MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_018656	GAATT	2	10	1234703	1234712	40 %	40 %	20 %	0 %	407465326
24503	NC_018656	T	7	7	1234711	1234717	0 %	100 %	0 %	0 %	407465326
24504	NC_018656	TGT	2	6	1234760	1234765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407465326
24505	NC_018656	CTT	2	6	1234791	1234796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407465326
24506	NC_018656	CCA	2	6	1234802	1234807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407465326
24507	NC_018656	TCT	2	6	1234859	1234864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407465326
24508	NC_018656	TCA	2	6	1234883	1234888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465326
24509	NC_018656	ATT	2	6	1235187	1235192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465327
24510	NC_018656	TTG	2	6	1235237	1235242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407465327
24511	NC_018656	AAT	2	6	1235259	1235264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465327
24512	NC_018656	CTAT	2	8	1235275	1235282	25 %	50 %	0 %	25 %	407465327
24513	NC_018656	ATT	2	6	1235317	1235322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465327
24514	NC_018656	ATT	2	6	1235344	1235349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465327
24515	NC_018656	CAT	2	6	1235360	1235365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465327
24516	NC_018656	AAC	2	6	1235378	1235383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407465327
24517	NC_018656	CAA	2	6	1235423	1235428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407465327
24518	NC_018656	AAT	2	6	1235451	1235456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465327
24519	NC_018656	TGT	2	6	1235457	1235462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407465327
24520	NC_018656	AAT	2	6	1235469	1235474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465327
24521	NC_018656	TAG	2	6	1235582	1235587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407465327
24522	NC_018656	CAT	2	6	1235640	1235645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465327
24523	NC_018656	AAT	2	6	1235655	1235660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465327
24524	NC_018656	AAAG	2	8	1235689	1235696	75 %	0 %	25 %	0 %	407465327
24525	NC_018656	ACTTG	2	10	1235709	1235718	20 %	40 %	20 %	20 %	407465327
24526	NC_018656	A	6	6	1235732	1235737	100 %	0 %	0 %	0 %	407465327
24527	NC_018656	AGT	2	6	1235748	1235753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407465327
24528	NC_018656	GCA	2	6	1235782	1235787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407465327
24529	NC_018656	CATCA	2	10	1235805	1235814	40 %	20 %	0 %	40 %	407465327
24530	NC_018656	TGT	2	6	1235862	1235867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407465327
24531	NC_018656	ATC	2	6	1235905	1235910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465327
24532	NC_018656	T	6	6	1235914	1235919	0 %	100 %	0 %	0 %	407465327
24533	NC_018656	ATT	2	6	1235931	1235936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465327
24534	NC_018656	ATG	2	6	1235950	1235955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407465327
24535	NC_018656	GTT	2	6	1235967	1235972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407465327
24536	NC_018656	CTG	2	6	1235993	1235998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407465327
24537	NC_018656	AGA	2	6	1236027	1236032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407465327
24538	NC_018656	GAAGAT	2	12	1236033	1236044	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407465327
24539	NC_018656	ATGG	2	8	1236094	1236101	25 %	25 %	50 %	0 %	407465327
24540	NC_018656	GCA	2	6	1236202	1236207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407465327
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24542	NC_018656	TCC	2	6	1236279	1236284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407465327
24543	NC_018656	TTGT	2	8	1236369	1236376	0 %	75 %	25 %	0 %	407465327
24544	NC_018656	T	6	6	1236376	1236381	0 %	100 %	0 %	0 %	407465327
24545	NC_018656	ATA	2	6	1236383	1236388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465327
24546	NC_018656	CCT	2	6	1236406	1236411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407465327
24547	NC_018656	ATACA	2	10	1236493	1236502	60 %	20 %	0 %	20 %	407465328
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24549	NC_018656	ATCAGG	2	12	1236568	1236579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407465328
24550	NC_018656	ATT	2	6	1236632	1236637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465328
24551	NC_018656	TAT	2	6	1237098	1237103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465329
24552	NC_018656	ATTT	2	8	1237171	1237178	25 %	75 %	0 %	0 %	407465329
24553	NC_018656	A	6	6	1237224	1237229	100 %	0 %	0 %	0 %	407465329
24554	NC_018656	ATC	3	9	1237231	1237239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465329
24555	NC_018656	TCT	2	6	1237252	1237257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407465329
24556	NC_018656	ATT	2	6	1237348	1237353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465329
24557	NC_018656	AT	3	6	1237360	1237365	50 %	50 %	0 %	0 %	407465329
24558	NC_018656	ATTT	2	8	1237476	1237483	25 %	75 %	0 %	0 %	407465329
24559	NC_018656	ATGT	2	8	1237544	1237551	25 %	50 %	25 %	0 %	407465329
24560	NC_018656	CAAAA	2	10	1237585	1237594	80 %	0 %	0 %	20 %	407465329
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24567	NC_018656	GTTT	2	8	1237742	1237749	0 %	75 %	25 %	0 %	407465329
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24570	NC_018656	TCTA	2	8	1237824	1237831	25 %	50 %	0 %	25 %	407465330
24571	NC_018656	TCTTTT	2	12	1237835	1237846	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407465330
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24574	NC_018656	T	7	7	1237994	1238000	0 %	100 %	0 %	0 %	407465330
24575	NC_018656	T	7	7	1238032	1238038	0 %	100 %	0 %	0 %	407465330
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24578	NC_018656	T	8	8	1238230	1238237	0 %	100 %	0 %	0 %	407465330
24579	NC_018656	GACTT	2	10	1238260	1238269	20 %	40 %	20 %	20 %	407465330
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24585	NC_018656	TTGT	2	8	1238455	1238462	0 %	75 %	25 %	0 %	407465331
24586	NC_018656	TCTACA	2	12	1238509	1238520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465331
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24590	NC_018656	ATTT	2	8	1238759	1238766	25 %	75 %	0 %	0 %	407465331
24591	NC_018656	GAA	2	6	1238974	1238979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407465332
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24595	NC_018656	AAC	2	6	1239215	1239220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407465332
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24598	NC_018656	T	7	7	1239372	1239378	0 %	100 %	0 %	0 %	407465332
24599	NC_018656	ATA	2	6	1239400	1239405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465332
24600	NC_018656	TCA	2	6	1239434	1239439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465332
24601	NC_018656	T	6	6	1239466	1239471	0 %	100 %	0 %	0 %	407465332
24602	NC_018656	ATC	2	6	1239628	1239633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465332
24603	NC_018656	TCAAT	2	10	1239729	1239738	40 %	40 %	0 %	20 %	407465332
24604	NC_018656	ATCC	2	8	1239782	1239789	25 %	25 %	0 %	50 %	407465333
24605	NC_018656	TAA	2	6	1239884	1239889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465333
24606	NC_018656	TCC	2	6	1239903	1239908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407465333
24607	NC_018656	TCT	2	6	1239910	1239915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407465333
24608	NC_018656	ATT	2	6	1239991	1239996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465333
24609	NC_018656	ATT	2	6	1240071	1240076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465333
24610	NC_018656	GAT	2	6	1240136	1240141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407465333
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24612	NC_018656	GCT	3	9	1240201	1240209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407465333
24613	NC_018656	TCA	2	6	1240261	1240266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465333
24614	NC_018656	TGT	2	6	1240284	1240289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407465333
24615	NC_018656	CAC	2	6	1240295	1240300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407465333
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24617	NC_018656	TGAAT	2	10	1240345	1240354	40 %	40 %	20 %	0 %	407465333
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