MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 20392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_019566	TCAAA	2	10	620175	620184	60 %	20 %	0 %	20 %	426401158
8502	NC_019566	TCT	2	6	620289	620294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401158
8503	NC_019566	ATA	2	6	620365	620370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401158
8504	NC_019566	ATA	2	6	620402	620407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401158
8505	NC_019566	TTTG	2	8	620445	620452	0 %	75 %	25 %	0 %	426401158
8506	NC_019566	TGA	2	6	620511	620516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401158
8507	NC_019566	TAA	2	6	620556	620561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401158
8508	NC_019566	TTG	2	6	620697	620702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426401159
8509	NC_019566	GCT	2	6	620732	620737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401159
8510	NC_019566	TTA	2	6	620822	620827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401159
8511	NC_019566	GAA	2	6	620843	620848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401159
8512	NC_019566	TTG	3	9	620856	620864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426401159
8513	NC_019566	GAA	2	6	621113	621118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401159
8514	NC_019566	GAT	2	6	621119	621124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401159
8515	NC_019566	A	6	6	621189	621194	100 %	0 %	0 %	0 %	426401159
8516	NC_019566	AAT	2	6	621221	621226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401159
8517	NC_019566	AATT	2	8	621235	621242	50 %	50 %	0 %	0 %	426401159
8518	NC_019566	ATGA	2	8	621269	621276	50 %	25 %	25 %	0 %	426401159
8519	NC_019566	TAC	2	6	621346	621351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401159
8520	NC_019566	GATG	2	8	621379	621386	25 %	25 %	50 %	0 %	426401159
8521	NC_019566	GCT	2	6	621389	621394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401159
8522	NC_019566	TA	3	6	621455	621460	50 %	50 %	0 %	0 %	426401159
8523	NC_019566	ATT	2	6	621479	621484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401159
8524	NC_019566	ACAA	2	8	621556	621563	75 %	0 %	0 %	25 %	426401160
8525	NC_019566	CAA	2	6	621580	621585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426401160
8526	NC_019566	TACCT	2	10	621621	621630	20 %	40 %	0 %	40 %	426401160
8527	NC_019566	AATG	2	8	621636	621643	50 %	25 %	25 %	0 %	426401160
8528	NC_019566	GTA	2	6	621662	621667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401160
8529	NC_019566	TAT	2	6	621819	621824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401160
8530	NC_019566	TGT	2	6	621828	621833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426401160
8531	NC_019566	TGG	2	6	622005	622010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426401160
8532	NC_019566	TTA	2	6	622046	622051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401160
8533	NC_019566	AGC	2	6	622182	622187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401160
8534	NC_019566	ATGA	2	8	622204	622211	50 %	25 %	25 %	0 %	426401160
8535	NC_019566	GCC	2	6	622212	622217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426401160
8536	NC_019566	T	6	6	622297	622302	0 %	100 %	0 %	0 %	426401160
8537	NC_019566	ATA	2	6	622307	622312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401160
8538	NC_019566	CAGG	2	8	622327	622334	25 %	0 %	50 %	25 %	426401160
8539	NC_019566	AG	3	6	622419	622424	50 %	0 %	50 %	0 %	426401160
8540	NC_019566	TAC	2	6	622428	622433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401160
8541	NC_019566	AAAG	2	8	622437	622444	75 %	0 %	25 %	0 %	426401160
8542	NC_019566	TGCC	2	8	622475	622482	0 %	25 %	25 %	50 %	426401160
8543	NC_019566	AC	3	6	622519	622524	50 %	0 %	0 %	50 %	426401160
8544	NC_019566	TA	3	6	622569	622574	50 %	50 %	0 %	0 %	426401160
8545	NC_019566	CGG	2	6	622577	622582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426401160
8546	NC_019566	TGA	2	6	622632	622637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401160
8547	NC_019566	AAG	2	6	622664	622669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401160
8548	NC_019566	TAC	2	6	622670	622675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401160
8549	NC_019566	ATT	2	6	622699	622704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401160
8550	NC_019566	GAA	2	6	622732	622737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401160
8551	NC_019566	T	7	7	622776	622782	0 %	100 %	0 %	0 %	426401160
8552	NC_019566	AGTT	2	8	622829	622836	25 %	50 %	25 %	0 %	426401160
8553	NC_019566	TAG	2	6	622854	622859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401160
8554	NC_019566	AGA	2	6	622929	622934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401160
8555	NC_019566	A	8	8	622951	622958	100 %	0 %	0 %	0 %	426401160
8556	NC_019566	TAC	2	6	623046	623051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401161
8557	NC_019566	AAT	2	6	623079	623084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401161
8558	NC_019566	CAG	2	6	623096	623101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401161
8559	NC_019566	GAT	2	6	623103	623108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401161
8560	NC_019566	AAT	2	6	623160	623165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401161
8561	NC_019566	TGAT	2	8	623186	623193	25 %	50 %	25 %	0 %	426401161
8562	NC_019566	TGG	2	6	623235	623240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426401161
8563	NC_019566	TAG	2	6	623243	623248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401161
8564	NC_019566	AT	3	6	623288	623293	50 %	50 %	0 %	0 %	426401161
8565	NC_019566	AAT	2	6	623305	623310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401161
8566	NC_019566	TTG	2	6	624341	624346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426401162
8567	NC_019566	ATT	2	6	624354	624359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401162
8568	NC_019566	TATT	3	12	624356	624367	25 %	75 %	0 %	0 %	426401162
8569	NC_019566	T	7	7	624370	624376	0 %	100 %	0 %	0 %	426401162
8570	NC_019566	TAA	2	6	624391	624396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401162
8571	NC_019566	A	6	6	624426	624431	100 %	0 %	0 %	0 %	426401162
8572	NC_019566	ACT	2	6	624435	624440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401162
8573	NC_019566	A	8	8	624471	624478	100 %	0 %	0 %	0 %	426401162
8574	NC_019566	TATTT	2	10	624804	624813	20 %	80 %	0 %	0 %	426401163
8575	NC_019566	ATAA	2	8	624814	624821	75 %	25 %	0 %	0 %	426401163
8576	NC_019566	T	6	6	624898	624903	0 %	100 %	0 %	0 %	426401163
8577	NC_019566	TTC	2	6	625032	625037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401164
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8579	NC_019566	CAAT	2	8	625112	625119	50 %	25 %	0 %	25 %	426401164
8580	NC_019566	T	6	6	625245	625250	0 %	100 %	0 %	0 %	426401164
8581	NC_019566	AGTT	2	8	625268	625275	25 %	50 %	25 %	0 %	426401164
8582	NC_019566	CAA	2	6	625310	625315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426401164
8583	NC_019566	CCTG	2	8	625360	625367	0 %	25 %	25 %	50 %	426401164
8584	NC_019566	T	9	9	625448	625456	0 %	100 %	0 %	0 %	426401164
8585	NC_019566	TG	3	6	625497	625502	0 %	50 %	50 %	0 %	426401164
8586	NC_019566	A	7	7	625551	625557	100 %	0 %	0 %	0 %	426401165
8587	NC_019566	TTG	2	6	625571	625576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426401165
8588	NC_019566	TA	4	8	625581	625588	50 %	50 %	0 %	0 %	426401165
8589	NC_019566	TAG	2	6	625608	625613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401165
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8591	NC_019566	ATC	2	6	625953	625958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401166
8592	NC_019566	CTT	2	6	626594	626599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401167
8593	NC_019566	CAT	2	6	626611	626616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401167
8594	NC_019566	TGC	2	6	626650	626655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401167
8595	NC_019566	ATT	2	6	627232	627237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401168
8596	NC_019566	AAATAA	2	12	627266	627277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	426401168
8597	NC_019566	ATTA	2	8	627335	627342	50 %	50 %	0 %	0 %	426401168
8598	NC_019566	AGC	2	6	627348	627353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401168
8599	NC_019566	TAC	2	6	627357	627362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426401168
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8601	NC_019566	T	6	6	627918	627923	0 %	100 %	0 %	0 %	426401169
8602	NC_019566	TGA	2	6	628702	628707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401170
8603	NC_019566	TAT	2	6	628735	628740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426401170
8604	NC_019566	TA	5	10	628785	628794	50 %	50 %	0 %	0 %	426401170
8605	NC_019566	A	7	7	628794	628800	100 %	0 %	0 %	0 %	426401170
8606	NC_019566	CGG	2	6	629680	629685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426401171
8607	NC_019566	AGC	2	6	629773	629778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426401171
8608	NC_019566	TCT	2	6	629805	629810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401171
8609	NC_019566	ATAA	2	8	629891	629898	75 %	25 %	0 %	0 %	426401171
8610	NC_019566	GCT	3	9	630095	630103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401171
8611	NC_019566	GGCG	2	8	630106	630113	0 %	0 %	75 %	25 %	426401171
8612	NC_019566	TGGT	2	8	630114	630121	0 %	50 %	50 %	0 %	426401171
8613	NC_019566	CGT	2	6	630172	630177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401171
8614	NC_019566	CTG	2	6	630255	630260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401171
8615	NC_019566	TTTA	2	8	630300	630307	25 %	75 %	0 %	0 %	426401171
8616	NC_019566	GAA	2	6	630314	630319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401171
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8618	NC_019566	TGT	2	6	630369	630374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426401171
8619	NC_019566	GA	3	6	630560	630565	50 %	0 %	50 %	0 %	426401172
8620	NC_019566	TCG	2	6	630576	630581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426401172
8621	NC_019566	AGA	2	6	630616	630621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401172
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8990	NC_019566	TCT	2	6	661343	661348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426401204
8991	NC_019566	GAA	2	6	661353	661358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426401204
8992	NC_019566	TGA	2	6	661403	661408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426401204
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