MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 20392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_019566	GAA	2	6	1398600	1398605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401959
19002	NC_019566	ACG	2	6	1398659	1398664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19003	NC_019566	CCT	2	6	1398699	1398704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426401959
19004	NC_019566	TCC	2	6	1398731	1398736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426401959
19005	NC_019566	CAT	2	6	1398754	1398759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401959
19006	NC_019566	TAAG	2	8	1398838	1398845	50 %	25 %	25 %	0 %	426401959
19007	NC_019566	CA	3	6	1398869	1398874	50 %	0 %	0 %	50 %	426401959
19008	NC_019566	TGC	2	6	1398962	1398967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19009	NC_019566	GCC	2	6	1398970	1398975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426401959
19010	NC_019566	CAA	2	6	1399013	1399018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426401959
19011	NC_019566	GAG	2	6	1399051	1399056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426401959
19012	NC_019566	AACT	2	8	1399099	1399106	50 %	25 %	0 %	25 %	426401959
19013	NC_019566	TTGG	2	8	1399189	1399196	0 %	50 %	50 %	0 %	426401959
19014	NC_019566	GCT	2	6	1399272	1399277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19015	NC_019566	AACCA	2	10	1399421	1399430	60 %	0 %	0 %	40 %	426401959
19016	NC_019566	AGC	2	6	1399490	1399495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19017	NC_019566	AGT	2	6	1399514	1399519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19018	NC_019566	CGTC	2	8	1399521	1399528	0 %	25 %	25 %	50 %	426401959
19019	NC_019566	TTGA	2	8	1399529	1399536	25 %	50 %	25 %	0 %	426401959
19020	NC_019566	ACT	2	6	1399605	1399610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401959
19021	NC_019566	ACC	2	6	1399739	1399744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426401959
19022	NC_019566	TAA	2	6	1399772	1399777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401959
19023	NC_019566	CTA	2	6	1399801	1399806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401959
19024	NC_019566	AGA	2	6	1399811	1399816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401959
19025	NC_019566	AAGC	2	8	1399864	1399871	50 %	0 %	25 %	25 %	426401959
19026	NC_019566	GCT	2	6	1399875	1399880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19027	NC_019566	GCA	2	6	1399939	1399944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19028	NC_019566	CAA	2	6	1399972	1399977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426401959
19029	NC_019566	TCCT	2	8	1400042	1400049	0 %	50 %	0 %	50 %	426401959
19030	NC_019566	GCC	2	6	1400144	1400149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426401959
19031	NC_019566	AAT	2	6	1400312	1400317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401959
19032	NC_019566	GTT	2	6	1400355	1400360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426401959
19033	NC_019566	TGA	2	6	1400366	1400371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19034	NC_019566	TAT	2	6	1400404	1400409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401959
19035	NC_019566	TCC	2	6	1400429	1400434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426401959
19036	NC_019566	TAT	2	6	1400440	1400445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401959
19037	NC_019566	AGCAAT	2	12	1400468	1400479	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	426401959
19038	NC_019566	ATCG	2	8	1400643	1400650	25 %	25 %	25 %	25 %	426401959
19039	NC_019566	ATG	2	6	1400743	1400748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19040	NC_019566	GCT	2	6	1400799	1400804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19041	NC_019566	ATC	2	6	1400873	1400878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401959
19042	NC_019566	TTC	2	6	1400945	1400950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401959
19043	NC_019566	AGC	2	6	1401002	1401007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19044	NC_019566	TTC	2	6	1401008	1401013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401959
19045	NC_019566	CTGC	2	8	1401127	1401134	0 %	25 %	25 %	50 %	426401959
19046	NC_019566	ATACCA	2	12	1401135	1401146	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	426401959
19047	NC_019566	CAA	2	6	1401259	1401264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426401959
19048	NC_019566	ACG	2	6	1401266	1401271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19049	NC_019566	CAA	2	6	1401388	1401393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426401959
19050	NC_019566	AGC	2	6	1401434	1401439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19051	NC_019566	TGAT	2	8	1401462	1401469	25 %	50 %	25 %	0 %	426401959
19052	NC_019566	CAG	2	6	1401523	1401528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19053	NC_019566	TGAT	2	8	1401599	1401606	25 %	50 %	25 %	0 %	426401959
19054	NC_019566	GATT	2	8	1401634	1401641	25 %	50 %	25 %	0 %	426401959
19055	NC_019566	GATGAC	2	12	1401645	1401656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	426401959
19056	NC_019566	GAT	2	6	1401663	1401668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19057	NC_019566	GAT	2	6	1401675	1401680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19058	NC_019566	GAT	2	6	1401699	1401704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19059	NC_019566	GAT	2	6	1401735	1401740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19060	NC_019566	GAT	2	6	1401747	1401752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19061	NC_019566	GAT	2	6	1401771	1401776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19062	NC_019566	GAT	2	6	1401807	1401812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19063	NC_019566	CTT	2	6	1401862	1401867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401959
19064	NC_019566	CAAT	2	8	1401963	1401970	50 %	25 %	0 %	25 %	426401959
19065	NC_019566	CTT	2	6	1402015	1402020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401959
19066	NC_019566	CT	3	6	1402028	1402033	0 %	50 %	0 %	50 %	426401959
19067	NC_019566	ACA	2	6	1402092	1402097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426401959
19068	NC_019566	TCT	2	6	1402161	1402166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401959
19069	NC_019566	GCA	2	6	1402191	1402196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19070	NC_019566	TGC	2	6	1402223	1402228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19071	NC_019566	CAG	2	6	1402231	1402236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19072	NC_019566	ATG	2	6	1402345	1402350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
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19075	NC_019566	ATG	2	6	1402550	1402555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401959
19076	NC_019566	GCT	2	6	1402596	1402601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
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19084	NC_019566	GCT	2	6	1403343	1403348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19085	NC_019566	TAGC	2	8	1403374	1403381	25 %	25 %	25 %	25 %	426401959
19086	NC_019566	TGC	2	6	1403385	1403390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19087	NC_019566	AAGCA	2	10	1403399	1403408	60 %	0 %	20 %	20 %	426401959
19088	NC_019566	A	6	6	1403426	1403431	100 %	0 %	0 %	0 %	426401959
19089	NC_019566	CA	3	6	1403450	1403455	50 %	0 %	0 %	50 %	426401959
19090	NC_019566	CCA	2	6	1403466	1403471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426401959
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19096	NC_019566	A	6	6	1403771	1403776	100 %	0 %	0 %	0 %	426401959
19097	NC_019566	CTG	2	6	1403779	1403784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19098	NC_019566	AATT	2	8	1403791	1403798	50 %	50 %	0 %	0 %	426401959
19099	NC_019566	CAG	2	6	1403890	1403895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401959
19100	NC_019566	CCAT	2	8	1404027	1404034	25 %	25 %	0 %	50 %	426401959
19101	NC_019566	CCT	2	6	1404121	1404126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426401959
19102	NC_019566	GCCA	2	8	1404214	1404221	25 %	0 %	25 %	50 %	426401959
19103	NC_019566	CTG	2	6	1404340	1404345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401959
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19108	NC_019566	TCA	2	6	1404564	1404569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401959
19109	NC_019566	CAT	2	6	1404640	1404645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401959
19110	NC_019566	TAC	2	6	1404652	1404657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401959
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19112	NC_019566	A	6	6	1404772	1404777	100 %	0 %	0 %	0 %	426401959
19113	NC_019566	CCA	2	6	1404825	1404830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426401959
19114	NC_019566	CG	3	6	1404844	1404849	0 %	0 %	50 %	50 %	426401959
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19116	NC_019566	CAA	2	6	1404992	1404997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426401959
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19233	NC_019566	TCT	2	6	1411999	1412004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401961
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19347	NC_019566	A	6	6	1417064	1417069	100 %	0 %	0 %	0 %	426401961
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19463	NC_019566	CAG	2	6	1422884	1422889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401961
19464	NC_019566	TCC	2	6	1422905	1422910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426401961
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19467	NC_019566	TCC	2	6	1423062	1423067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426401961
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19473	NC_019566	CATG	2	8	1423322	1423329	25 %	25 %	25 %	25 %	426401961
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19491	NC_019566	CCAAC	2	10	1424190	1424199	40 %	0 %	0 %	60 %	426401961
19492	NC_019566	CAG	2	6	1424237	1424242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401961
19493	NC_019566	CAA	2	6	1424247	1424252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426401961
19494	NC_019566	AG	3	6	1424269	1424274	50 %	0 %	50 %	0 %	426401961
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19496	NC_019566	T	7	7	1424388	1424394	0 %	100 %	0 %	0 %	426401961
19497	NC_019566	CAGA	2	8	1424420	1424427	50 %	0 %	25 %	25 %	426401961
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19499	NC_019566	CT	3	6	1424473	1424478	0 %	50 %	0 %	50 %	426401961
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