MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a plasmid pCuri3

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018657	TAT	2	6	188	193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472017
2	NC_018657	ACT	2	6	224	229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472017
3	NC_018657	TAA	2	6	232	237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
4	NC_018657	ATAA	2	8	260	267	75 %	25 %	0 %	0 %	407472017
5	NC_018657	TA	3	6	311	316	50 %	50 %	0 %	0 %	407472017
6	NC_018657	ATT	2	6	347	352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472017
7	NC_018657	ATA	2	6	387	392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
8	NC_018657	ATA	2	6	399	404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
9	NC_018657	A	6	6	406	411	100 %	0 %	0 %	0 %	407472017
10	NC_018657	CAAT	2	8	415	422	50 %	25 %	0 %	25 %	407472017
11	NC_018657	GCA	2	6	556	561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407472017
12	NC_018657	ATG	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
13	NC_018657	TCA	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472017
14	NC_018657	TTAACA	2	12	584	595	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407472017
15	NC_018657	TAA	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
16	NC_018657	AT	3	6	776	781	50 %	50 %	0 %	0 %	407472017
17	NC_018657	ATG	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
18	NC_018657	AGA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472017
19	NC_018657	A	6	6	921	926	100 %	0 %	0 %	0 %	407472017
20	NC_018657	ACT	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472017
21	NC_018657	TAA	2	6	958	963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
22	NC_018657	TGA	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
23	NC_018657	GAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472017
24	NC_018657	ATG	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
25	NC_018657	GTGA	2	8	1250	1257	25 %	25 %	50 %	0 %	407472017
26	NC_018657	AGA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472017
27	NC_018657	GAT	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
28	NC_018657	TAT	2	6	1595	1600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472018
29	NC_018657	TAA	2	6	1657	1662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472018
30	NC_018657	TTCG	2	8	1694	1701	0 %	50 %	25 %	25 %	407472018
31	NC_018657	T	7	7	1736	1742	0 %	100 %	0 %	0 %	407472018
32	NC_018657	GAA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472018
33	NC_018657	AGG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472018
34	NC_018657	GGT	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472018
35	NC_018657	T	6	6	1920	1925	0 %	100 %	0 %	0 %	407472018
36	NC_018657	TGA	2	6	1988	1993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472018
37	NC_018657	GA	3	6	2013	2018	50 %	0 %	50 %	0 %	407472018
38	NC_018657	TGA	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472018
39	NC_018657	TGA	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472018
40	NC_018657	TTGA	2	8	2079	2086	25 %	50 %	25 %	0 %	407472018
41	NC_018657	AGA	2	6	2111	2116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472018
42	NC_018657	A	6	6	2129	2134	100 %	0 %	0 %	0 %	407472018
43	NC_018657	AGG	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472018
44	NC_018657	GTA	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472019

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.