MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci 01DC12

Total Repeats: 21795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019391	CGA	2	6	169	174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410857989
2	NC_019391	AGA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857989
3	NC_019391	CTT	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857989
4	NC_019391	T	7	7	255	261	0 %	100 %	0 %	0 %	410857989
5	NC_019391	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	410857989
6	NC_019391	A	6	6	273	278	100 %	0 %	0 %	0 %	410857989
7	NC_019391	GT	3	6	308	313	0 %	50 %	50 %	0 %	410857989
8	NC_019391	TCT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857989
9	NC_019391	A	7	7	477	483	100 %	0 %	0 %	0 %	410857989
10	NC_019391	TG	3	6	497	502	0 %	50 %	50 %	0 %	410857989
11	NC_019391	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857989
12	NC_019391	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857989
13	NC_019391	GCGT	2	8	587	594	0 %	25 %	50 %	25 %	410857989
14	NC_019391	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857989
15	NC_019391	ATG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857989
16	NC_019391	TC	3	6	726	731	0 %	50 %	0 %	50 %	410857989
17	NC_019391	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857989
18	NC_019391	ACA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857989
19	NC_019391	AGC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410857989
20	NC_019391	GTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857989
21	NC_019391	AGC	3	9	999	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410857989
22	NC_019391	CTA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410857989
23	NC_019391	GGT	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857989
24	NC_019391	CTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857989
25	NC_019391	CTT	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857990
26	NC_019391	AC	3	6	1294	1299	50 %	0 %	0 %	50 %	410857990
27	NC_019391	TTAA	2	8	1352	1359	50 %	50 %	0 %	0 %	410857990
28	NC_019391	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857990
29	NC_019391	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
30	NC_019391	GT	3	6	1460	1465	0 %	50 %	50 %	0 %	410857990
31	NC_019391	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857990
32	NC_019391	TAG	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
33	NC_019391	TC	3	6	1583	1588	0 %	50 %	0 %	50 %	410857990
34	NC_019391	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
35	NC_019391	CTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410857990
36	NC_019391	TTC	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857990
37	NC_019391	TG	3	6	1887	1892	0 %	50 %	50 %	0 %	410857990
38	NC_019391	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857990
39	NC_019391	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857990
40	NC_019391	GAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857990
41	NC_019391	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
42	NC_019391	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
43	NC_019391	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857990
44	NC_019391	CTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857990
45	NC_019391	T	6	6	2209	2214	0 %	100 %	0 %	0 %	410857990
46	NC_019391	T	8	8	2288	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	410857990
47	NC_019391	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857990
48	NC_019391	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857990
49	NC_019391	AGAT	2	8	2542	2549	50 %	25 %	25 %	0 %	410857990
50	NC_019391	T	8	8	2616	2623	0 %	100 %	0 %	0 %	410857991
51	NC_019391	T	8	8	2628	2635	0 %	100 %	0 %	0 %	410857991
52	NC_019391	AGT	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857991
53	NC_019391	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857991
54	NC_019391	TCC	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410857991
55	NC_019391	T	6	6	2729	2734	0 %	100 %	0 %	0 %	410857991
56	NC_019391	TTC	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857991
57	NC_019391	GA	3	6	2785	2790	50 %	0 %	50 %	0 %	410857991
58	NC_019391	TTA	2	6	2802	2807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857991
59	NC_019391	TGTT	2	8	2840	2847	0 %	75 %	25 %	0 %	410857991
60	NC_019391	T	6	6	2884	2889	0 %	100 %	0 %	0 %	410857991
61	NC_019391	T	6	6	2896	2901	0 %	100 %	0 %	0 %	410857991
62	NC_019391	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857991
63	NC_019391	GAAG	2	8	2951	2958	50 %	0 %	50 %	0 %	410857991
64	NC_019391	TAT	2	6	2971	2976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857991
65	NC_019391	AGTA	2	8	2981	2988	50 %	25 %	25 %	0 %	410857991
66	NC_019391	TAT	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857991
67	NC_019391	T	6	6	3010	3015	0 %	100 %	0 %	0 %	410857991
68	NC_019391	GAA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
69	NC_019391	TTTG	2	8	3299	3306	0 %	75 %	25 %	0 %	410857992
70	NC_019391	TCCT	2	8	3325	3332	0 %	50 %	0 %	50 %	410857992
71	NC_019391	GA	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	410857992
72	NC_019391	GAAAA	2	10	3355	3364	80 %	0 %	20 %	0 %	410857992
73	NC_019391	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857992
74	NC_019391	AGT	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857992
75	NC_019391	CTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857992
76	NC_019391	CAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857992
77	NC_019391	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410857992
78	NC_019391	TGG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857992
79	NC_019391	AAG	2	6	3918	3923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
80	NC_019391	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
81	NC_019391	T	6	6	4190	4195	0 %	100 %	0 %	0 %	410857992
82	NC_019391	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857992
83	NC_019391	AT	3	6	4226	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	410857992
84	NC_019391	GAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
85	NC_019391	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410857992
86	NC_019391	TAA	2	6	4312	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857992
87	NC_019391	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	410857992
88	NC_019391	AGA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
89	NC_019391	CTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857992
90	NC_019391	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857992
91	NC_019391	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857992
92	NC_019391	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410857992
93	NC_019391	CT	3	6	4728	4733	0 %	50 %	0 %	50 %	410857992
94	NC_019391	GAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
95	NC_019391	CTGTGG	2	12	4819	4830	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410857992
96	NC_019391	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
97	NC_019391	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857992
98	NC_019391	AAG	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
99	NC_019391	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
100	NC_019391	TTA	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857992
101	NC_019391	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857992
102	NC_019391	GAAA	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	410857992
103	NC_019391	T	7	7	5456	5462	0 %	100 %	0 %	0 %	410857993
104	NC_019391	AGA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857993
105	NC_019391	CGAG	2	8	5525	5532	25 %	0 %	50 %	25 %	410857993
106	NC_019391	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857993
107	NC_019391	TAT	2	6	5620	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857993
108	NC_019391	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857993
109	NC_019391	CAA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857993
110	NC_019391	GAT	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
111	NC_019391	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857993
112	NC_019391	GGA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410857993
113	NC_019391	T	6	6	5785	5790	0 %	100 %	0 %	0 %	410857993
114	NC_019391	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857993
115	NC_019391	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
116	NC_019391	GAT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
117	NC_019391	TGT	3	9	5982	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857993
118	NC_019391	TGA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
119	NC_019391	TGC	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410857993
120	NC_019391	T	7	7	6071	6077	0 %	100 %	0 %	0 %	410857993
121	NC_019391	AC	3	6	6152	6157	50 %	0 %	0 %	50 %	410857993
122	NC_019391	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410857993
123	NC_019391	TGA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
124	NC_019391	GAA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857993
125	NC_019391	A	6	6	6277	6282	100 %	0 %	0 %	0 %	410857993
126	NC_019391	GAG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410857993
127	NC_019391	TTC	2	6	6296	6301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857993
128	NC_019391	CCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410857993
129	NC_019391	CTT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857993
130	NC_019391	GTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857993
131	NC_019391	CT	3	6	6468	6473	0 %	50 %	0 %	50 %	410857993
132	NC_019391	T	6	6	6483	6488	0 %	100 %	0 %	0 %	410857993
133	NC_019391	ACA	2	6	6549	6554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857993
134	NC_019391	ATA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857993
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136	NC_019391	GA	3	6	6892	6897	50 %	0 %	50 %	0 %	410857994
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400	NC_019391	CTT	2	6	19651	19656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858001
401	NC_019391	GCGT	2	8	19667	19674	0 %	25 %	50 %	25 %	410858001
402	NC_019391	GT	3	6	19673	19678	0 %	50 %	50 %	0 %	410858001
403	NC_019391	CAA	2	6	19700	19705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858001
404	NC_019391	CGT	2	6	19801	19806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410858001
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429	NC_019391	GTT	2	6	21072	21077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858002
430	NC_019391	TAAA	2	8	21088	21095	75 %	25 %	0 %	0 %	410858002
431	NC_019391	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	410858002
432	NC_019391	TC	3	6	21145	21150	0 %	50 %	0 %	50 %	410858002
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