MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 45806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018719	TGA	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402625
2	NC_018719	TGC	2	6	279	284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402625
3	NC_018719	CGGGCA	2	12	297	308	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408402625
4	NC_018719	A	6	6	322	327	100 %	0 %	0 %	0 %	408402625
5	NC_018719	TGT	2	6	328	333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402625
6	NC_018719	CAA	2	6	454	459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402625
7	NC_018719	CGAC	2	8	510	517	25 %	0 %	25 %	50 %	408402625
8	NC_018719	TACA	2	8	530	537	50 %	25 %	0 %	25 %	408402625
9	NC_018719	A	6	6	542	547	100 %	0 %	0 %	0 %	408402625
10	NC_018719	ATG	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402625
11	NC_018719	AGC	2	6	725	730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402625
12	NC_018719	AGGAG	2	10	792	801	40 %	0 %	60 %	0 %	408402625
13	NC_018719	GCG	2	6	854	859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402625
14	NC_018719	GGGA	2	8	866	873	25 %	0 %	75 %	0 %	408402625
15	NC_018719	TGA	2	6	952	957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402625
16	NC_018719	CG	3	6	968	973	0 %	0 %	50 %	50 %	408402625
17	NC_018719	TAA	2	6	1044	1049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402625
18	NC_018719	ACC	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402625
19	NC_018719	GCG	2	6	1144	1149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402625
20	NC_018719	ATA	2	6	1160	1165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402625
21	NC_018719	CTT	2	6	1178	1183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402625
22	NC_018719	GACA	2	8	1195	1202	50 %	0 %	25 %	25 %	408402625
23	NC_018719	ACA	2	6	1259	1264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402625
24	NC_018719	AAG	2	6	1269	1274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402625
25	NC_018719	TTA	2	6	1299	1304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402625
26	NC_018719	CTA	2	6	1311	1316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402625
27	NC_018719	CTG	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402626
28	NC_018719	CACGTG	2	12	1473	1484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408402626
29	NC_018719	CAT	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
30	NC_018719	TCC	2	6	1528	1533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402626
31	NC_018719	GTG	2	6	1639	1644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
32	NC_018719	CAT	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
33	NC_018719	CAA	2	6	1680	1685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402626
34	NC_018719	GGT	2	6	1751	1756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
35	NC_018719	GCTG	2	8	1780	1787	0 %	25 %	50 %	25 %	408402626
36	NC_018719	CCT	2	6	1797	1802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402626
37	NC_018719	CAG	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402626
38	NC_018719	CCGCG	2	10	1866	1875	0 %	0 %	40 %	60 %	408402626
39	NC_018719	CATC	2	8	1895	1902	25 %	25 %	0 %	50 %	408402626
40	NC_018719	TCA	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
41	NC_018719	GAC	2	6	2008	2013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402626
42	NC_018719	GGT	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
43	NC_018719	ATG	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402626
44	NC_018719	GC	3	6	2168	2173	0 %	0 %	50 %	50 %	408402626
45	NC_018719	GCC	2	6	2224	2229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402626
46	NC_018719	T	7	7	2232	2238	0 %	100 %	0 %	0 %	408402626
47	NC_018719	GTC	2	6	2280	2285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402626
48	NC_018719	TTC	2	6	2305	2310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402626
49	NC_018719	CAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402626
50	NC_018719	CTA	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
51	NC_018719	TTA	2	6	2404	2409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402626
52	NC_018719	CGC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402626
53	NC_018719	GGT	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
54	NC_018719	CAG	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402626
55	NC_018719	ATT	2	6	2674	2679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402626
56	NC_018719	ACT	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402627
57	NC_018719	TTTTC	2	10	3053	3062	0 %	80 %	0 %	20 %	408402627
58	NC_018719	GTC	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
59	NC_018719	GGC	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402627
60	NC_018719	ATT	2	6	3176	3181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402627
61	NC_018719	ACC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402627
62	NC_018719	ATA	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402627
63	NC_018719	TTC	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402627
64	NC_018719	CGC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
65	NC_018719	CTGC	2	8	3403	3410	0 %	25 %	25 %	50 %	408402627
66	NC_018719	GCTT	2	8	3432	3439	0 %	50 %	25 %	25 %	408402627
67	NC_018719	T	6	6	3443	3448	0 %	100 %	0 %	0 %	408402627
68	NC_018719	GCG	2	6	3574	3579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402627
69	NC_018719	CAA	2	6	3649	3654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402627
70	NC_018719	CGG	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402627
71	NC_018719	ATC	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402627
72	NC_018719	TC	3	6	3729	3734	0 %	50 %	0 %	50 %	408402627
73	NC_018719	CAG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402627
74	NC_018719	GCC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
75	NC_018719	AAT	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402627
76	NC_018719	GTC	2	6	3857	3862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
77	NC_018719	TC	3	6	3865	3870	0 %	50 %	0 %	50 %	408402627
78	NC_018719	GTTG	2	8	3892	3899	0 %	50 %	50 %	0 %	408402627
79	NC_018719	AGC	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402627
80	NC_018719	GCT	2	6	4065	4070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
81	NC_018719	GCT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
82	NC_018719	TGC	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
83	NC_018719	GCCT	2	8	4110	4117	0 %	25 %	25 %	50 %	408402627
84	NC_018719	CTT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402627
85	NC_018719	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402627
86	NC_018719	GCC	2	6	4185	4190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
87	NC_018719	CTG	2	6	4264	4269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
88	NC_018719	TGC	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
89	NC_018719	GCC	2	6	4370	4375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
90	NC_018719	CT	3	6	4377	4382	0 %	50 %	0 %	50 %	408402627
91	NC_018719	CCT	3	9	4423	4431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402627
92	NC_018719	GCC	2	6	4445	4450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
93	NC_018719	TGCC	2	8	4550	4557	0 %	25 %	25 %	50 %	408402627
94	NC_018719	TTG	2	6	4575	4580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402627
95	NC_018719	GTA	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402627
96	NC_018719	GCC	2	6	4908	4913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402628
97	NC_018719	AG	3	6	4914	4919	50 %	0 %	50 %	0 %	408402628
98	NC_018719	GCC	2	6	4960	4965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402628
99	NC_018719	CCCGG	2	10	5010	5019	0 %	0 %	40 %	60 %	408402628
100	NC_018719	AGC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402628
101	NC_018719	GTG	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402628
102	NC_018719	TCG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402628
103	NC_018719	GCT	2	6	5100	5105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402628
104	NC_018719	TGC	2	6	5147	5152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402628
105	NC_018719	AGGA	2	8	5196	5203	50 %	0 %	50 %	0 %	408402628
106	NC_018719	TTC	2	6	5290	5295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402629
107	NC_018719	CGG	2	6	5317	5322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402629
108	NC_018719	ACCT	2	8	5334	5341	25 %	25 %	0 %	50 %	408402629
109	NC_018719	TCA	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402629
110	NC_018719	CGA	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402629
111	NC_018719	GAC	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402629
112	NC_018719	A	7	7	5579	5585	100 %	0 %	0 %	0 %	408402629
113	NC_018719	CG	3	6	5622	5627	0 %	0 %	50 %	50 %	408402629
114	NC_018719	TCA	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402630
115	NC_018719	CCA	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402630
116	NC_018719	TCGTCA	2	12	5766	5777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408402630
117	NC_018719	CT	3	6	5786	5791	0 %	50 %	0 %	50 %	408402630
118	NC_018719	CAG	3	9	5947	5955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
119	NC_018719	CAT	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402631
120	NC_018719	AGG	2	6	6026	6031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402631
121	NC_018719	CTG	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402631
122	NC_018719	ACG	2	6	6076	6081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
123	NC_018719	GAG	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402631
124	NC_018719	CGC	2	6	6312	6317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402631
125	NC_018719	ATA	2	6	6319	6324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402631
126	NC_018719	CGG	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402631
127	NC_018719	GCGAT	2	10	6392	6401	20 %	20 %	40 %	20 %	408402631
128	NC_018719	TTC	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402631
129	NC_018719	ACG	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
130	NC_018719	GAT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402631
131	NC_018719	CGGGA	2	10	6487	6496	20 %	0 %	60 %	20 %	408402631
132	NC_018719	GTG	3	9	6568	6576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402631
133	NC_018719	TGGG	2	8	6582	6589	0 %	25 %	75 %	0 %	408402631
134	NC_018719	CA	3	6	6595	6600	50 %	0 %	0 %	50 %	408402631
135	NC_018719	A	7	7	6609	6615	100 %	0 %	0 %	0 %	408402631
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140	NC_018719	GA	3	6	6836	6841	50 %	0 %	50 %	0 %	408402631
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144	NC_018719	AGCG	2	8	7018	7025	25 %	0 %	50 %	25 %	408402632
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156	NC_018719	TTC	2	6	7402	7407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402632
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160	NC_018719	AACT	2	8	7662	7669	50 %	25 %	0 %	25 %	408402633
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263	NC_018719	TAT	2	6	14056	14061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402642
264	NC_018719	CAGG	2	8	14126	14133	25 %	0 %	50 %	25 %	408402642
265	NC_018719	TCA	2	6	14187	14192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402642
266	NC_018719	TGCG	2	8	14239	14246	0 %	25 %	50 %	25 %	408402642
267	NC_018719	GCTCGG	2	12	14247	14258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408402642
268	NC_018719	CAC	2	6	14359	14364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402642
269	NC_018719	AC	4	8	14457	14464	50 %	0 %	0 %	50 %	408402642
270	NC_018719	GAG	2	6	14474	14479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402642
271	NC_018719	CTG	2	6	14519	14524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402642
272	NC_018719	GAC	2	6	14561	14566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402642
273	NC_018719	GGT	2	6	14581	14586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402642
274	NC_018719	CGC	2	6	14592	14597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402642
275	NC_018719	GCT	2	6	14602	14607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402642
276	NC_018719	CTG	2	6	14611	14616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402642
277	NC_018719	GCA	2	6	14726	14731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402642
278	NC_018719	AGGGA	2	10	14736	14745	40 %	0 %	60 %	0 %	408402642
279	NC_018719	CAC	2	6	14752	14757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402642
280	NC_018719	GCA	2	6	14777	14782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402642
281	NC_018719	AGGC	2	8	14783	14790	25 %	0 %	50 %	25 %	408402642
282	NC_018719	TTC	2	6	14888	14893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402642
283	NC_018719	GGC	2	6	14905	14910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402642
284	NC_018719	GGT	2	6	15019	15024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402642
285	NC_018719	CA	4	8	15091	15098	50 %	0 %	0 %	50 %	408402642
286	NC_018719	A	6	6	15140	15145	100 %	0 %	0 %	0 %	408402642
287	NC_018719	ATG	2	6	15157	15162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402642
288	NC_018719	GTC	2	6	15171	15176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402643
289	NC_018719	CA	3	6	15186	15191	50 %	0 %	0 %	50 %	408402643
290	NC_018719	ATG	2	6	15259	15264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402643
291	NC_018719	GCA	2	6	15299	15304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402643
292	NC_018719	GGT	2	6	15339	15344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402643
293	NC_018719	AAC	3	9	15545	15553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402643
294	NC_018719	TTC	2	6	15676	15681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402644
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296	NC_018719	GGT	2	6	15914	15919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402645
297	NC_018719	GC	3	6	15959	15964	0 %	0 %	50 %	50 %	408402645
298	NC_018719	ACAA	2	8	15966	15973	75 %	0 %	0 %	25 %	408402645
299	NC_018719	GCG	2	6	15988	15993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402645
300	NC_018719	AAGC	2	8	16028	16035	50 %	0 %	25 %	25 %	408402645
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302	NC_018719	CAC	2	6	16118	16123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402646
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304	NC_018719	TGA	2	6	16264	16269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402646
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306	NC_018719	GTC	2	6	16334	16339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402646
307	NC_018719	TGA	2	6	16357	16362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402646
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312	NC_018719	CT	4	8	16604	16611	0 %	50 %	0 %	50 %	408402646
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336	NC_018719	CA	3	6	17986	17991	50 %	0 %	0 %	50 %	408402648
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353	NC_018719	GCG	3	9	18802	18810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402648
354	NC_018719	GCAA	2	8	18816	18823	50 %	0 %	25 %	25 %	408402648
355	NC_018719	GCA	2	6	18849	18854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402648
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359	NC_018719	GGC	2	6	19175	19180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402648
360	NC_018719	AGC	2	6	19192	19197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402648
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362	NC_018719	GCT	2	6	19397	19402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402648
363	NC_018719	GACC	2	8	19433	19440	25 %	0 %	25 %	50 %	408402648
364	NC_018719	GCA	2	6	19482	19487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402648
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368	NC_018719	GAGCA	2	10	19957	19966	40 %	0 %	40 %	20 %	408402649
369	NC_018719	TGG	2	6	19994	19999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402649
370	NC_018719	GGCT	2	8	20033	20040	0 %	25 %	50 %	25 %	408402649
371	NC_018719	GTT	2	6	20047	20052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402649
372	NC_018719	A	6	6	20054	20059	100 %	0 %	0 %	0 %	408402649
373	NC_018719	AGG	2	6	20132	20137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402649
374	NC_018719	CAA	2	6	20217	20222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402649
375	NC_018719	GA	3	6	20223	20228	50 %	0 %	50 %	0 %	408402649
376	NC_018719	TGA	2	6	20232	20237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402649
377	NC_018719	GGC	2	6	20277	20282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402649
378	NC_018719	CTG	2	6	20290	20295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402649
379	NC_018719	CGG	2	6	20406	20411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402649
380	NC_018719	CTA	2	6	20442	20447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402649
381	NC_018719	GAC	2	6	20458	20463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402649
382	NC_018719	ACA	2	6	20468	20473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402649
383	NC_018719	GC	3	6	20543	20548	0 %	0 %	50 %	50 %	408402649
384	NC_018719	GCT	2	6	20580	20585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402649
385	NC_018719	GAT	2	6	20589	20594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402649
386	NC_018719	TTA	2	6	20637	20642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402649
387	NC_018719	CTTC	2	8	20664	20671	0 %	50 %	0 %	50 %	408402649
388	NC_018719	GAC	2	6	20746	20751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402649
389	NC_018719	CAT	2	6	20760	20765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402649
390	NC_018719	GGC	2	6	20803	20808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402649
391	NC_018719	ACT	2	6	20822	20827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402649
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393	NC_018719	CAT	2	6	20901	20906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402649
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495	NC_018719	CGG	2	6	26909	26914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402655
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497	NC_018719	GCGCG	2	10	27196	27205	0 %	0 %	60 %	40 %	408402655
498	NC_018719	TTG	2	6	27247	27252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402655
499	NC_018719	GCC	2	6	27265	27270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402655
500	NC_018719	AAT	3	9	27276	27284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402655

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