MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_018656	ATA	3	9	643796	643804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464641
13003	NC_018656	CTT	2	6	643931	643936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464641
13004	NC_018656	AAC	2	6	644390	644395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464642
13005	NC_018656	CAG	2	6	644656	644661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464642
13006	NC_018656	ATT	2	6	644664	644669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464642
13007	NC_018656	ATGGA	2	10	644724	644733	40 %	20 %	40 %	0 %	407464642
13008	NC_018656	TAA	2	6	644817	644822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464642
13009	NC_018656	T	6	6	644844	644849	0 %	100 %	0 %	0 %	407464642
13010	NC_018656	AGT	2	6	644896	644901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464642
13011	NC_018656	TGTT	2	8	644923	644930	0 %	75 %	25 %	0 %	407464642
13012	NC_018656	T	6	6	644929	644934	0 %	100 %	0 %	0 %	407464642
13013	NC_018656	ATA	2	6	644968	644973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464642
13014	NC_018656	TTA	2	6	644997	645002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464642
13015	NC_018656	TCA	2	6	645033	645038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464642
13016	NC_018656	TCA	2	6	645081	645086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464642
13017	NC_018656	A	8	8	645192	645199	100 %	0 %	0 %	0 %	407464643
13018	NC_018656	ATC	2	6	645202	645207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464643
13019	NC_018656	AGC	2	6	645250	645255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464643
13020	NC_018656	TGA	2	6	645300	645305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464643
13021	NC_018656	CAA	2	6	645319	645324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464643
13022	NC_018656	GA	3	6	645325	645330	50 %	0 %	50 %	0 %	407464643
13023	NC_018656	TGG	2	6	645429	645434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464643
13024	NC_018656	T	6	6	645448	645453	0 %	100 %	0 %	0 %	407464643
13025	NC_018656	GCC	2	6	645478	645483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407464643
13026	NC_018656	TAATTT	2	12	645636	645647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464644
13027	NC_018656	T	8	8	645799	645806	0 %	100 %	0 %	0 %	407464644
13028	NC_018656	TCC	2	6	645811	645816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464644
13029	NC_018656	AATT	2	8	645861	645868	50 %	50 %	0 %	0 %	407464644
13030	NC_018656	ATG	2	6	645900	645905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464644
13031	NC_018656	A	8	8	645931	645938	100 %	0 %	0 %	0 %	407464644
13032	NC_018656	ATT	2	6	645944	645949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464644
13033	NC_018656	TGA	2	6	645982	645987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464644
13034	NC_018656	ATT	2	6	646026	646031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464644
13035	NC_018656	CATT	2	8	646062	646069	25 %	50 %	0 %	25 %	407464644
13036	NC_018656	CAAT	2	8	646081	646088	50 %	25 %	0 %	25 %	407464644
13037	NC_018656	TCAT	2	8	646089	646096	25 %	50 %	0 %	25 %	407464644
13038	NC_018656	ACA	2	6	646177	646182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464644
13039	NC_018656	TCA	2	6	646307	646312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464645
13040	NC_018656	TGT	2	6	646317	646322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464645
13041	NC_018656	AAT	2	6	646342	646347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464645
13042	NC_018656	TGTTT	2	10	646372	646381	0 %	80 %	20 %	0 %	407464645
13043	NC_018656	TGG	2	6	646405	646410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464645
13044	NC_018656	AAT	2	6	646411	646416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464645
13045	NC_018656	ATT	3	9	646442	646450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464645
13046	NC_018656	CAA	2	6	646493	646498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464646
13047	NC_018656	ACAATA	2	12	646519	646530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407464646
13048	NC_018656	A	6	6	646563	646568	100 %	0 %	0 %	0 %	407464646
13049	NC_018656	TTTTG	2	10	646653	646662	0 %	80 %	20 %	0 %	407464646
13050	NC_018656	T	6	6	646692	646697	0 %	100 %	0 %	0 %	407464646
13051	NC_018656	AGA	2	6	646930	646935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464647
13052	NC_018656	T	6	6	646943	646948	0 %	100 %	0 %	0 %	407464647
13053	NC_018656	T	6	6	646960	646965	0 %	100 %	0 %	0 %	407464647
13054	NC_018656	CTG	2	6	647010	647015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464647
13055	NC_018656	CTTA	2	8	647071	647078	25 %	50 %	0 %	25 %	407464647
13056	NC_018656	ATC	2	6	647413	647418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464648
13057	NC_018656	T	6	6	647441	647446	0 %	100 %	0 %	0 %	407464648
13058	NC_018656	TGA	2	6	647502	647507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464648
13059	NC_018656	CAT	2	6	647511	647516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464648
13060	NC_018656	A	6	6	647523	647528	100 %	0 %	0 %	0 %	407464648
13061	NC_018656	T	6	6	647563	647568	0 %	100 %	0 %	0 %	407464648
13062	NC_018656	T	6	6	647570	647575	0 %	100 %	0 %	0 %	407464648
13063	NC_018656	AAT	2	6	647600	647605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464648
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13065	NC_018656	TCCCTC	2	12	647664	647675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464648
13066	NC_018656	TCT	2	6	647729	647734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464648
13067	NC_018656	CTTG	2	8	647750	647757	0 %	50 %	25 %	25 %	407464648
13068	NC_018656	T	7	7	647798	647804	0 %	100 %	0 %	0 %	407464648
13069	NC_018656	TCTTG	2	10	647892	647901	0 %	60 %	20 %	20 %	407464648
13070	NC_018656	AGAGT	2	10	647910	647919	40 %	20 %	40 %	0 %	407464648
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13073	NC_018656	CGG	2	6	648192	648197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407464649
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13089	NC_018656	TGA	2	6	648954	648959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464649
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13094	NC_018656	TAG	2	6	649107	649112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464649
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13103	NC_018656	TGAA	2	8	649513	649520	50 %	25 %	25 %	0 %	407464650
13104	NC_018656	TGC	2	6	649580	649585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464650
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13108	NC_018656	T	8	8	649827	649834	0 %	100 %	0 %	0 %	407464650
13109	NC_018656	TGA	2	6	649865	649870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464650
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13111	NC_018656	TTG	3	9	649894	649902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464650
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13119	NC_018656	TCCT	2	8	650437	650444	0 %	50 %	0 %	50 %	407464651
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