MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 20392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019566	ATC	2	6	68202	68207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400576
1002	NC_019566	ACT	2	6	68262	68267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400576
1003	NC_019566	GA	3	6	68295	68300	50 %	0 %	50 %	0 %	426400576
1004	NC_019566	TAC	2	6	68312	68317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400576
1005	NC_019566	TCA	2	6	68338	68343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400576
1006	NC_019566	CTG	2	6	68357	68362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400576
1007	NC_019566	GCT	2	6	68398	68403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400576
1008	NC_019566	AGC	2	6	68442	68447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400576
1009	NC_019566	TTCAGC	2	12	68463	68474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	426400576
1010	NC_019566	AAT	2	6	68593	68598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400576
1011	NC_019566	T	6	6	68626	68631	0 %	100 %	0 %	0 %	426400576
1012	NC_019566	CGG	2	6	68684	68689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426400576
1013	NC_019566	TTA	2	6	68731	68736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400576
1014	NC_019566	GA	3	6	68807	68812	50 %	0 %	50 %	0 %	426400576
1015	NC_019566	CTT	2	6	68886	68891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400576
1016	NC_019566	T	7	7	69034	69040	0 %	100 %	0 %	0 %	426400577
1017	NC_019566	AAAC	2	8	69041	69048	75 %	0 %	0 %	25 %	426400577
1018	NC_019566	ATTT	2	8	69078	69085	25 %	75 %	0 %	0 %	426400577
1019	NC_019566	TA	3	6	69123	69128	50 %	50 %	0 %	0 %	426400577
1020	NC_019566	TAA	2	6	69153	69158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400577
1021	NC_019566	AAC	2	6	69251	69256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400577
1022	NC_019566	ATA	2	6	69278	69283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400577
1023	NC_019566	GCC	2	6	69321	69326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400577
1024	NC_019566	GTT	2	6	69408	69413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400577
1025	NC_019566	AGC	2	6	69415	69420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400577
1026	NC_019566	T	6	6	69435	69440	0 %	100 %	0 %	0 %	426400577
1027	NC_019566	TTC	2	6	69502	69507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400577
1028	NC_019566	CATTG	2	10	69553	69562	20 %	40 %	20 %	20 %	426400577
1029	NC_019566	GCT	2	6	69745	69750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400578
1030	NC_019566	TCA	2	6	69754	69759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400578
1031	NC_019566	CAT	2	6	69812	69817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400578
1032	NC_019566	ACT	2	6	69847	69852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400578
1033	NC_019566	CGA	2	6	69928	69933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400578
1034	NC_019566	T	6	6	70015	70020	0 %	100 %	0 %	0 %	426400578
1035	NC_019566	TCT	2	6	70039	70044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400578
1036	NC_019566	TCA	2	6	70087	70092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400578
1037	NC_019566	TTC	2	6	70134	70139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400578
1038	NC_019566	TTC	2	6	70155	70160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400578
1039	NC_019566	CCAG	2	8	70185	70192	25 %	0 %	25 %	50 %	426400578
1040	NC_019566	CGA	2	6	70225	70230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400578
1041	NC_019566	AG	3	6	70242	70247	50 %	0 %	50 %	0 %	426400578
1042	NC_019566	TAC	2	6	70260	70265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400578
1043	NC_019566	TCA	2	6	70288	70293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400578
1044	NC_019566	TAC	2	6	70332	70337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400578
1045	NC_019566	AAT	2	6	70365	70370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400578
1046	NC_019566	T	6	6	70376	70381	0 %	100 %	0 %	0 %	426400578
1047	NC_019566	CAT	2	6	70460	70465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400578
1048	NC_019566	AAT	2	6	70524	70529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400578
1049	NC_019566	CTT	2	6	70550	70555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400578
1050	NC_019566	CTCTT	2	10	70620	70629	0 %	60 %	0 %	40 %	426400578
1051	NC_019566	AAC	2	6	70758	70763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400578
1052	NC_019566	TAT	2	6	70790	70795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400578
1053	NC_019566	CTC	2	6	70797	70802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426400578
1054	NC_019566	GCT	2	6	70864	70869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400578
1055	NC_019566	TGG	2	6	70887	70892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400578
1056	NC_019566	TTC	2	6	70899	70904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400578
1057	NC_019566	AGT	2	6	70995	71000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400578
1058	NC_019566	TTGC	2	8	71093	71100	0 %	50 %	25 %	25 %	426400578
1059	NC_019566	CTT	2	6	71117	71122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400578
1060	NC_019566	AGCTT	2	10	71342	71351	20 %	40 %	20 %	20 %	426400579
1061	NC_019566	TTC	2	6	71359	71364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400579
1062	NC_019566	TTCAA	2	10	71396	71405	40 %	40 %	0 %	20 %	426400579
1063	NC_019566	GAA	2	6	71555	71560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400579
1064	NC_019566	AAT	2	6	71623	71628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400579
1065	NC_019566	CGT	2	6	71661	71666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400579
1066	NC_019566	CCG	2	6	71702	71707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400579
1067	NC_019566	ATA	2	6	71708	71713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400579
1068	NC_019566	TCT	2	6	71765	71770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400579
1069	NC_019566	ATTT	2	8	71892	71899	25 %	75 %	0 %	0 %	426400580
1070	NC_019566	CTT	2	6	71948	71953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400580
1071	NC_019566	TAA	2	6	72002	72007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400580
1072	NC_019566	ACC	2	6	72111	72116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400580
1073	NC_019566	TGT	2	6	72154	72159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400580
1074	NC_019566	ACG	2	6	72165	72170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400580
1075	NC_019566	TGA	2	6	72175	72180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400580
1076	NC_019566	CGC	2	6	72181	72186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400580
1077	NC_019566	GTA	2	6	72239	72244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400580
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1080	NC_019566	ATT	2	6	72372	72377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400580
1081	NC_019566	T	6	6	72441	72446	0 %	100 %	0 %	0 %	426400580
1082	NC_019566	GTCA	2	8	72465	72472	25 %	25 %	25 %	25 %	426400580
1083	NC_019566	TTC	2	6	72516	72521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400580
1084	NC_019566	CTT	2	6	72586	72591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400580
1085	NC_019566	AACTC	2	10	72602	72611	40 %	20 %	0 %	40 %	426400580
1086	NC_019566	CAT	3	9	72737	72745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400581
1087	NC_019566	GCA	2	6	72772	72777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400581
1088	NC_019566	ATT	2	6	72795	72800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400581
1089	NC_019566	ATT	2	6	72882	72887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400581
1090	NC_019566	GTAT	2	8	72894	72901	25 %	50 %	25 %	0 %	426400581
1091	NC_019566	TC	3	6	72960	72965	0 %	50 %	0 %	50 %	426400581
1092	NC_019566	CAG	2	6	72974	72979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400581
1093	NC_019566	CAA	2	6	72980	72985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400581
1094	NC_019566	AGC	2	6	73014	73019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400581
1095	NC_019566	CAC	3	9	73058	73066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400581
1096	NC_019566	CCG	2	6	73081	73086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400581
1097	NC_019566	CCA	2	6	73138	73143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400581
1098	NC_019566	TA	3	6	73167	73172	50 %	50 %	0 %	0 %	426400581
1099	NC_019566	ATG	2	6	73175	73180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400581
1100	NC_019566	TCA	2	6	73186	73191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400581
1101	NC_019566	CTT	2	6	73211	73216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400581
1102	NC_019566	CAT	2	6	73244	73249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400581
1103	NC_019566	AAC	2	6	73281	73286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400581
1104	NC_019566	T	6	6	73375	73380	0 %	100 %	0 %	0 %	426400581
1105	NC_019566	GGCA	2	8	73428	73435	25 %	0 %	50 %	25 %	426400581
1106	NC_019566	ATA	2	6	73471	73476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400581
1107	NC_019566	TAT	2	6	73502	73507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400581
1108	NC_019566	AT	3	6	73553	73558	50 %	50 %	0 %	0 %	426400581
1109	NC_019566	ATCTA	2	10	73560	73569	40 %	40 %	0 %	20 %	426400581
1110	NC_019566	TTG	2	6	73658	73663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400581
1111	NC_019566	GCAA	2	8	73716	73723	50 %	0 %	25 %	25 %	426400581
1112	NC_019566	AAG	2	6	74440	74445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400582
1113	NC_019566	ACC	2	6	74485	74490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400582
1114	NC_019566	ACT	2	6	74501	74506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400582
1115	NC_019566	AAC	2	6	74543	74548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400582
1116	NC_019566	GAA	2	6	74561	74566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400582
1117	NC_019566	ATA	2	6	74579	74584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400582
1118	NC_019566	CAT	2	6	74667	74672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400582
1119	NC_019566	CTA	2	6	74699	74704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400582
1120	NC_019566	ATCA	2	8	74713	74720	50 %	25 %	0 %	25 %	426400582
1121	NC_019566	TTCG	2	8	74842	74849	0 %	50 %	25 %	25 %	426400582
1122	NC_019566	TAAT	2	8	74874	74881	50 %	50 %	0 %	0 %	426400582
1123	NC_019566	CTC	2	6	74890	74895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426400582
1124	NC_019566	CGA	2	6	74896	74901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400582
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1126	NC_019566	T	7	7	75085	75091	0 %	100 %	0 %	0 %	426400583
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1243	NC_019566	TCCC	2	8	85560	85567	0 %	25 %	0 %	75 %	426400595
1244	NC_019566	CTT	2	6	85598	85603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400595
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1249	NC_019566	ACT	2	6	85759	85764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400595
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1499	NC_019566	A	6	6	103851	103856	100 %	0 %	0 %	0 %	426400618
1500	NC_019566	TGT	2	6	103865	103870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400618

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