	0 %	427715696
5562	NC_019682	TTTG	2	8	363270	363277	0 %	75 %	25 %	0 %	427715696
5563	NC_019682	TCT	2	6	363356	363361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715696
5564	NC_019682	CGC	2	6	363370	363375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715696
5565	NC_019682	GCC	2	6	363392	363397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715696
5566	NC_019682	GAT	2	6	363405	363410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715696
5567	NC_019682	T	6	6	363439	363444	0 %	100 %	0 %	0 %	427715696
5568	NC_019682	CCG	2	6	363445	363450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715696
5569	NC_019682	T	6	6	363507	363512	0 %	100 %	0 %	0 %	427715696
5570	NC_019682	GAC	2	6	363513	363518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715696
5571	NC_019682	ATG	2	6	363592	363597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715696
5572	NC_019682	CAG	2	6	363618	363623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715696
5573	NC_019682	A	6	6	363661	363666	100 %	0 %	0 %	0 %	427715696
5574	NC_019682	CTT	2	6	363678	363683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715696
5575	NC_019682	CAT	2	6	363729	363734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715696
5576	NC_019682	GTG	2	6	363740	363745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715696
5577	NC_019682	TTTA	2	8	364087	364094	25 %	75 %	0 %	0 %	427715697
5578	NC_019682	T	6	6	364117	364122	0 %	100 %	0 %	0 %	427715697
5579	NC_019682	CAT	2	6	364243	364248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715697
5580	NC_019682	ACC	2	6	364310	364315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715697
5581	NC_019682	GTA	2	6	364406	364411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715697
5582	NC_019682	ATTA	2	8	364475	364482	50 %	50 %	0 %	0 %	427715697
5583	NC_019682	CGA	2	6	364548	364553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715697
5584	NC_019682	TGGC	2	8	364555	364562	0 %	25 %	50 %	25 %	427715697
5585	NC_019682	CTA	2	6	364602	364607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715697
5586	NC_019682	ACTG	2	8	364784	364791	25 %	25 %	25 %	25 %	427715697
5587	NC_019682	ATG	2	6	364808	364813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715697
5588	NC_019682	CTG	2	6	364820	364825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715697
5589	NC_019682	TTG	2	6	364904	364909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715697
5590	NC_019682	A	6	6	365142	365147	100 %	0 %	0 %	0 %	427715697
5591	NC_019682	GCT	2	6	365448	365453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715698
5592	NC_019682	TTG	2	6	365483	365488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715698
5593	NC_019682	AGC	2	6	365525	365530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715698
5594	NC_019682	CAC	2	6	365568	365573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715698
5595	NC_019682	ATA	2	6	365640	365645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715698
5596	NC_019682	CAA	2	6	365702	365707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715698
5597	NC_019682	AAATAC	2	12	365738	365749	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	427715698
5598	NC_019682	GCCA	2	8	365826	365833	25 %	0 %	25 %	50 %	427715698
5599	NC_019682	CAA	2	6	365944	365949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715698
5600	NC_019682	GGTTGG	2	12	365979	365990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715698
5601	NC_019682	AAT	2	6	365992	365997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715698
5602	NC_019682	GACT	2	8	366037	366044	25 %	25 %	25 %	25 %	427715698
5603	NC_019682	CTT	2	6	366046	366051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715698
5604	NC_019682	GAA	2	6	366075	366080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715698
5605	NC_019682	CTT	2	6	366109	366114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715698
5606	NC_019682	GCT	2	6	366115	366120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715698
5607	NC_019682	ATG	2	6	366160	366165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715698
5608	NC_019682	TTCTGC	2	12	366185	366196	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	427715698
5609	NC_019682	TC	3	6	366205	366210	0 %	50 %	0 %	50 %	427715698
5610	NC_019682	CTG	2	6	366260	366265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715698
5611	NC_019682	AGT	2	6	366281	366286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715698
5612	NC_019682	AGC	2	6	366287	366292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715698
5613	NC_019682	GAT	2	6	366331	366336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715698
5614	NC_019682	AGC	2	6	366359	366364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715698
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5616	NC_019682	CAGTC	2	10	366413	366422	20 %	20 %	20 %	40 %	427715698
5617	NC_019682	CTT	2	6	366445	366450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715698
5618	NC_019682	AGT	2	6	366553	366558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715698
5619	NC_019682	CTGC	2	8	366567	366574	0 %	25 %	25 %	50 %	427715698
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5621	NC_019682	GCA	2	6	366636	366641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715698
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5987	NC_019682	ATA	2	6	386299	386304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715716
5988	NC_019682	TCT	2	6	386350	386355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715716
5989	NC_019682	CTGCAA	2	12	386419	386430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427715716
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